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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl16g09480 | GWHBECQ00000016 | 9727857 | 9728777 | - | "Transcription termination factor MTEF1, chloroplastic |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl16g09480.mrna1 | 60 | 180 | PF02536.17 | mTERF | Family | 45.5 | 5.10E-12 |
Nl16g09480.mrna1 | 190 | 296 | PF02536.17 | mTERF | Family | 94.8 | 5.10E-27 |
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>Nl16g09480.mrna1 ATGCCAACAACAGCAATACACTCTATTTTCTGTATCACTTCACATTCATCACCATCTTCT TCTTCTTCTTCTCCTTCTTCCTCAAATTCTCAACAACAACCCTTAGCAACAAAACCCAAT AGTCTTCTCCAAAACCACCCTCTCTACCCACCAACTCATGCAAATCTCTCCCTCCAAATC CAAGAAAAAATAATCTGTCTTGAAATCATGGGTGTTGATTCCGGCAAGGTGCTCTCCCTC AACCCCTCTCTCCACTCAGCTCCACTCCATTCCATTCACTCCATAATCCACTTTCTCCAA TCCAAAGGCCTCCGCCACAAGGACTTGCCCAGGATCTTTGGGTTGTGCCCAAAACTCCTC ACTGCTGACATCAAAGCTGACCTCACCCCAGTTTTTAACTTCCTCTCGCATGACCTTAAA GTTCCAGAATCCAACTTCAGGAGGGTCATCAACAAGTGTCCAAGACTGCTGGCCTCTAGT GCCAGAGACCAGCTCAAGCCTGCTTTGTTTTATCTTCAAAGACTTGGCTTTAAGGACTTG GAGGCTTTGGCTTATCAAGACTCGGTTTTGTTGGTGTGCAGCGTGGAAAACACCTTGATA CCAAAGCTCAAGTACATAGAGAGTATTGGGTTTTCCAGGGAGGAAGCTGTGGTTATGGTG TTGAGGTGTCCAGCTCTGTTCACTTACAGTATTGACAACAATTTCAAACCCAAGTTTGAC TACTTTGTTGAGCAAATAAAGGGAGAGATGGAGGATTTGAAGGAATTTCCACAGTACTTT GCTTTTAGTTTGGAGAAGAGGATAAAGCCTAGACACATGGAGGCTGTCCAAGCTGGCTTG AGAGTTGCTCTGCCGGCGTTGCTCAAGCCCAACGATGATGAGTTCAAGGATCTCATCAAA CGAGGCCGAGGGCCTGCTTGA
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>Nl16g09480.mrna1 MPTTAIHSIFCITSHSSPSSSSSSPSSSNSQQQPLATKPNSLLQNHPLYPPTHANLSLQI QEKIICLEIMGVDSGKVLSLNPSLHSAPLHSIHSIIHFLQSKGLRHKDLPRIFGLCPKLL TADIKADLTPVFNFLSHDLKVPESNFRRVINKCPRLLASSARDQLKPALFYLQRLGFKDL EALAYQDSVLLVCSVENTLIPKLKYIESIGFSREEAVVMVLRCPALFTYSIDNNFKPKFD YFVEQIKGEMEDLKEFPQYFAFSLEKRIKPRHMEAVQAGLRVALPALLKPNDDEFKDLIK RGRGPA*
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>Nl16g09480.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 TCAATAGTTGATTTTTTTCCTTTTTAAATGTGACATTTTCCGTCTAATTACTGCTTTGCA AAGCAAATTGCCTGGATTGATAGTAATTTTTCCCACTTCCCCACCCTTATGCACAAACAT TTATTGTTGATATGCAAAAACTTGAGAGCTAGATATATTAATTTAGTTGCAAAATTGAGG AGCTATATAAACTAGATACAGGCATGATTAGCTCTTGTCAAATCTAGCCCCATATTAATG TTGGATTTTACTGTATTTAACTATTTGTGGCTTCTCTCTTGTCAAAGATTGTGTACTCTG ATTGATTCTCTTCTTCTTTGTCTAGTGATATATATATATTGTTGTAAATTCCATTATGCA GGATGATCACCAAACTCCTGGCAGAAAGCTCCTTCGACGGCACTCCATGAGCAAAAGCCA TGGGCAACATTAAGAATCAACACAATGAGCAAAGTTACTGGCAGTTCTAGGCAAGTAATA TTTGGGATGAAGCTCTTAACTTCCATTTCTTGAATTGACTATTATTGAAAACTGGATTCC CAAATTGACCTCTTGCAACTCTGCATTTTTTGTACCAAATGTTTATTTCATGAGTGCAAA ACAGTAATACCTGATTATCCTCCATCCTCTGCCATGCCAATGTTTTTGTAGGATCAAGAC GTTGTCCATATTGTAAGCAAATTGGAAATAGATTTCCCTGGTTACAACAAGAGCTGCTGT GGGAACTTGTGGCAGTTTCTTTTCCAAAATTTTACTCTCTTTGTGGCAGGATAATTATGT TATTCGAGGAGATGCGTGTTCTACAACTTACTTTGGTACTGTTTTTAAGAGTTTGCTTTT CGGTATTTATGTTTAGTAGGATGTTTTGTAGAGATCTTCGACCAAATACTGTTTTTGAGT TTTCTGGGATTTTATTTGTTTGGATATCACAGATGATAGATTAAACACTTGAACCATCAT GAATCTAATAATTGTAAGAATTCAATTATCGACATTTAGATCAGCATGAGTGTTAGCTGC AGTGATTCATTTGACATTTCCATAGCCAGAGTGGAAATAAATATTTGCTTGTATATCATT TTCCTTAGTTTAATCTCACTTCAGGCTTTCCTTTTCTAAATTTAATGCACATCTGAATTG ATCTAACTGGGAGCCTGATGGTTTGAGAGCAATTGCTAATTATTTTTGTATTATTATTAT TATTATTTTTGAATAAAATTATTTTTGTATTATTGGCATGAAATGGGGACTAGTTCACTC TCTAGACGTGCTTTAATTTCTGGTTTTTGCCAGCGGACAAACATTAAAAATTCTCTGGTT CAACCTGACTCGGTGGTAGTCACTTCTACCCTTGAATAATTTGACAGGTGGCTCGTCTTT TCAAAGAGTAGAAGCAGAAATAACTCCTCCAAGAGCCGAAGAAATTAGAAAAAAAACCAT GGTTCTAAAAAAGTACGTTTATAGTTTCAAAAAGAAGGAAAAAACAAAAAACGTTTATAA TTAATTTTAATGCAAAACTTTAATAGTATGAAGCCTGACGAACTGCCGAACCGATTTTTC ATTTTTTTTTTTTTAAAGGAACTGCTAAGTCCGTTGTGATTAATTATTGCTTAAGTGGTT TGGATAGGTGTATATTCACCTCAACTAGGATGAATGTGCCTTACTGACACTTTCCAAATG TAGAGGGCCTCCGAAAATCGCAAGAAACAAGTGCCTGATATTCCAAAAGCCATGATGTTT ATAAATAAACAGGGAGTTGGACCCTTCGGCTCACCCAAAGTCCAAACCAAATGGTTTGGT AGTGTGGCCGAGTGCAAAAGAATCCACTAATAAGCATAGTGGACAGGAGCAGAGGAGCTC CACTCAATTTACTAACCCATATAATCTACGATAACCGAATATGAGCCAATCAATTCTGGT GGAACGTCCACATGACACTGCCACATAAAAAGCAATCGGGATGAGCTTTTGGAAAAAGAA TCCATCTCTTCTCAAACACC
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>Nl06g00080.mrna1 GenomeSequence + ATGTGTTCGATTTTGAGAAAACTCAAGCATCCAGGGAAGACATCATTAATGATGAAGAAT GGGGGAATTTTATTGGAAAAGCTTATTGCGTCTAGTAAAGGTAAATATAATCCGATTCGT TCCTTCTCAGTTGAAGAGGTTAAGACAGCAACAGACAACTTTAATATACAGAATGTTGTA ACGAGAGATAGTGCATATGAAGTCTATGAAGGTTTTCTGCATGACCGTCCAGTGTCTGTT ATGAAGTACGGTCCTAATAGCTCAGAAACACAAGAATATAGTTTTAATAACATTGTATTT GCAGCACAAATGTGTCACAAAAACACTTTGAAGTTAATCGGATGTTGTTTGGAAACCCAA ACTCCCATCCTAGTTTTTGAATCTGTGAAGTATGGTTCTTTGGCTAACCGTATTCATCAT GACGGTCAACCTGATTTTGAGCCTTTACTGTGGACTCATAGGTTAAAGATTGCTATGGAG ATAGCTAGTGTGGTTGCATATCTCCATGTTGGATTCTCTAGACCAATCATTTTTAGAAAT ATAAAACCATATAACATCTTATTCAATGAAGAGCACACCGCAAAACTGTTTGATTTGTCG CTTTGCATATCTATTCCAGAAGATCAAACTCATATAATTGATCGAGTGATAATAGGAACT TTTGGATATCTTGCACCTGAGTATCTGCGTTTTTATTATTGTGATGAGAAATGTGACGTG TTTAGCTTTGGTGCATTGCTGCTAGAGCTTTTGACAGGACAAAGAATAAATGATTGTTTT GGTTCCGCAACTGGAGAAGAGTATTACCTGCGGGATCATGTACTGAAACATATTGAAAAC AATAGGTTTAAAGACATGGTAGATCCTATAATAGTTGGAGATGGGCTCTCTCGCGAAAAA 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