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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
whz_000056-RA | GWHBECP00000012 | 19690479 | 19694172 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
whz_000056-RA | 53 | 90 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 41.2 | 1.60E-10 |
whz_000056-RA | 190 | 248 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.9 | 3.80E-07 |
whz_000056-RA | 391 | 449 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.3 | 2.90E-07 |
whz_000056-RA | 465 | 520 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.9 | 3.90E-07 |
whz_000056-RA | 483 | 499 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.9 | 0.94 |
whz_000056-RA | 512 | 567 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.1 | 1.30E-06 |
whz_000056-RA | 549 | 592 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.7 | 1.80E-06 |
whz_000056-RA | 557 | 579 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.3 |
whz_000056-RA | 723 | 961 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 125 | 3.70E-36 |
whz_000056-RA | 724 | 1040 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 125.3 | 2.70E-36 |
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>whz_000056-RA - Up_Stream_Len 2000 TTCTTACTCTCTACATTTGGTTATTGTGATTCTCAACATTTTCAAAATAGCTAACAATAT AAAGAGTGATTAGAGCAATAAAATGTTATATCATTAGTATTTTTTATTTAGGACTATGAA TAGCTAATATGATCGGATATGCCTATACCCTCAATATTCGTTATTGAACCTTTATCAACC TTCCATGGTGCCTTACATTGAAGCCTGTCTTTCATCTTCTATCAAAGTGATTCTTAGTTT AAGAAAAAAATCATATACAGAAAGAAATTCCCAAGATTCTTTTAGTTGGTGGGACTTCAT TGATAGACTAACAGCAGACATTAGAATTCTTTAGTGTAAGATTAATCATGACAATGAATT TGTAATGATACAAATCACTAGAAGACAAAAATTCACATATTGAATTTCATACAAACATAC ACACTAGAGAAGCTCATTTTTCTTATAAATTAACAACTTTCTTCGTGTTATAAAATAAAA AAAATAAAATAGAAATAAAAGAAGATAGTTAACCAAAATAATAAACTATATAAAATTAAT AAGGTTAAAAGAGTATAAAAAATGAAACAAAAAATGGTAAGAGAGATAGAGAGCTCTTAA TTTTTATTTATATTCTTTCTTCTTTTTCTTACAAGAAAACAAACTATAAACTATATATAT ATATAGAGAGTAATACAAAGATGACATTGATGCTATAAAGTCAATTAGAGCAGGTAATCA TAATTACTAAAGATTGATTGCAAAACTAATTAATTGACTTTTGATAAGTTATGTTTATAT TTTTGTCTCTGTATGTATGGTTGGGAATCCAACAAAATATAATATAATAAAATATATATA TCATAACACTTCAACATTTTTGGATGAACTTCCCATTTTCAATGGTGTATGTTTAGTTAC TCTTTCTTTTTATGTAGTTAAAATAGTGATTTCTATGGTTTGTCTTTTGTCTTTTTTTTT TTTTTTTTTTCAGAAGTCTATCAAAATCTGTTCAAATATATATATTTTTTAAATTAACAT CAAATGAGTCAAAAGTCCAACAAGACCTGATACGACTTGCTGAGTCCAACCATTAATTTC AACACGTCTTGCTAGACATTTATTTAGTGGTAGGGTCATGATAATAATTCCAACCATTAA TTAAAATTTCATATTTATTGTTTACCTAACTTAGATAAATTTTGCAACTTTCTCAATTTC TAACTTACATAATACTTCTTCTCAAAAAAAAAAAAATCACATAATACTTTATGACCAACT GTTCATATTTTTTTAGACTTTTTTGTTTCTTCTTTGGAAAAATGAATGATCTTCTAACAA GAGTAAACTTTTTTCATGCTTCATATTATCTCTAACCATGCTAACTATCTATTATGTTTA ACAAAAAACCTAATGATGTGAGATTTTATTGACTCCAAAAATCTGTTCACATTCAAAGAT AACCACTTATGAGTAAATTATACAAATATTTAACTTTGTATATAATTTCCAAAACAAAAA AAATAAAAAATAAAAAATCATCCTTTACATATACGTATATTAAGTGGAAAACATGTTAGA ATAAATGAAGCCAATATGACACAAGATTTTTAAATATCTAAAATGTGAAAAATTTACTTT AATATATCGTTTTTAATAAACTTTAACAATATAATTATATTTTACTAATGTAATGAATAA GGAGAGTGCAGATGTATCGTATAGAGCTTAAAATTAAACTTCTTTTCTCAAAAGACTATT TTTGAATTTTTGCCTCGTGTATATATATATATATATATAGATATATTTATTTATATTTAT ATCTCTTTGATCAAGTGACTAGAGACCTTAGTGCGTTTCTTTGCTGAATTTTCAAGAATA ATCAGTTGCTTTGATGATTGCTCTGTAGAAACTCTAGCAAGAGATAAACAGTATTGTTGA CCCCCAAAAAATGAACCAAAGCTGTCCTACAGGACACCCTTCGCGGGTTTCCTCTATAAA GTCCACTCACATGAGCTTGG
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