Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
Nl08g03990GWHBECQ0000000834313113434670+PHD finger protein ALFIN-LIKE 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
Nl08g03990.mrna111139PF12165.11AlfinFamily233.25.40E-70
Nl08g03990.mrna1200249PF00628.32PHDDomain41.69.00E-11
Download   Copy
>Nl08g03990.mrna1
ATGGACGCAGGCGGAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG
GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAG
TGTGACCCTGAGAAGGAAAATCTTTGCCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAATGGGAGGTA
AATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTT
GCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCT
TGGTTACTTTCTGTGGCCTTCTATTTTGGTGCTAGGTTTGGGTTTGATAAAGCTGATAGG
AAACGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACGATATTTGAGGTTGTTACAGGGACA
GCCAAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAG
TCGAACTCAAAGCGTGGCGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCGAAG
GATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGACGATGAGGAGCATGGTGAGACACTATGC
GGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAG
AAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAG
TACAAATGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGA
Download   Copy
>Nl08g03990.mrna1
MDAGGGYNPRTVEEVFRDFKGRRAGMIKALTTDVEEFYQQCDPEKENLCLYGFPSEQWEV
NLPAEEVPPELPEPALGINFARDGMQEKDWLSLVAVHSDAWLLSVAFYFGARFGFDKADR
KRLFNMINELPTIFEVVTGTAKKQTKEKSSVSNHSSNKSKSNSKRGAESQTKYSKTVQSK
DEEEEALEEEDDEEHGETLCGACGENYAADEFWICCDVCEKWFHGKCVKITPARAEHIKQ
YKCPSCSNKRARP*
Download   Copy
>Nl08g03990.mrna1
ATGGACGCAGGCGGAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG
GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAG
TGTGACCCTGAGAAGGAAAATCTTTGCCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAATGGGAGGTA
AATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTT
GCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCT
TGGTTACTTTCTGTGGCCTTCTATTTTGGTGCTAGGTTTGGGTTTGATAAAGCTGATAGG
AAACGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACGATATTTGAGGTTGTTACAGGGACA
GCCAAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAG
TCGAACTCAAAGCGTGGCGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCGAAG
GATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGACGATGAGGAGCATGGTGAGACACTATGC
GGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAG
AAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAG
TACAAATGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGA
Download   Copy
>Nl08g05520.mrna1 +  Up_Stream_Len 2000
CACACATGCAAAATTCAGTTAAATAACTAAAAAAAACACACCACATTAAACAAATTGTAA
AATAATAAAAATAAATAACCCTAAAAAAAATAAAAATTAAAAAAAACTCTGATAAAAATG
AAAACCTCCCTGCCAAGCAACGACCCTGGTACGCTTTCTTTTTCAGCCTTTCCTTTTAAA
TCAAGCAAAAAAGTAAAAAAACAAAATAAAATAAAAAAGTAAAAATAAAAATATCTACGG
CAATAAATAAGAACAGTAACACTTTATCCACTGGACAACTGCTCGAAGAAGACTCGCATA
GCGATTGGTGTCTTCAAACAAAGGCCCCACCTCAATCGATCTTCACTACTCGATGCTTGA
CACGTGGCGACAAATCTGACATTCAATCGTGGGTCCAACTTGCGTACAGAGTTCTGTCTC
CTCATGCATTGTTTGTTACGCTGATGGTCTGGGAGTAAAATTCGATTTATCCAAACTTGC
CTGAAATCATCTGAAATTTATCATCTGTGTAATAATTCCAATTTACAACTTAATTTCACT
GTAATTTTTTTAGTTAAAGAGTTGACTCGTTCGTGATCCTACGTAACAAGGTAAATTGAA
AAGTGAAGTAGGCAGGCCTTTGTAGCGGGGGACACGTTAGTGAGATCCTGGCCGTTAATC
TGACCAAGTTGAGCTGTAACTGTCGTGCTTACTAGTGGGCTTTGAATATAATAAACGAGT
TTATTAGGAGTTAAAAATATTATTATAATTAATTAAACAAGTTTTAAAAAATTGAGTAAA
TATCAAAGAAAAGAGAAAAAAAAAAAATTTAAAACACGAACCTCGAGGAAAATTAAAAAG
CAAAGGAATCGGGCTGTAAATTTGGACGCTAATGCCACAAGCCTCAGCGACAAACCTGCT
AGATCGGTTCCTAAGGAGTTGAATTTGATTATTTTGATCCCACAATTACCCCTTAATCTT
CATTTTAATTATTTTGCTAATTACCGGTTTACCTAGTTATCCGATTACAAAAAATATTAT
TACCATATTGCCCATATCGCTGCTGCGACTTGTGAGCCTGTGACTGGTCTTGTAAGCAAC
ATTCATAATGATAGTGTGCGGCACGTGCAGTGATGATTATTGTGCAACCGGTTGATCATC
ACAGCTATCATCATCACGTGCAAGTGTGTGTGGCTGATTTTTCACTGTTAAGACAGTATG
CGGATCCCTTTCAAACGATAGCTCAAAATTGATAATTTAACAGATCATGAAAGAAATTTC
TTTTAATGTTTTGTTGTATGTATAAATAACAATTAAACTGTTTCTTTTAATGTTTTGTTG
TATGTATATATATATATATAAAAAAACCATGGTTTAATGAACATTGCACAACAACTTATT
TGAACATTTCAACTGTTTTGATCGGTTCGCAAGGGAAAAAATGATCAAATTAATAAAAAA
CATGAAATTACCTTCTTGGCATTCCAGTATATAACATGTCAAAATTTGAAAAATTTGGTG
ATTAAGAAGTTATTTGAACCATAAACAAAAGGGCAGGAATGGCAAAACAAGTGCATAAAA
AGCCTCGAAAAGAAAAAGGGCACTTAAATAACATCAGTAAGATTTTCCTTTAACTAAATC
AAAGCCTCTTTAATTATAATTAAATAATAATTATATTTTAACTTCTATTTTTCTTCCTCT
AAAAACTTTTGTTTAAATTATTTTTAAAAATTTATTTAATTTTAGTCCTCGTCAAAATCC
TCCATTTTAGCTGTCCGCCTGTCCCCTTCAAACGCAAATAAACCCTCTCTCTCTCTCTTC
ACAAAACCACAACTGCTCTCACTTCTCTCCTCACATTCTTCAAACTACACTCTCTCTATT
GCCTTGCTCTTTATTTTGTTGCCTTAAACGTGAACTCAGGAGCAAATAGAGAAAAAAAAT
AAAAGGAGAAAAACAAAGCAAAGCGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGAAGAG
AGAATAATTACTAGTAGATT
Download   Copy
>Nl08g05520.mrna1 GenomeSequence + 
ATGGAAGCTCCAGAATTCTATCAAGGAAACCATTGCTCACAATTCGCGGCCGAGAAGTTG
GATGCTAAAACGACGGGCGGTGACCATTTCATCGTCGAGGACCTCCTCGACTTCTCCCAT
GATGAAGACGCTGTCGTCACTGACGCTGCTGCTGCTGCTTTTGACAACGTCACCGGAAAT
TCCACGGAGTCTTCCACCGTCACTGTCGTTGATAGCTGTAACTCCTCCTCTCTCTCAGGC
TGTGAGCCTAACTTCGCCGGTGATGTCGGCCGCCGGAATTTCGCTGACGGTCACTTCTCT
AACGACCTCTGCGTGCCGGTAATTCAATTAATTCAATTACATGCAATATTTCCGTTGTTA
TGTATTAAATTTTGGATTGTTGTATCATATTCTTCTCTATATGAGTTTAAAAAAAAGTTG
GTTAATTATATTTACATCAAAATAACATATATATGAATCCACAGGATCTTTTATATGTAT
ATATATATATGTATTATGTAATATTAAATTAAAAAGGTTTCGACAATGGAACATGACAAT
TTGCAGAGTTTCTTTTTCAAAGTAAAATCAAGGCTTTTAAAGAAATTAAAATATCAAAAG
AAGTTAAAATAAAAATTTAAAACAATGAAGTTGTTAACAGTTTGATATGTCTTCTTTTTT
TTTTTTTTTTTGTTTGGTGGTGTGTGCTTTGAACAGTACGATGATTTGGCTGAGCTGGAA
TGGCTGTCGAATTTCGTGGAGGAATCATTCTCCTGCGAGGACCTGCAAAAGCTCCAACTG
ATATCGGGCGTGAAAGCCCGGACAGACGAATCATCTGGGACCCGCCAATTCCAGCCCGAG
CCCAACCGAAACAACAACAGCAGTTGCAGCAGCAACAACAACCCGATATTCAACCCGGAA
ATGGCAGTTCCTGCCAAGGCCCGAAGCAAGCGGTCCCGGGCCGCTCCATGCAACTGGGCT
TCCCGCCTACTCGTCCTCAGCCCGAGCACTTCCTCTTCAGAGTCCGACATTATCTCGACC
GAGCCACAGCTGCCACCGCAGCAGCCTCAAAGTTCCAGTAAAAAGACCGTTAAAGCAAGT
GCTTCGAAGAAGAGAGAGAGCGGAGACTGCAGTGAAGGGAATGCAGAGGGCAGGAAGTGT
CTGCATTGCGCGACGGATAAGACTCCGCAGTGGCGGACCGGCCCAATGGGCCCGAAAACT
CTTTGTAATGCATGTGGAGTGAGGTATAAATCGGGCCGGCTGGTGCCCGAATACCGGCCC
GCCGCTAGCCCGACGTTTGTGCTGACGAAGCACTCGAACTCGCACCGTAAGGTGCTTGAG
CTGAGGCGTCAAAAGGAGATGCAAAGGGTGCAGCAACAACAGCAACAGCAGCAGTTTATG
CATCACCATCAGAATATGATGTTCGATGTATCATCCAACGGTGACGATTACTTGATCCAC
CAACACGTTGGGCCCGATTTCCGGCAGCTCATTTAA