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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Dil.12g002690 | Chr12 | 1929055 | 1934084 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Dil.12g002690.1.t1 | 46 | 70 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.4 | 1.80E-09 |
Dil.12g002690.1.t1 | 49 | 70 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10 | 1.1 |
Dil.12g002690.1.t1 | 50 | 70 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 24.6 | 1.70E-05 |
Dil.12g002690.1.t1 | 89 | 113 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.6 | 7.70E-10 |
Dil.12g002690.1.t1 | 92 | 112 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.7 | 0.72 |
Dil.12g002690.1.t1 | 134 | 158 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.5 | 3.90E-10 |
Dil.12g002690.1.t1 | 137 | 157 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.7 | 0.34 |
Dil.12g002690.1.t1 | 280 | 305 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 41 | 1.30E-10 |
Dil.12g002690.1.t1 | 284 | 304 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.5 | 0.00058 |
Dil.12g002690.1.t1 | 326 | 351 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.70E-08 |
Dil.12g002690.1.t1 | 330 | 350 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.9 | 0.3 |
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>Dil.12g002690.1.t1 ATGCCAGATAACCGACAAGTGAAGAGCAATGCTGTGTCAACTCAATCTGCTGATAACATT GAAGAAGCTATATGGAGGTTGAAAATTCATGATAATCAAGAAGGGGGTGGTGTCGCTCAG TACCCGGATCGCCCAGGTGAACCAGATTGTCCATTTTACCTAAGGACTGGGTTGTGTGGT TATGGAAATAACTGTCGGTTCAATCATCCTGTGAATGCTGCACAGGGTGCTCAATATAGA GAAGAGCTTCCTGAGAGACTTGGACAACCTGACTGTGGGTATTATTTAAAGACAGGGACC TGCAAATATGGATCGACATGTAAATATCATCACCCAAAGGATAGGAATGGTGCTGGACCA GTCTTGTTCAACATTCTAGGTCTTCCTATGCGTCAGGATGAAAAATCTTGTCCATATTAC ATGCGGACTGGATCATGTAAGTTTGGAGTTGCATGCAAGTTTCACCATCCCCAGCCTGGA ACTAGCTTACCAGGAACTGAAAATGCTGCATTGGGATCGATGGGGTCATCCATTCTGCCT TCATCTGGTCTATCTTATGCAGGTGGCCTTCCAACATGGTCATTGCCTAGGTCACCGTAT GTCCCTGGGCCACGTCTACAAGGGACACAAGGCATTTTACCTGTTATTGTTTCTCCTTCT CAAGGCATTGTAACTGCACCAGGCTGGAGCACCTACATGGGGAACATGAGCCCTTTATCT TCTACCGGTGTTCTTGGATCCAATCTCATTTACAACTCCAGGAATCAAGGTGAATTAGGT GCTGGTGGACAGGTGAACTTGTTACCAGCTACTGGTCTAAATTTACCTGAGAGACCTGAT CAACCAGAATGCCGGTATTATATGAACACTGGAACCTGCAAATATGGCTCTGATTGCAAG TTCCATCACCCAAAAGAAAGGATTGCTCCATCAACAGGAAATACTATAGGCCCACTTGGC CTTCCCTCAAGACCTGGACAAGCTGTGTGCTCAAATTACAGTATGTATGGTATCTGCAAG TTCGGTCCTACTTGTAGATTCGATCACCCCTTTGCAGGATATCCTTGTAACTATAGTTTC AGCCTTCCACCACTATCTGTATTGGATTCATCGCTCATGAATCATCAGGTCATACAAACA GCTCACACATCCGAGACTTCTCCTGCTATGTCATCAAAATACCCTGATTGGGTGCAAAAT TCTGATACTGCAAGTGTTAAACATCAGGTCCCTGATACGAAGAACTCTGCTACAACCAAT TCAGATGAGTCGCCTACACCACCGGATCACTCTCCACCTCATTCCATGCAGAATTCTTCA GAACCATCACATGATCAGTCTAATTGA
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>Dil.12g002690.1.t1 - Up_Stream_Len 2000 CTCCAATTCAACTCTCAATTTAACAAAAAAAAGGAAGTAAAGCTTAGTGGAAGTAGCGCT ACTGTGCTACTTCACTTATTTTTTATTTTTAAGGTTAGAACAAATTTAAAGATCAATTAG GATTATATGATATTTGACTCTGAAAGTGGATCGAACAGTAATTTTTATGTAGGAATGAGC ATCCCACATAAAGGTGACGAGGAAAAACCCATAAGAGGTGATGAGAAGACCTATACGTTA AATAATGAGATGTATTATTTCAACATAGAACTGTGTAGTGGTGCACGGGGACAGACATCC CCCAGCTACGTTGTGCCACTCCACTTGAAACTTATTTTCATGATATTTTCATAAATTGGA TTTTCGATATTTTTATTAAAACCGGAGTTTTTCCCTGGGTGCGGCCTGCGGGTAAGGTAG CATGTCGCAATCGGTAGCTTTTGCTCGGCGAGTAAAAATGGCCGTCCGAATCTCCACTTC TTAAAATCTGGGACCCACAAGAGACAAAAGCTCGTTTTTTCTATTTTTTTCCTCGGTTGT GGGTCCCACTCAATATCTCACATACTCCATATCTCACCACCACCGTTCACGTGCCCCATA TCTCACCTCTCTCCCCTCCCTTTGACGGCGGCGATTTTTCTCCTAAAAACAGAAAAAAAA ATAAACACATAAATCGAAAAATATATATTAAAAAAACAACTACAAAGATTATATATAGTA ATTTCGCGCCCGACTTTAATGTATAATAATAGTAACCCACAAAATTGTAAGGACATAAAT TGCCCCTGCCCCTTGCACCCCCCACCGATCATCACTGTAATGACTAAAGGTCAAAAAACA ATGTGTGTAGGGGTAGTTTCGTCAACTTGGGGGAAAATGGCTTCACAAATGGGTCCCAGT GGAAATTCAAATCCAGTGGTCCACACCTCATCGCCGCCTCCCAGGTTCGCGCCCTTTAAC GGTGATGATGATATTTTTCATTTTATTAATTATATTTTTCGCATATTTTTAAAAAAGAAT TTTATGAATTGAATTACAAGGACAATGTATAGTTTACTGTGACTTTCACGCTTTTTCTTT TTCGTCTTGTCCATTTGAGACACCCAAAAGACATAAATACCCTTACTGAGATAGTTTTGA TTCTCTTTCTTTTTCTATGATTAGGACACGATTTTGTTACTTTATTATTTGCCTTTTGTT AGACGACAAACATTTATCCAGCATTACTAAACACCCTAATATTCTTATAATTCCTGTAAC TCGTATCAGTTCACACAGATTATATAATCAATACCTATCATAGTTTTGATCAACTCCAAT AAATATGATCTAGAATCATAAATACTGTTGATGACCCGGCATGCTAAATATATTCTAACA TAACAAATTGTGCATCCCATAACTAAAATAACTTAAAATAGTAAATGATGGCTAAATTTG TAATTGGGCAAGGGATGAAAGCTCTCCACCCCCTAAAATAAAAAGTAGAAATAATTTGGT TGACAATACGGTTAATAACTACTAAAACAGAGTAGTTGTGGGGGCAAAACCGTCTTTTCT CCCCGCGAAAATAAGGATGTTATTATTCGTACAAGAGTCGAAACAAGTTCACTTTTTTAA TGTTATGTTGTGTTGTGTTTTATACATATAACAAAAAAAAAATTAAAATCAGTTTTTCAC ATTGAAGACACGAGATCCGAAAGTGCGTGTAACAAATACATGAGAATCGTAGAAAAAGAA AAAAAAGAATTTTTAATCAAATTGGAATATATTTTCAAGATTTCACTTTTCGATTCTTCA TTGTTTGTTTATCTATCAGTTGTTTGTATTTTTCTGGCAAAAAAAAGAGGAAAAAATCTT GCTAATTTTTTTTTTTTTTCCATGTTGATGATTTTTACTTGATTTTGTGTTAAGGGTTGA GAAATTGTTTCTGGGTTGTTTTTGTTTTTGGTTTTTGATTGTGAGTAGAAGAAAGTTTTG TGTTTTTGAGTGTGCCACCG
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>Dil.12g002690.1.t1 GenomeSequence - TTCACATTGAAGACACGAGATCCGAAAGTGCGTGTAACAAATACATGAGAATCGTAGAAA AAGAAAAAAAAGAATTTTTAATCAAATTGGAATATATTTTCAAGATTTCACTTTTCGATT CTTCATTGTTTGTTTATCTATCAGTTGTTTGTATTTTTCTGGCAAAAAAAAGAGGAAAAA ATCTTGCTAATTTTTTTTTTTTTTCCATGTTGATGATTTTTACTTGATTTTGTGTTAAGG GTTGAGAAATTGTTTCTGGGTTGTTTTTGTTTTTGGTTTTTGATTGTGAGTAGAAGAAAG TTTTGTGTTTTTGAGTGTGCCACCGATGCCAGATAACCGACAAGTGAAGAGCAATGCTGT GTCAACTCAATCTGCTGATAACATTGAAGGTAGTACAATTTTGTTTGTTTTTTCTATGCT ATTTTGGTTGATGATATGGGGATCTGATTTTGTTTGTTTGTTTGTGTTTGTGGGTTGTTT GATGGGATATGATTGTGTTTGGTTTTGTGATGATCATGAGTGGATGGATGGTTTTTATAT CGTGATCGACGTTTGCAATGTGTGTTTTGTGTTTTTTTGGTTGAAAAGTTTGAGACTTTG TTTGCAAGTTTGTGTTTATTTTGTTCATGTGGGGGTGTGTTTAATTCTTTTAGTAGCTGT GATTGTTGATACAAATGTATGTAATGAATTTTGGTTTGTAATTGTTGAGATTTGTCATGG ATGTTTTGATGGAGTATTGGAGGGTTCTTCTTTTTGATGTTTGTGATGTGGGTTTTTGGT TTTGAGGGCTGTGGTTGATGATGAAATGAATGTTGAGGCATTGAAAGATGATGGTTTTTG TTAATGGTTTAATTTTGAAGCTAAAAAGTGACAAAATCGGTTTCGAATAGAGTGTGGTAT 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