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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl08g03990 | GWHBECQ00000008 | 3431311 | 3434670 | + | PHD finger protein ALFIN-LIKE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl08g03990.mrna1 | 11 | 139 | PF12165.11 | Alfin | Family | 233.2 | 5.40E-70 |
Nl08g03990.mrna1 | 200 | 249 | PF00628.32 | PHD | Domain | 41.6 | 9.00E-11 |
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>Nl08g03990.mrna1 ATGGACGCAGGCGGAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAG TGTGACCCTGAGAAGGAAAATCTTTGCCTTTATGGGTTTCCTAGTGAGCAATGGGAGGTA AATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTT GCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTTATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCT TGGTTACTTTCTGTGGCCTTCTATTTTGGTGCTAGGTTTGGGTTTGATAAAGCTGATAGG AAACGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACGATATTTGAGGTTGTTACAGGGACA GCCAAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAAG TCGAACTCAAAGCGTGGCGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCAAAGACAGTGCAATCGAAG GATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGACGATGAGGAGCATGGTGAGACACTATGC GGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATTTGCTGTGATGTCTGTGAG AAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGGGCTGAGCATATTAAGCAG TACAAATGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGA
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>Nl08g03990.mrna1 GenomeSequence + ATGGACGCAGGCGGAGGCTACAACCCACGTACGGTGGAGGAGGTCTTTAGGGATTTCAAG GGCCGCCGAGCTGGCATGATTAAAGCCCTCACCACTGGTTCTCTTTTTCTACTCCTACTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAATTATTATTTATTATTATTGTTGTTGAATTGA TGTATTTAAATTTTGTTGTTTGGTGGTTTTGTAGATGTTGAAGAGTTTTATCAGCAGTGT GACCCTGGTAATTATTTATTTTTGATGAATTTTTATATTTACAGTGAATTGTTTTATTTT GATGTTTTTATTGTTGTTGTTGATGATGATGATGATGATGGTGTGGTTTTGGTGTAATAT TGTTCTCTGTTTTGAATTTTATTGTTACTAGCTTTTATTTTAAACCTGTTTTACGTGCGT GTGTGTTGATAATTTGAGTTTGTTTAATGGAGATGCATTGATTAGAAGGGAAGAAGTTGT TATTGTATGGTAGACGTTGCCTTGCAATTTCAAACTGGTATTGTTAGTTGGTATGGGATT GTTGGTGGTGTGATTAATAGAGTTTTGATGTGGTTGTTTATATTGAAATTGAATGGAAGT GAGAATGCATTTTGGAATGTCAAAAATGTAGGTTGAAGATGAACATGAGATACGTGGGAG AGGAGATGAGTATTGATGTAATGTTTTAGCGGGAATATGTTACTGTTGGGTTTTGGATTT TCGTTATGAGCTTTTCTTCTCGCATTGAATGAGCTTGCTATGTGGCGTTCTGTTATTGGG GGCGGGTGTGTGCAATGTGTGCCTCTGAAGTTCTTCTCATTTATTAGAGATTGTGTGATC AGATGGCGGAAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAGAAGTTCCGTTTTTAGCATATGAAATGTTT AAGTTGTATATTAATGAAGAGTGGTTGTCACTGAATAGTAAAAACTTCACTATGCTTGAG GCGCATATCACTCACCCCATATGTTGAAGAATCTCTCCTTTAAATGAATTTTGTAGAATC TGCGATGTGTCCATGTCAGCGTGACCTTGTCGTGTTTTGTAAGTGTCGGGTATGACACCA ACAAAGATATTTGGGCCAGGCACAGTTTTGTGACAGTTTTCTCATTTAAATGGGAAACAT GTTACTTGTTACATGCACGTGTGTTTAACAAAACTATGTGTATACGGTATACCTATGATC GTGTTAACAACTTAACATGTACTTTGAGAGCATATGTTTTTTTTTTTTTTTCCTTGGAAG GCATTTGAGGGCATATGTTATGAATTAAAACAGTGAATGCAAGTTTATATTTATATTTTC AATATGGGTGGGAAGTTGTGTATTGGATGATTAAGTATTTGTTTTTTATTTTTTGTTTAT TTTTAATTTAATTCTTTGGGTAGATGATTTGAGCATCCTAAATTTATTTTTAATATCTTC TTTCTCGTCAACCTAACAAATAGAGCATTAGATAGAAACTTTGTGGCCTTCATTTATTAG AGATTTGAGAAACCCATACGATATTTTGAACTGCTTCTCTATTTTTTATGTGGCATCCTA CGGTGTCATTTACATAAATGCAAAACTTTTGATTGCAGAGAAGGAAAATCTTTGCCTTTA TGGGTTTCCTAGTGAGCAATGGGAGGTAAATTTACCTGCTGAAGAGGTGCCTCCAGAGCT TCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAACTTTGCCAGAGATGGGATGCAAGAAAAGGACTGGTT ATCTTTGGTTGCTGTCCACAGTGATGCTTGGTTACTTTCTGTGGCCTTCTATTTTGGTGC TAGGTTTGGGTTTGATAAAGCTGATAGGTATGTTTTTCTCTTTGGCAAATTGTGGATGTG GTTTAGCTTTGTAAACAATGCGAATGAGTCCAAATTATGGCGATGGTCTGTTGTTGCTTA CACACTCGTTACCAAGAGCTTGTACATCATTGTCACTGTCCATCGCATCCTGTTCCACAG AAATAGTGCTATTGATACATGATTTGGGTATATTGATTGGATGACTTGTTTTAAAATGAT TATGTTATAGATTCAACTGTTTTAAACTCTCAATTTGCAATTATGTTATAGATTTCAAAT TTTCAATGTTTTAAGCTCCCAATTGGCAAATGATTTAATGTCTATTTTAATAAATAACTT TTTGCTATAATTTTTTTTTTCACACCCATGGTATTTGTAATTGATAAATTAAGTCCTAGA TTTGTTATTTTTCTATCCCATATTTCCTTTGGTCATTAGGATGGATTGAGTTTTACTTCA CCACATGTATATGGTCTAAGAATTTTGTTTTTGTTCACAACTTTTGTTTTTTGAAAAGTA TCATCGAATTAATGTTTATGTTCCATGTACTGCTTCTCATGGTCACATTTAATTCTGTGT TGTGCCATCGAATTTTACATTCCTGAAGGTCGAAGACCGATAAATGGCTAGTCTTAATTC ACAACTCTAGGCTCTAGGAGGTGTTTAGGATCTTAAATTGATTAAATTGCAGTTTTCTAT AAGAGACGTAAAGGCACCATAACTCATTTGATTGTAAAATTTTTGTGTACCACTGTTTAC GGGTTCTATGTTGACCTTCATTGTTTTCTCAATGATATTTTCTTGGTATATGTGGTGCAG GAAACGTCTTTTTAATATGATAAATGAACTTCCGACGATATTTGAGGTTGTTACAGGGAC AGCCAAGAAACAAACAAAGGAAAAATCTTCAGTCTCAAATCACAGCAGCAACAAATCTAA GTCGAACTCAAAGGTGCGATAGGATGTCTACTGACATAATCTTTATTTGATTATATTTCC ATAATATCTTTTAAATTTGGGATTCTTTTTGGCCTAGTTAAGCTTTAAAGAGGGAAGTAA TTTATTATCAATTTGACATTGGATTGAGAAAATCAAGTGTTGGTAGAATGGTTTTACTTT GTTGTTGAATGAGTGTTTTTTAAAAGTATCATCTGTATATTCCGATATTAGGCTTAGAAG AAAATAATTTTTCATAATTGTGTAGTATTATGCTTAAGAAAAGATACTTGACAAACTTGT TCGTCCGTTCTTTTTTGTTGGCATGTGCAGCGTGGCGCTGAATCTCAGACCAAGTATTCA AAGACAGTGCAATCGAAGGATGAGGAAGAGGAAGCCTTAGAAGAGGAAGACGATGAGGAG CATGGTGAGACACTATGCGGGGCTTGTGGAGAGAACTATGCAGCTGATGAATTCTGGATT TGCTGTGATGTCTGTGAGAAATGGTTCCATGGAAAGTGTGTTAAGATCACACCAGCTAGG GCTGAGCATATTAAGCAGTACAAATGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCACGCCCTTGA