Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
Nl05g13550GWHBECQ0000000565312036535791-GATA transcription factor 25

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
Nl05g13550.mrna16596PF06200.17tifyDomain50.21.30E-13
Nl05g13550.mrna1129171PF06203.17CCTMotif54.97.20E-15
Nl05g13550.mrna1129151PF09425.13Jas_motifMotif235.80E-05
Nl05g13550.mrna1198234PF00320.30GATADomain55.14.30E-15
Download   Copy
>Nl05g13550.mrna1
ATGTACGGTCACTCTCAGCCAATGAACGTCCCCGCCCAGATTTCCCCCGGCGCCGACGAC
GACGACGTCTCCGTCGGCGCCGATAACCACCACCACCTAGGTTACGACCCCCACACCGCC
ATCGAAAACGGCGTCGTTGTCGAGGATGTCGCTGCTGATTCCGTCTATGTTCCCACCGGC
TCCGAGCTGTCTAATTCCAGCCAGCTTACCCTCTCTTTCCGCGGACAGGTCTATGTCTTT
GACGCTGTCACTCCCGATAAGGTTCAAGCGGTGTTGCTGTTGTTGGGAGGATGCGAGTTG
TCATCGGGCCCACAAGGAATGGAGGTGATTGCTCAGAATCAGAGGGGTGTTTCGGAATTT
CCTGGAAGATGTACTCAACCTCAAAGGGCAGCTTCATTGGATAGATTCCGTCAGAAGAGG
AAAGAGCGGTGCTATGATAAGAAAGTCAGATATAGTGTCCGCCAAGAAGTTGCTCTCAGG
ATGCAGCGTAATAAAGGCCAATTTACGTCTGCTAAGAAGTCCGAAGGTGGAACTTATAGT
TGGAGCTCTTCCCAAGAGGCAAGACTAGATGAAAGCCCGTCAGAAACCTCGTGTACGCAT
TGTGGTACTAGTTCAAAATCCACTCCAATGATGCGGCGTGGTCCATCTGGCCCAAGGTCT
CTCTGTAATGCCTGTGGTCTTTTTTGGGCAAACAGGGGTACTCTGAGAGACCTTTCCAAG
AAAACCCAAGAACATTCTCTTACGTCAGTCGAGCAGGGTGAAAGTGAGGCAAATGAATCG
GACCGTGGAACTACTGTCCATGCAGGCAACGAAAGAGTTCCATTCTCAAATGACGATAGC
TCAGCTTTAATATCCCAGCATTAA
Download   Copy
>Nl05g13550.mrna1
MYGHSQPMNVPAQISPGADDDDVSVGADNHHHLGYDPHTAIENGVVVEDVAADSVYVPTG
SELSNSSQLTLSFRGQVYVFDAVTPDKVQAVLLLLGGCELSSGPQGMEVIAQNQRGVSEF
PGRCTQPQRAASLDRFRQKRKERCYDKKVRYSVRQEVALRMQRNKGQFTSAKKSEGGTYS
WSSSQEARLDESPSETSCTHCGTSSKSTPMMRRGPSGPRSLCNACGLFWANRGTLRDLSK
KTQEHSLTSVEQGESEANESDRGTTVHAGNERVPFSNDDSSALISQH*
Download   Copy
>Nl05g13550.mrna1
ATGTACGGTCACTCTCAGCCAATGAACGTCCCCGCCCAGATTTCCCCCGGCGCCGACGAC
GACGACGTCTCCGTCGGCGCCGATAACCACCACCACCTAGGTTACGACCCCCACACCGCC
ATCGAAAACGGCGTCGTTGTCGAGGATGTCGCTGCTGATTCCGTCTATGTTCCCACCGGC
TCCGAGCTGTCTAATTCCAGCCAGCTTACCCTCTCTTTCCGCGGACAGGTCTATGTCTTT
GACGCTGTCACTCCCGATAAGGTTCAAGCGGTGTTGCTGTTGTTGGGAGGATGCGAGTTG
TCATCGGGCCCACAAGGAATGGAGGTGATTGCTCAGAATCAGAGGGGTGTTTCGGAATTT
CCTGGAAGATGTACTCAACCTCAAAGGGCAGCTTCATTGGATAGATTCCGTCAGAAGAGG
AAAGAGCGGTGCTATGATAAGAAAGTCAGATATAGTGTCCGCCAAGAAGTTGCTCTCAGG
ATGCAGCGTAATAAAGGCCAATTTACGTCTGCTAAGAAGTCCGAAGGTGGAACTTATAGT
TGGAGCTCTTCCCAAGAGGCAAGACTAGATGAAAGCCCGTCAGAAACCTCGTGTACGCAT
TGTGGTACTAGTTCAAAATCCACTCCAATGATGCGGCGTGGTCCATCTGGCCCAAGGTCT
CTCTGTAATGCCTGTGGTCTTTTTTGGGCAAACAGGGGTACTCTGAGAGACCTTTCCAAG
AAAACCCAAGAACATTCTCTTACGTCAGTCGAGCAGGGTGAAAGTGAGGCAAATGAATCG
GACCGTGGAACTACTGTCCATGCAGGCAACGAAAGAGTTCCATTCTCAAATGACGATAGC
TCAGCTTTAATATCCCAGCATTAA
Download   Copy
>Nl05g13550.mrna1 -  Up_Stream_Len 2000
CTCGAGGTTAGGCAGACGTAGATTTGGCCACATCATTTGCATTTGCATCTCTCATTTCCT
TTTTTTATCCTTTGATATCATTTCAAAGGACTTCTACACATGCGAAGTACACTTTCTTTT
TCGAGCAACTTTACTTTGCTTTAACTTACTTGAACTTCCCGCATTTTCTTCCTCATCTTC
AACCTCATCTTTGAAATCAATGTTATCGTCTTCGAAGTCAACACCTAGATTCATATCTAA
GAACCAATTGACCATGAAAACATATTTCGTTACACTGGAAATATATATGAAATACATTAT
CAAATTAAAACTAAACACACCATGTGAAGGTCAACTAATCTGTATTTGTTTAGATTTTTT
TTTAAAAAAAATTCATTTGCATGCTATTTATGAAATATAAAAATAGTAAAAAATTAAATA
AACATATATAATACAGAAAAGTTACAAGAATCGAAATACTAATTCAAGTTAAATAAACAT
AATCAATAGACAATATCACAAGTTGATGTTCTAAACATGGAAAACTTGACTTGATGGAGC
TAGAACATAATCAATATATTTAAACTTTTTTTCAAGTTTCAACAATTATGTTACACAAAA
AATTAAAGACAATAGGAAAAAAAAAATGAGAACAAGAATCAAAATACGGAAAACACAAAA
AAATGGAAGAGAATGACACCTGAAGGTTGAAGCTAGTCCTACCAGATCTGATATAGTGCT
GGAGATGGTGGATACGGTGGTGGAGTCGTGAAGAAGGGGTGACCGTGAGGAAGAATGAGC
TGTGATCGGTGACCATGAGAAAGAAGGAGCGGCGATCAGTGATCGTGAGGAAAAAGGAGC
AACTGTCGTTATGGCAAAGGGGTGGATTCCGTGGTATGGTGTGGCCGTGTGGGTGTGGGA
GAAGGGGAGAAGAGCTGTCGTCGAGTCTGGGAGAAAGGGAGAATTAAAAAAGAGAAGGTG
ATTGCCGAAAATTTGAAATGAATGGATTAGATTTAGGGTTTGGTTAATGTTTATATATAT
ATATATATATATATATATGCATAATTACACACTAACCCCTATAATATTTCAATATTATAA
TTTCATCTCTAATTTAATTGTGTCAACCCGCGATTCGTTTAAACAAATCCAATTCGATTC
GTTTAATAAACGGGCTAAGTGGATTGACACGATTACGACATAAATTCGTTTAACTCCAAC
TCATACCCATTTGTTTTTTGCGAAGTTGTGTCGACCCGTGGTGTTGTGACCTATATTACC
ACCCCTAATCTGGATGTTCTAACTTGAAGAAGTAAGGACTAACTAATTAAATTCATCTAT
TTCATTTGAATTAAATAGGAGAGAGAAATTGTTTTGGGAGAGATAATGTAATAGATGAAT
TTAATTGGCTGATCCTTATGTTTTAAAGTTATGATATCTTGATTATAAAAATAACATATA
TATACATATATATATATATATATACATACACACATATAAACATACGCTACTCATTAATAT
CCGAATCTAATTTAGACAAAACACACCGTTTTCAATCAGTTGCACGCCTTTCCGTAACTT
GCTAAAAAGAGAACGAGATGCAGGAAAAAGCAAGCATAAAATAGGCTGGTAAGGGCATAT
CTCGTAAATACACGTACTATCTAGGGTCACTTTCCTCTTTCCCCATACGGTCCTGTCCTG
AGCTGTCCTTCACTCTCTGGTCTCTCTCGCACACGGAAAACTCACCAACACAAACACACC
CACGCCCATCACAAGCACTCACACATAAACACAACACCCAAAAAAAGAAAACGCTCCTTG
TATTTTTTTCTCTTCAACACAGACTTAAATTCTCCCTCTCTAAAATCAAATTTTCTTTTT
TTCTTAAAAAAAAAAAATTCACTTTCCACTCTTTGTCAGACCTTTTTTTTTTAGGGTTAG
GGTTTCGTGGAAATCTCCCAAATTGTTATCCCTTGTTCGCGAATGCTTCGTAACTTCGTC
AGTTTGACCCCCAACCAGCA
Download   Copy
>Nl05g13550.mrna1 GenomeSequence - 
ATGTACGGTCACTCTCAGCCAATGAACGTCCCCGCCCAGATTTCCCCCGGCGCCGACGAC
GACGACGTCTCCGTCGGCGCCGATAACCACCACCACCTAGGTTACGACCCCCACACCGCC
ATCGAAAACGGCGTCGTTGTCGAGGATGTCGCTGCTGATTCCGTCTATGTTCCCACCGGC
TCCGAGCTGTCTAATTCCAGCCAGCTTACCCTCTCTTTCCGCGGACAGGTCTATGTCTTT
GACGCTGTCACTCCCGATAAGGTATTGGAATTTTTTTTTTTTTAATTGTTGTTGTCCTTT
TAGTTTTTTATTCTTTGAATTAGGGTTTGGAATTGGATTGTGTATTTGCCGTCACGTGAA
TTTGTTGTTTTGGGACATTGATTGGTGCTTATATGAACTACTATGTTGTACTTGAAGATG
CCAGCTTTGATTTCTCTATTGGTTGTGTGTGCATAGGGAGATGGGGGTTGATACATTGCT
TGTTTAAAAAACGTATGTCTGTAGGTTCAAGCGGTGTTGCTGTTGTTGGGAGGATGCGAG
TTGTCATCGGGCCCACAAGGAATGGAGGTGATTGCTCAGAATCAGAGGGTATTCTTTTCC
TTTACCGTTTAAGTTGTATGTAGTGTAGATGTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGCTTTTTGTT
TTTTGTATTTTTATTATTTATTATTGGATTGCATGGTGTTTAGGGTGTTTCGGAATTTCC
TGGAAGATGTACTCAACCTCAAAGGGCAGCTTCATTGGATAGATTCCGTCAGAAGAGGAA
AGAGCGGTGCTATGATAAGAAAGTCAGATATAGTGTCCGCCAAGAAGTTGCTCTCAGGTG
TTGTGATTTGTTTTTGTTCATTGCTTGAATTTATATGTCTTCCAAAAGCAATTGCTGTAA
AAGGAAGGCAAGTAGTTAATGAGAAGTAACTAACAATTAGTGGTTGTTAGTCTAGCCAGC
ATGTGAGTACTAGTTTTTTTATGGTTAAATTTGGATATGTGTGTCTTCTAGCAAGCTATT
TATGATTAGTTGTTGTCCTTGAGCAAGGTGTTTATTTGTGGACAATCTGGGTACTTGCTC
CCTTGTTAGCTAATGGAAATCCTAGCAAGATGTATCGTGTCACCTAACACCTTGGAATTT
AAGCTCCGCTTGTTTTATACTTAGCTTATTAGAGTGCATGAATACCATTCTTGGGTCGTT
TCCTATCAGGTTAAGCTTTTGGGTCGATTGATTAATAATATGATATCAAAACTTTGTTAC
ACAAGGAAGTCTTGGGTTTTGAGTCCCCCATTGTGATAATTTTTGAATTTGTGTTTAGTT
TTGGGCTACAACCATGTGGCTAGCCTGTTGGACTTGCACATGAGAGGGTGTATTAGAATG
CTTCAATACTATTATTGAGCCATTTTTTTCGGCTTAAGCTTTTATAGCTCCCACAACCGA
TGCATACCTTTATTTAGATACACCAGTACTTGTGGACTAGTAGATGGTTAGTGCCTATTG
CAGCCACCCCTTATTCAATAAAACAATCATGTCAAGGAATTATGATATTATAAATTCAGA
ATTATCTGCGAGTTTTTGTACATTTTTTAATTTGAAACCACATTGTATGCAATGAAGTAT
TAATTTAGATATTGTTTCTAGAAAGCTGGCTTAAATTTAGGGTGCTTTGTTGATCTAAAA
GTCAATCTTACTATGTGAAAGATTAGGTGAAATCATTGTTTATGCTTCAAAGATTAGTGG
ATCTTGATGAGGTCAATCTTACTATATGACCTATTATTTTGTAGGTAATAACCCACTTTA
AATGTAAAATAATATCACTTATACTGAAATTTCATCAATTATTTGAGAATCTATGATCAC
TTCTGAGTACCCACTACCATTTTGTTAAATTTAAAATGTGAAATCTCATTCTAAATGCGT
AACAAAATTCTGAGAGGGCAAAAGTAACAGTAAAATGAAATCTTTGTGGTGCCCTTTCAA
TGCGATAATATTCTAGCAATCTCTAAGATTGCATGATCTAATTGGTCGATTCATCTAGGT
CAGCTAGTAAAGTCTCTTCCAATTGTGTATGAGATAGTGAATTCCGATTCCACCTGCATC
AGGTTTTGGGTGTGGGGTTGCAATTTACATTATAATATTATATCAAACATTATTTATGAA
GTAATTGATGAATTAGGAATTTTTAAATGGGTTGAATATGTTATTGTGATATGAAATAAC
TTAATTGCCTTTTATTATATAATAGAATTTGTTTGTAATTGTTGTTATCGTTTAAAATGG
ATATGAGAGGAGGGATGAGGGACTGTGGACAGTTATGTACGTGTGTTCAATGTCATTTTG
TGATTTATTTTAAATGCACCAGCAGATTGTGTCCTTGCTTGATAGGTTGTTTTTGTATCC
ATAATGAAGAAATGGTGCATGCATAATTTTCTTGTTGCATGTTATGAGGTGTTTTTTGCC
TGTTGTACTGTTGATTGCTCTGTGGAAGCATGCATGATTTGACGGACTGCCTCTATTGTA
AATATTTGCCAACTGACGTTATTGCAATTTACAACTGTGATCGCATTTTTCAATTACTGA
CATTTATGTGGTTTTTCTCAGGATGCAGCGTAATAAAGGCCAATTTACGTCTGCTAAGAA
GTCCGAAGGTGGAACTTATAGTTGGAGCTCTTCCCAAGAGGCAAGACTAGATGAAAGCCC
GTCAGAAACCTCGTGAGTTTCATACCATCTCTAATGTTCATTGTTTTCTTTAACTCTCTT
ATAAAATTTGGTGGACCTAAACTTGTTATTTGTAGTACTTTGTTTTCCATCGTCTGTATT
TTGAGGGTCATTTTATTCTTTTGCTATTGGACATCTATTTTGAGGTTTAACTTATTTTTA
CTGATGTTTCTTTTTCTTCTTAGCTGCAATGAATTTTAACCATTTTTTATACTTGCTTGT
CTAGGTGTACGCATTGTGGTACTAGTTCAAAATCCACTCCAATGATGCGGCGTGGTCCAT
CTGGCCCAAGGTCTCTCTGTAATGCCTGTGGTCTTTTTTGGGCAAACAGGGTAGGTTTCT
GTTAAGTGTTTTTATATGTATCTATGTTTCTTGTATGCGCATGCTTGTTTAGGTCTCTTT
GCATAATAAGATTCCAGATTTGCTGTTACTGCTCTAGTTCTACTGGTGCATCTGTTGTCA
AGCTGCTGCAAAAGCATAACAGCTATTTAAGTATTCACAAGATCCGAAACTTTATTCGTT
GGTACAGGCCCAAATAATGGTATTTGAGTGCCTACAAGCTTAAGCATGGGTCTATTAGTT
ACAGTTTATTGTATCACTGTCAGAGGTATTTAATAGAAGTGTTTGGGTTCAAGTCTCACT
TTGGGATTGAATCCCGTGTTATTATCTGTGTGTTTGGGCTGGGCTACGTTGCAATCCCCA
TTAGTCTTGTATGTAGTAGGGTTTATTAGTTGGATATTATGAGTTGTCCTTGTTTGCAAG
CTTAAGCTTTTAGACTAGTGGTCATTTAAAAATTACTTTATATGTTTATTTAGGTATTAT
GCCTGTGCTTGATTTGCTTGTCAATTAAACTTTTCTGTTTCTTACTTCTCCTTCTAGTGA
AGATTGTTTGTTGGAATCAATTTTTGTTGTGAGGTAAGTGTGCGGTGCCACATTCCAAGG
CTTAATCTGTTTGTCACCTGCATACTTCTTTTTGAAGATGATGATTGGGTTGAACCAAAG
ACAGCATTAGACATACAAGTCCTATGAGTAGCCTATTAAGCCACGAGCATTTTTTTTTTT
TTTTTGTTTATAGGGATATTTCAAAGTTTGGTCACTTGTTTTCGTATTTAAAATTTTCAC
TGTTTGTTAATCAATAGTGTGAAGGAAAAGAAAATCTACTATACCGATGTGTCAGAATTT
GAGTGTGGCATTTGAATTTGTAACTTTTTCAGTCTTTTAGCAATCAGAAAAGGTTGTAGG
CAGTTATATGCATTTTATTTTAATAAATTACGCAAATGCACATTGTGACATGCTGTAATT
ATGGCTATTTTTGTGTTTCCAAGATTGCTATGCGGTTGTATGATGTGGTAACTTGAAGCT
GAGTTATAAATTCTGTCTATGTTTGTTTATCATATTCACAACAATTCTCTTCATGCTGTT
TTTGGCTTGTGAGCGAGGTTTGCCAATAATTAAAATTCATTTAAGGTTACATTTGTCACC
TTATAATGGCTTCAATCATCAATTGCTAACTTGTCAACTGGAAATTTCTAATTTGCTTCA
ACTCTTTAATTGCCTCTACTATTAATTCTCCCCTGAATAAAATTCAGTGTCGCATTTTAA
CAATGCAACTCTGCAGGGTACTCTGAGAGACCTTTCCAAGAAAACCCAAGAACATTCTCT
TACGTCAGTCGAGCAGGTATGTTCTGCTATATTTCTACCCTTTTATCACCTGTAGCGCAA
ATGTGGCACACTAATTCTTAGTGCATTTTCTCTTGATATAGGGTGAAAGTGAGGCAAATG
AATCGGACCGTGGAACTACTGTCCATGCAGGCAACGAAAGAGTTCCATTCTCAAATGACG
ATAGCTCAGCTTTAATATCCCAGCATTAA