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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031092 | Chr4 | 16300165 | 16302222 | - | Transcription repressor OFP2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031092.m1 | 1 | 38 | PF13724.9 | DNA_binding_2 | Domain | 63.6 | 1.80E-17 |
LITCHI031092.m1 | 322 | 378 | PF04844.16 | Ovate | Family | 86.4 | 1.00E-24 |
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>LITCHI031092.m1 ATGGGAAATTACAGGTTTAAATTCTCAGATATGATGCCAAATGCCTGGTTTTACAAGCTC AAAGATATGAGTAAAACCAAAATGCATCCTGTGAAGAAAAACCTATCCAAAAAAAAACCC GCAGAGAAGTCTAACAAGCTTCATCACATTTCCCAGCCAAGGTACTCCTATTACCTCACA TCAGAACCCATCAAACCTGTAGGATTCTACAATTTTCCTGTGAATAGGAAGGCCTCAGAT ACTCATTTCCCTGATTCAACATTCAGGAAATCAACTTCCAGGAAAAGTTCCAGGAGAAAA ACAGTTTACAAGCCTTCTTCTGGACACTTTTCCTCAGCTGCTGGTAACAATAATTGTACT TGTCATCGTCAGGTTAAAGCTGAACAATCTCCAGAGTACTTCATTTCTTCTTCTGATGAA AGCTGCCTGGAGCCTGGTCAGTTTCCTGAATCTCCTCTGTGCTGTTCTGAGGAGGGGGAG GAGGAGATATTTGTCGATCCTGATCCTGATGATGAAGTCTCTTCGCCTGATTCCTGCAAC TGTGAAGTCACTTCTTCTACAACTCATGACATCATAATCGACATAAACAGCAATGAAACC TTCACTCAAAAAGCCGAAAAGCTTGCCAGGTTTGATCCAATTTCAGAGCTGGAGCTCCCT CCAATCCTGACAAAACCAGCCAAGTTCCATGACAGAATCAGTCAAGCCACCAAGTACAGG AAAAGTTCTGAGAGAGTAAAAATTGTCAAGGAAGAAGATGTCAGGACTCAAAAGGAGCAC AAAACAAGTCCTTTAATCCGAAAATCATCCTCTTCGAATTCTGCAGGAATAAAGCTGAGA GCCAGTTCTCCCAGGATTGCCAGCAAGAAAATCCAGGCCTATGCAAGAAAGAGCATCTCA TCAAACACATGCACGAAATCGCAGAAAAGGAGCCTCTTTGAGAGCTTCATAGTTGTCAAG TCATCACTTGATCCCCAGAAGGACTTCAGGGATTCAATGGAGGAGATGATCATGGAGAAC AATATCCGAAATTCGAAGGATTTGGAGGATCTTCTGGCTTGTTATCTGTCATTGAATTCG AATGAGTACCATGATCTGATTGTCAAGGCATTTGAGCAAATCTGGTTTGATATGACTAAC CTTCGCTTGTAA
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>LITCHI031092.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATAAGTGACTCCAGTTGCACAAAAAATTGTTAAGCATTGAGGTGTCCTTGCAAAAATCTC TTTCTTAACCTATTGTTGATAGAGTTGTCGCATTCCATTTCATATTAGTTGGATAGAAAG ATTGTGTAACAACCACTTAGGTTCCGCCTAAAATAAGAAAATAAATTTATTGCAATCCAC GGTAAAAGAGAGATAAAATTTTTTTAGTATAAATTATAATCATTGCAAATATTAATGTAT CATAACCTTAAATCTTAAATACTATAATTAAACTTTTTCTTATCAATTTGAGTTTTTAGA TATAAGAATAACTGAATAGTATTAAAATCTGAAGGTTTATGATTCAAACCCTCTCTCTCT CCTATATCTGAAATTTTTCATGTTATACATGTTATATGATAGCATATCACATTGCACGCT AAAGGATGTGATAACGTATTATAATATTAAATCTTAAATCTTTTGTTACAAAGATTTAAA TATGCAGAAAAGGGCTCATATTTTAATTTTCGTCACAAATTTGCATCAAATACATCATGT GGTGATAATACAAAATCATGGTTAAACTATATTATTCTTTTATGTAGGAAGCTGAAGAGA AGAATATGCAATTCCATCAATCAAATTATATTTGTGAAAACAAATATCAACCTTTCAAAA TATTAACTATATATGTGAAAAGAAATATGCTAGAACATAGAAATAATGAAAAGCCAGAAA TGGTCCCTCGCTTTTCTCTTCACCAAGCGTATTGTCGGGGGGACAACTCCAGCACACAAG CAAGTGGGTCCAATGGACATCAAGAAGTTGAGAAAGGCAAGGAATATCATCATTCATGAA GCATGAAATTATGTTTTAATTTTTTTTTAAAAAACGGATTAAAAAAAAAAAAAACCGCAC TTAGTAGACATATGGAAGGTCTTGATTGTTTTGTTAAAATCATCATTATCACTCTCCTTA ATATATGCTTTCACATAATTAAAGATTTTGAGGATCCAGATGATGAAGTGTTGACAAATG ACAATTCTTCAAGAAGCAGCAAAAAAAATTCGTCAACAATAAAGGCATAATTTGCGAGTG ATTTTGTATTAAAAGCTTTTGTCATTAAAATTGTTTTATATGAAAGTGATAATAAAAGTT CCTAATATATATATATTCAAGTCATTTTCTAGAAAACAATTCAATTATTTATAAAAAATT TACATACTGTAAAAACATCTAGTCAATATCTTTTTTATTTCAAAAAAAATATCTTTTTTT ATTTTAAAAAACACTAAAAACAAACGATATCCACATTAAAAACGCGTAAATGAAGTCCAT GACCAAGAACAAAATTGTCAAGTACGAAGAATACAATAAAAATTATTAAGTATAAAAGTG TTCATATATATATATATATGTATTAATTTCAAAACACTTTTTTAAGCGATTTGGCGCGAT GGTCAAATTCAGCCCACTTTCACAAACTACAGCAAAATTCGAGTATATATGTTCACAAAA AGTGAACACTTATCTCCTAACTTACTTATATGTAGGTAAAAAACTCATAAATCCCTTCGA TTGAAGAACTGTTGAGTTTCGAAGCTCTTATTTAGGGGTTGTAGTAGTTATAATTATATT TGTAATATAGAAAAAAAAAAAACACATTTTTGATATCAAATTAAGGAAATATCATGCTTA AAACAGTGTTGATTATTATGTTTTCAATGTAATGATTCAAAATGGTTAATTTGATAGACA AAAATATTCTTGACTCCCTCACTTTCTTCAATGCTCAAAACTTTTCCAGTGGACCCCAAC ACTCTCTATTGCTGTTTTCTTCTCTTCTATAGTCCAAACCCGGTGATCTCTTTTTATCCT GTTACCTTCAACCCCTCCACTGCCAAAAGCTCTGATAACTTGCAGACCATTAAATAGAGA GAAACACACAACAAACCAACTCTCTATAGAGAGAAGAGAGAATGATCAGAAGTGTGTGCA ACTGACAGAGAGAGAGAGAG
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>LITCHI014316.m1 GenomeSequence - CACTTTTAGTGCCTACGCGTCGACATTCATTAATGCTATGCAGTCTACAACTTTCAACTC CAAAGTTCCGACAGTGCCACCCACCGCTTTCAAACGATCGTACCTGTAACTGGTCGAGTC ATCAACTTCTCAACTTGACTCGACAAAACCACCATCCTCCATCAACCACCCCTGATTGTC AACCTAGCTTCCAACCAACCTCTCCAAGTCTTTGCATCACTAGTAGTAAGCCCGCTTCCT CTCTTAAACTACTTGTAAAAATTCTACCTTCAAAGTTGCCTTCTTTTCTCTTCAAGATTC CTTTTTTTTTAAATGCATTTTTATCATCTTTGCTTACTGACTTTTTTTTTTAATTGCTTT TGGCAGTTTGAATTGTTATAATTAAATGAGAAAGAGAAATAAAGAATCATAAAGTTTTTT ATAGTGGGGGTGTGATTATTTTGATGAAATCTAACTTGTTCAATGAGGATGAAAAACTGG TCTGGTGGGTTGTTGATAATGGCTCTTGCTGTGATTTTGGTTATAAGTTATAGTTTTATG GGGACTAGTACTACTCAAGAACCGAGAAAGGGAAAACAGTCAGCTTATAGTTTTTGGAGG AACCATCCAGCTGATGATGATAAGGGGAAGGGGGGTAATGATGCTGCTGTTAGGTCTCCT CCTCCAATTGGAGTGAAGAGATTGTTTAGGTTGTCAGACAAGCCTCATCTTGTAGATGTC GATGGACTTGGTGATCTTTATGGAGTGAAAAATATGTCCAAAGTGGAGTCTAGTGCTTTA CTTGCTTGGAGTCATATGCGTTTAGTTTTGTCACGGTCTGATGCTTTGCCTGGAACTGCT CAAGGTGTTAAGGAGGCTGCGATGGCATGGAAGGATTTGTTGTTGATGATTGAGGAGGAG 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