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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl08g11570 | GWHBECQ00000008 | 9674517 | 9676917 | + | Homeobox protein ATH1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl08g11570.mrna1 | 307 | 452 | PF07526.14 | POX | Domain | 98.4 | 5.40E-28 |
Nl08g11570.mrna1 | 513 | 552 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 52.8 | 2.80E-14 |
Nl08g11570.mrna1 | 514 | 552 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 26.7 | 4.00E-06 |
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>Nl08g11570.mrna1 ATGGAGAGTGATATGTTCAATGCGCCAATCGATATAGCCAGCCAAAATGCTGTTGTCATA GATGGGATGCCAAACTCACTGGTTGGATTCAATTCAATTGAATTAAACCGCCAAAACCGA GCGCTGGCTGGATTTCCAGTGCTTTCAGCATTGCAAGGAGAACCTATCAGTGGTATCCAC AATGATCTTCACATGACGAATGATTCCAGGAATTTTGATTCTAATGCCTTAGCTACATTG CTTGGAAGGAATACCGTAAGAGATGCTTCGCTTGGAAGCTCTTGTCCAATTGATAACATG AACTTTCAAGAGCAATTGGAGGGTGGAACGCTGATTTCTTCTACCTCACTTGCTAACTTA GTGGCAGCAAGAAGTGGTCTTCAAGAAAATATGAACAATTTAGCGATTTCAGTTCCATCT ATCTATCCTTTTGATGTTCTTAGAAATTACATTGCAGAGGACTGCTCTAATGATTTAAAT TCTTCATATGCTGCCTCAGTAAACTGTGGGTATGATGAGGTACTTGGCAATATGAACGAT AAGTGGGATTTGGAAAATTCTCGTGCTCTTCCACAGTTTGGTGGAAAAACCTCTTTACGA ACAGGATTTCAACCATTTTCCTCCACAGGAAACCTGCATCCTAACGAGTATATGTCCTCA AATGTTGCAGATGTGAACACAGATTGTCTCTATGGTTCCTCTGAATACAGCAACGAGCTG TCTTTAAGTCTTGCCACGTCACAGCCTGCTATCATTGGAGGGACAAATATCCCTGATCAG TGCTCCGGGATAAGTTGTTCTGGTGCAACTCACCGTTGTTTAGATACAAGAAGGTTGTGC TCGGAACAGGCTTCTTGCAACAATAAGGAGCTCTCCCTGAGTTTTGGTTGTCATGAACCC GCTCAGTTTGCTCAGTTTATATCAGGATCGAAGTATCTTCATGCAATTCAGGAAATCCTA GCTCAAATTGCCAGCTATTCACTTGAAAATCAAGATGATGTAAGTTACTTAACAGGTGAG AGGAGGATCGGAGAAAATATTTATATACCACCGTCTTCAAGTTCCCATGCTGAGAGGGGT ATACAACCAATGGATCATGACGAATCTCTAGATACGGATAGTAGTTTCAATGTTGTTACG GATACCTCGTTACATAGACAAGCAGTTGAAGTGAAGAAAACCCAGTTGCTGGCGTTACTA CAACTGGTTGATGATCGATACAACCAGTGCTTGGATGAGATCCATACGGTTGTATCTGCA TTTCACGCAGCAACAGAGTTGAATCCTCAGGTGCATGCTCGTTTTGCTCTTCAAACAGTC TCGTTCTTATATAAAAACCTGAGAGAGAGAATCAGCAACCAAATCCTTGCAATGGGAGCA CATCTTGATAGTGAAGGTCCAAGAGGGAAGGAAAGAATTTTTGAAGACTCTTTCATCAAG GAACAGTGGGCTCTTCAACAGCTAAAGAGAAAAGAACATCAAATATGGAGACCCCAGAGA GGGTTGCCTGAAAAATCGGTTTCTGTTTTACGAGCGTGGATGTTTCAAAACTTCCTTCAT CCGTACCCTAAAGATGCAGAGAAGCATTTACTTGCAGTGAAAAGCGGATTGACACGAAGC CAGGTATCCAATTGGTTTATAAATGCTCGGGTACGTTTATGGAAACCAATGATAGAAGAA ATGTACAGGGAGATGAACAGAAGAAAGGCTCGGAAGAACGAGGAAGGAATAGATAGCAAT CAGAGAAGCCGGATTAGCGTCAACCAGCAAAGACTTACTATGAATTGA
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>Nl08g11570.mrna1 + Up_Stream_Len 2000 ACTCTATTTACTCCTCTATCTCATCACGTTAGCTTGCTGTCTTAAAATAGCCAAAAAAGC AATTATCTTTCTCAGAAAATGGCGCTGAGAAGACCTGCCATGAACAGAAGTTTGAACAGA GAGAATCCACGTATTTTGATTATGATGATTGCAGAGAAGCAGATATTAATAGGAGGTGGT GAGGAGGACAGAGGAAATCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGAATGGGCCCTCTAAAGC CTGCAACAGATATGAGTGGCACTGCACCAAAGACTAATGTGTTTCCTTCTCTCTCTCTCT CTCTCACTCTTGCCTTGTTTTTACTCTTTGTGTGGTTCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGT CTAATGAGGGTCCATTTCCTTCTATCTCCACCTGTCTGCAAAAGCTTTTTTGCACTCTCT TTCTTTCTTTTCATAACCTCACTGTGTTTGTGAGTTTTAAATCTTGTAGAGGTAATGAAT CTTGTTGGGGTCTGAAACTTTGAATCTCAGTTTCTTGGGTTTTGGGTTCTTAGAAAACAA TCCCACTTTTCAGCTCATGCAAAGAAATTAGCTCACTTTTTATTATTATTATTATTATTA TTTTGTGGTCTGAGAATAGTGGAGATACTGCATGAGTACTACTTATTAGCTTTTTCACCT TGCTTCTTTTTGTTAAAGAGGAAAAAATAAAACACACAACTTCTGTAGCACTGTTTTCTG GCTTTTGGTTATACCCTTTTATGGAGAAAGTGAAACCAACTAAATCATGTGAACTTTGCT TTGCAATGGCTTGTTTTGGATTCTTTGAGGAAGCCTATATGTATTGTCTATCAGTATAGA AACAAACCACTTTTTCTTTTGACTGTTGAAGAGATTTCTTATGTCTGATATTACAAAATT GTTATATGTATCTCCATCAAAAATACTCCTCCTTTTTACTTTGCTTTCTAACTAGCTTTA CTGCAGAATTTTAATTTGTATTCTCAGCTTTGCAGTGTTTTAGCTCCATCTGCAAAGGAA CTCAAGGTTTGTCATTGTTTGCATTCTTAGCTTTTGCTTCTTCATTTACAATTCCTTTGA ATCTTGGGGAAGGAAATGTTAATAATTTCTCTCTTTAATAATGCTGTTGTAGAATCACAA ACTTGTTTATGTTTATATAGTCTGTGTAATAAACTATGATGTATGGCTTACTTGTTCATG CTCTTAGTATGTATTGATTTTACCGTCTTTTGGTTAGTCTAAATTATGTTTCACGGACTA GGAAGATCAGCTATATTAGGTTACAAGTTAATTGATGATAATACTAGTAACAAAATCATT TAAGATGTTTTGAGATGAGCATTTTGCATATGACTTGTGAAGGCAGAGGCTTGTCTTTCC AATAAGGGTTGATGTTGAGACATTGTTATTTCTAAAGTAAGATCTATCACTCATATCTCC CTAATTTCTGCTGGTTCCATTTATGTGTACCCTTGCTTGCAAGTAGCTAGGCTGTTTAAT TGAAATCTGTTTGGAAACAAAGTTTTATACATGTTATGCTACTGGTTCCTTGTTTGCCGG TCAACAAGTTTTCTGATCAGACAATAAGGTGGTGGTTGGTTCCTTCAACAAGCAGATGAT TGATAAAAAATGGGAATGGAAGTGAGGAGGAATGAGAAACTATATCAGCAGGAGCATTGT TGTGTTATTTATTTATTTTTATTAACTGATTATCATAAAATCACCTAGGATTAATTTATC ATAAAATGACCTCGGATTCATTTAAATTTTTACAGGTCAACGTTTTTTGAGGGCAGATTG TCAAGGACTAAAGAGAATGATCTCCAAGCAGCATTTATATGTTTATGTCTCCTGTAATTT TGTCTGATAGAGGCTCCTGAAAGAGTCAAGAGTTCTGTTACTGGAGATAAGCTAGCTTAA CATACATACAATTGAAGCATGAGATTTTGCAAAAATTAGTAGTTGTTCAACCTTGCCGAC TTTTGATTCCTGATAGCCTG
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>Nl08g11570.mrna1 GenomeSequence + ATGGAGAGTGATATGTTCAATGCGCCAATCGATATAGCCAGCCAAAATGCTGTTGTCATA GATGGGATGCCAAACTCACTGGTTGGATTCAATTCAATTGAATTAAACCGCCAAAACCGA GCGCTGGCTGGATTTCCAGTGCTTTCAGCATTGCAAGGAGAACCTATCAGTGGTATCCAC AATGATCTTCACATGACGAATGATTCCAGGAATTTTGATTCTAATGCCTTAGCTACATTG CTTGGAAGGAATACCGTAAGAGATGCTTCGCTTGGAAGCTCTTGTCCAATTGATAACATG AACTTTCAAGAGCAATTGGAGGGTGGAACGCTGATTTCTTCTACCTCACTTGCTAACTTA GTGGCAGCAAGAAGTGGTCTTCAAGAAAATATGAACAATTTAGCGATTTCAGTTCCATCT ATCTATCCTTTTGATGTTCTTAGAAATTACATTGCAGAGGACTGCTCTAATGATTTAAAT TCTTCATATGCTGCCTCAGTAAACTGTGGGTATGATGAGGTACTTGGCAATATGAACGAT AAGTGGGATTTGGAAAATTCTCGTGCTCTTCCACAGTTTGGTGGAAAAACCTCTTTACGA ACAGGATTTCAACCATTTTCCTCCACAGGAAACCTGCATCCTAACGAGTATATGTCCTCA AATGTTGCAGATGTGAACACAGATTGTCTCTATGGTTCCTCTGAATACAGCAACGAGCTG TCTTTAAGTCTTGCCACGTCACAGCCTGCTATCATTGGAGGGACAAATATCCCTGATCAG TGCTCCGGGATAAGTTGTTCTGGTGCAACTCACCGTTGTTTAGATACAAGAAGGTTGTGC TCGGAACAGGCTTCTTGCAACAATAAGGAGCTCTCCCTGAGTTTTGGTTGTCATGAACCC GCTCAGTTTGCTCAGTTTATATCAGGATCGAAGTATCTTCATGCAATTCAGGAAATCCTA GCTCAAATTGCCAGCTATTCACTTGAAAATCAAGATGATGTAAGTTACTTAACAGGTGAG AGGAGGATCGGAGAAAATATTTATATACCACCGTCTTCAAGTTCCCATGCTGAGAGGGGT ATACAACCAATGGATCATGACGAATCTCTAGATACGGATAGTAGTTTCAATGTTGTTACG GATACCTCGTTACATAGACAAGCAGTTGAAGTGAAGAAAACCCAGTTGCTGGCGTTACTA CAACTGGTACTTAATTTTCGATGCTGATAGGTTTTATAGTTAACCGAATTCGATCTTGGT CATATTTAGCATACTTAAATTTTAATTCTTGAAACTGAAATATAAAAAATCTTGATTGCA GCATTGAATCTGTGACTGACCACAGTATCTTGATAAGCAATCTAGTTGTTTTCTTATCCA TTTGTTGACATGCTAACGATCTCACTTATTAATTCATACGTCTCTTTTAGTGTGTTGGAC ATAGCACTTTGACCACTTGGACTGGTTTTGTGACTTTGATGTTCGACGCAGGTTGATGAT CGATACAACCAGTGCTTGGATGAGATCCATACGGTTGTATCTGCATTTCACGCAGCAACA GAGTTGAATCCTCAGGTGCATGCTCGTTTTGCTCTTCAAACAGTCTCGTTCTTATATAAA AACCTGAGAGAGAGAATCAGCAACCAAATCCTTGCAATGGGAGCACATCTTGATAGTGAA GGTCCAAGAGGGAAGGAAAGAATTTTTGAAGACTCTTTCATCAAGGAACAGTGGGCTCTT CAACAGCTAAAGAGAAAAGAACATCAAATATGGAGACCCCAGAGAGGGTTGCCTGAAAAA TCGGTTTCTGTTTTACGAGCGTGGATGTTTCAAAACTTCCTTCATCCGTAAGCTCCTCTC ACCATCAAATTATTTTAACATTCGGGGCCTGGGCAAAATCAGTCTCACTTAATGGTTTGA TTAGTAAACTCAGTTTTATTGGTGCCTTGTAGTTCTTACAGGTAATTGTATTTCAGGTAC CCTAAAGATGCAGAGAAGCATTTACTTGCAGTGAAAAGCGGATTGACACGAAGCCAGGTA CATTAAGAAAACATATTAATGCCCTTCCTTTGCGTTGAATCGAAAAGGAAATGCTCTGCA GTGTTATCTAGGAATGTCACATAAATATATTTTTCAAAACAAAGTAGAGCCTTGGTAATG GCCTACATGTTCACAATCTTTATATGATCTCAATTTTGTAAATGATCTCATATTTGTAAC TTTTTTAAATCACCAGGTATCCAATTGGTTTATAAATGCTCGGGTACGTTTATGGAAACC AATGATAGAAGAAATGTACAGGGAGATGAACAGAAGAAAGGCTCGGAAGAACGAGGAAGG AATAGATAGCAATCAGAGAAGCCGGATTAGCGTCAACCAGCAAAGACTTACTATGAATTG A