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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031852 | Chr4 | 33238827 | 33241938 | - | High mobility group B protein 14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031852.m1 | 31 | 101 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 63.3 | 2.50E-17 |
LITCHI031852.m1 | 33 | 101 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 67 | 1.60E-18 |
LITCHI031852.m2 | 31 | 76 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 36.6 | 5.50E-09 |
LITCHI031852.m2 | 33 | 78 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 44.2 | 2.00E-11 |
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>LITCHI031852.m1 ATGGCGAAGAAAGCTACCAAAAATCCAAAGTCGTCGTCTTCGTCGTCGTCGATTACGAGG AAGAGGAGGGAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCCCCAACTGCCTTC TTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCT ATGCGGGACATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAGACTATCACATATGAGGAAAAG GTCAAATATTATGATATAGCCACCGAGAAACGAGCGGAATTTGACAGAGCCATGGCGGAT TATATCAAGCGACAGGAAAGTGGTGAAGCTGAAGAAACAGAAGATGATTCTGAGTATGAT GGATGA >LITCHI031852.m2 ATGGCGAAGAAAGCTACCAAAAATCCAAAGTCGTCGTCTTCGTCGTCGTCGATTACGAGG AAGAGGAGGGAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCCCCAACTGCCTTC TTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCT ATGCGGGACATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAGACTATCACATATGAGGTAGCA CAACTCTTTTCGGGTTTAGTTAGCTTAATGGTTGGTAAGGTTACCATTAATAACAACCAA TTCAAGGAATATTATTGA
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>LITCHI018107.m1 MQSESLSCCMKALSSLKEKVYNIQDLEVKEQTLEQDKTLVHKQATSVSTQMIADATDGRR KKGHKRGSKRKAVEDTLARWKMQNQLEVAANGAEEAQKTPPRRSKKGRRWGKWVAEVREP TQKSNVSKGTKGKRIWLGTFDTAIESALAYDRAARAMYGSGAHLNFSENSMESLNSPNKA LPVVTTRKLVAASTSYNSEEHKVNHHSLLYARGCSQSPVLRGSMENLDSYGVCVDNGLKV ESDCFEFFVNEELKEKPEDITGEPRGASIDFEVETSVFRKEKDRELEEIEKLCDWQLAKI KDGENCRIQWLNGFNFKTSNDVKVEMPTKKEEMLGKPLERTVLLTGDELLSNNNSILQHE GNHSCNGSTTTSMDNRDCGSSAGLSCALDYMQEIDSELGLNHAAFYVTS.
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>LITCHI018107.m1 CTACAAAAGTACCATTTCAATGCAATCTGAAAGCTTGTCTTGTTGCATGAAAGCTCTCTC TTCTTTAAAAGAAAAAGTATACAACATCCAAGATTTGGAAGTGAAAGAGCAGACTCTAGA GCAAGACAAAACGTTGGTACACAAACAAGCAACATCAGTTTCAACACAAATGATTGCTGA TGCTACTGATGGGAGGAGGAAGAAGGGACATAAGAGAGGCAGCAAGAGAAAAGCAGTGGA GGATACTCTTGCAAGGTGGAAGATGCAGAACCAACTTGAGGTGGCTGCAAATGGAGCAGA AGAGGCTCAAAAGACTCCCCCGAGGCGCTCGAAAAAGGGCAGGAGATGGGGCAAGTGGGT TGCTGAGGTTCGCGAGCCTACTCAGAAGAGCAATGTGTCGAAAGGTACTAAAGGGAAACG GATTTGGCTTGGGACCTTCGATACAGCCATTGAATCAGCTCTTGCGTATGATCGAGCTGC AAGGGCTATGTATGGTTCTGGTGCCCATCTCAACTTCTCCGAGAACTCTATGGAATCACT AAATAGCCCCAACAAGGCGTTGCCTGTGGTTACTACTAGAAAATTGGTAGCTGCTTCAAC ATCATATAACTCTGAGGAGCATAAGGTGAATCATCATTCCCTTTTGTATGCACGCGGTTG TTCTCAATCGCCTGTACTAAGAGGATCTATGGAAAACCTTGACTCTTACGGTGTTTGTGT TGACAATGGCTTAAAGGTTGAATCAGATTGTTTTGAGTTCTTTGTAAATGAGGAATTGAA GGAGAAGCCAGAGGATATTACAGGAGAGCCTAGAGGTGCATCCATTGATTTCGAAGTTGA GACATCTGTATTTAGAAAAGAGAAGGATAGAGAACTTGAGGAAATTGAGAAGCTCTGTGA CTGGCAACTAGCAAAGATCAAAGATGGTGAAAACTGTAGAATCCAATGGCTTAATGGTTT CAATTTCAAGACTTCAAATGATGTGAAAGTTGAAATGCCAACGAAGAAGGAAGAAATGCT GGGAAAACCTCTAGAAAGAACAGTTTTGCTTACTGGAGATGAATTGCTTAGCAATAATAA CTCTATATTACAACATGAGGGTAATCATAGTTGTAATGGATCGACAACAACTTCAATGGA CAACCGGGACTGTGGAAGTTCAGCTGGTTTATCATGCGCCTTAGATTACATGCAGGAGAT AGATTCAGAACTGGGTTTGAATCATGCTGCTTTTTATGTGACCTCCTGATGATTTTTTAC GAAGACAGTATTGCATTGTATTGTAAGCTTTGTTACACTTTCGTATTCGCCCATGCTTTC TCTGCGATGAACATTTGGTATAAGTTCATGCTTTCTCCTATCGGTGGAAAACATGACTTC AATTACCTTATATAGTTAAGTAGTTATATAATGTCTCACATCTATGATTTATGAATTCAG AGGTTTTTGTTTCTCTTTAGTTAGTTTTAAGTCTTAACTCAGTCATGTATCAAATAGTCG TTGAAATTTCCTTGTTAGTTCATTGTTGCTTAGATAATACAGAAAGAGTTTGCATAAAGT AAATGGAAACAACCAACCACGATTTCAAGAGTCACTGTTAATTGAGAAACTATACATCAT ATATCAATAAACTTTACAGCACGTTTTCTAACCGGTATCAATTTAAC
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>LITCHI018107.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTGGTGGGAGTAGAACCCACGCCTACACACGCGGCGTGGGGGCTGCTGGCGCCAACGGCG CCAGTAGCCAAATCTTGTGTGTAGGTTTTTCACTTTATCCTTTTTGTGATTGTGATATGC CTGATGATGGAAAAAAAATCAAGGAAGTTTTTATCATTATCTTAAACTATAATAGGTATT TTTTGAAAATTTTTAAAAATTATAATAAATTTTTAAATATTTTTAAATTAGAAAAAAATA GGAAATCCAACTATAGAGGTTTTTAATTAAAGTAAAAATAGGATTATCATTTAAAATAAA CTAAATGAACAACTTGTGTGTTATAAACAGCAAGAAAAGCGTACCCATCCACTTGTCCAG TGCCAGTCCCAACTTCGAAGGAGAGTTTATTTCGGGAATTATAATCGAAGGACAAATTCC GTCATGTTTCTATTTATGACATGGCAGCTTTTTAATTATTTATAAATTATAATATGTTAT TCATTTCACCGCAGCCGCAATTTCATAAAAAGGATTTGATGGTTACCGGTACAAAATTAA TTGGCGAGTTTGGATTTAACAATCAGTCCTGCAAAGTGAAGTCTGCACCGCGAAGAAAAG GACGTATGGCCGTCTCTGGTGTATCAAATTTGCCATCATTTTTATGTAAAAATATCTTTA AAAAATATTTTATATATAATTTTTTAATTAATATTAATTTATTTATTTTATATAAAATTT TATTCTTAAATAATTATTCATAATATATTAAATAATTATTAAATACTTATAATTTTTTTA ATTTTTTTTATAATAAATTATTCTCATTATATTTCTATCTAATTTTTTAATCACTTAATA TTTTTCAATTCATTTTTATTCAACTAATTATTTATCTATCTCATTTTTCCAACTATTTTA TTATCCACTCCATTATAAAATCTTATTCTTAAATAATTACGCATAATATATAAAAAAAGT TATTAATTTCTCACATAATTTTTTTAATTTATTATAAAATATTGTTATCATTAATAAAAT ATATTTGTTTCACCAAAAAAAAAAATGATGGTTTTATCCGAATCATTAATCTAACACTAT CCTAAGTATGATACAAAAATCTAACATTATATGATCTCTACCGTTAGATAAAAAGTAGTT TGATCCTAACCATTAAACGACATTCTTATCTCTTCCACACTCTATCCTAGGTCTGACATA AAAATCTAACATGATATGATCTCTACCGTTGGATGAAAAGTGGTTTGATCTTAATCGTTA AACGATATTCTTATTTCTTCCACACTCTATCCTAAGTCTGACATAAAAATCTAATATGAT ATGATCTCCACCGTTGGATGAAAAGTGGTTTGATCTTAACCGTTAAATAGTATTCTTATC TTTTCCACACACTATCCTAGATTTGACATAAAAATCTAACATGATATGATTTCCACCGTT GGATGAAAAGTGGTTTGATCATAACCGTTAAACAGTATTCTTATCTCTTCCACACACTAT CCTAGATCTGACATAAAAATCTAACATGATATAATCTCCACCATTTGATGAAAAATAGTT TGATTATAACCGTTAAACGGTATTCTTATCTCTTCCACACTTTATCCTAGGTTTGACATA AAAATCTAATATGATATGATCTCTACCTTGGATAAAAAGTGGTTTGATCCTAACCGTTAA ATGATATGTTTATCTATTTCACAATTGATCTATAAATAATGATTATTTCTCAAAATTAAA ATATCTTTCTCTTTTAGTTCCAATTAGTAAACATATATATTTACAAAAATATCATTAATT AAGAATTTAAGTGATAAATCTAAAAATATTTTACAAAGTACTTCACATTCGAATGAAGAG GACCAACTCCTTTGTCATGTATGTCTTGATGTTTTCCAAAATCCAATGATAGGCATAAAC CATTTCAATACAATCTGAAAGCTGCTTGGTATCCATATCTCAATAGAATTTGTTATATAT ACTACAAAAGTACCATTTCA
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>LITCHI018107.m1 GenomeSequence + CTACAAAAGTACCATTTCAATGCAATCTGAAAGCTTGTCTTGTTGCATGAAAGCTCTCTC TTCTTTAAAAGAAAAAGTATACAACATCCAAGATTTGGAAGTGAAAGAGCAGACTCTAGA GCAAGACAAAACGTTGGTACACAAACAAGCAACATCAGTTTCAACACAAATGATTGCTGA TGCTACTGATGGGTGAGTTTTCTTGTGGTTTTGGAATGATAAAGCTGTTGTATAAAGGGT GTAGCTATCTAAATTACCAAGATTATGAGCTTGTGTTCCTTTTTGTTGATGTAATAGATA AATTTTAAGAATTGAAGATTGTGTAAACTGTGATCATGTTGTTGAGAAACTTTTATCAAT TGTGTTCAAACATATGGGGTTGTGAAGCGGTGTTTGAGTTGTTAGGACCTGAGTACTTAG TTATGGATATTGGTTTCAGGAGGAGGAAGAAGGGACATAAGAGAGGCAGCAAGAGAAAAG CAGTGGAGGATACTCTTGCAAGGTGGAAGATGCAGAACCAACTTGAGGTGGCTGCAAATG GAGCAGAAGAGGCTCAAAAGACTCCCCCGAGGCGCTCGAAAAAGGGCGTATGCCAGGAAA AGGAAGACCTGACAACGCGGTTTGTGGATATAGAGGTGCTAGGCAGAGGAGATGGGGCAA GTGGGTTGCTGAGGTTCGCGAGCCTACTCAGAAGAGCAATGTGTCGAAAGGTACTAAAGG GAAACGGATTTGGCTTGGGACCTTCGATACAGCCATTGAATCAGCTCTTGCGTATGATCG AGCTGCAAGGGCTATGTATGGTTCTGGTGCCCATCTCAACTTCTCCGAGAACTCTATGGA ATCACTAAATAGCCCCAACAAGGCGTTGCCTGTGGTTACTACTAGAAAATTGGTAGCTGC TTCAACATCATATAACTCTGAGGAGCATAAGGTGAATCATCATTCCCTTTTGTATGCACG CGGTTGTTCTCAATCGCCTGTACTAAGAGGATCTATGGAAAACCTTGACTCTTACGGTGT TTGTGTTGACAATGGCTTAAAGGTTGAATCAGATTGTTTTGAGTTCTTTGTAAATGAGGA ATTGAAGGAGAAGCCAGAGGATATTACAGGAGAGCCTAGAGGTGCATCCATTGATTTCGA AGTTGAGACATCTGTATTTAGAAAAGAGAAGGATAGAGAACTTGAGGAAATTGAGAAGCT CTGTGACTGGTATGGCTTCAATGATATGAACAACTGCTTGCAAAGTGAATTGGAGAATGT GGGATGTGAATCAAGGATTGATTGTGAGCGTTTTGGTGATATCGAATTTCAGGCAACTAG CAAAGATCAAAGATGGTGAAAACTGTAGAATCCAATGGCTTAATGGTTTCAATTTCAAGA CTTCAAATGATGTGAAAGTTGAAATGCCAACGAAGAAGGAAGAAATGCTGGGAAAACCTC TAGAAAGAACAGGTTTTAGTGGCATAACCAGCTTCAATGATGTACTCAAATCACTTGGAT AATATGTTAATAGGTATTTGCCAGAAAAATCTTTTTCTTTCAGGATCAGAATTTTACTAA ATTTCTATTTTTTAAATAAGGTTAAATTAGAGAAAATTCTTCAATCATTTTCAGAAAACT CTTTATTTATTTATTTTTTAATCAGATCGGTCTTTTTGATAAAATCAAAATTACTGAAGT AATGACAAAAGAATCTTTACTATTTACTTTATCACCAAAATCAAAAGTTATTGAAAAATT ATTACAAGATAATAAAGAAAGAATCTTTATTGTTCTCTAAAGATTTTAAACGTACTGAAC AATTGTCCTTTCTGTAATAATTATCTCTTATAATCTTCTTATCTTCCACGTTTTGTGAGA ATTATCCTTTGTAATTGTCTTGTTTCGACCTTATCCCTAAGCTCTAACTTCATGTATATA TATCCTTCCTAATAAAAGAAAGATGCGGGCACACCTACGCTGCTTTCTGTTTGATTGATA ACAGCTATAACTATTGCTCCTATATGGATGTCTGAAAATTTGTTTTTCTTTAGCAGTTTT GCTTACTGGAGATGAATTGCTTAGCAATAATAACTCTATATTACAACATGAGGGTAATCA TAGTTGTAATGGATCGACAACAACTTCAATGGACAACCGGGACTGTGGAAGTTCAGCTGG TTTATCATGCGCCTTAGATTACATGCAGGAGATAGATTCAGGTCAAGACATTTCGGATTG CTCCAGACTTGATTTTGATACTGGCTATGTGAACTAGCGAGAGAGAGATGATTGTGGTTT CAGAGTTAGGATTCTAAATACATCAGATGCTTGACATTGATGTTTGCTGATTTTGTTTCA TCTGCCTGTGAACAGAACTGGGTTTGAATCATGCTGCTTTTTATGTGACCTCCTGATGAT TTTTTACGAAGACAGTATTGCATTGTATTGTAAGCTTTGTTACACTTTCGTATTCGCCCA TGCTTTCTCTGCGATGAACATTTGGTATAAGTTCATGCTTTCTCCTATCGGTGGAAAACA TGACTTCAATTACCTTATATAGTTAAGTAGTTATATAATGTCTCACATCTATGATTTATG AATTCAGAGGTTTTTGTTTCTCTTTAGTTAGTTTTAAGTCTTAACTCAGTCATGTATCAA ATAGTCGTTGAAATTTCCTTGTTAGTTCATTGTTGCTTAGATAATACAGAAAGAGTTTGC ATAAAGTAAATGGAAACAACCAACCACGATTTCAAGAGTCACTGTTAATTGAGAAACTAT ACATCATATATCAATAAACTTTACAGCACGTTTTCTAACCGGTATCAATTTAAC