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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI031001Chr41484202714844153-LOB domain-containing protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI031001.m116107PF03195.17LOBFamily109.51.00E-31
LITCHI031001.m216108PF03195.17LOBFamily116.56.90E-34
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>LITCHI031001.m1
ATGTCAATTCATGAATGGAGAAGACAAGTTTTTGCCGGCGTTTTAGCATGCAAGCTTCTC
CGCCGGAGGTGCACCATCGGATGCCTTCTACTTCCCTACTTCCCGCCCTCTGAAGCAGAC
AAGTTTGCAGCTGTGCATCGGATCTTTGGTGCCAGTAACGTCTGCAAAATGCTGCAAATT
CCAACTGAAAGCAGAGAAGATGCTGTGAAAAGCTTAGTGTATGAATCAAAAGCAAGGCTT
AGGGATCCAGTGTATGGTAGTGCTGGTGTAATAGCTTCTCTCCACAGCCAGGTACTTCAC
TTGCATGGTGAATTGGAAGCAGCTCTTGCAGAAGCAAAAGCACTTAAAGAACAACTCTTT
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CTCCAAGAATCTCGTAGCTGTGACTTCTATGCTTATTGTAATGGACTTCAAGGACTTGAT
TCCCCCTGGTCTTAG
>LITCHI031001.m2
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CCCCTCCAAGAATCTCGTAGCTGTGACTTCTATGCTTATTGTAATGGACTTCAAGGACTT
GATTCCCCCTGGTCTTAG
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>LITCHI031001.m1
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PTESREDAVKSLVYESKARLRDPVYGSAGVIASLHSQVLHLHGELEAALAEAKALKEQLF
QTSFLLSNDCQASMNIHHQPLQESRSCDFYAYCNGLQGLDSPWS.
>LITCHI031001.m2
MSIHEWRRQVFAGVLACKLLRRRCTIGCLLLPYFPPSEADKFAAVHRIFGASNVCKMLQK
IPTESREDAVKSLVYESKARLRDPVYGSAGVIASLHSQVLHLHGELEAALAEAKALKEQL
FQTSFLLSNDCQASMNIHHQPLQESRSCDFYAYCNGLQGLDSPWS.
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>LITCHI031001.m1
GGCTAACTACAAATGGATGTGTCACCAAGGACATCACAGAACCTGGAGATTATGGTGGCT
TCCCTGATATGTCAATTCATGAATGGAGAAGACAAGTTTTTGCCGGCGTTTTAGCATGCA
AGCTTCTCCGCCGGAGGTGCACCATCGGATGCCTTCTACTTCCCTACTTCCCGCCCTCTG
AAGCAGACAAGTTTGCAGCTGTGCATCGGATCTTTGGTGCCAGTAACGTCTGCAAAATGC
TGCAAATTCCAACTGAAAGCAGAGAAGATGCTGTGAAAAGCTTAGTGTATGAATCAAAAG
CAAGGCTTAGGGATCCAGTGTATGGTAGTGCTGGTGTAATAGCTTCTCTCCACAGCCAGG
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AACTCTTTCAAACCTCATTTCTTTTAAGCAATGACTGCCAAGCAAGCATGAACATCCACC
ACCAACCCCTCCAAGAATCTCGTAGCTGTGACTTCTATGCTTATTGTAATGGACTTCAAG
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CAAATAAGAAAGTCCATTAATTTAGTTGGTTAAGATTTTTTTTTCTTATTTTATATTAAA
TTTAGATTTAATTTTATTTGCCGTAAGAGTAAGAGGA
>LITCHI031001.m2
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TCCCTGATATGTCAATTCATGAATGGAGAAGACAAGTTTTTGCCGGCGTTTTAGCATGCA
AGCTTCTCCGCCGGAGGTGCACCATCGGATGCCTTCTACTTCCCTACTTCCCGCCCTCTG
AAGCAGACAAGTTTGCAGCTGTGCATCGGATCTTTGGTGCCAGTAACGTCTGCAAAATGC
TGCAAAAGATTCCAACTGAAAGCAGAGAAGATGCTGTGAAAAGCTTAGTGTATGAATCAA
AAGCAAGGCTTAGGGATCCAGTGTATGGTAGTGCTGGTGTAATAGCTTCTCTCCACAGCC
AGGTACTTCACTTGCATGGTGAATTGGAAGCAGCTCTTGCAGAAGCAAAAGCACTTAAAG
AACAACTCTTTCAAACCTCATTTCTTTTAAGCAATGACTGCCAAGCAAGCATGAACATCC
ACCACCAACCCCTCCAAGAATCTCGTAGCTGTGACTTCTATGCTTATTGTAATGGACTTC
AAGGACTTGATTCCCCCTGGTCTTAGTTTAGGGAGGCATTTTAGAAAAAATAATAAGTTT
GGACAAATAAGAAAGTCCATTAATTTAGTTGGTTAAGATTTTTTTTTCTTATTTTATATT
AAATTTAGATTTAATTTTATTTGCCGTAAGAGTAAGAGGA
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>LITCHI031001.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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AGAGTTCCCTGTTAAATTGGCTTAAGAAATATGATGAAGGGGTGAGTAACAGTGTGGGGT
TGGACTGTCTTTTTTCATATCTTCTTCCCACTAAAATCTTCAATAGTAAATGGACACAAG
TGTACACTTATCTAACAAAACATTGATTCGTTTTAAATCTTTTTTAAAGCGTAGCGATCA
TGATAGCAATTGAGATAATTAACAAGGAGGATTTTGAGTACTAATTGATATGCAACAATC
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GCAGCTGTGATTGATGTGTTGACTTCCCTTGAAAGTGGTTTCATGATCTTCAAGAAGAAC
AATCTCTATAGGCTACTGTAATTTTATAGATGTGTAACAGATTACAGATTACTTGAAGGT
GACTTCATTGAAGACGTTTTGTATTGTAAATATGAACTTTGAGTTCTTGAGTTGTTAATA
GGGGCGAATTGGACCGGATCAAAAATATCAGTTTTCAATTTGTATTCTGTTCGGTTTGGT
TTTTTTAATCAAAAATCGAATTTTTCGGTTTCGGTTCAGTTTTGGATAGCAAAAACAGAC
GCGAAACTAAACATTAAAAAAACAAAAAAGGGTATGAAAGGCTCACGGTTCACAAACCTT
AAATAACCCATTCTTTCTTAGTTTCTCTTTTCCTACCGTTGAGCCGCTGACCTTGAAACC
TCCTCTGATCTCACCACCAACTCTTCTCTACACCTCCTCCGCCGTCGCAAGAGCTCCACG
AGCGACGGAAACTTAGTTTTTTTTTCGGTTTTTCTCTCACACGGCTTCTTTATACCTCGG
CTTCAATGAGTTGGCTACATTGGCTCTCTCGATCTCCACGGACACCACCACCGTCGGCTG
ACCCTTCCACGCTATTTGCTCCTTCAAGAAGATAGAATTTTTTCTTGCTTGTGATGTGTT
TGGATTTTTTTTTAATAATAGGGTAGGGCTGTTAAATATGGATTCTTTTGTGATTAATTA
GGGCTGTTTTTATTGGACTTTATTTGTTTATGGGATTAGTTAGGGCTGTTTTGAACTTTG
TATTTTTATTATTATTATTTTTTTAACGGTTTAAGACTCTGTTTTAGGACTGTTTTAGTT
CTTTTTGCTGTTTTGGACTGTTTTTTAGGTCGTTCTGGCTGTTTATGCCGATGTTTATTT
TACATATATCATATTCATACACGTGCAATTTTCTATATGACCATTTTATGTGAATGAATC
CAGTTTTGTTAGGGATATGTTTTTTAAGCAACATTGAGAAATGTTTTATTTCTACGTGGA
TAAAATAAGGCTTTGAATTGAATTAAAATTGAAGTTTAATATCCCAATTGAAGTAGAATC
AAAACTCAGTATGAGTGGCGATATTTTCACCCCTCTAAAACTGTATATACATTCCAAAAT
ATAATTTTTTTTAAAATTTCAATATTAGCGTTAATAATATTTTTGAAAAAGCAAAATTGG
GTGCAACCTTTGAAATCGCACCAGCCCTGCTACAACAGTTCCGCATTCGTTAGATGGTCA
TCACTTTGAAATCTTATTGACGTGGGACTGTTCATGCATTGGAATAAATTTTGAGTCTCT
CCCTTCTAGGCCAGGCCAATCTTACTTGTCCTCAACTTATTTGGAGTGTATATACGCAGT
GCTCAGACTAATCGTTCCCCTGTCAACTTAAATTTCAGGCTAACTACAAATGGATGTGTC
ACCAAGGACATCACAGAACCTGGAGATTATGGTGGCTTCCCTGATGTGAGGACTTATCTG
ATGCTCTTTATTTTTACTGCATTTGATTTGTAATGAGGATTAAAAATTGAGTTCATCATC
AAAGTTTCTGCATCTGTTTACATTTGGTGGACATCTATGTGAAACTAATCTGTAAACTTG
TTCTGTCGATTGCTTTGCAG
>LITCHI031001.m2 -  Up_Stream_Len 2000
CCAACAAACGCCAGAAAGTCGATAGTCCAGATAGAAGTTCCACTTCATTGGAAGCAACAG
AGAGTTCCCTGTTAAATTGGCTTAAGAAATATGATGAAGGGGTGAGTAACAGTGTGGGGT
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TTCTGTCGATTGCTTTGCAG
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>LITCHI031001.m1 GenomeSequence - 
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TCCCTGATGTGAGGACTTATCTGATGCTCTTTATTTTTACTGCATTTGATTTGTAATGAG
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GAGAAGACAAGTTTTTGCCGGCGTTTTAGGTTGCTTACCTCCACTTTCTCTTCATTTTTT
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TTAGTAATTTATGGGATATGATTATTAACTTTAATATTTCAAAAAAAATTAATGGGATGA
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GCGCTGGCAATTGAATTATAATTAAAGTTTAACATGGTGCAAATTGAAGTTTAACATGGT
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ATGGTCACAAAATCTGTAATCCAGCATAGTCTGTCAGGAAATATCTCGCAAGTTGCATCA
AATTTTCCAGAGACCACCCTAATTACCTTATAAATACACCAAATACATCATCTTGTGTGA
GTTAATCCATGGACTAGGGTCCTCAGTTTATTGATCTCAGAAAATAATCTTTAAATTAGA
ATTCTCTACTTATTTCAATTGGATAATTATTATTGTTAACCTGCCATTTTATATTTGTTC
AAGTAAGAATTAAGGTTAGAGAATAATCTTATTTTTTATTTCACTATTTTATTTTGTTGT
ATTCATTTAGTTAGTTAACTGATATCGTAAATTTTGTCTTTATTCAGATAAAAAACTCGA
TTTATTGGAGAATGCTTGTTTCCAAAAGAAATACTATAAAATAAAGACGTAAAACTTTCA
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GTGCAGCATGCAAGCTTCTCCGCCGGAGGTGCACCATCGGATGCCTTCTACTTCCCTACT
TCCCGCCCTCTGAAGCAGACAAGTTTGCAGCTGTGCATCGGATCTTTGGTGCCAGTAACG
TCTGCAAAATGCTGCAAGTATAATATTTCTAATTGTATAACATCAACAAGAGTTGTTACA
TCTTTTCTTATAGTATATTTTAACTTCAAAATTCATGTAATAATTAAAGAGTTATGGTAA
CTTAACTTTAAAGAAATATTTCTATCAATAAAATTAGTTATCTGAGCGATTTTGATTATA
TTTATTTATAATTAGACTCAAATCGAGTAAATCACTTTTTTCATCAAATTTTTATAATTT
TTTTTTTCAATGTGACCATATATTAACAGAACTGTACTTAGATATCCGTATAAAAAAGCA
TGTTAATATGCTACCATTCAATTAGTAACCAAAATATTCAATTTCTGTGCAGAAGATTCC
AACTGAAAGCAGAGAAGATGCTGTGAAAAGCTTAGTGTATGAATCAAAAGCAAGGCTTAG
GGATCCAGTGTATGGTAGTGCTGGTGTAATAGCTTCTCTCCACAGCCAGGTACTTCACTT
GCATGGTGAATTGGAAGCAGCTCTTGCAGAAGCAAAAGCACTTAAAGAACAACTCTTTCA
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AGTCCATTAATTTAGTTGGTTAAGATTTTTTTTTCTTATTTTATATTAAATTTAGATTTA
ATTTTATTTGCCGTAAGAGTAAGAGGA
>LITCHI031001.m2 GenomeSequence - 
GGCTAACTACAAATGGATGTGTCACCAAGGACATCACAGAACCTGGAGATTATGGTGGCT
TCCCTGATGTGAGGACTTATCTGATGCTCTTTATTTTTACTGCATTTGATTTGTAATGAG
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GAGAAGACAAGTTTTTGCCGGCGTTTTAGGTTGCTTACCTCCACTTTCTCTTCATTTTTT
GGAAAAAAACCATTTTTTTGATTGAGAGTACGTGGAGATTAGAAAGAAGAAAATGATATA
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ACATAAAAAAGGTGCACATACATTATCTTAGGGGATCCAATGTGGCCGCTCATTCGTATC
AAGCCAATTGAATTAAAATTGAACTTCCTATTTTACTTCAGTGAGGGCTGGGTAGTGGGG
GCGCTGGCAATTGAATTATAATTAAAGTTTAACATGGTGCAAATTGAAGTTTAACATGGT
ACAAACTAATCCACTCACGTGAAATTCCCTTAAATCGTTGTCAAACTCCAGTAATTTCTA
TTCGGTTCATTGAATTTCTCACATGAAAATGACAGGCGGCCAATTGCCTTACTCCCTAGA
ATGGTCACAAAATCTGTAATCCAGCATAGTCTGTCAGGAAATATCTCGCAAGTTGCATCA
AATTTTCCAGAGACCACCCTAATTACCTTATAAATACACCAAATACATCATCTTGTGTGA
GTTAATCCATGGACTAGGGTCCTCAGTTTATTGATCTCAGAAAATAATCTTTAAATTAGA
ATTCTCTACTTATTTCAATTGGATAATTATTATTGTTAACCTGCCATTTTATATTTGTTC
AAGTAAGAATTAAGGTTAGAGAATAATCTTATTTTTTATTTCACTATTTTATTTTGTTGT
ATTCATTTAGTTAGTTAACTGATATCGTAAATTTTGTCTTTATTCAGATAAAAAACTCGA
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CAATTTCAAGCACAAAAATGGATGACAACCCGAATTCTGCAATCAATCTAACAATGCCAT
GTGCAGCATGCAAGCTTCTCCGCCGGAGGTGCACCATCGGATGCCTTCTACTTCCCTACT
TCCCGCCCTCTGAAGCAGACAAGTTTGCAGCTGTGCATCGGATCTTTGGTGCCAGTAACG
TCTGCAAAATGCTGCAAGTATAATATTTCTAATTGTATAACATCAACAAGAGTTGTTACA
TCTTTTCTTATAGTATATTTTAACTTCAAAATTCATGTAATAATTAAAGAGTTATGGTAA
CTTAACTTTAAAGAAATATTTCTATCAATAAAATTAGTTATCTGAGCGATTTTGATTATA
TTTATTTATAATTAGACTCAAATCGAGTAAATCACTTTTTTCATCAAATTTTTATAATTT
TTTTTTTCAATGTGACCATATATTAACAGAACTGTACTTAGATATCCGTATAAAAAAGCA
TGTTAATATGCTACCATTCAATTAGTAACCAAAATATTCAATTTCTGTGCAGAAGATTCC
AACTGAAAGCAGAGAAGATGCTGTGAAAAGCTTAGTGTATGAATCAAAAGCAAGGCTTAG
GGATCCAGTGTATGGTAGTGCTGGTGTAATAGCTTCTCTCCACAGCCAGGTACTTCACTT
GCATGGTGAATTGGAAGCAGCTCTTGCAGAAGCAAAAGCACTTAAAGAACAACTCTTTCA
AACCTCATTTCTTTTAAGCAATGACTGCCAAGCAAGCATGAACATCCACCACCAACCCCT
CCAAGAATCTCGTAGCTGTGACTTCTATGCTTATTGTAATGGACTTCAAGGACTTGATTC
CCCCTGGTCTTAGTTTAGGGAGGCATTTTAGAAAAAATAATAAGTTTGGACAAATAAGAA
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