Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
Nl08g09260GWHBECQ0000000874948117497477-Auxin-responsive protein IAA27

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
Nl08g09260.mrna129273PF02309.19AUX_IAAFamily298.83.90E-89
Download   Copy
>Nl08g09260.mrna1
ATGTCTATGCAAGTGGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA
AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCAGAGTCG
CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTGGTTCTCTCACTCAAGACCCTT
TCAGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACGCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT
GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTAATACCAATGCTGCCAACTCGGAT
TCCGTTGTCAAAGAGGCTGCTTCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT
GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG
AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG
GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGATGGTGCCCCATATCTGCGTAAAGTTGATCTC
AAAACATACGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT
ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA
TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGATGGCGAC
TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGACATGTTCACCAACTCCTGTAAGAGGCTAAGG
ATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGCTCCAAGGGCAATGGAGAAGTGTAGAAAC
CGTAACTAG
Download   Copy
>Nl08g09260.mrna1
MSMQVEHDYIGLSLEVPCMENSGLNLKATELRLGLPGSESPERGDTTDEGTAVVLSLKTL
SASGAKRGYADAIDRKWVFSADGSDAALFSPANTNAANSDSVVKEAASPQSPKPQEKKPH
GSGPSKAQVVGWPPIRSFRKNTMSSHSAKNDDDSEAKLGLGCLYVKVSMDGAPYLRKVDL
KTYGSYMELSSALEKMFSCFTIGQCGSHNVPSRDGLSESRLMDLLHGSEYVLTYEDKDGD
WMLVGDVPWDMFTNSCKRLRIMKSSEAIGLAPRAMEKCRNRN*
Download   Copy
>Nl08g09260.mrna1
ATGTCTATGCAAGTGGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA
AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCAGAGTCG
CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTGGTTCTCTCACTCAAGACCCTT
TCAGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACGCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT
GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTAATACCAATGCTGCCAACTCGGAT
TCCGTTGTCAAAGAGGCTGCTTCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT
GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG
AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG
GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGATGGTGCCCCATATCTGCGTAAAGTTGATCTC
AAAACATACGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT
ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA
TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGATGGCGAC
TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGACATGTTCACCAACTCCTGTAAGAGGCTAAGG
ATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGCTCCAAGGGCAATGGAGAAGTGTAGAAAC
CGTAACTAG
Download   Copy
>Nl08g09260.mrna1 -  Up_Stream_Len 2000
TTTTACTCAGTTTTTATTGTAAATAGAAGGCTTATCTAGTGCAATTTTGAGCTCCAATTA
ATTTTCTGTTAACTTTTACTCCTGAATTTCTTTCTCTAAACTTGTCTTTTGATGATGACA
TAATTGATAATTTTTTTTGTCCTCCCGAAAGCCAATACCAAACCAATAAAAAATTTATTT
GAATTTATCAAGATTAATCTTTATTTCTATGGTATAATTATCTACTCGAATAATGACGAG
ATAATTCATACATATACTTGTAAAAAAAGTATGATAGAACTCACTCTACTATCACCATAA
TCAATGAGAATGTGCATAATCTTTAGAGTTAGAAGATGATATATCTAACAAATATGATAA
TTATATTAATATAATCTTTTTAAACCCTATATTTAAATAATTTTAAATATTACACAATCA
TTCTGAATACAAACTGTTAAAATTAATTAGATTTAAGAAACAAAAAAAAAAAACATGGAC
TGATTTTATTTGAAGCTATTGGCATTTTAAGACTAGGAGTATGTTGGAGAGTGACGTGTT
AAGGGATTTATACAAGCATTGCCGTCCACTCCATAACATAACGCCGTTTTGTCCCCCACC
AACCCATCTCTTTTCGTGGACTTCTTTTAAACCGTGCAGCCTTTTAATATAGTGCAATTA
TTATAGTACCACAATATGTTAATTTATTATTATTCCATTGATCAATGCTGTTCAAACTAC
TTGATTGGCCATTAAAAAGTAAACGTCAGTGGATTTAGAAAGATCCATTTGGTTGATTGT
TTAATTTGAATAAAAAACGTTTATTATTTTTTTTTTTAACAAAATAAAAAATGTTTCTAG
TACTACGGTTGGGGCGGTATGGTTGCATATATTATCACCTTCTTAATATTTATTTGAATA
CATAAAAATTAATAACAACTATACATAGCCATCAGAGAAGGGATTAAATTAGCAATTTTC
TCATGTAAGGTTTAGGATCGAAATCTCTCATGAACATTGACATAGCGAAAGGTCACTCCA
GTTTCAATTTTGGGTTTAGAGAGTTTATTTATTTATTTATTTTTATATGTTATAAACATA
TTTTATAACTATCGAAATCTTTTGACATGAACTGTATTATAAAGTCTGAATCTCTATTCT
TTAATATATGGAAGGAAGTGATTCACGTAAAAATGAAAAAACTAGCCATGTACCGACGGA
TTTTTAAGAAAACTACTAGCACTTCTGGCAAGGGCAGTCGAATCCAGCGCTCCATTTGAA
AGAAGCAAAATGTGAAGAAGAGAGAAATAAAGAAATGGAGAAAAAAGAGCGAGTAGTGTG
ATGTGTGAGACTGTGAGTGTGAGGTGTGGTAGAGAATCAGAGACAAAGATTTCTTTTCAG
TTAGTCCCAACTGCCGTTTTCCCTGGTGTCAGCTTTCTTCACTTTCTAGGGCTTATCACT
CATTTTCCTTTTACATCTAACTTTTTCCCACAATCCAAACACCAAATCGGCCAAGATATA
TATATATCTGTCATTATTTCTACTCTACACCCCCGAGTGAACCCATTTCTTCTCTTCAAA
ATCCGAGCTAATTTGGCCTCTCAAAACAGTCCTTTCGTTTTCAAATCAAAATTTCCTCTG
GCGCATCTTAGCAACTCCTGTCCATCTCAACCCCACCCGCCCGCGCATTGTAGCCCCCTT
CATTAGAAAAATAAAATAAAACAAAGGGCAATATCGGAAAGTTTGCCGGGGACTTTTTGT
GACTTGTCGGAGTGGTTGCCCACAAAAAGTTGTCCATCATAATAAAATCATTTTTATTTT
TACTGAAAACAGTTGCACCTGTGTTGTGTTGTGTTGTTGTGTTTCCAAGCACACTGTGAT
TTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACTTATTAGAGACAG
AAACAGAAGAAGAGAGAAGCTTCTCTGTTTTGCTTCAACCACATACCATACATATCTCAT
GCTTTTCTGAGCTATTTTTG
Download   Copy
>Nl08g09260.mrna1 GenomeSequence - 
ATGTCTATGCAAGTGGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA
AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCAGAGTCG
CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTGGTTCTCTCACTCAAGACCCTT
TCAGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACGCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT
GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTAATACCAATGCTGCCAACTCGGAT
TCCGTTGTCAAAGAGGCTGCTTCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT
GGTTCTGGTCCTTCAAAGTAATTATTATACTATTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTG
CTGCTATGTGTTTTCACATTTTCTTTGTTTCTTTGTTAGTATTTGTTCTATTTATTTGGA
ATATCCTGTTCAAAGAGCACAACTTGGGCTTTTGAGTTGGGTCGTTTTTATATGCAAATA
TTTTTGGATTCATTCTATCAGGCCAAATTTGGTTGTGAAAGAGTAAAATATTCATTTCTC
AATATATATATATATATATATATATATTCATTTAGTTTTTTCTTTTAATCAGAGAAAGCC
TTCCCGAATTTGTACTTAATTGCGTGAAGTTGGATTTTTATGTATATATGTAAGTTGGTT
ACTTCTAAGGATCTTGCTAGCTCATGCTTCTCTGTTGCTTGTGACTCATATTGAAAGCCC
TCGGCTTGCATGTCTTCCTGTGCTGCATAATTACAATTCCAAATGACGAAAGAACAAGGT
TTTTGATATTTGCATTGAAATCTTTAGTCCATGGAAGAAATGGAGTCTCTTAACCTGTTT
TACTATGTATTATTGCATTAATCATGGAAAAAAAGTTGATTGGGATTCTTATCCGAAGAT
GTATCTGTATTTTGTGACAGGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGG
AAGAATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGA
CTGGGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGATGGTGCCCCATATCTGCGTAAAGTTGAT
CTCAAAACATACGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGC
TTTACAATTGGTAAAATCTCTTTGTAAACCATCCCACCAATTGCTACAATCTGTTTCTGT
GTATGTGCACATTTTTAATTCCACTGATTGTGCGAACAAATTTCTTCATTAATTCTGTTC
TAGTGGATTTCATCAAAATCACATTGGCTTGTGCTCTCTCCTCCTTGATAAAGATCTCTA
GCAGTTTGTTTGAGGAATCTTAAATTGCTTTTCATGAATGTCTGGTTTAGGTCAGTGCGG
TTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGATTAATGGATCTTCTTCA
TGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGATGGCGACTGGATGCTAGTTGGTGA
TGTTCCCTGGGAGTAAGTGTGATCCAAAACTCACAATTTTTGTGGCTTACAGTATATCTA
GGTTGGATCAAGTTATTCTGGATTAGCTATCAATTAGTGCGGAGATATTATGGAAAGGAA
TTACAAAAACTTTTTCAGAAAGCAGATCGAAAAACAGATGTGGCTGCTTGAATTTGTCTA
TGAATTAGCTTCATCTGCAAGTCAGTCTAATTAAATTACTATTATGTTGTTGTCTTTATT
TTAGAAATTTGACATTATTAGGAGTCAAAGCATTCCCAATTGATATAAATTATAATACTA
CATGACATGGTCCAGTTCTTCATTCACTGGAGCTTTGATTGACTTCACATCCTTTTTCCC
AAAAATCATTAGGAAGACTCAAACAGGAGCAGGCACTCTTCACGTTGCATAAGTGGCTTT
TAGTGATCTGTCAGTAGTGCCTCCTTAGAGAATTTCTGTTGTCATTTTTGTTTTTTGTCT
TTTAATTAAACTTACTTTTTAACCACTGATTCACCAGCATAACCTTTAAAATATGCAATA
CTAACCTAATCTGGTTTATTATTTAACAATTATGTTGGATGGAGATGAACTGATACTACT
CTGGCCACCCTTTTCTCAACTCTTAACTCTGTGAAATTAAAGAGGGAGTTTGGGAATGTA
GGAATATCCCTTCCTAATCTTGCTTTCTTTGTGCAGCATGTTCACCAACTCCTGTAAGAG
GCTAAGGATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGGTATGTTCTAGTAGTACTCCGT
GTATTGAGTTTATAACTAATATGAACCAATAAAATTCTACCATGCACCTCTTCTACCTAG
ATGTTTAGTATAGAGTACTGAAACTTGAAAACTCCAAACGTTACAAGAAATAAAATGCCT
AAGAGATGGTTTGATGCTTTTGATTGGTAATCAGGAAGATAGAATCTACCATTTTGAATG
CAGACAATCATTTTGCTTTAGTCTTTGGTTGTATGAATTACTCCTGTTTTAGACGATTGG
CATTAGGCAAGGCTTTACTAATGTATGTTACCGTATCTGTTTCTTGCAGCTCCAAGGGCA
ATGGAGAAGTGTAGAAACCGTAACTAG