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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031830 | Chr4 | 32817313 | 32818499 | + | High mobility group B protein 14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031830.m1 | 18 | 89 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 44.2 | 2.30E-11 |
LITCHI031830.m1 | 20 | 89 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 38.1 | 1.70E-09 |
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>LITCHI031830.m1 ATGATTGAAATTCGACAGAGGAAGAGGAGGAAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCA AAGAAACCCCCAACTGCCTTCTTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAG CAGAATCCTCATGTGAAGTCTATGCGGGACGTATGTTGTTCAATTACTCACTCACTGCTT ATGTCTCTCAATTCAAAGGAAAAGGTCAAATATTATGATATAGCCACCGAGAAACGAGCG GAATTTGACAGAGCCATGGCGGATTATATAAAGCGACAGGAAAGTGGTGAAGCTGAAGAA ACTGAAGATGATTCTGAGTATGATGGATGA
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>LITCHI031830.m1 CTTATGAAATGTGAGGGGGTCCAAGGGGTGATACATCAAATCTGAGGGGCGGCTGAAAAA GAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTTACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGCTG GTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTAGCCCTAATCTAAAACATCAGATGGCGAAG AATGCTACCAAAATTCAAAGTCGTCGTCGTCTTCGTCGTCGATTACGGTGAGTAGTGTGG TCTCCGTTGTTTAAACTAGCATGTATAGTCTGAGTGAAATTGAAGGAATTAATGATTGAA ATTCGACAGAGGAAGAGGAGGAAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCC CCAACTGCCTTCTTCTATTTCTTGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCT CATGTGAAGTCTATGCGGGACGTATGTTGTTCAATTACTCACTCACTGCTTATGTCTCTC AATTCAAAGGAAAAGGTCAAATATTATGATATAGCCACCGAGAAACGAGCGGAATTTGAC AGAGCCATGGCGGATTATATAAAGCGACAGGAAAGTGGTGAAGCTGAAGAAACTGAAGAT GATTCTGAGTATGATGGATGA
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>LITCHI031830.m1 + Up_Stream_Len 2000 GCTTAAATTACTAAGAATAAAAGGAAAAAAAAAATTAGACAATTAAGCTCTTACAAATAG CAAAATAAATAATAAAATTGACAACTAATTGTCTTGTAGAATAATTGGTAAGAAATTAGC CCCATTTTTGGAAAGTCTTGATAACCAAGAATCTTCTCCATATTGGAAAGTTTTGATGAC CAAGAAAATGCTCTATATTGGAAAGTCTTTCATTAGCAGCAAATTAGCTATAATTAACCC CATCAATTGCTTCAATTAAACTAATTAAACTTTGCTCTTATTTTGGGCCCATCTTGGAAT TCACCATTTTAGAATCAGCCAAAATCTTTTGAATCAATCCATTGAGTGTTTTTTTGAACC TCTTAGCCCTTACCCTTGTAGTTGGCCCAACTGGAATATGCAATGGATCCTTTGGTGATG CTTCTTTGTTCTCATCACATCACCTTTGAAGACTGTAGAAATAGTTTTAAAATAGTGTAG AGGAGGTTAGTGACATGCTTAATATTTGATTATGTTGTTTCAGATGTCCTCATAAGATGG TTTTTAATAATTTGCGCAGAAATAATTTTATTTTCGTTGTTAAGGGAGTTTGCTTGATAA ACAAGTAATGGGCCAATAACATGAGTTTTTTCTTCTGTTCTATTCATTTTTGCAGTTTCA ATATCTTTGTAAATGGCAGGTTGTATTGTTTCAGATGTCCTCCTAAAGATGTTTCTGATA AAATGGCCTATGGGTTTAGCTCTACTGGGTCATGTTATTAAAACCCAATAAATAATAGTT TGGCCTTATCTCAAACCCATTAAAACCGGTATCATCCATTAATGTCATAATTACTTCTAA TTTCAATTGTACTGCAAAATAAAACTCAATAAATGTATTACTAATTACATTTGCAATTGT AAAGAAATGCCAAAATGCATTAGAAGATAAGTGTCTTCAATTTAAAATATGTGTTTGCTT ATTCAGACAATATTTGTTATTGAAGTTTTTCATAAAATTGTTTTCATATATATATATATA TATATTTTTTCAGTTTAATTTAATTGTAGATATGAGTTATTATTCCATTATAATATATTT GTTTGTATCAGATTATTCATGTGCTTTTATATTTTCAATTTTGTCATAATTTTCTTTTTT TTAATCCCATAATTTTCTTATTTTAACACTTTATTTTTATTTTTTAATTCTTTAATTACA AGAAATTATTAATTACTGAAAATTATAATTATAAAAGATTATGAATTAAATGAATGAGTT TTTTATTTTCATTTCCAAACCCAATCAGCTAAAGCAGGAGTTGGATTAGTCAAAATTTGA CTCTAAACCCTCAACAATTTGACATGTATTCCCTTACGATAATTCTACTTTTCCTTTATA GTTTGGCATATTACAAAAATCTTTAATTATTTTAAAGATAGTTGATATCCCCTTATCAAT TTATGAAATAAATTAAATACCCCTATAATGTATGAAAATATCCAAAAAAAAGTCTTACCT TTAAAATTAACCTTAAAAATTAAAGTTTAGCAGTTAATATGAAAGGACAAAATTATAAAG ATGTTTTGATTATTTCAATCATTTTAATAACAACAGCAATAATAGGGAATGAAATAAAAT TTTTTAAAATTATAGAAGATAATTAGTAATTATATCAAAATATAGGGGAGGAAAATAGGA TTATCGCTTCAAAATTTGACGTGCATTCCCTTATGAAATGTGAGGGGGTCCAAGGGGTGA TACATCAAATCTGAGGGGCGGCTGAAAAAGAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTT ACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGCTGGTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTA GCCCTAATCTAAAACATCAGATGGCGAAGAATGCTACCAAAATTCAAAGTCGTCGTCGTC TTCGTCGTCGATTACGGTGAGTAGTGTGGTCTCCGTTGTTTAAACTAGCATGTATAGTCT GAGTGAAATTGAAGGAATTA
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>LITCHI031830.m1 GenomeSequence + CTTATGAAATGTGAGGGGGTCCAAGGGGTGATACATCAAATCTGAGGGGCGGCTGAAAAA GAGTAGTAACAGTAATTGAATGCATAAAGTTACAAAAAGAATACTAGTGTACACGTGCTG GTTGCTTGAAAAGTGAATGCACACAATTTTAGCCCTAATCTAAAACATCAGATGGCGAAG AATGCTACCAAAATTCAAAGTCGTCGTCGTCTTCGTCGTCGATTACGGTGAGTAGTGTGG TCTCCGTTGTTTAAACTAGCATGTATAGTCTGAGTGAAATTGAAGGAATTAATGATTGAA ATTCGACAGAGGAAGAGGAGGAAAACTGCTAAGTTTGATGTCAAGAAGCCAAAGAAACCC CCAACTGCCTTCTTCTATTTCTTGTATGTCTTTGTTCCTAGTCTCTTGTTTTGTCTTTCT TTCTTTCATGTTCTGTTGGTGTCTTTGTAATAACTGTCTTTCTCTCTCCCTCTCTCTTTC TGTTAAGGGAGGATTTCCGCAAGGAATTTCAAGAGCAGAATCCTCATGTGAAGTCTATGC GGGACGTATGTTGTTCAATGTTTTTTTCATTTCCATTTCTATTATTATTATTTTCAATTC AATCCCATGAAAAGAAATTTTTGCTTTCAGATTGGCAAGGCATGTGGAGACAAGTGGAAG ACTATCACATATGAGGTAGCACAACCCTTTTCAGGTTTAACTGGGTTTAGTTAGCTTACT AGTTGGTAAGATTACCATCAATAACAACCTATTCAAAGATTATTATTGATGGATAACTTT ATCCCTCTTTCCGGTTAGTTATTTCACTGGTTGGTAAAGTTATACATCAATAACAATCAA TTTAATTCAAGGATTGTTATAGATGGACAACAAGTTAGTAAAACAACTTTCAGGTTTAGA TTACATTGGTTCTACTTCAATTTAATGTTTACTAGTACTCACTCACTGCTTATGTCTCTC AATTCAAAGGAAAAGGTCAAATATTATGATATAGCCACCGAGAAACGAGCGGAATTTGAC AGAGCCATGGCGGATTATATAAAGCGACAGGTACCTTTTCCTTTCATCTTTGTTAATGCT TGCTGTTGTTTGTATTGTACCATGTTGTTGCAATTCAATAATTAAGCCACTTACAGGAAA GTGGTGAAGCTGAAGAAACTGAAGATGATTCTGAGTATGATGGATGA