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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl08g01330 | GWHBECQ00000008 | 1270765 | 1272920 | - | Protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl08g01330.mrna1 | 29 | 177 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 215.4 | 4.10E-64 |
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>Nl08g01330.mrna1 ATGGGAGCCCCAGACTTGGCCGTCTTCGACGCAGCTGCTCGCATCAACAGAGAAGATTGC AAGCGAACCAAACACGACTCCCAGTTTAACAAATGGCAGGTTCTCGTTGGACCTTCAGAT TGGGAAGATCACTCACTTGGTAAGGAAGGAGTGACTAAATATAGGGTTGACAACCTCCCT CCTGTTACCTCTCCTGGACTTTATGAGCTTGGTGTAGCTGTGTCTCCCACTGCCAAGAGA CACTCGGATGATGTGGTTGCTGTTTACCTTGGACAAGCTGACAATGTCCGGACACGACTT CAGTGCTATGGTCGTAGTGGAGCTCATTTGAATTACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGG GGGCCTGGATTCTTTGAGGATATATTCAGTAGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTT CCTATGAAAAGCAAGGCAGATGCCCTTAAGATGGAAACTCAGCTTCTAGGTAGATTTGAT TATGCGTGGAACAAAGGCAGCAATGGTGCACGTCGCCATGATGATGTCCTTAGGAAACTC GACAGAGCTCCTTCAAGGAATATTCAGTTTCCTAAGTTGGTCAGGAAGATTCTACATTAC AGTCAAAAGCCGGTGGGCATCAAAATCAAGGAAACCAAGTTTCTTTTCCCAGAACAGAAA TGCAACAATTATGCTGATGAGAAGAGTAACAATTTATTTCCTCAAGTTTTTAAGTTTAGC ATATCACAGCCCAGGTTAGTTTTAGATGGACAAGGTGCTGAAGATAGACATTTAATTATC AAAGGGTCCATCTCAAAGTCGACTAGAGGAGGGAAAATACAAGTGGAAAGTGCTGACTCA GAATCCAGCATCTCTGGTAGCAGAGAACTTAGTTCCATTTTTGACCCAGTGAAGCTTCCT GTGGATGTTCCTATCAGTGAGGTCTACAGTGAGACTTGTGGCGTTGTCTTGGATGACGGC AGTCTTTGTATAAAACAGCCAGTTCAAGGAAATAAAAGGTGCAACGAGCACAAATGGAAG AAAACTTATGGATCTGATTCTAAGTCAGGAGGAACATCACATTCAGTGACCGATGCGGCC TATGTTTCTTGTGATAGGAAGGCTTTAAATTATGATACGCAGAATTCCCCTGAAATGTAT AGAGCAGGAAGGATATTTTTCCCAAAGGGCTCTGAAGGCAACCCACACTATGATAATATA TGTGGGGTGGCATTAGGTGATGGATATTTCTGTACCAGTCAACCTGTCAAGGGAAGAGTG AGGTGTGAGAAGCATAAAGGGTTGAAGGTGAATGGGAACTTCTCTAGGTCAGATGAAAAG GATAAAACTCGTGTATATGATGAGGATTCGAAATCCAGCACATTTGCTGACAGGGAATAC GGTTCCTCTGTTTGTGGAGGAAAGACGGCGAGTGGTTCCTATTGCACAAGGCCAGTCAAG GGAAATACGAGTTGTTGGCAACATTCAGTACAGATTTCTTATGGGGACTCAACAATCAGT TCCTCTTATGACTGGAAATATGGAGGAACCTCTCTCTGTGGAGCACGCACACAAAATGGT TCATGTTGCAGAAGGCAAGTAAAGGGAGGTGGAACGTGTTGGCAGCATTCGGTACAAGCG CAAGAACACAGAGGACCTGGACTTTTGCCATCCCTGAGTGTGTCTGATAGGCATTCAACA ATCAGTTCCCACAGTGACCGGAAATATGGAGTAACCTCTCTCTGTGGAGCGCCCACACGA AACGGTTCTTCTTGCAAGAGGCAAGTTAAGGGAGGTGGGAGGTGTTGGCAGCACTAA
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>Nl08g01330.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 CCATGTTTTGATTTCTTTATTTTTTGGTCTTTTTTTTTATGTTTTGATGTTGGTGTTGAT GATGTTGTAGAAGATGATGATATTGATGAATTAGATGGATGATATTGACAAATTATATCT GATGATGTTAAATTGTGGGAGATGTTGATGAATTGGATCAATGATGAGATGATGAATCGT GGTTTTTTTATTTTTTTTAGATTTTGTATAAAATTAATTTTATATAATAAAAAATTTAAA TTAATTTCATTTCAATGCAATCCTAATCTATACCAAATTTGATATGATATAATTTTTAAT TCAATCTCAAGTTCTACCAAACATGGGATAATGATTTTCCATTTCAATCCAATTCATTTC ATTTCAATCCAATCCATTTCATTTCAATCTCGCGTGCCAAACAGAGTCTTATAATAACTG CTAGTGCTATTGAATCATTGACAGTGTATATTTGATAGGGCTTATCTGTTCACCAGAAGA ATTTTTTAAATTCAAATGTTTGTATTTTAATTTTCTTATATTGTTTGGTTGTCACTCTAG TAGAGTTTTAAATCATTAAAAAAGTTATTTTATATTTATTAAGAGAACTTCAAATTTTAA GTTTTTATAAATAGATTTTCTAAGTTTTTTAAAGAAAGAATTGCATAATGTTAACCTGAG GTTTCCTCTTTTACAAATGGATTAAACTTTACCTGTTGATGATAGTTTACCCCCACTCTG TTAGTCAGTATCTATTCATGGTAGTCAAACTTAATAGACTTAAGGGCACTTTAATCTTTT ATCCCTTTATTAAAATTTTTCTTTTAAAATATAAAAATATGAAGTTATTGAAAATAAGAA ATAATTTGGATCTCCACTGTCGGCAGAGATTTTTTATGAGAAAATAAATTTTTTAAAATA AAAAAAAAAACAATGAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATCTCCATTGTCCACCAC TGTGATGGACGGTGGAGAAATTATTTTACGAAAACGAAATTTAAAAAAAAAAAAAGGTAA AATTGTGAATATTCAAATTAGATCTTCGTCATCCATTTTTATGAAAATTGAGATCCTATT GAAGGACCAAATTTAGGTCTCCGTTCACAATAGAGACCTAAATTTAATCTTTGTCACTGT GATAGAAACCTAAAATATAGATCTATATCACAACGATGGAGACTCAAATAAGTCTCTAGT TGTGATAAAGTCCGAAATGGAATAAATGGATGGTTGCCTTTTCACTTACTCCTACGAGAT CACAAGCTCATAGAGTCAACCCTATCATCACCGTCGACACCCTCTTTTGTTTTTTCAACA ATTGATCTCTCATCAGTTGAAAGTTGAATAGTTAAAGATGAACGTTGGTGTAGAATCAAT CTATTGGATCTCTGACAATTGTTTTTTTTTTTTAATAATTCTTTCGATTTTCTTCTCATT TTCATCGTCCATCAAGGTTGGACGATAGAGATTACACTTTTCTTAAATATCTTTCTTATT TTCAATTTTTCTTTAATATTTCTTTTATTAGTTAATTATTAAAAAGAATCTTGGTCATTC CCGGTATAAGAGCTGGTCAACGGTTAATGTTAACACTATTGACTAATGGATTGGAGTTTT ATGTAATTTTGAGATAGAGTTTAATCCGTCCATAAAAGAGAAAACCTAAGGTAAGTAATG CGTAATTCCTTCTTTCTAATAATATTAAAATGTTAAAAATATCCTTATAATATTTTATTA AATAATCAAAATTCAGAGGTATTATTTAGATGTAGCAATGGTGTGGTTGTAGAGTAGGAA CAGTTGAAAACACACAGCAACTGTGCAACGCACAGAAAATAAGAACAATTTAATCAACTT GTTAAAATGACATTTTAAAGAGGGCAATTTGGTCCTTACACATTACAAATTTACCATTTC GCCTTTCTCCCGGTATAGAAACCAAGGCGCACATAAATTGCACCGTAACGGTCAATGTTC CTCCACTGCCAAAGAAGCTA
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>Nl08g01330.mrna1 GenomeSequence - ATGGGAGCCCCAGACTTGGCCGTCTTCGACGCAGCTGCTCGCATCAACAGAGAAGATTGC AAGCGAACCAAACACGACTCCCAGTTTAACAAATGGCAGGTTTGTTCACTTACCCTCCTC TTCAAGACCTTATACGTACGCATTTCATCGCTTTATTCCACTTCCTGTTCAATCTAAGTT AAAGTAAGCTTTCTGGGTTTCTATATCACTCTTCAAAATCACATCTTTCACTGTACTTTC AAATTTTCAGATGCACTTGCTAAATATTGATGGGTTTGAAATTTGGATGGCTAAAATTGA TGAGGGCAAGTGTTGTTGTAAAAATGATGTGTATACAGGTTCTCGTTGGACCTTCAGATT GGGAAGATCACTCACTTGGTAAGGAAGGAGTGACTAAATATAGGGTTGACAACCTCCCTC CTGTTACCTCTCCTGGACTTTATGAGCTTGGTGTAGCTGTGTCTCCCACTGCCAAGAGAC ACTCGGATGATGTGGTTGCTGTTTACCTTGGACAAGCTGACAATGTCCGGACACGACTTC AGTGCTATGGTCGTAGTGGAGCTCATTTGAATTACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGGG GGCCTGGATTCTTTGAGGATATATTCAGTAGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTTC CTGTAAGTGTGTCTTTTTTAGCTTTTGAGTTTTGGGTAATTTAATTTTTGCTTGGTTTTG TATTATTTTTATGTTCGCGGAGGCATACTATGTAAATATGGATTTTGTTTTGAATTGGGC AGATGAAAAGCAAGGCAGATGCCCTTAAGATGGAAACTCAGCTTCTAGGTAGATTTGATT ATGCGTGGAACAAAGGCAGCAATGGTGCACGTCGCCATGATGATGTCCTTAGGAAACTCG ACAGAGCTCCTTCAAGGAATATTCAGTTTCCTAAGTTGGTCAGGAAGATTCTACATTACA GTCAAAAGCCGGTGGGCATCAAAATCAAGGAAACCAAGTTTCTTTTCCCAGAACAGAAAT GCAACAATTATGCTGATGAGAAGAGTAACAATTTATTTCCTCAAGTTTTTAAGTTTAGCA TATCACAGCCCAGGTTAGTTTTAGATGGACAAGGTGCTGAAGATAGACATTTAATTATCA AAGGGTCCATCTCAAAGTCGACTAGAGGAGGGAAAATACAAGTGGAAAGTGCTGACTCAG AATCCAGCATCTCTGGTAGCAGAGAACTTAGTTCCATTTTTGACCCAGTGAAGCTTCCTG TGGATGTTCCTATCAGTGAGGTCTACAGTGAGACTTGTGGCGTTGTCTTGGATGACGGCA GTCTTTGTATAAAACAGCCAGTTCAAGGAAATAAAAGGTGCAACGAGCACAAATGGAAGA AAACTTATGGATCTGATTCTAAGTCAGGAGGAACATCACATTCAGTGACCGATGCGGCCT ATGTTTCTTGTGATAGGAAGGCTTTAAATTATGATACGCAGAATTCCCCTGAAATGTATA GAGCAGGAAGGATATTTTTCCCAAAGGGCTCTGAAGGCAACCCACACTATGATAATATAT GTGGGGTGGCATTAGGTGATGGATATTTCTGTACCAGTCAACCTGTCAAGGGAAGAGTGA GGTGTGAGAAGCATAAAGGGTTGAAGGTGAATGGGAACTTCTCTAGGTCAGATGAAAAGG ATAAAACTCGTGTATATGATGAGGATTCGAAATCCAGCACATTTGCTGACAGGGAATACG GTTCCTCTGTTTGTGGAGGAAAGACGGCGAGTGGTTCCTATTGCACAAGGCCAGTCAAGG GAAATACGAGTTGTTGGCAACATTCAGTACAGATTTCTTATGGGGACTCAACAATCAGTT CCTCTTATGACTGGAAATATGGAGGAACCTCTCTCTGTGGAGCACGCACACAAAATGGTT CATGTTGCAGAAGGCAAGTAAAGGGAGGTGGAACGTGTTGGCAGCATTCGGTACAAGCGC AAGAACACAGAGGACCTGGACTTTTGCCATCCCTGAGTGTGTCTGATAGGCATTCAACAA TCAGTTCCCACAGTGACCGGAAATATGGAGTAACCTCTCTCTGTGGAGCGCCCACACGAA ACGGTTCTTCTTGCAAGAGGCAAGTTAAGGGAGGTGGGAGGTGTTGGCAGCACTAA