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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI031079 | Chr4 | 16103399 | 16106471 | + | Transcription factor RF2b |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI031079.m1 | 139 | 186 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 27 | 3.80E-06 |
LITCHI031079.m1 | 141 | 193 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 35.1 | 1.10E-08 |
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>LITCHI031079.m1 ATGGAGATCCAAGACCCAGACCCACAGCCCGAATCCAAATGCAAAATGGATCCGTCTGAA AGCTTCGCAGCCTTGTCGTCAGCAGCATCGTCATCATCAGCATTTGAGTCCCACAGAAGG GCCCACTCGGAGGCCAACTTCCGTGTCCATGATGATGATGCTGTGATGATGGCTTCAATG GTGGATACGATGGGGTCGCATTCAAGCCTGGATGGGTTGGGGGCGTCGGAGGACGACCTG TTTTCAACCTACATTGACGTGGAGAAGCTAACCGGATCGAACACGTCAAACATGACGTCG TTGAAGGGAAGACAGAGCAAGCATCGGCAAAGCAATTCTGTGGATGGTTTTGGGGAGATC ATGGAAGCCAAGAAAGCCATGCCACCTCATAAATTAGCCGAGCTCTGGACCGTCGATCCC AAACGAGCCAAAAGGATATTAGCAAATCGGCAATCGGCTGCTCGTTCAAAAGAGAGGAAG GCTCGTTATATATTGGAACTAGAACGCAAAGTGCAGACACTTCAAACTGAAGCTACCACT CTTTCTGCCCAACTCAATTTGTTTCAGAGGGATACCACAGGTTTGAGTACTGAAAATACC GAGCTTAAGCTGCGGTTACAGGCTATGGAACAACAAGCTCAGTTTTGTGATGCGATGAAT GAAGCCCTGAAGAAGGAAGTTGAGATGCTGAAGATGGCAACCGGAGAAAGCATGAGCTGC TCTGAGTCGTTTAACATGGAAATGCATCGGATGGGACACACCCCGTCAAATGTTTTTGTT GTAGCACAGCAACCATGTGCAGCACCTGCAGCCGCACATCCGATGATGCAGATGCTACCA CAGCACTATCATCTACACAATCAAACAAATTCTTATCCTCTCTCAGATGTTTTACAGGAT GATGATTCTCTTGGTCGATTGCAGGAGCTTGACATTAGCAGTAAAGGATCATCTTTAGTG AAATCTGAAGGTCCTTCTCTTTCTGCTACTGAAAGCAGTTCCACTTTTTGA
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>LITCHI031079.m1 + Up_Stream_Len 2000 CAATTTTGTTTACTGATTTTTCAGGCTTTTTTGTAGACTTTGACCCAAAAAACCTAATTC GAACTTTGTTCAACAATTTGAGAGATTAAAATAGGTGTCTTACTTACATCGAACCTTAAA GCCTCTTTTGATACACAAGATTTGATAAGATAAGAGTAGAATATGATTGAATATAATTGG ATTGGATTGAATTTAATAATTATGTGTTTGATGCAGTTGGAATTGAATTAGATTTGCCTA AATTAAGAAGAATTAAATTTATATTTTATAATAAATTAATTTTTAATATATTTAATAAAA GAACAATTAAATAAAAAAAAAAAAAATTAATTATATTAAAATAGAATTTACTTTCAATTG ATATTAAATTATTATTTTATAATAATATTTGTAACAACTTATAATTATTTTATTATAATA AATAATTTATATATTATTTAGTAATTAAATTAAAAAAAAAATGCTTTTGAAATCCCGAGT CGGACAGAATTTCAAAAACCAATTGATGTCAAAGAAATCTAGCTTGACCACGATTTGATG AGGGCCTAGGAAGAGATTCTTCTTTCCCCTTCCCTTCCTTTTCCGTGCCAAACACAGGTT TAGTAGGACCAAGATTTGTAATTCTTTACCTTCCCACCAATTCCTGTTAAACAAACATAG TCTAAGGGGACAGTGTAATTTCCCTTTTTTGTTTTTTTAATTTCGGCAAAATTGCTAATT ATAGCCATTAATCTTATTTTATCTTAATTTTAATGGATTTATTATGCTACCGAAATTTTT ATAGTAAATATGGAAAGAAAGTACATAACCCATTAAGTATAAGAGTACACTTACATTTAG AGGGGGGAAAAAAAGACATGCACTTATATACATTAACTTTTAGTCATATAAAATCTGGTA TCAAATTAATATATTTGTATTACTTATTGATTATATAAAAACTAATATTGACAAAAGATT CTGTATTAATCCAAAGCCATAAATCAAAGTTAACAAATTGATAATAATTTCCTTTTTCCT CGCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAACGAATTGATGTAATATTTT GAGTTGTTTGATTGATAATGTGATTTTATTTTCGGATAAACACTAGATATTATTAGTCCA AATAGTCGGATGGATAATTAGTAAAAATAAACAAATGAATTAAATATGGCAATTTAAGAG CAACGATTAGACTGGTTTGAACTAATTATAGTTGCAAAAACCTGTTAACTTGTCTAAAAT TAAACCATTATTTGTTTAGACTCCTTGAACTAGAAATATTAACTTCAAATACCTTAAACT TCAAAACTAACTTTTATTTTGCATAAAACAATAACTTCTATCTATTTTCAACATGTTATG ATATTATTAAATACTGAATGTAAGATAAAATACAATAATTTTGAACATCTAGATCTAGTT ATTATAGTGCACTTGTGCAAAGTACATTTTATGTACTGAAAATTAGCTTTTTCTACTCAG ACACTACGAGAGAGATTATTAATTTTTCGTATAGAAAATTTATTAAATTGAAAGTTCATA AAAGTCTAATTCGGATTAATTTTTTTTTAAACATAATCTAAATAACACAAGATCAAAATT ATATTTTTTGTAAGAATATTTTGACTTCACATTTTGTTCATGTTAAAAATATTAGATAGA GAAATATCAACCATAATTGATAATATATATGTAATAATATCATTTCTTTTAACATTAGTT AAATCATAATTTCTTTCTAGATGTGACTATGTTACCGGTTTGATAACTTCAATAATTACT CTTACAGCCAATCGATAGATGTAATTGTTGGGTAAGATTACTTAATCTTTTTTTAATTCC ACCATACCAAAAATAATAATAATAAAATTTTCAGATAAATAATTAAATCGAAAAAAAAAA AAAAATTGTTTTTTCTTTCTCCACCAAAGTGAGAGAAAATCGGAAAATGAAAAGCAACAG CAATTCTTGTGGCGAAAGGG
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>LITCHI031079.m1 GenomeSequence + AGCCAATCGATAGATGTAATTGTTGGGTAAGATTACTTAATCTTTTTTTAATTCCACCAT ACCAAAAATAATAATAATAAAATTTTCAGATAAATAATTAAATCGAAAAAAAAAAAAAAA TTGTTTTTTCTTTCTCCACCAAAGTGAGAGAAAATCGGAAAATGAAAAGCAACAGCAATT CTTGTGGCGAAAGGGATGGAGATCCAAGACCCAGACCCACAGCCCGAATCCAAATGCAAA ATGGATCCGTCTGAAAGCTTCGCAGCCTTGTCGTCAGCAGCATCGTCATCATCAGCATTT GAGTCCCACAGAAGGGCCCACTCGGAGGCCAACTTCCGTGTCCATGATGATGATGCTGTG ATGATGGCTTCAATGGTGGATACGATGGGGTCGCATTCAAGCCTGGATGGGTTGGGGGCG TCGGAGGACGACCTGTTTTCAACCTACATTGACGTGGAGAAGCTAACCGGATCGAACACG TCAAACATGACGTCGTTGAAGGGAAGACAGAGCAAGCATCGGCAAAGCAATTCTGTGGAT GGTTTTGGGGAGATCATGGAAGCCAAGAAAGCCATGCCACCTCATAAATTAGCCGAGCTC TGGACCGTCGATCCCAAACGAGCCAAAAGGTTTGATTTTCATTTTCATAATTTGGTTGAA AGTAAATGCATGGTACCATACCTTTCATATTCTAAACATACACGGCTTGTTTGTGATGAC TTTCGAAAGCCATTTTTTTATTTTTTGAGCTCAAAAACTATTCTAAGAGCCGTTTTAATG AAAATTAGAAATGAGTTTTTATCATTTAAAATTAGAAGGAAGCCTACCTTTTGCCAAAAA AAAAAAAAATTTACATTTCTCTTCTTCTACTATTAAAAGTTAAAATGTGGAAAATTAAAA GCAAAAACTATCCTAAAAGAGCCAACAATATGAAAACTGAGTCCAAAAGTCATAGCATTT TTATTTTCATTTTTTGAAGGATTTCGAAAAATATCATTTAGAAAATAATATCAAACATGC CCTTGATTAATTATATAGTTTTTAATATGATTTTTAAGATCTTATCAAATATGCAATTAG CTGCCGTTTCAAAGTAGAGGAAGAGGCCGATTCATTATTTTCAATTTAATAATTTTGATT TTTGATTAGAGTAAATGATATCTGATGTGTTTTTGTATTTTGAAAACAAAATCGAAAATA TATGCTGTTATTATTTTTTTTAAAATTATTTTAGTAAATAGTTTATGGAAAAAAAAAATA AATGTATGTTAAATTGTTTATTTATGTATGTATGAATTATGATATGAAGTTTTTTACTTT GTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAGATGCTTTTCATTCG TAATTATTCTTATTGTAAACGACACTAGACATATATCCATAATTTGAAACAAAATAAAAT ATATTTACATTTTTATTTTTGAAATGATTCATTTTACAAGATATGATTTGAAAAGGAATG CTAAACACAACTTTAATTGTTATATATATTTATATATATATATATATATTATGATTTTAG GATATTAGCAAATCGGCAATCGGCTGCTCGTTCAAAAGAGAGGAAGGCTCGTTATATATT GGAACTAGAACGCAAAGTGCAGACACTTCAAACTGAAGCTACCACTCTTTCTGCCCAACT CAATTTGTTTCAGGTTTTCCTCTTCTTTTTTAAAATAAATGAATAAATAAATCAATGCCC GAGTAAATGTCCATATTTCTTTGTTTACTAGGCTCTAAATTAGGACTACTGCCTGATGAC ACGTAAAAAGTTGTCATTTATTATAAGAGTTGGTTGTCTTAGTGGTTAAATAATTACCTG TCAATAACATTCATCAAATTGATTGTAATAATGGTTATTAAGATCAATCTGATAGTTGTA ATTGATATGTAAAGTTATCTAATCAATAAAGTAATCAAATCCCTATTATAAATTACAAAT CCTAATTCAATACACGTTTGAGCCACCTAGTTGTATAGAACATTAAAATCCTATGAGTTG TAATGGTTTGAATGGTCTAGCAGTGGTACTTTATAGTTTGAAACTTGACACACATGATAT AAAAAAATTATATGTACAAAATAAAATTAAAAACCCCTCTAATTTGTTTCTTGATATTGT TTATGTAGAGGGATACCACAGGTTTGAGTACTGAAAATACCGAGCTTAAGCTGCGGTTAC AGGCTATGGAACAACAAGCTCAGTTTTGTGATGGTAAGTGTCAAGTTAGACAACACCATA TCTGTTGTTCTGATAATTAAATTAAGATCATCAATAATGCTTCATTTTAGTTATCATGGC TGAGATTGTCCTTGTTTATGATAATAAAATTAAGATCATCAATAAATTAATGCTACATTT TAGATCATCAATAATGCTTCATTTTAGTTATCAACCAGTAATTTTGATTGAACTATTAGT AAAACGTTGGTTTGTTCATTGTGTTGTTTACAATACGAAGCGATGAATGAAGCCCTGAAG AAGGAAGTTGAGATGCTGAAGATGGCAACCGGAGAAAGCATGAGCTGCTCTGAGTCGTTT AACATGGAAATGCATCGGATGGGACACACCCCGTCAAATGTTTTTGTTGTAGCACAGCAA CCATGTGCAGCACCTGCAGCCGCACATCCGATGATGCAGATGCTACCACAGCACTATCAT CTACACAATCAAACAAATTCTTATCCTCTCTCAGATGTTTTACAGGATGATGATTCTCTT GGTCGATTGCAGGAGCTTGACATTAGCAGTAAAGGATCATCTTTAGTGAAATCTGAAGGT CCTTCTCTTTCTGCTACTGAAAGCAGTTCCACTTTTTGACACCATGGTAGATTTTTATTT CTTTGGGCTTTATCTACAAACTAGGAAGCTCCCTCAGGTTTTTGATGTATTGTTGTATCA TTGTGCCATTCTCTTTTCTCTTTTCTATCTATCTTATTAATTTCATATAGCACTGCCTAA ACTTTGTGTTGAATTAGTCTTGTCGATCTCATTTGGTTTATTGGGTATAATAGAATTTTG TGGATCTGAGCTG