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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
whz_016163-RA | GWHBECP00000011 | 4230515 | 4233394 | - | Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g37170 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
whz_016163-RA | 71 | 127 | PF02701.18 | zf-Dof | Family | 108.6 | 1.30E-31 |
whz_016163-RA | 392 | 418 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14 | 0.048 |
whz_016163-RA | 416 | 446 | PF12854.10 | PPR_1 | Repeat | 31 | 1.70E-07 |
whz_016163-RA | 418 | 448 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 35 | 1.30E-08 |
whz_016163-RA | 421 | 448 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 39.6 | 3.50E-10 |
whz_016163-RA | 451 | 477 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 26.6 | 4.60E-06 |
whz_016163-RA | 522 | 551 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14.1 | 0.045 |
whz_016163-RA | 545 | 599 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 22.5 | 9.90E-05 |
whz_016163-RA | 550 | 598 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 47.8 | 1.30E-12 |
whz_016163-RA | 553 | 583 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 19.9 | 0.00064 |
whz_016163-RA | 626 | 646 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 11.3 | 0.37 |
whz_016163-RA | 654 | 683 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 29.3 | 6.40E-07 |
whz_016163-RA | 694 | 717 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 10.2 | 0.81 |
whz_016163-RA | 727 | 751 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 12.3 | 0.17 |
whz_016163-RA | 769 | 831 | PF20431.1 | E_motif | Repeat | 75.9 | 2.20E-21 |
whz_016163-RA | 836 | 863 | PF20430.1 | Eplus_motif | Motif | 35 | 9.00E-09 |
whz_016163-RA | 867 | 959 | PF14432.9 | DYW_deaminase | Domain | 140.9 | 9.20E-42 |
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>whz_023011-RA GenomeSequence + GTGAGTTCTGTAAAACGACGTTGTAAAAAGAGAAACGGAATCGACTTTCCCGGCCTTTCA CGTATAAATGCTCCCGGTTTTTCCTGCTTTTCCATTTCGTTTTCTTCTCAAATCCAAACT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTATCTATCTTTCACGTCGAAACGCGTCGTTTAA TCGCTCTTCACGGTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGTCTTCAATTGTGTTTGCTG TATGTTAATAGTGCATTCAGTGAAAATAGCTTCGAAACGACATCGTCTTTCGTGTTTTTT GAAGTTGTACTAGTTCCAAACATACCGCCACTGGTACTGACGAATCGACGATTTTGTTAT GGTAATCGACGTTGCTGTCTCGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTCCGAGTTTGATCTTTTTAT TTTGTTGATTAATTTAATTTAATTTAATTCTTCCATAAATTGTGTATTGTTTGTTAGATC ACATTAGACATTGATATTCATACTTTTGTGTTGAAAATGGAAATGTCTACTTCTTATTTG TTTATTCAGCTTTTATATGGAATCTGTTGCTGAATCATCAAATATTAACATTTTATAAAT TTATGAACTCAATTATTCGATAGCTATATATCTTTATACAAATTATTAGTGAGGTACCTG GATTATTGGCTTGAATGTGTGATTACAGAACCTACACGATAACGTAATCTAGTAATATAA TATTGATAATGTTATCATTTTTAATTTTAAAATGTGACTGACTATAGGATATGCGTTTAA TGTTAACTACAAATATAATACGGATTAGTAATATGGTTTTACCTTAACATGTGACCATAG GACATATATTGACGTAATCCAGTAATATAATAGTGGAAATATTAGTAATATAATATTAAT GATCAGTACAATGTTACGGATATTGATTTAACATGTAACTATATGACGTATGTTAACTTA ATCTAGTTATAATATGATACAAATTATTAGTATGCTGTTACTATGATTATTGACTTTAAC ATGTGATTGTACGAGGTAGGCTCATGTAATTTTGTAATATTTTTAAGCTTTTGTTGGTAC ATAGTATCTAACCAACTGATTTTGCTGTTGAAGATGCCTGCTGCAGATTCCAATTCGTCT GACAGAGATGGGGAGCCTTTTATGGAAGTTGATCCGAGTGGTCGATTTGGGAGGTACAAT GATCTGCTGGGTTCTGGTGCTGTGAAGAAGGTTTACAGGGCGTTTGATCAGGAGGAAGGC ATAGAGGTGGCTTGGAACCAGGTTAGGTTGAGTCATTTCAGTGAGGATCCGGTGCTCATC AACCGGCTTCACTCTGAAGTTCAGCTGCTGAGGACGTTGAAGAACAAGTATATCATTGTT TGTTACAGTGTGTGGCTGGATGATGAGCGCAACACGTTGAACTTTATAACTGAGGTGTGC ACGTCGGGTAATCTGAGGACTTACAGGAAGAAGCATCGTCATGTTTCGATTAAGGCCTTG AAGAAGTGGTCGAAGCAGGTGCTTGAAGGGTTGGAGTATCTCCATACCCATGAGCCTTGC ATTATTCACCGTGACCTAAATTGCAGCAACATTTTCATCAACGGGAACATCGGTCAGGTA CTTGCCAGTACTTCAATTCGATTAATATAAATATGATCATTAGTCAACTCGGTGAGTCGT TTATAATCACTTGAAGATAGTACTTTTGCTTTTTAGGCTTCATTTATTTGATGGGATATA AACTTATCTATGTGTATACATGGTATTTTATTAGGTAAATTTAGGTGATAAATATACGTT ACGCTGTTGGCTGATGAGACCATGATTGAAATACTGTTGGAGAATTAACAGAATATAAAA AGAAAGAAAGTCGCCATGCTTTCTCCCATTTTTGGAGAGTTGCATCTAATTTCTAGTGTA GGACTTTGTAAGTTGTTATGCACTAGTTTCATTTACTTGGTTAGCAGACCTTCAGTAGAT GAACTATAAAACAAGCAGAAACAACTAATATTAAGTTTTTTAAGTCGTGTTTAGACCATT TTTCTCTTATTATTCCTCTGTTGTCGTAGGTGAAAATTGGGGATTTGGGGCTTGCAGCAA TAGTTGGGAAGAGTCATGCAGCCCATTCGATCATTGGGACACCAGAGTACATGGCACCAG AGCTTTATGAGGAAGATTACACTGAGATGGTGGACATATATTCCTTCGGATTGTGCTTGC TGGAGATGGTGACTATGGAGATACCTTACAGCGAATGCGACAATGTGGCTAAGATATACA AGAAGGTCACAGCTGGAATCAAGCCCCAAGGCCTGAACAAGGTAAAGGATCCAGAAGTCA AAGCCTTTATAGAGAAGTGCATAGCACAGCCAAGGGCCCGACCTTCAGCCTCTGAACTTC TTAAGGACCCCTTTTTTTCCGAGCTCAATGACGATGAGGCCGACCCAGATGCTTGACAAC GTCTCAAATGAATCATGTTCTTAAAGCTATATTGTAAGTCTCTTTCCTGAATTACACTAT TAGTTGGCAGGTTTCATAAGGATGTCTTGAAGCTACATCTCGTTGCTTTGAAATTGATGT CTCCTTTCAAAACATTGTACATAGTTAGTGGACTGCTATTATTGTTTTTCCACTTCAATC GTTTTAGTCCTTATGGTTAATAGTAATGCTACGTAACCCAAAAATTTATCCAAATTCATT GCACAAATTATGTGGCATGTGAATTGTCAAGATCTCATAAATCATAAGATGATGTAATAA TTAATGAGATGTTGACAACTCATTCATCACATCATTTGGACAATGAATTTAGATAAACTT TTGAGCTATGTAGCATTACTCTATGATTAATTGGGATGTAATGTAAATCAGTTTTACTAC TAGATATGGTATTTTCACGAGTCACAATTTTATTTAGCACCTCTAAATTTTTCTTAGCAT GTCCAAAGACAATTGCTCCTGTTGTTGAATGGCCCAAAAAAAAAGAAAGGTTCGTGCTAT AACTATATATGTGCAGGAGCTGAAGGCTATCTTGGGCTCTAGTATTTTAATCTGTTATCC GATACGGTATTATTTTTATTCAGTGACTTATTGAGTGTGAC