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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl13g08520 | GWHBECQ00000013 | 13657070 | 13663393 | - | "Casein kinase II subunit alpha-4, chloroplastic |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl13g08520.mrna1 | 122 | 421 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 202.1 | 1.10E-59 |
Nl13g08520.mrna1 | 124 | 326 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 63.5 | 2.00E-17 |
Nl13g08520.mrna1 | 246 | 285 | PF01636.26 | APH | Family | 24.2 | 2.90E-05 |
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>Nl13g08520.mrna1 ATGGCCATAAGGCCTCTCCATTTCACAATCTACCGCTTCAACAACAACAACTCCCTCCTC CTTTCTCTCTTTTTATCAACCTCATCCTCATCATCACCAACCACACCTCTCGTCTCTCCT CCTCCTCCTCCTCCTCGCAAAGCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTTCCTCCGC CGATTCGTCTCCCTCACTCAGGGCCGCCGCCTCTCCGACACGCTGGCGCAGAAGATCGGA AAATCGATTCGCCGCCCCGGCGCCCCTTCCAAGGCTAGGGTTTACTCCGACATCAATGTC GTCCGCCCCAAGGATTACTGGGACTACGAGTCCCTCACCGTCCAGTGGGGGGAGCAGGAC GATTACGAGGTGGTGAGAAAAGTTGGGAGAGGGAAATACAGTGAGGTCTTTGAGGGTGTG CACTGCACCGATAACGAGAAGTGTATTATTAAGATTCTTAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAG ATTAAGAGGGAGATTAAAATACTGCAGAATCTTTGTGGAGGACCAAATATTGTGAAGTTG CTTGATATTGTTCGGGATCAGCAATCAAAGACGCCGAGTCTTATATTTGAATATGTGAAT AATACTGACTTTAAAGTGCTTTATCCAACATTATCAGACTATGATATTCGGTATTATATT TATGAACTTCTAAAGGCAAGTGAACCACTCCCTTGTTTTTCATTAGAAGAGTTGGATGCT TTGGATTATTGCCATTCGCAAGGTATTATGCATCGAGATGTGAAGCCCCATAATGTCATG ATTGATCATGAACAGAGGAAGCTTCGACTTATTGATTGGGGCCTTGCTGAGTTCTATCAT CCTGGCAAAGAATACAACGTCCGCGTTGCCTCGAGATACTTCAAAGGTCCCGAGCTTCTT GTTGATTTGCAAGACTATGATTACTCTTTAGACTTGTGGAGCCTTGGCTGTATGTTTGCT GGAATGATTTTCCGTAAGGAGCCATTCTTCTACGGGCATGATAATTATGATCAGTTGGTC AAAATTGCCAAGGTCCTCGGGACAGATGAATTAAACGCTTATTTGAATAAGTACCGTATA GAGTTAGATCCGCATCTCTCAGCTTTAGTTGGGAGGCATAGCCGGAAACCATGGTCGAAG TTCATCAATGTCGACAATCAACATTTGGCTGTTGCAGAGGCTGTGGACTTCCTTGACAAG TTGTTGCGATATGATCACCAAGAAAGGCCAACTGCTAAGGAAGCGATGGCCCATCCTTAT TTCTTCCCGATCAGAAATGCAGAAAGCAGCAGAAATCGATCTTAG
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>Nl13g08520.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 TCTAATGCTTCAACAGATTATTAAAAGGTAATTTGATATCAATGGTCTGACGGATTATTA TAAGATAATTTGAGATTGGTAGTCCACGCTTAAAACTCTTTTATCATAACATTCAATGGT TCCACAAATTTGATCCTAAAATTCTACTCCCACAATAATTAAGGGATGAGACTCGTTATA CTTGCTAATAAAATCTTATGGTGGAACTTAAAACCTTATCATAGTCATAGAAAGAAAGTA TATAAACTATTTAAATTATGAGTGAATGTAGTTAGTTTATTGAATTTGGGAATATAGTTT TCAGTTTTTTTTTTTTTGGCAATGAAATCATCCAAAATAATCAAATAAATGAAAACTTTT ATAAAAGCACCCTCAAGAATATTCTTACTTCCCCATCAAGACAATAATAGTATAAAGTTT GTTTTGTTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTAATAGAATAATAGTGTCGAAGTTGTAGTGTAAG TCATTTAAGGTTAACTTTATTAAATGAACACCGGTGCCATTACAGAATTGCTTAAAAGTG AGTTTAGGTGGGAGAGTAAAATAGATATGTTTATCTTTTATATCCCATTGACATTTTAAT CAATGATATGATGAATAAATACATATAATAATTTATTTCATTTATAAAATATAACCATTC ATCAATTATATATATATAAGTTGAATGTATATATATATATAAGTTGGATGACTATTATAG TAGTTAAAGGTGGGCAAAAAAAGGGTCAATCCGACCCGAAAATGTTGATTTTCAAGTTGA TTTCGGGTTGGGATCGGTTTTGAAAGTTAAAAACTAATTCTTTTCTATTTTGGGTCAAAA AAACTTTTGAACTTGAAAACTGATTCGAAAAAACAATTATATTTATATATAAAAAAACCA AACACACAACACAATCCTAACCGTCAAAACCAAACACCCAACACAGCTCTAGCCGTCAAA ACCAAACACTTCCACTTCTCTCGGTCATCATTCATCCTTCATCACCATCACCGACCTCCA CTTGTCATCTTCCATTTTCCACTTTCCTCTCTTCTTTCTTCTTCCATTTCTTCTTATTCT TGTTGTGGTCACCTTACCACCTATCATCTTCAACTTTGGTGACTCTCTTATTCTTGTTGT CATCGCCTTTTCATCTATCATCTTCAAGTTTGGTGACTCCAACTCCGACACAGGTGGGCT CCTTGCTGACCTTGACTCCCCTATCAACCACTCCAACCCTGCAAAACCCTCACCTCATCT TTGCTATTCACACCTTCATCACCATTTTTTCTTTACAACTATCACCAATTGTCCATAGCT CATCAAGATCTACGGTTTTTGTTTTTAATTTACATTTTCATTTTTTTATTTGTTTTTCTA GTCTCATATGTTTGTAATTCGTGGGTTTGGTGATGAATTGGTGATTTTGGTTTTGGTGAT GAACTGATAATTGATATTGGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTGGTTT TGATTTGGATTAGGTGATGAACTAGAGAAATAAGTGCAAAATCGACGCAAATTGATCGGA TCGAATCGACTCAACACTAGTCGGTTCAAGTTGATTTTCCTCCCTAAATTGAGTTGAGTA GGTTTTTTATTTTAAAAGCCAAAAATAGTCTGTTTCGGTTCGCTTATACAAAACCAAACC GATCCAACCCGTGCCCACACCTAAAGATAGTAGAATAAGAAACTATTGTACCTAAACACA AGTGGAAATGTGTAATTGCCATGACATTAATGGCATGTGCACTCATACATGCTCCTCCCA CACTCAACTCACTGATATGCTGAAGCCTGGGGCATAACCATAATAATCATCATAAAAATT AAAAACGCGAAAAAACGACGTCGTAAAAGTAAAAGGAAAAACAAACAAGGAAAAAAAAAT GAACGAAAAAGAAAAGGAAAGCATGAAAGAAGAAAACCCGACTCCCGTTCCGGCTAACTT TTGTAATAGTCTCTAAATAG
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ATTTTTTATTCGCTTTTCATTTAGTGTGAGCATGCACAATATATATATATATATATATAT ATATTTTGTTGGGGTGTGGTGTTGAATATTAAATTGTTGACCTCTTGTCTTTGATCCTTG TAAATTGGTCCCTTAATGAAGTGTGTTGAATCTTAATCTGCAGGCTTTGGATTATTGCCA TTCGCAAGGTATTATGCATCGAGATGTGAAGCCCCATAATGTCATGATTGATCATGAACA GAGGAAGCTTCGACTTATTGATTGGGGCCTTGCTGAGTTCTATCATCCTGGCAAAGAATA CAACGTCCGCGTTGCCTCGAGGTTTGTGTTTCCTTTGTCTTTTTCCCTTCATTCTGATTT TTGACTAATCAGTTTTCATGCTGTACTTTTCTTTTTTTTTTTGGGAAAATTGTCATACTG GGAGTTCTCTTTTTTGTTGATCACATGCCTGTCATAGACATTTTGGGATAAAAAGATTGA CCTGCTAAAAAGGATGGAAATAACTCAACCAAAGAATAAAAAAGTGGAAAACTCATTTTA TTGCACAACCAAGAATGACAGAAAATTTAGGTGGTTCTCACGATTATTAGGAATCATGCA ACTGGTTTGGTAGGTGATAGCTACTAGAGTAATGGGTGCAGGGGTTTAATAGAAACAGAA GGGGAACCAGAAGTTAGGCTAAATTGTGAATTGAAAGAAAAAATGAGGCTAAGATGTCAA AGTTACAAGCGATGGAGCTTAGATGAACATTTCAGAAAACCAACAAAATTAATTTTAAAA CAGTAATTAATTAGGTAGTTTGAACAGCATCAATGTAAGTGAACTTTTAAAACTTGAAAC AACCTAAATCGTTTTCAAACTGACTTGAACATGTCAAATGGGTGAGTTACGTTGCAAACT GTTCCACTGGTTTAGAATTGGAGTGTTTGGAGGTGTGGGGTGTGCTGGATATCAACATAA 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