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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031852 | Chr4 | 33238827 | 33241938 | - | High mobility group B protein 14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031852.m1 | 31 | 101 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 63.3 | 2.50E-17 |
LITCHI031852.m1 | 33 | 101 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 67 | 1.60E-18 |
LITCHI031852.m2 | 31 | 76 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 36.6 | 5.50E-09 |
LITCHI031852.m2 | 33 | 78 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 44.2 | 2.00E-11 |
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>LITCHI031852.m1 ATGGCGAAGAAAGCTACCAAAAATCCAAAGTCGTCGTCTTCGTCGTCGTCGATTACGAGG AAGAGGAGGGAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCCCCAACTGCCTTC TTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCT ATGCGGGACATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAGACTATCACATATGAGGAAAAG GTCAAATATTATGATATAGCCACCGAGAAACGAGCGGAATTTGACAGAGCCATGGCGGAT TATATCAAGCGACAGGAAAGTGGTGAAGCTGAAGAAACAGAAGATGATTCTGAGTATGAT GGATGA >LITCHI031852.m2 ATGGCGAAGAAAGCTACCAAAAATCCAAAGTCGTCGTCTTCGTCGTCGTCGATTACGAGG AAGAGGAGGGAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCCCCAACTGCCTTC TTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCT ATGCGGGACATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAGACTATCACATATGAGGTAGCA CAACTCTTTTCGGGTTTAGTTAGCTTAATGGTTGGTAAGGTTACCATTAATAACAACCAA TTCAAGGAATATTATTGA
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>LITCHI031852.m2 CCCTTGTGAAATGTGAGAGGTTCCAACGGGAAATACATCAAACCTGAGGGGGGAGTCAAA AAGAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTTACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGC TGGTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTAGCCCTAATCTAAAACATCAGATGGCGA AGAAAGCTACCAAAAATCCAAAGTCGTCGTCTTCGTCGTCGTCGATTACGAGGAAGAGGA GGGAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCCCCAACTGCCTTCTTCTATT TCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCTATGCGGG ACATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAGACTATCACATATGAGGTAGCACAACTCT TTTCGGGTTTAGTTAGCTTAATGGTTGGTAAGGTTACCATTAATAACAACCAATTCAAGG AATATTATTGATGAATAACTTTATCTCTCTTTCGGGGTTAGTTATCTCACTGGTTGCTAA GGTTATCCATCAATAATAACCAATTTAATTCAAGAATGGATGACTTTATACAACCAGTAA GTTAGTAAAACAACTTTCAGGTTTAGATGACATTGGTTCTACTTCAATTTAATGTTTACT AGTACTCACTCACTGCTTATGTCTCTCAATTCAAAGGAAAAGGTCAAATATTATGATATA GCCACCGAGAAACGAGCGGAATTTGACAGAGCCATGGCGGATTATATCAAGCGACAGGAA AGTGGTGAAGCTGAAGAAACAGAAGATGATTCTGAGTATGATGGATGATGATGCTTAAGA TTTTTGTTCTTGGGCTGCTGATGTAAATTATTACACCTGGGTAGCTAGCTGCTATATGGT TATTGCTTTTAAGTTTGAATTTTCTATCATTAATGATGCTTTCTACCACTGTACCAATAT 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>LITCHI031852.m1 - Up_Stream_Len 2000 AGAGTTGGCAAGGCAGATACTGCTTAGCTTCATTTAAAGTCAGTACAACAACATGTAGAT GGGTCTAAAGCTAATGAGAAGAAGTTTGATTATCTGAAAAGTTATGCAAATGACACCAAC AATGCAATCATAAATGGCAAGACAACTTTGGCCTATTAGTCCCCTGATAACATGGAAGAT GAAAACATAAAACGTGGGGATGCCGAAGGATTTGTAGTTATGACAAAGCGGAGAAGAAAC CGACAATAGTTCCCTAATGTTGTATCTAGCCTGTATAATCAACAATCCATTTGTGCTTCT GTTCAATAAAGAATAGGGATGGTAAAAATACTTAATGCGATTCAAACCCGGGGAAACCCG GTCTATTCGAGATGGGTTTAAAGCAGAAAGTATTGATTCGTTTAAGCCACGGGTAGGGCA CCTTTAAAAAATTTCTGGTTAAGTTTGGGGCAGGCTGATCCAAACCGATCCGACCTGTTT CCATTTGTAATAAAGATATAATTGTTCTATCAAGTTTCTTTGCATCACCTTTGAATACTG TAGAAATGGTTTAAAAAATAGTGCAAATGAGGTTAGTGACATGCTTAATATTTGATTATG TTGTTTCAAATGTCCTCATAAGATGGTTTTTAATAATTTGCGCAGAAATAATTTTATTTT CGTTGTTAAGGGAGTTTGCTTGATAAACAAGTAATGGGCCAATAACATGAGTTTTTTCTT CTGTTCTATTCATTTTTGCAGTTTTAATCTCTTTGATTTGGCAGGTTATATTGTTTCAAA TGTCCTCGTAAGATGTTTTTGATAAAATGGCTTATGGGTTTAGCTCTACTGGGTCATGTT ATTAAAACCCAATAAATAATAGTTTGGCCTTATCTCAAACCCATTAAAACCGGTATCATC CATTAATGTCATAATTACTTCTAATTTCAATTGTACTGCAAAATAAAACCCAATAAATGT ATTACTAATTACATTTGCAATTGTAAAGAAATGCCAAAATGCATTAGAAGATAAGTGTCT TCAATTTAAAATATGTGTTTGCTTATTCAGACAATATTTGTTATTGAAGTTTTTCATAAA ATTGTTTTCATATATATGTTTATTTTCGTTTTAATTTAATTGTAGATATGAGTTATTGTG GCATTATAATATATTTGTTTGTATCGGATTGTTCATGTGCTTTTATATTTTCAATTTTGT CATAATTTTCTTTTTTTTAATCCCATAATTTTCTTATTTTAACACTTTATTTTGTATTTT TTTAATTCTTTAATTACTGAAAATTATAATTATAAAAGATCATGAATTAAATGAATGAGT TTTAGATTTGCATTTCCAAACCCAATAAGCTAAAGGAGGAGTTGGATTAGTCAAAATTTG ACTCTAACTCATTAACAATTTGACATGTATTCCCTTACGATAATTCTACTTTCTTCTTAT AGTTTGACATAATACAAAATTCTCCAATTTTTTTTCAAAATCGTTAGTATTCCTTTATTG ATTTATGAAATAAATTAAATACCCCTATAATGTATGAAAATATCTAAAAAAAAAAAAAAC TTTACCTTTAAAGTTTATATTAAAAATTAAAGTTTAACAGCTAATGTAAAAAAGCTAAAT TTATAGGTATTTTAATTATTTCGATTATTTCAGTAATGACGGTAACAATAAAGGGTAAAA TAAGATTTGTTAAAATTATAGAGAATAATTAACAATTATATTAAATTATAAGAGACAAAT TTTTTAAAATTATAGAAGATAATTAATGATTATATCAAACTATAAGAGATGAAAATGAGA TTATCCCTTCACAATTTGACATGCATTCCCTTGTGAAATGTGAGAGGTTCCAACGGGAAA TACATCAAACCTGAGGGGGGAGTCAAAAAGAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTT ACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGCTGGTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTA GCCCTAATCTAAAACATCAG >LITCHI031852.m2 - Up_Stream_Len 2000 AGAGTTGGCAAGGCAGATACTGCTTAGCTTCATTTAAAGTCAGTACAACAACATGTAGAT GGGTCTAAAGCTAATGAGAAGAAGTTTGATTATCTGAAAAGTTATGCAAATGACACCAAC AATGCAATCATAAATGGCAAGACAACTTTGGCCTATTAGTCCCCTGATAACATGGAAGAT GAAAACATAAAACGTGGGGATGCCGAAGGATTTGTAGTTATGACAAAGCGGAGAAGAAAC CGACAATAGTTCCCTAATGTTGTATCTAGCCTGTATAATCAACAATCCATTTGTGCTTCT GTTCAATAAAGAATAGGGATGGTAAAAATACTTAATGCGATTCAAACCCGGGGAAACCCG GTCTATTCGAGATGGGTTTAAAGCAGAAAGTATTGATTCGTTTAAGCCACGGGTAGGGCA CCTTTAAAAAATTTCTGGTTAAGTTTGGGGCAGGCTGATCCAAACCGATCCGACCTGTTT CCATTTGTAATAAAGATATAATTGTTCTATCAAGTTTCTTTGCATCACCTTTGAATACTG TAGAAATGGTTTAAAAAATAGTGCAAATGAGGTTAGTGACATGCTTAATATTTGATTATG TTGTTTCAAATGTCCTCATAAGATGGTTTTTAATAATTTGCGCAGAAATAATTTTATTTT CGTTGTTAAGGGAGTTTGCTTGATAAACAAGTAATGGGCCAATAACATGAGTTTTTTCTT CTGTTCTATTCATTTTTGCAGTTTTAATCTCTTTGATTTGGCAGGTTATATTGTTTCAAA TGTCCTCGTAAGATGTTTTTGATAAAATGGCTTATGGGTTTAGCTCTACTGGGTCATGTT ATTAAAACCCAATAAATAATAGTTTGGCCTTATCTCAAACCCATTAAAACCGGTATCATC CATTAATGTCATAATTACTTCTAATTTCAATTGTACTGCAAAATAAAACCCAATAAATGT ATTACTAATTACATTTGCAATTGTAAAGAAATGCCAAAATGCATTAGAAGATAAGTGTCT TCAATTTAAAATATGTGTTTGCTTATTCAGACAATATTTGTTATTGAAGTTTTTCATAAA ATTGTTTTCATATATATGTTTATTTTCGTTTTAATTTAATTGTAGATATGAGTTATTGTG GCATTATAATATATTTGTTTGTATCGGATTGTTCATGTGCTTTTATATTTTCAATTTTGT CATAATTTTCTTTTTTTTAATCCCATAATTTTCTTATTTTAACACTTTATTTTGTATTTT TTTAATTCTTTAATTACTGAAAATTATAATTATAAAAGATCATGAATTAAATGAATGAGT TTTAGATTTGCATTTCCAAACCCAATAAGCTAAAGGAGGAGTTGGATTAGTCAAAATTTG ACTCTAACTCATTAACAATTTGACATGTATTCCCTTACGATAATTCTACTTTCTTCTTAT AGTTTGACATAATACAAAATTCTCCAATTTTTTTTCAAAATCGTTAGTATTCCTTTATTG ATTTATGAAATAAATTAAATACCCCTATAATGTATGAAAATATCTAAAAAAAAAAAAAAC TTTACCTTTAAAGTTTATATTAAAAATTAAAGTTTAACAGCTAATGTAAAAAAGCTAAAT TTATAGGTATTTTAATTATTTCGATTATTTCAGTAATGACGGTAACAATAAAGGGTAAAA TAAGATTTGTTAAAATTATAGAGAATAATTAACAATTATATTAAATTATAAGAGACAAAT TTTTTAAAATTATAGAAGATAATTAATGATTATATCAAACTATAAGAGATGAAAATGAGA TTATCCCTTCACAATTTGACATGCATTCCCTTGTGAAATGTGAGAGGTTCCAACGGGAAA TACATCAAACCTGAGGGGGGAGTCAAAAAGAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTT ACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGCTGGTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTA GCCCTAATCTAAAACATCAG
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