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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl16g05980 | GWHBECQ00000016 | 13081700 | 13084925 | - | Squamosa promoter-binding protein 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl16g05980.mrna1 | 53 | 126 | PF03110.17 | SBP | Domain | 111.3 | 2.30E-32 |
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>Nl16g05980.mrna1 ATGGACACAAGCAAAGCTGAAGGGAAGAGGAGCTTGAAGGAGGTGGTGGTGGAGGATGAA GAAGAGGATGATGATGAAGACAGTAGTGGGTTAGGGTTTGGAGAGGATGACAAGAAAAGG AAAGGCAAGAAAGGATCAAGCAGTGCTGCTGCTTCTTGTCAAGTGGAAAATTGTACGGTT GATATGTCCGACGCCAAGCGATATCATAGGCGCCACAAGGTCTGTGAGGTCCATGCTAAG GCTGCTGCTGTTCGTCTTGCCGGACTCCAACAACGTTTCTGCCAGCAATGTAGCAGGTTC CATGATGTATCAGAGTTTGATGAAGCCAAGAGAAGTTGTCGTAGGCGTTTGGCTGGACAC AACGAGCGCCGCCGTAAAAGCTCCGCTGATTTATACCATGGAGAAGGCTCAAACTGA
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>Nl16g05980.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 AAAAACCTTAAACTAAACTATTTTAAAAGCCTATATGAGTGGGACTGTGGGACCATGCTA GAATGATAGTGGCCATGATTCTGTATGAACATCAAAAGCTCTAGGAAATTAGGTCCTACT GTGATTTTCGTTGTTCAACTTTAACTTAATTAAGATATTGTTAAATTGAAAAACCATTAT TTACCATCAAATCTTATTATTTATTAGCTTATAATATAATTTTTTTTTTTTTTACAAAAA ATTATTAAAATTACAGATCTTGACAAATTTTGTTCGGTGACAGGGTTCGCAGAAAAAGAA AGTTGGAGTACCTGCGTTACCAACTACCAAGTAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAATTGCCA ATTTTCAATCTTTTCAACATTTTGTGATATACGGTATCAAATTATGGAACCTCAAGATTT AAGTTGTCCTACTCCTACCCCAATTTTCTCAGTAACCAATTTGAAAGTCATTGACCGTAT TACATGATAGAGGGGACCCTCTCCACTTGCACGTGGTTATGTTGACAATTATTGTCTTAG AAATATGAATACTTTTACAACCTCGTTAATGGGCACAATGGAACTTCAGCTAAGGATTAA TCTATGGTCCCAGCTGACTCTCTGTAAAGAGAATTTTTACAAAACTGTTGTTGACATCTA CCTGTAATATCATTTATTCGTAATATATCACGTGATATGAAAATAATGTATAAGTATAAA TATATACCATATAATATTACTGATTCTTAATATATTATATGACATGAAAACAATGTTTAA ATACAAGCATATTCCACACAAGTTGTTTTTCTCTGATAAAAGCACTCGGTTCTCTGAGTA CCTAATCAACCTGACATATGTGCAACCACATTACATTGGATCATTGATCTGAATTCAATT CCCTCGTACATTTGGCGGGGGACCAGTATATTTAAAAGCTAACTGACCAGTGTGGTCCTC TTTGTATGATCATGAAACCAGTAAGGCAAGCAAGGATGTATACAGGTGCCCCACTATGCT CAAAATCTGTTGGCTGCACCAAAAAATGACATGTGAAACCCAACAGGAGAGGGAAAAAAA TAAAAAGAAGGAAAGAAAAAGAATAAATGCAAAGGACATGAAATTCCAGCCCAGTACAAT AGACATGGCAAGGCTTGATGGATTGATGGGTTTGCTCGCATATGGAACCCTTAAAAAGTT AATTTTTTTACCTTTCAGCTTTCACCTTCCAATAATACACTCAAAAGTGCAGGAATTGTC CCTTTCTCAAGAAAAGGACTATCAGTTATAATGAAGAGAGAGAATCCTACATGCATGCAT CCTTGGAAAAATTTTCATCTATTATAAAAAGGCCTGTACATATTTAATAAGTCGGACCAT AGACTTTCAATGACTGAATACAGTAATTTGTCTCTAACAATAACTACTAATGTAGTCGCC AATCAAAAACATAGAAGTTAAAATTTTTGTCTTTGATTGTGACAGACATCAGAAACTGCT TCAAAATTGAATACGCTACGGTCAACATTAATTTCTGCAAAACCAAGAGAAAACCTAATA ATTGTAGTTGATAAGTAAAACTTATCTAACTAATCTTGGTCGATATATCTTTATAAAGAG AATGAAATGACATTAAAAAATATATTCATTATGTATTTTACTAAAATAATAATAAAATAC GAAATCTTTCAAAATTTGAAAGAGCTTATATCAATAAAAGAATATTTATTTAATAAATTG GAAATACTCATTTCTGAAAATCAATATATCCGTATATGAAATGGAGCAATCATAAATCTT AGCCTCCTATGTCCTTTACTGGTGTGACAGGGAAAATAAAATGGGAAATTGTGGTCCTTC ACATATATTCTTCTCTCCTTTTTAACCTTATCAACCAGGTTTATAATAATTCTCCTCCTC CTCCTCCTCCTTCTCCTTGTCCGATCCATCTCCTTGGATATATAGTTGTAATTTTCCTTC TAGCTCTTACTTAAAACAAG
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>Nl16g05980.mrna1 GenomeSequence - ATGGACACAAGCAAAGCTGAAGGGAAGAGGAGCTTGAAGGAGGTGGTGGTGGAGGATGAA GAAGAGGATGATGATGAAGACAGTAGTGGGTTAGGGTTTGGAGAGGATGACAAGAAAAGG AAAGGCAAGAAAGGATCAAGCAGTGCTGCTGCTTCTTGTCAAGTGGAAAATTGTACGGTT GATATGTCCGACGCCAAGCGATATCATAGGCGCCACAAGGTCTGTGAGGTCCATGCTAAG GCTGCTGCTGTTCGTCTTGCCGGACTCCAACAACGTTTCTGCCAGCAATGTAGCAGGTTA GAAAACCCTAATTTCCATTCAAGTATGTTCTTGAACTGTTCTTTATTATGTTTTGTGTTT GATTATGATTTTGTTGCTCAATTCGATTGAATCTTTATTGCATTATAAGTAATTAAAAAG ATTAATTTGATGTGTGTTGAACTCTTACAAGATGTGTTTGTTTTCTCTATGTTTGCAAAT TTGTAATGTATAATGATTTGTGTTGTATCTCTCAATTAATCAGACGGTTTTTTAGATGAA TTTTGAGCCAAAAAAAAAGAAAAAACAGAAAGATGAATTTTAACTACTTGTATTTATCTC GAAGAAAGCAATCAAATTTACGTTTTAAAACTAAAAATAAGAAATAAAAAATGAAAGAGG GGAAATAGGACTCGTATACACTTAAATTGGTCTTTAACATAGATCGTAGAAGGCAATGAC AATTGACTTCGTTCTGCTAACAAAAATATCTGGCAGACTTATCATCTGGCTCTGTATATA ACTCTGATAAAGGTGAATTAAGCGGAGGAGATATTATTAATTTCAAAGTGAAAACACAGT GATAACTCAAACTGTTTTTAAAATTGGTAAAAAAATATTTATTTATTTTACACACACTTA TATCAATATGTTTGCATAATTAATTTCTACCACAATTCCATGGAGAATCTACATAAAAAG AAAAAAAAAAAAACCCTTATTATCTAATCAATTAGTTAATACCTACAAATATTTATAGTG TTTGAAATATATACTCTTTACCTATTAAAATAAGCCGTTAAGTTGATTTTTCTTTTTTAA ATTTTAAGAAGTGAAAATCCTATGCAATAGCACTAAAAAATGGTCGAATTAGGAAATGTC ACTAAAAAACTTAAATGAATTTTTTTTAGCATCTTCAGTTACACAAATTATAATTCGTAA ATGAAAAAAAATATTTGAATGTTGTAAACCATATGAATTATTTTCTTTATCAATGAGCTA TAATCTACGATAACTAAAGATGTTAAAAAAACTCATTTCAATTTTTTGAAAACATGTTCC AAACTTACATTTTGTTGGTGCTTGAAAACAAAAAAAAAGAAAAAGATCACATTTTAAAAG GGGGTATTTGAATTTTGGACCTTAACATTTGTTAAGAGATTTAGTAACACACTTATTATG CTTGCAACCGGTTATTATTAGTTTTTGAGTTGTTACAATTTTGAGAGGTGGGGTAGAGGG CATGAGTCAAACTCAATCTCATTGATTTGGACATTAGAAAAACTACCACTATAATCATCT CAACTTTCATTTTTGCAATCACAATTATTAAGAATTTTTCTATTGACAGGATAGTCATTA AGAATTTTGAGAATTTTTGTTATTATGGTCAAATCCCTTTCCTTAATCCTTGACATAACC ATCTAAGTTTCTTCCCTCTTCAAACACAACTCTTTCAAATTAATAAAAGATGGAGCTGAA ACCCCTAACGCAAGCGCAAGCGTGAAAAAAAGAGCTGACAAAGATAAAGATGTGAGCTGG AAGTCATATTTACATGAATTATTGTGGAAAGCGTATTGAAGAGGTGGACCAAGAATCTAC TCCTACTTATAGACATACATATCTATATATAGAGAACATGATCATCAATTAGTATAACTG CATTGACACCACTGAGATTAGTCGATTAATTAACTAACAATTTGAATGATTGTTTACCTT TTGTAAGAATTTAGTGTATTTTTATATAACAACGGATAGAGGCGTATCCATATATTTTTA GTGATTAGTGGCTTCATCGATCCTATGAGAAGTTGTCCTTTCAAATGTCGTTTAGGACAA TATTAGATGAATATGTATGTAACCTGAATTATACTCGTTATCCATGGTGGTAATAGAATG ATTAGATAGTTGTTTCCCTCTCTCTTCCTCAAATCTGTTGACTTGCAAAGAGATGGTGTA TATAAGTGGGTATCAATTAATTCAAGTAGCAAGGTCATCTCTTATTCTTCTCTTACACAA TGTTCTCAATGAGGTTGGCTTTGCATCTAATTATTGTTTGTTCTAAAACAAGAAGGGTGT CATTAGAATCCATCTACTACTGACTTATCGACTCCATCTTGTAGTCACATGCAGTGTTAA CATGTCAAATTCCATGTGTTACATATGATAATCTTAGAAAGTAACTAAGGTGTGGTTACT AACTTAGACACACACAAATAAAAAATTAAAATCCGGTTGAAAAAGAAATTTAATTCCTCC ACTCCCACTTAAGAAATCAAATTCTTTTTTTAATTCCTTTTTGGGCACGTCCATCAATAG AGAATATTAATAAAGAAAAAAGAATTTAATTTATGTTTTTTTATTAAATTCTTTGCTAAA ATTGTTGAGAATCAAACCACATGGAACCATACACAAATTAAGATTAAGTTTTTAAAGGGG GCTGAATTGCCTGCTTTCACTTAAAGATATAACTTCTGTTTCTTGATTTCATTTCTATAA TGAAACTTGGTAAACATGCATTTTTAGTAGAACTTAATCCCTTCTCATTTGATTCTCAAT TTGTAAATTTATACTATACATTTTAGGTTAAGTGGTTACATGATATTAGAGTCATAAGAT TCCGGGTCAAGTTACCTCTCTCCCCTTTTCTCAATTTCTCGTTTCCTGGTTGTTGTCCAC ATTGTACAATAGGAGTAAGAGTGCTTGCTAAATGTAGTGATATGTATGTTAACTTGGATC TTATGTTTCATCCAGGTGTTTTCTCATTGTAACATGAACTACGCTAACCCAAGTTCAAGT ATTTCAATTAAAATTTGAAACTAATAAATGTCGCATTACATGTAGGTTCCATGATGTATC AGAGTTTGATGAAGCCAAGAGAAGTTGTCGTAGGCGTTTGGCTGGACACAACGAGCGCCG CCGTAAAAGCTCCGCTGATTTATACCATGGAGAAGGCTCAAACTGA