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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031197 | Chr4 | 18690216 | 18697824 | + | "Transcription termination factor MTERF6, chloroplastic/mitochondrial " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031197.m1 | 5 | 50 | PF02536.17 | mTERF | Family | 29 | 5.40E-07 |
LITCHI031197.m1 | 51 | 104 | PF02536.17 | mTERF | Family | 43.1 | 2.70E-11 |
LITCHI031197.m1 | 104 | 173 | PF02536.17 | mTERF | Family | 77.6 | 8.40E-22 |
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>LITCHI031197.m1 ATGATGGGCGACATTAAGGATGTTAGAAGAAAACTGTTTACTTTTGAGGAGGTCGGTGCC ACGGATAAAGATGTTGGTAAAATGTTGCTAAAGTATCCATGGATCCTTTCAACAACCATT CGAGAAAATTATAAAGAGATTCGCTTATATATACTTGCTCGCTGCCCAGAACTTTTTGCT GCTAGCATCGAGAAAACTCTGAAGAAAAAGGTTGAATTTCTATACAGCATTGGAGTTTCT AAAGACCACATACCTCGAGTTATCAATAAATATCCGGAGCTTCTTTTTTGGGACATCGAC AGAACCTTACTTTCTATATTCTCTCCTCTGCTGGGGTACAGCATTGACGAGGTACTACAA CCGAAGGTAGGCTTCCTGGCAAACACAATGGACGAGCCACTAAAGGAGGTAGTGGATTAT CCGAGGTATTTTAGCTATTCATTGGAACAGAAGATAAAACCCAGATTTCGGGTGCTAAAA GTAAGAAATGTTGAATTTAGCTTAAAAGATATGTTAGAGTTTATTATTATATGTGGGTAG
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>LITCHI031197.m1 ATGATGGGCGACATTAAGGATGTTAGAAGAAAACTGTTTACTTTTGAGGAGGTCGGTGCC ACGGATAAAGATGTTGGTAAAATGTTGCTAAAGTATCCATGGATCCTTTCAACAACCATT CGAGAAAATTATAAAGAGATTCGCTTATATATACTTGCTCGCTGCCCAGAACTTTTTGCT GCTAGCATCGAGAAAACTCTGAAGAAAAAGGTTGAATTTCTATACAGCATTGGAGTTTCT AAAGACCACATACCTCGAGTTATCAATAAATATCCGGAGCTTCTTTTTTGGGACATCGAC AGAACCTTACTTTCTATATTCTCTCCTCTGCTGGGGTACAGCATTGACGAGGTACTACAA CCGAAGGTAGGCTTCCTGGCAAACACAATGGACGAGCCACTAAAGGAGGTAGTGGATTAT CCGAGGTATTTTAGCTATTCATTGGAACAGAAGATAAAACCCAGATTTCGGGTGCTAAAA GTAAGAAATGTTGAATTTAGCTTAAAAGATATGTTAGAGTTTATTATTATATGTGGGTAG
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>LITCHI031197.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCGGCTTGTAAAACACTTCGTCATAGCAACATTGTGCACTTAAAGATCTGCGTGCACTAA AAGTTTTCGGACGTGTTTCCCATAAGATATCAACATTGTTGTTCTGTTAATATGTTTTCG ATATAAATGGCATCTTTGGCTATGAAATTGTCTGGTTTATTCAGCGTGCGTATAGCTAAG ATTGCATTTGTGCATGTATAACAATATTATTCTTCCACTCAACGTTTTGACGGCATTTTT TTTTTCCATATGATCTATTATCAATTGCATAAAATTTTCTCTTCAACATCTGATCTTCAG TGTTGAAATTTAAGGTTGTTTGACTTGATTTGGTTTTTCTTATCTTCCAGTGCCTCTTCT CCATGTCGGATATGGTTTTGGAGCTTCATTTGTTGCCCTGTGTGCCCAGTTGGGTGGTGG AATATACACATAAGCGGCTGATGTTGGGGCAGACCTTGTTGGAAAAGTAGAGCAAGGCAT ACCAGAAGATGATACTAGGAATCCTGCAGTTATTGCAGACTTAGTAATTTTTCACTCATC TTTGTTGGCACCCTTGGTGAAGGGCCTGTACATTAGTTTCTGCGGCTTGCTTCTGTCATT CAATTTTGTCTATTGTCCAAATTAACAATCTTATAATGTATTTTGTGTAAACAAAATGGA AGTACAAGTTAATATGAGAAGCGTATTGAGTGATCTTACAAAATTTTATTTGCATCACGT TTAGGTTTCTTTGAGGAAGAACCAATAAGGTACTGTAAACTATGTTTCAATTTATGTCAG CACAAAATTTTAAGGTGGCTGTTATGTTTGTTTACAGTATTTCCTTCCAAACTTGTTTTT GATGTAAGGTAAAGAGTCTGATCCTAGTTTCAATGTTATATAGTCGTAATAATGTATGCG AATGTAGATGTTCTGAGTTCTGTTCCTATATGTTTTTTTTCAGTCAGTGGGTTTGCTAAG ATTGGCTTCACTGTCAGTAGAGAAGAGTTTAGTTATTATAGTTTGAGGAATGCTGTTAAG CTTTTTGGGATGGCCTTGATTAATATGACTGGTTTTAATTTGTACAGAACTTAACTTTGG GATTCTTAGTGCTCTGGTCCTCTTCGCTTCCCACAACCCACCCGAAAGCCAGCTGGACTA TCCAACGCTGACTCGCTAAGCACTCTCTGAGTTTCTCCTCCAACTGGGGGTGCTCAATGT GGAGGTTGACTCCATTTCATCGAATTCGCCTAAATATGTGCAGATGCTAATGGACAGCAT GCTGGAGCTGGAGGAGTTGGGTTCTTGGGAGAGTAATGATAATGGGGAGGAGGGTTTTGT TGGGTTTAAGGAGAGAGTGATTAGATTGGCAAAGGAGAAAAGTGATGATGGCAAGGTTGC ATTTTTGGAGAGTGTTGGATTGAGTCTCTCCTCTGCTTTCGGTGTTGGATTAACTCATGA AGCACTCTCTGAGTTTCTGCTCTTATTGATAAAGTAAACATCAAAGATTCTATGGTTTTT TTGGCTTGAAAAGATTGCACGTGGGACTTTTGAAAGTAAATATTCTTTTCTGGTGGTAGT AACGGTAAAAGACTGGTTCGAGAGAATGCTAGACGTATGATGAGGCCCTTGTCAGTTCCT GTTGATGGTGATGTGCAACAAACTTTAGCCCTCTTTGAAAAGGTTTAGTATGTCAGTTTT GATTTTTAAATCTTTGTTTCGTGCTTGTTATTTTGATTATGTGGCATGTGCAGTTCATGA ATGTATGTATTATGATGATTTTTTTTTTTTTTATTTCTTTTTTCTGTACATTAAATTGAG TGTGTGATTTTATAGATTTAAGCAAGGCGTGGAGGTTTAGACATGTTGGGTTCTGCGGAT GCCTCTTTCCGATATTTCGATGAATCGTTACCACGTCTTCTTTTGTTATTGGTTGAATCC AATTTGAAAAAATTGGAATTGATAAGGAGCGCATGAGGAACATATTTTTACTTTTGAGGA GTTGAATCCAATTTGAACCC
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>LITCHI019623.m4 GenomeSequence + TTTTCGTCTTTCATTATCCTTTGGAAGAGATTTCATGTGGAATGATCTGACTGGAAGCAT ACCAAAGGAGATAGGAAGTCTTTCAGCCTTGACACTCTTGTAAGCTTCAATTATTTTGGA TTCATTTTCTTGTTTTCTTCTTCTTCTACTTTGTTTTTAATACGTCTCCTTGGACTACCC TTCTAACATAAAGGTACATAGTTTTATCTGGCATGTCCTGTACTTCGGACTTCCATTAAC CATCATTTGGAAATGAAAATAACCTATTAGTAAACGAAAATAGTTCTGACCCACTTAGTG TTTTTTTAATAGTGCTTTGAGCAATTTTCGTACTCCATGAAAAGGATACTGAAATTTTAT TATTTTTTCCCTAGTCAATGTGTAAATGCTGGCTAGGATAATCTGATGTATTTGAGTGTG CAGGCTCTTGAATGGAAACAAATTATCAGGTTCTTTACCTGAAGAGCTTGGCTATCTTAC AATGTTAAATAGGCTTCAAGTAGACCAGAACCATATGACAGGCCCTATACCAAAATCATT TGCTAACTTGAGCAGTGTGAAACACCTGTAAGTGGGATAATCAATCTAATGCTGCTCCAA TTTATAGAGATGAGTTGTGTTTTTTCTACTCATTTTATCTGCTTTCTATTAAACTTTTGC AGTCACTTGAACAATAACTCATTTAGTGGTCAAATTCCAGCTGAGCTCTCTAATTTATCT ACTCTTCTTCACTTGTGAGTTAATAAGAAACATTTTTTTTCCATGTTATATTCAATCTTC ATTGAATGTTATTGACTTGATATGAACAACGTTCGGCTGATGAAACAATTATTGACAGGC TTTTAGATAATAATAACTTTTTTGGGAATCTTCCACCAGAAATCTCAAAGCTGCCAGAGT 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ATTTCATTGGTTGGGATATTTGATCCGTACAATAACTATATGCATTGTATTACCCATATG TAGGTGAAGATATTGAAAGAAGAATAGTCAATTACTGGATTTGCATCCAAAACAATGGCA AGCGTAGAAGGCACTTCACGCAGCCGTCAGCCGCCTGTCATTGTCAAAGCATATATAGGG AAACCGGGTAGAGTTCTGTTTTCCCCAATCCCACATAGGCACGTCGACACGTGGCAGAAA AAGCCTAGATCTGCCTAACAACGTTGATAATAATGTACTACCCTCCAAGTGGGGTCCAAA CTCTCTTGTACTTTCTTCTGTCTACCGCCGTTGTCCCAAAAATGCCTGGAAAGTGGACCC CCCAACCCCCCACGTTCAAATCACGTGCTGTTAAAAAATGTTAGTGGCAGAGCAGGTAAG TGTAGACACAAGTCCAAAAGTCTGTAGAAGTAATAATAGCCAATCAACCTGGACACTCTT GAGATGTTAAATTTCAAATATGCTGACAGGAACCTCAGCCCTTTCTTTCCTTTTTTTTTT TTGTTATATATTTTATATATAAATATTCTATGTCACATATTTTAATTGTAACAATCAAAG ATTGATGATAATGTCTTGTTTTTCCTTGCTAAATTGGATGAATAACCATGACGACAGTGC CATCTCAGAATTTTTTTTTTTTTTTTAGTGAGGGGGGAAAAAAAAAAGACTGCAATGATG TACCTGACATCTACAATGCATCATAACACAAAGCTTGATGGGTTTGCTTCAACATACTCA GAATAACCAGATGAGTGATGAGTGATGAATGATGATTCCCCACCATTGACTTAATTGCCT CCTAGTTCCAAGCTTCAAGTTTTGATTTTGATTTATCTACTTGTCTTTTTTTTCTCAGGT AAGTTGATAAATATCTCCTTTTTTAGTTATCTATAAATGTGTGATGGATCTCTAGTTTTG 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