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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl08g09260 | GWHBECQ00000008 | 7494811 | 7497477 | - | Auxin-responsive protein IAA27 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl08g09260.mrna1 | 29 | 273 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 298.8 | 3.90E-89 |
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>Nl08g09260.mrna1 ATGTCTATGCAAGTGGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCAGAGTCG CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTGGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCAGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACGCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTAATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTGCTTCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGGAAG AATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGACTG GGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGATGGTGCCCCATATCTGCGTAAAGTTGATCTC AAAACATACGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGCTTT ACAATTGGTCAGTGCGGTTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGA TTAATGGATCTTCTTCATGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGATGGCGAC TGGATGCTAGTTGGTGATGTTCCCTGGGACATGTTCACCAACTCCTGTAAGAGGCTAAGG ATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGCTCCAAGGGCAATGGAGAAGTGTAGAAAC CGTAACTAG
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>Nl08g09260.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 TTTTACTCAGTTTTTATTGTAAATAGAAGGCTTATCTAGTGCAATTTTGAGCTCCAATTA ATTTTCTGTTAACTTTTACTCCTGAATTTCTTTCTCTAAACTTGTCTTTTGATGATGACA TAATTGATAATTTTTTTTGTCCTCCCGAAAGCCAATACCAAACCAATAAAAAATTTATTT GAATTTATCAAGATTAATCTTTATTTCTATGGTATAATTATCTACTCGAATAATGACGAG ATAATTCATACATATACTTGTAAAAAAAGTATGATAGAACTCACTCTACTATCACCATAA TCAATGAGAATGTGCATAATCTTTAGAGTTAGAAGATGATATATCTAACAAATATGATAA TTATATTAATATAATCTTTTTAAACCCTATATTTAAATAATTTTAAATATTACACAATCA TTCTGAATACAAACTGTTAAAATTAATTAGATTTAAGAAACAAAAAAAAAAAACATGGAC TGATTTTATTTGAAGCTATTGGCATTTTAAGACTAGGAGTATGTTGGAGAGTGACGTGTT AAGGGATTTATACAAGCATTGCCGTCCACTCCATAACATAACGCCGTTTTGTCCCCCACC AACCCATCTCTTTTCGTGGACTTCTTTTAAACCGTGCAGCCTTTTAATATAGTGCAATTA TTATAGTACCACAATATGTTAATTTATTATTATTCCATTGATCAATGCTGTTCAAACTAC TTGATTGGCCATTAAAAAGTAAACGTCAGTGGATTTAGAAAGATCCATTTGGTTGATTGT TTAATTTGAATAAAAAACGTTTATTATTTTTTTTTTTAACAAAATAAAAAATGTTTCTAG TACTACGGTTGGGGCGGTATGGTTGCATATATTATCACCTTCTTAATATTTATTTGAATA CATAAAAATTAATAACAACTATACATAGCCATCAGAGAAGGGATTAAATTAGCAATTTTC TCATGTAAGGTTTAGGATCGAAATCTCTCATGAACATTGACATAGCGAAAGGTCACTCCA GTTTCAATTTTGGGTTTAGAGAGTTTATTTATTTATTTATTTTTATATGTTATAAACATA TTTTATAACTATCGAAATCTTTTGACATGAACTGTATTATAAAGTCTGAATCTCTATTCT TTAATATATGGAAGGAAGTGATTCACGTAAAAATGAAAAAACTAGCCATGTACCGACGGA TTTTTAAGAAAACTACTAGCACTTCTGGCAAGGGCAGTCGAATCCAGCGCTCCATTTGAA AGAAGCAAAATGTGAAGAAGAGAGAAATAAAGAAATGGAGAAAAAAGAGCGAGTAGTGTG ATGTGTGAGACTGTGAGTGTGAGGTGTGGTAGAGAATCAGAGACAAAGATTTCTTTTCAG TTAGTCCCAACTGCCGTTTTCCCTGGTGTCAGCTTTCTTCACTTTCTAGGGCTTATCACT CATTTTCCTTTTACATCTAACTTTTTCCCACAATCCAAACACCAAATCGGCCAAGATATA TATATATCTGTCATTATTTCTACTCTACACCCCCGAGTGAACCCATTTCTTCTCTTCAAA ATCCGAGCTAATTTGGCCTCTCAAAACAGTCCTTTCGTTTTCAAATCAAAATTTCCTCTG GCGCATCTTAGCAACTCCTGTCCATCTCAACCCCACCCGCCCGCGCATTGTAGCCCCCTT CATTAGAAAAATAAAATAAAACAAAGGGCAATATCGGAAAGTTTGCCGGGGACTTTTTGT GACTTGTCGGAGTGGTTGCCCACAAAAAGTTGTCCATCATAATAAAATCATTTTTATTTT TACTGAAAACAGTTGCACCTGTGTTGTGTTGTGTTGTTGTGTTTCCAAGCACACTGTGAT TTCAACAATATTCTCAGATACAATTTATTTCGTCTTCTGAGTTACACTTATTAGAGACAG AAACAGAAGAAGAGAGAAGCTTCTCTGTTTTGCTTCAACCACATACCATACATATCTCAT GCTTTTCTGAGCTATTTTTG
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>Nl08g09260.mrna1 GenomeSequence - ATGTCTATGCAAGTGGAGCATGATTACATAGGCTTGTCACTGGAGGTTCCTTGCATGGAA AACTCCGGTTTAAACCTCAAAGCAACAGAGTTGAGACTCGGCTTACCCGGCTCAGAGTCG CCTGAAAGAGGAGACACCACTGATGAAGGAACCGCAGTGGTTCTCTCACTCAAGACCCTT TCAGCTTCAGGCGCTAAGAGGGGTTACGCTGATGCCATTGATCGCAAGTGGGTTTTTTCT GCTGATGGATCTGATGCTGCCTTGTTCTCTCCTGCTAATACCAATGCTGCCAACTCGGAT TCCGTTGTCAAAGAGGCTGCTTCTCCTCAGTCACCAAAGCCCCAGGAGAAGAAGCCTCAT GGTTCTGGTCCTTCAAAGTAATTATTATACTATTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTG CTGCTATGTGTTTTCACATTTTCTTTGTTTCTTTGTTAGTATTTGTTCTATTTATTTGGA ATATCCTGTTCAAAGAGCACAACTTGGGCTTTTGAGTTGGGTCGTTTTTATATGCAAATA TTTTTGGATTCATTCTATCAGGCCAAATTTGGTTGTGAAAGAGTAAAATATTCATTTCTC AATATATATATATATATATATATATATTCATTTAGTTTTTTCTTTTAATCAGAGAAAGCC TTCCCGAATTTGTACTTAATTGCGTGAAGTTGGATTTTTATGTATATATGTAAGTTGGTT ACTTCTAAGGATCTTGCTAGCTCATGCTTCTCTGTTGCTTGTGACTCATATTGAAAGCCC TCGGCTTGCATGTCTTCCTGTGCTGCATAATTACAATTCCAAATGACGAAAGAACAAGGT TTTTGATATTTGCATTGAAATCTTTAGTCCATGGAAGAAATGGAGTCTCTTAACCTGTTT TACTATGTATTATTGCATTAATCATGGAAAAAAAGTTGATTGGGATTCTTATCCGAAGAT GTATCTGTATTTTGTGACAGGGCACAAGTAGTTGGATGGCCACCAATTCGTTCTTTCCGG AAGAATACTATGTCTTCTCATTCTGCAAAGAATGATGATGATTCGGAAGCCAAGTTGGGA CTGGGGTGTCTCTATGTCAAAGTCAGTATGGATGGTGCCCCATATCTGCGTAAAGTTGAT CTCAAAACATACGGCAGCTACATGGAACTCTCATCAGCTCTAGAAAAGATGTTCAGTTGC TTTACAATTGGTAAAATCTCTTTGTAAACCATCCCACCAATTGCTACAATCTGTTTCTGT GTATGTGCACATTTTTAATTCCACTGATTGTGCGAACAAATTTCTTCATTAATTCTGTTC TAGTGGATTTCATCAAAATCACATTGGCTTGTGCTCTCTCCTCCTTGATAAAGATCTCTA GCAGTTTGTTTGAGGAATCTTAAATTGCTTTTCATGAATGTCTGGTTTAGGTCAGTGCGG TTCTCACAATGTTCCAAGCCGAGATGGATTGAGTGAGAGTCGATTAATGGATCTTCTTCA TGGTTCTGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGATGGCGACTGGATGCTAGTTGGTGA TGTTCCCTGGGAGTAAGTGTGATCCAAAACTCACAATTTTTGTGGCTTACAGTATATCTA GGTTGGATCAAGTTATTCTGGATTAGCTATCAATTAGTGCGGAGATATTATGGAAAGGAA TTACAAAAACTTTTTCAGAAAGCAGATCGAAAAACAGATGTGGCTGCTTGAATTTGTCTA TGAATTAGCTTCATCTGCAAGTCAGTCTAATTAAATTACTATTATGTTGTTGTCTTTATT TTAGAAATTTGACATTATTAGGAGTCAAAGCATTCCCAATTGATATAAATTATAATACTA CATGACATGGTCCAGTTCTTCATTCACTGGAGCTTTGATTGACTTCACATCCTTTTTCCC AAAAATCATTAGGAAGACTCAAACAGGAGCAGGCACTCTTCACGTTGCATAAGTGGCTTT TAGTGATCTGTCAGTAGTGCCTCCTTAGAGAATTTCTGTTGTCATTTTTGTTTTTTGTCT TTTAATTAAACTTACTTTTTAACCACTGATTCACCAGCATAACCTTTAAAATATGCAATA CTAACCTAATCTGGTTTATTATTTAACAATTATGTTGGATGGAGATGAACTGATACTACT CTGGCCACCCTTTTCTCAACTCTTAACTCTGTGAAATTAAAGAGGGAGTTTGGGAATGTA GGAATATCCCTTCCTAATCTTGCTTTCTTTGTGCAGCATGTTCACCAACTCCTGTAAGAG GCTAAGGATCATGAAGAGTTCAGAGGCTATTGGATTAGGTATGTTCTAGTAGTACTCCGT GTATTGAGTTTATAACTAATATGAACCAATAAAATTCTACCATGCACCTCTTCTACCTAG ATGTTTAGTATAGAGTACTGAAACTTGAAAACTCCAAACGTTACAAGAAATAAAATGCCT AAGAGATGGTTTGATGCTTTTGATTGGTAATCAGGAAGATAGAATCTACCATTTTGAATG CAGACAATCATTTTGCTTTAGTCTTTGGTTGTATGAATTACTCCTGTTTTAGACGATTGG CATTAGGCAAGGCTTTACTAATGTATGTTACCGTATCTGTTTCTTGCAGCTCCAAGGGCA ATGGAGAAGTGTAGAAACCGTAACTAG