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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Nl05g11480 | GWHBECQ00000005 | 9408226 | 9411414 | - | Auxin response factor 17 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Nl05g11480.mrna1 | 126 | 227 | PF02362.24 | B3 | Family | 78.9 | 2.20E-22 |
Nl05g11480.mrna1 | 255 | 336 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 85.4 | 2.60E-24 |
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>Nl05g11480.mrna1 ATGCCTCAGCAGCGACGCCCCTCTCCTTCCCAGCCAAGCCGGGTAGACCCGGCCATCTGG CGCGCTTGCGCCGGTTCTCTTGTTCAAATCCCGGCCGTCCATTCTAGGGTTTACTACTTC CCCCAAGGCCACCTGGAGCGATCCTCTCTCTCCCCTAACGTCCTCTCCTCTCTCAACATC TCCAGAGCCGTCATCCAATGCGTCGTCTCGCAGCTTCACTTCCTCGCCGACCCCGTCACC GACCAAGTCTTCGTCAAAGTGCTTCTCACGCCTGTCAACACTCTGGAGTCTTCGAGAGAG CAGCAGCAACAACAGCACCAAGTGGTGGAGGACAGGAATGTCGAGAACTACGTTCATGAC AATGTCGTGGCGCCGTTTGCTAAGATTTTAACGCCGTCGGATGCTAATAACGGCGGCGGC TTCTCCGTCCCGAGATTCTGCGCCGATTCGATCTTCCCGCCGCTGAACTACCAGGCGGAT CCTCCCGTGCAAACCCTGTCCATCACCGACATCCACGGCCACGTTTGGGATTTCCGCCAC ATTTACCGGGGGACGCCACGGCGCCATCTCTTGACCACCGGCTGGAGCAAGTTCGTCAAC CGCAAGAAGCTGATCGCCGGTGATTCCGTCGTTTTCATGAGAGATTCGATAGGGCGGCTG TTCGTCGGAATCCGGCGGGCGGAGAGGTATGGGAGCAGTGGAGGAGACGGTGCGCGGTGG GGGGAGCATTCGGGAGTGAAGGTGGAGGCTGTCACGGAGGCGCTGGAGAGAGCGTCGCTG GGGCTGCCTTTCGAGGTGGTGTATTATCCCAGGACTGGATGGCCGGATTTTATAGTGAGG GCTGATGTTGTGGAGGCCGCTATGAAGATCTTTTGGACGGCTGGCGTGAGAGTGAAGATG GTGACAGAGACGGAGGATTCCTCAAGGGTCACGTGGTTTCAGGGGACCGTTAGCGATGCT TCTATGCCCACTACTGGGCCTTGGTGTGGCTCTCCATGGCGGATGCTTGAGGTTACATGG GATGAACCTGAAATTCTGCTGAACGTGAAGAGAGTAAGCCCTTGGCAACTTGAATTTGTG TCATCCTCTCTACCACTTCATACCCCTTTCCCCTCAGCAAAGAGATTGAAATTTCCTCAG AATTCTGGGTTGGTGACTGATGGAGAGGAGGACATCTTCTCTCCGCTGAGAGGATTAACT AATTCAACAATGGGGCAGATGAACCCTTCATCGTTGAATTGTAATACTTTTCCTGCTGGC ATGCAGGGAGCCAGGCAAAATACTAATAGCTTTTTTAGTTTATCAAATTTCATAAGTGAG AATACTCATCAGACGTGCACTGAGAATACCTCTGGCATCAACATTGTGCCAAAGTTGAAA AATGTGTGTACTGAGTTGAACATGGGCAGTTCACAGTCTGATAACTTGTCACCTGATAGC CATAGTAGTGCATACTCCTTTGGCACTGAACTTGGAAATCAGGGATGCAACTCGTCTAAA ATTGGGGCTAGTTCATTTCAGTTGTTTGGTAAGATCATACATATGAATCAGCCTGTTGAA AGTGGTTTTGATGATGTTGCTTGTGTAGAAGATGATGGTGGCAAGGAGTTCAATGAAGCT GAAGGTGTGAACAAGCCAACAGATCTTTCCTTGACTTACACGGCACTGCTCAACAGGTTT GGTGTCCAATGCCAAAGAGAATCAGCAGATGAAGAAACTTGCTCTTTATGA
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>Nl05g11480.mrna1 - Up_Stream_Len 2000 AACAACAACAATATTAAGAATCAAACAACAATAACAACAACAACAACAATATTAAGAAAA AAAATCAAAACTGCTTAAAAAAAAAATTGAACGTTTGGGCTCGTCGAACCCAGATGAAGA AGTTGGGTTCGTCGAACCCAGACGAAGCCGCTCTTCGTCTGGGTTAGACGAACCCAAACG ACCCCAGACGAAGAGTGGCTTCGTCTGGGTTTGATCGAACCCAGATGAAGAGAGTCTTCG TCGGGGTTCGATCGAACCCAGATGAAGAAATGCTTCATCTGTGTTAGGTTGTCTTTGTCT GGGTTCGATGGAGAAGGGAGAGTGAATCTGGGCAGAAGAGACTGAAGAAGAAAGAGAAGG GACGGAGAAAGGAAGACGGAGGAGGCGGAGAAGAATGAAGGAGATGAGAGATAGGTTTGA TCTGGATTCCAGATCAAATAAGAAACAGAAAAAATTAAGAAATTTAATTTTTTTTTAATT TCTTTTATTTTTTAATTTAATATTTTTCAAATTGATTTTTTTTTTTTGAAATCTGTTTTT GTATTAATTTATTGTTTAATTTAAACAAAAAAAAAGTAATAATATTTTTTTAAAAAATAT ATAATTACGTATATATGTGTCAATTTTTCATTGGTTAGATGATATATAATATTTTAATTT TATTAAGGGTAAAACAGTCATTTTAAGTTATAAGGGGTAATTGAGTCTTTTTCAAATTTT TGGTTAGTTTGACTGTTAGTTAACTACGGGTTTGGATCATTTTGAAGCGTTTTGGAAAAG TTAGGGATTAAAATAGCTGTTTTCAATAGATGTTTAAAATTTTGATATTTCGTAAAACCT TAGGGACTAAAATGAAGTTTCCCCTTGAAAAAACATTGACATGTCGGCAACAGGCATACC AGTACACTAGGGCATAGGGGTCCGATCCGTGCTTAGTCCTGTCAGTTGTGTTTTTGTGTT CAAATTTGCTAATCCGAATACACCATATGTGAGTTATTAACTCATCATCCATTCTCAATC TTCCCTGGTCGGGGCACGCATTAATTTTACAGTCAATTGTCCGCTTCCCGTCGTTATTAA ATTCTGTACTAACCGCCATTAATGTGTTCTCCGTATTGCTGCTAAATTAGAAATTTAGAA TGAATATCACTAAAGTCTACAATCTTATCAGGGTTATTTATGACATTTCATATTTACTCA ATACTTATATCTCACATTCTGATCTGATAATTTAATTAATATTTTTCAAAAAAATCAAAG ATAAATTACTATTAATGAGTATTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTAATGAGAAAATGACAAT TATTTTTCAACACACGAATTCCGTTGCAGGGTTAAAGATTTATACAACAAACAAACTCCT ATCCTTTGCGAACAAATTTGTGTACTCTCTACTTGATAGGCTCCCTGTCTCTTCTTACTC TCCTGTCTTCAAATCACCTGTGTCTTGTGGCTATTCTATCACAAAAATATTTAAAAACAA TTCTTGTAAAAATTAAATATCAAACTCTAAAATTAAAAAAAAAAACCAATATTGATTTGA TCAATTTTCAATATATAAAAAGATTAAAACATATATATAAAAAAAAAATCAATTAAGTAG AATTTCTCAAATTATATACTCGACCACAAAAATCTTAATAAGTAGAGTGTTGACAAGATA TTATTAAAAAAAAGTGTGCAATTGACGTTGATGGCATGATGTTGAAAAGAGGGTGGCCCA CGGCCCACATAAAGTGGAGGGTAAAAGTGTAAAAAACCGGTCTGGGACATACAGACTAGA GAGAAACAGAGCTCCGCTATATTGTTTAGGTGGCTGGCGGTTCTCCGACCCCAATACGTC TCTCGCTCTTGCCCTCCCCAGGACACACTAATGTACTCAGTCTCACACGCTATAATTACT GTTTTTAGGAGGGAGACACGCACCAGAATCCCACTCTATGTTAAAACTCTCTGATTTTTG CAAACCAAAAGCCCTAACTC
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>Nl05g11480.mrna1 GenomeSequence - ATGCCTCAGCAGCGACGCCCCTCTCCTTCCCAGCCAAGCCGGGTAGACCCGGCCATCTGG CGCGCTTGCGCCGGTTCTCTTGTTCAAATCCCGGCCGTCCATTCTAGGGTTTACTACTTC CCCCAAGGCCACCTGGAGCGATCCTCTCTCTCCCCTAACGTCCTCTCCTCTCTCAACATC TCCAGAGCCGTCATCCAATGCGTCGTCTCGCAGCTTCACTTCCTCGCCGACCCCGTCACC GACCAAGTCTTCGTCAAAGTGCTTCTCACGCCTGTCAACACTCTGGAGTCTTCGAGAGAG CAGCAGCAACAACAGCACCAAGTGGTGGAGGACAGGAATGTCGAGAACTACGTTCATGAC AATGTCGTGGCGCCGTTTGCTAAGATTTTAACGCCGTCGGATGCTAATAACGGCGGCGGC TTCTCCGTCCCGAGATTCTGCGCCGATTCGATCTTCCCGCCGCTGAACTACCAGGCGGAT CCTCCCGTGCAAACCCTGTCCATCACCGACATCCACGGCCACGTTTGGGATTTCCGCCAC ATTTACCGGGGGACGCCACGGCGCCATCTCTTGACCACCGGCTGGAGCAAGTTCGTCAAC CGCAAGAAGCTGATCGCCGGTGATTCCGTCGTTTTCATGAGAGATTCGATAGGGCGGCTG TTCGTCGGAATCCGGCGGGCGGAGAGGTATGGGAGCAGTGGAGGAGACGGTGCGCGGTGG GGGGAGCATTCGGGAGTGAAGGTGGAGGCTGTCACGGAGGCGCTGGAGAGAGCGTCGCTG GGGCTGCCTTTCGAGGTGGTGTATTATCCCAGGACTGGATGGCCGGATTTTATAGTGAGG GCTGATGTTGTGGAGGCCGCTATGAAGATCTTTTGGACGGCTGGCGTGAGAGTGAAGATG GTGACAGAGACGGAGGATTCCTCAAGGGTCACGTGGTTTCAGGGGACCGTTAGCGATGCT TCTATGCCCACTACTGGGCCTTGGTGTGGCTCTCCATGGCGGATGCTTGAGGTATAAATC AAATATGATATGTTATGACTTCTTTCAGTTTAAGTATGATAAAATAATATTATCTTTTGT ATTCAACCATGTTTCCTTATTAAAGCTGCATTGATATTGAATATGGATGTTATTGCTTCC AGAATACAAGATTATTCACGGCACAAGTGGGGTTTGTTCCATGATATTGAATATGGATGT TATTACTTCCAGAATATGAGATTATTCACGGCACAAGTAGGGTTTGTTCCACGTTTAGGA CAGGGGAATTCAGTTTGTTAGATGGCTTGTAATTAATACTGCATTGTGGAATGTTGTCAT TGTTTTGTGAATAAGATTCAGTGCATTAGATGGGTCTTTTATACTGGACTAGCAAGGGTA CACCATGTTTAGGACTATAAGGATGCAGCTTGATAGGTTGGTAATTTCAATTTTGAGTGG AAGGCATATTTATGAATGAATATGGCTTAACAACCCTTGGTCCCTTTGAGGAAAACTGAA TATTTCCACATGTTTTAATAATTGGTCTGATTTTGTGTTGCAGGAAGGGAAAAGAGGAAC AATTTTTTTGGTTGTGAATTCTAGTGTTTTGGGATGAACCATGATCAATATGGTACTAAA GAATATTTGTTTGACCATGTTGTAGCCTTTGCTTGGCTTTGAATTTTAGGAGGCAGTTTT CACATTAAATGTGAAAATAAATGCCTGAAAAGCCAATTTTGCAAAGCGCGCCTAGAATTG TGTTTATAGATTCTTTTGATGCAAAATTGTGAACAGATAGGTGGTCTTGATATGAATTTG GTTAAAAGTATAGAATTCAAAAATTAAAGTAAAGAAGTCATATGTATACTATTTTTTTCA CTGATCTTTATGTTAAATGCCTTGTCTCATCGCTATTAATTTCTCAAGTCTGTAGCTTTA TGTTTATGGTGTTTGTGCACTGTAAGCAACAATGTTACTGGATACATTACCTCAAATATT GAAGTTTAGCGGCTTGTTCTTTTATTAATCTTCTTACCCTTTTGAGACTGAAAATGCCTG TTTCAAATAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGACTGAATATGCCATTTTATTGTTCAA TTGAAGACATAGATCTTGTGCAACATAGTTTTCTGAAAATGATATTGCTCAACATATATT GTTGATTGCAAGCTATACTATAATCTTAATACAAGGTTATTTAAGCTTGCTTAAATTAGA TCCTGCTTAGAACTTGATTTGACTACTTTACATGGCATGTTATTATTTTATTTGAGTGAT GAGGAAACAATATAACTATTTATCTATATAGTTTAGGTCTCATAGTTGCAGATTTGCTGT GATGTTTTAGGATATGAATCTATGAAGTCATGAAAAGCAGTTAGATTAGTTTTTCTGTTT CTGTAACTTAACTAATATTTCTACATTCTTTTCCTTTTAGCCTATTAAGATTTTAAATTT TTGTCATAGGTTACATGGGATGAACCTGAAATTCTGCTGAACGTGAAGAGAGTAAGCCCT TGGCAACTTGAATTTGTGTCATCCTCTCTACCACTTCATACCCCTTTCCCCTCAGCAAAG AGATTGAAATTTCCTCAGAATTCTGGGTTGGTGACTGATGGAGAGGAGGACATCTTCTCT CCGCTGAGAGGATTAACTAATTCAACAATGGGGCAGATGAACCCTTCATCGTTGAATTGT AATACTTTTCCTGCTGGCATGCAGGGAGCCAGGCAAAATACTAATAGCTTTTTTAGTTTA TCAAATTTCATAAGTGAGAATACTCATCAGACGTGCACTGAGAATACCTCTGGCATCAAC ATTGTGCCAAAGTTGAAAAATGTGTGTACTGAGTTGAACATGGGCAGTTCACAGTCTGAT AACTTGTCACCTGATAGCCATAGTAGTGCATACTCCTTTGGCACTGAACTTGGAAATCAG GGATGCAACTCGTCTAAAATTGGGGCTAGTTCATTTCAGTTGTTTGGTAAGATCATACAT ATGAATCAGCCTGTTGAAAGTGGTTTTGATGATGTTGCTTGTGTAGAAGATGATGGTGGC AAGGAGTTCAATGAAGCTGAAGGTGTGAACAAGCCAACAGATCTTTCCTTGACTTACACG GCACTGCTCAACAGGTTTGGTGTCCAATGCCAAAGAGAATCAGCAGATGAAGAAACTTGC TCTTTATGA