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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030982 | Chr4 | 14666448 | 14667647 | - | High mobility group B protein 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030982.m1 | 33 | 87 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 27 | 5.40E-06 |
LITCHI030982.m1 | 39 | 88 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 45.7 | 6.90E-12 |
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>LITCHI026311.m1 ATGGTCACTGATAAGGCACTATCTCTTTGCAGATTCTTTAATATTACAGGCTTTGGAAAC ATGACGATTGGCAGCTATATTGGCATTAGAAAATCCAATTTCTTGCTTGTATATACAGAG TTACCTGCTTTTGCATTTTGCAAATCCCAGCTAATTTCTTCGTCAACTATTAGGATCACA AGTAACAATGTTAAGAAGTCGAGGTTGATTTCCAAGTTTCAGTGTTCGGCTGCTGATAGA ACTTTTGTGTCTAGTTCTGTTGATGCGTCTGCATCTAAGCCAAAGACTGGTCGTTCAGGT TGGAAGCAAGGAAGTTCCTCGTCTTTGTATAGTCGTCCTAGTTTATTGGAGATGAAGAAT GAAAGGATGACAAACCGTGCCAAGGTTTATGATTTCTTAAGGGGAATTGGTATTGTTCCT GATGAGCTTGATGGGTTGGAACTTCCTGTGACGGCTGAGGTTATGAGGGAGCGCGTGGAT TTCCTTCATAGTTTAGGGCTAACCATTGATGACATCAACAACTACCCTTTGGTTCTTGGT TGCAGCGTCAAAAAGAACATGGTCCCTGTTCTTGACTACCTTGGCAAATTGGGTGTAAGG AAATCCACTTTCACAGAGTTCTTGAGAAGATACCCCCAAGTCCTTCATGCTAGTGTTGTT GTAGACCTTGCTCCAGTGGTCAAGTATCTGCAAGGGTTGGATATCAAAGTAAATGATATT TCTCAGGTTCTTGAGAGGTATCCAGAAGTGTTGGGATTCAAGCTTGAGGGAACCATGAGC ACATCAGTGGCTTATTTGGTTGGAATAGGAGTGGCAAGAAGAGAAATTGGGGGGGTTTTA ACTAGATACCCTGAGATATTGGGGATGCGAGTGGGCCGAGTGATCAAACCTTTTGTGGAG TATCTTGAAGACTTGGGTATTCCAAGATTAGCTATAGCTAAATTGATAGAAAAGCGACCA CACATACTGGGATTTGGATTAAAGGAGAGGGTGAAACCAAATGTTGAATCCCTTCTGGAG TTTAATGTTAGAAGGGAAGCACTTCCTTCCGTAGTGGCGCAATATCCTGAAATTATAGGA ATGGACCTGAAATCGAAGCTTATTGGTCAACAGTATTCACTCAAATCGATTATTGATATT GGTCCTGAGGATTTTGGCAGCATTATTGAGAAGATGCCCCAGGTTGTTAGTGTAACTAAT TCTGCTATTACGAAACATGTGGACTTCCTAAAGGATTGTGGATTCCCCTTGGAGCAAGTG AGGAAGATGGTTGTGGGGTGTCCCCAAGTGCTTGCTTTAAACACTGACATCATGAAACTT AGCTTTGATTACTTCCAAAGGGAGATGCAAAGACCTCTTGATGATCTGGTTGCTTTCCCA GCGTTCTTTACATATGGTCTAGAGTCCACAATAAAACCAAGACAGAGGATGATTGCGAAG AAGGGTTTAAAATGTTCTCTATCTTGGCTTCTTAATTGCTCCGATGAGAAGTTTGAGGAA CGAATGGACTATGACACTATTGACATGGAGGAGATGGAAACAATGCCATCATTTGACATG AATACTCTTGTGGAACCAAGGAGTGAAGATGAGTTAGGTTCTGAATATGAGGAAGATAGT GATGATGAGTATGTA
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>LITCHI007166.m1 MELTQHGFLEELLAPRRETWSSFPSELLIPSGWNFDSLEDNPTLAATNPSFVGFSTPAEP TTFECPFGDQAAYPFLDHGFTVPEIDSSSYTKNETCSFPTQEDYNPSIVEDEELGGYIGS DHHHSLELERKSSCCVEMEQASNSTTTTPQIFNMGLYGERKSKAKKIEGQPSKNLMAERR RRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTSILGDTIDYMKELLERINKLQEEETEGVTNQILMG NLKEHKQNEVMVRNSPKFDVERREIDTRIDICCAAKPGLLLSTVSTLEALGIEIQQCVIS CFNDFSMQASCSEVGEQRTLLGSEDIKQALFRNAGYGGRCL. >LITCHI007166.m2 MELTQHGFLEELLAPRRETWSSFPSELLIPSGWNFDSLEDNPTLAATNPSFVGFSTPAEP TTFECPFGDQAAYPFLDHGFTVPEIDSSSYTKNETCSFPTQEDYNPSIVEDEELGGYIGS DHHHSLELERKSSCCVEMEQASNSTTTTPQIFNMGLYGERKSKAKKIEGQPSKNLMAERR RRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTSILGDTIDYMKELLERINKLQEEETEGVTNQILMG NLKEHKQNEVMVRNSPKVRFSFFFSFQ. >LITCHI007166.m3 MELTQHGFLEELLAPRRETWSSFPSELLIPSGWNFDSLEDNPTLAATNPSFVGFSTPAEP TTFECPFGDQAAYPFLDHGFTVPEIDSSSYTKNETCSFPTQEDYNPSIVEDEELGGYIGS DHHHSLELERKSSCCVEMEQASNSTTTTPQIFNMGLYGERKSKAKKIEGQPSKNLMAERR RRKRLNDRLSMLRSIVPKISKVIYHLITCFSLLFKHPSLA.
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>LITCHI015918.m1 GAAAACTACCCTAGTCCGCATAAATTTTCACATAATTTGACCTCTGATTACTAGGTCAAA TTGAAATTATTCATTTAATGTGAACTGGTATACGCGAGCACGACCTGGCTTCAGTGAGAA GCACAGGCGTAGTTACCGCTTGGGCAAGTAACTTTGTAGAAGTTTGAAAGATTTAGTGCA CGACGAGATAAGCAAGCGCTAGTAAATGCAGGTTGAATATCTCAAAAGTCGAAAATGAAG GTAGACCACATGAAAAATTGCGAGCAACAGACAGCCACACATGGTGGGATTGACCCCACC AAGTGCTTGGCTGTACCACCAAATTTCACGCATTTGATACACAGAATCTGAACCCTTATC TTCACAAACTCAAGACTTGTCTATATTCTACACCACTCACACTCTTCTCTTCCACCACCA ACCACTCCTTTTTTATTTTCTCTGATCTTCCTCAACCTTCTTTTCTTTTCTTCCCCTTTC CTCTGTATTCGTCTACACTCTGCACTGTTTTTGTTTGCTTAAAATATTCTGCTAAGAGGG AAAAAAAACAGACCACCACAGTTCTTGGTTTGGTGTTGGGATAGTATCATACGAGGAAAC ATGAAGATTCAGTGTGATGTGTGCGAGAGAGCTCCAGCCACAGTGATATGTTGCGCAGAT GAGGCTGCTTTGTGTGCCAAATGTGACGTTGAAGTGCATGCAGCCAACAAGCTAGCAAGC AAGCACCAGAGGCTTCTTCTTCAGTGCCTTTCTAACAAGCTTCCTCCTTGTGACATTTGC CAAGAGAAGGCAGCCTTCATATTCTGTGTTGAAGACAGAGCCCTGTTTTGTAAGGAGTGT GATGAGCCTATCCATTCACCTGGCAGCCTTTCTGCCAACCATCAGCGCTTCCTGGCCACT GGAATCCGAGTAGCTTTAAGCTCTAGTTGTAGCAAGGACACCCAGAAGAGTAGGTTGGAG CCACCCAAACAGACTGCTCAGCAAACTTGTGTCAAAATACCCTCACACCAACAGCAGACA TCTAATAGTATCACTTCCTCATGGGTCATGGACGACTTATTACACTTTTCAGACTTTGAA TCCTCCTCTGAGAAGGTAACAAAAACGTCTGCAATTAAGGAGCAGCTTGAGTTCGGAGAA CTTGAATGGCTAGCAGACATGGGACTTTTCAGTGATCAACCTTCTCAGGAGGCTCTAGCA GCAGCTGAAGTTCCTCAACTTCCTGTTCCCCAGTCCAACAATATTACATCATACAGATCG ACCAAATCCAACATGCCTCACAAGAAGCCTAGAATTGAGGTCCTAGATGATGATGATGAG CATTTTACTGTCCCAGATCTTGGCTAA
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>LITCHI017366.m1 - Up_Stream_Len 2000 GGGTGGCAAAAAGGGTTGACGTGTCGGGTTGAACCGAATTCGATTCGATTCGTTTACGAA TTCGACCAATTCGACACGAATTCGTTTAAGAAACGGGTTGATATTTTTGGATTCGACACG AATTCGTTTATAAACGAATGACACGACCCGACACGATTAATTCGTTTAATACTTGAATCA TAAAATATTCTAACCCATTAACCCGTTAATTCGTATAATCCATTAATTCGTTTAATTCAT TTAACCCATTTAACTCGTTCAACCCATTTAACCCGTTTAACTCGTTCAATTCGTTTATTC GTTCGATTCATTTAACTCGTTTAATCTTAATAATATTTTAATCATATACATAATAAATCA TTCGCATTTAAATATTCTAACAACAAATTCAACGGATAAAAAACAAAATCCAAAATCAAC AGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAATTCATCAGAATCAAATATTCAAACAACAAATT CAACGGATAAAAACCAAAATCCAAAATCAACAGAATCAACACAAAAACTAAACACCAAAT TCATCAGAATCCACACATAAAAACCAAATACCAAATTCAACATAATCAACACATAAAAAC CAACACAATCATTTTCAAAAAAATAAAAAATAGTAAATTTTTTCAACAACAAAATCAAAT CAAATCATGCTCAAACTCAATACAAAATTACAAATACATGAAAATTAAATTTGCATAACA TTATGGTGGTGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGGGAGCCGTGGA TCTAGTGGCGGAGTCGTGGATCTGGTGGCGGAGCCGTGGATCTGGTGGCGGACCGTGGAG AAGAGGCAAGATCTTTAGGAGAAATGGAGAAGGGGAGTCGACCGTGAGAGAGGAGGGGAG CACAGACGGCGACTGTGAGGGAGGAGGAGTGAATAGGCGACGAGCGTGAGGGAGGAGGGA AGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGCAAAGAAGATAGGACGGCGAGCGTGAGGGAAGAGG GAAGAACGACCAGCGACCGTGAGGGAGGAGAGAAGATAGGACGGCGAGCATGAAGGACGA AGGGAGAACGGGTGGCGACCGTGGAGAGAAGGTGGCGACTGGACGGCGACGGTGAGGGAG AAGGGGTGACTCGGCGGAAAGGGTAGTGGGGTGTGAGTGTGGTTGCCGAAAAATGAGTGA AAAGGTTTAGGTTTTGGATGAATATGTGTGTATATATAAATGCATAATTACACACTAATC CTTCTAATATGTTAAATTATAATTTACCCCTATTTTAATCGGGTCAACCTGCGATTCGTT TAAGCAAACCCAATTCGTTTCGTTTAATAAACGGGTTAAGCGGGTTGACACGATTACGAC ACGAATTCGTTTAACTCCAACCCATACCCATTTATTTTTTACGAATTCGTGTCGGAACCC ATATTGCCACCCCTAGTTGGTGGTTCATTTTCAAATCAGAATATCCACTCTGGCAAGCTA TTAGCCACCTCAGCGACCATTGATCACAGAATTCAGTGAGTCTGTAAGAAGATGACGTGG CGAGATCTGGATGGCAAATTTGCGAAAGTTGCATCATACTGGGTCGCCGATGCAACCCAC GCGTCAACTTCCAAGTGGACCATGGAGCCTTATTTTGTTTATTTATTTTGGTTTCCACCA ATAATAGTATCGAAATGGGCCGAAACAGAAACGACATCCGGTTCACGGACTCGTACCGCA TTTATCAAATCCAGTTAATGAATCCACTTTGATTTCCGATTCAAATCCAGACACCCACCC ACCCAACAGACCCAGACCCAGTTTTGCGTTGCGTCTCTCTCTTTCTCTCGGGGGAGGTCA AAATATTTTCACATCATTATTCTTTCCCTCCTTTACTCTCAGTCTCAGTCTCTCTGCTAT TCGATCTCTCCTTCATTTCCTGGACTCGAACAGTGAAAAAAAATAAATAGAAGAGTTGTG AAGTCGAAATCGATTGGGTG
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>LITCHI009809.m1 GenomeSequence + GCGAGGTGAAGTGAATCTGGTCACTTTGTTGGAGTGGCAGCATCCGTACTTGACGTGATG AATGGGAGATGGAACAGAGAGAAAATCAAATGGTTGCTGTTAGTTAATAAGATTCATGTG ATTTAGGGTTTGGATTGAATAGAGTGGAGTAAAAGAGAGAGAGTGATTGATGGCCAACCA GCTGTACTATGGCGCAGCGAAATCCCCAACAAGCGTCTACACTTCTCGTTCGATGACGGA CGCTGCTCTCCATTACGATCCCGATCATTCTCTTTACCATTACTCTCACACTGATATGTT GAGATACTCCAGCATCAACACCTCCTCCCAACCCTGGCCTCCTGGTGTCGATCCCACTTC TGCCATCAAACGCTCCTCCGAAGGTTCCTCCTCTTAATTTCATTTGCCCTGCATTTCTAT CATTTAACACTCCTTCATTTAGTCTTTGTCTCATGTGTCGGAGTTCAGATATTCTGCTTT TTTATACAATATATCGAATAGCTACAAGATTGGGCACCTGTATAATGTATCATAACATGT GCTTGCATTGGCATGCATGCCTCTATTGACAACTCTGCTTTCCTTTCACTTAAGTTTTAA CATATGCTACAAATATCATTATATTTTCATTTGTTTATTTCAATTATTATTAGTAGTTGC TAATAATATCTGTGAGGAGAGGTTAGTAATAATGGTTAGGCCTATGGTTTGCTCCCACAA GGTCTGAGCTTCAAACCCTCATGGTCATGGGTACCTACTTGGCCAAAGCCCATAGCATCT TGCTTCCTAAAGATTCTAGAGTTTGGTCGGAGTTCCAATATTGAACTCAGATTCGCTAGG CGGCAGCAGGGGATTTCTGGATTATCAAAATAAAGAAAAAAAAATTGTAGTTGCTTGTAT ATTTCAAGCCATATTAATATAGTTTTTCCCTTAAATATAAAATTTTAAGATTGTTTTGCT TACCTGATGTACTGTTGCATTGGGCTACTTTTATATTTTGTAAGTGTAAAGTTTACTTAT TTCTATAGTAACTGTATTTCTTAGCTGGTATTACTCTTCGTATATAATTTTTATTTCCAT GTATCTGTATATAGTTATTTACATTTGTAGTTAAAAATTATTTTATACATTATACTTATT TAGTAGCATATAACTTTTTTTCCTGTTTTGTTGTATAAATATATATACTATGTATTATAG TGCTCTACCATCCGAGTGTTTTGGGTACCCATACCACAATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGT ATGCTACCAACTCTTTAGCCAAGCGCACTAGATTCGAGAGTGCCGGCAATTTACCTGTAT ATCCACAAAGGCCAGGAGAGAAGGATTGTGCCCACTATATGCAAACAAGAACCTGTAAAT TTGGAGAAACTTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGTTCCTGAAGGTGGAATCCCAGATT GGAAAGAGGTGAAAGCACGTTGCTGTTTTCTATGTCTCTTATAATATATCTTATTAAACT AAACATTGATATATAATTCTATAATCTAATAAGTTTTATCTTGAGATGGATATCTGCTTT ATACTGATGAGGGTATTGATATAACATATGAGCTTTATTTTAATATATGTATATACAGAA TTTTTGACATAATATATGAGACAGCAGTAAGATAGTATGTATATACATTTACCACTATTT ACATAGATTATTTCCCTAGGTTTCCCCTTTCATTTGTTTTTGAGACAGGCTTTTCGCCCC TATGTGTTTCTCTCTTCTCTTACACTCGTTTTTCTCTTAGATATCTAGGTAAAGTAATTG TTGTACCAGATGAGTAGTATTCTTAGTTTACTTGAAGTGGTTAATTTGATAATTAATGCC CGAGCCTTTGTAGCTTGCTTTTGTAGTTTATGTTACCTGGATGTTTTAAGAGTGAACTGT GTTATTGGAAAAGGTATCTGTAGTTGTTCTAGCCTCTAGGTGAGGAGAAGTGATTTATAT AGGTTAGTTATTTTGTGTTTCATCGTACCCTGGAGACACAAATAAGTAGAGTAACAAAGT TGGCTTCTCTCTGTTACACATCAATAGCATAGCATATCAATCATGAGCAACATTTCTTAC TTTAAGATAACATCGTCATTGATTCGTTGTTAATCAGGTTCCACTTATCACAACGACTGA ATCTCTTCCTGAGAGACCAGGAGAACCAGATTGTCCCGTAAGCAAGATTTTAAACTTTCT TATATTTGCAAGTTATGTAATTATATTTTGGAGCTGTTAAAGTCTTAACCATTTCATCTT CTGTTTAATTTGTTGCAGTACTTTCTGAAAACTCAAAGATGTAAGTTTGGTTTGAAGTGC AAGTTCAATCATCCAAAGGATAAATTGGTTACTTCGGTAGGTGCAATTTGCATATAATGT GCCCAGTTAGTTCAAGTTTATTCTGAGTTATTTTCTTTAATTCATAAGAATATGTTGTTT TACTTTTGTTTCAGAGTGCTTCAGGAAATGCTGACATTTTTGCCTTACCGGAGAGGCCTT CTGAGCCTGCATGTGCTGTAAGATTTTTTATGTTTGGTTCTTTGGCGGAGCTTGCTATTT GGTTCTGTGATTTGCTCTTCCTATATCCTGTAATTCTTGAACAGTTCTATATGAAGACCG GGGCTTGTAAATTTGGTGCAACATGCAAGTTTCATCATCCAAAAGATATCCAGATAGCAT CAGCTGGACAAGAAAATGCTAGTGGCAAGCAGAATGAATTTTCATTTAAGGCTGGTGACA CAACAGGTGGTATGAATCCATATAATCCTCTTGTATCATTCGCCCCAGCAACATTACATA ACACAAAAGGACTTCCTTTGAGACCGGTAACTAACTATTTTGTCTGCTGTACTGGTGCAC ATGGTTTTAGTTACTTATATAATCATATACACACACACATACATATTTTTTGGAACTGGT GCTTGTGTGGTCTGTTGTTATAATTATTATCATTATTATATTGCAAGTTGTACTTGTGTG ATGACATCTTTTGTCTCCTTTATCATTTTGTTGAGCTTGTGATTTTCTTTTTCTTGAGGG TCTTTGAGGATAGTTAGCTACTTAGCTTACAAGAGTTTAGTGCTAGCTTACAACAATTTA GTGCTTCTATGGGTGAGTATAATTCACATTGGCTGTGAACTGAAGATAGGTTCTTGTCAT TTATTAGATTTCTAGAATCTTTTCTCATTAAATATTAGAGACTAAAAATGAGATGGTTTT TGAGTTTCAAATTACGTAACAATTGTTATTTAAAATGAAGGTGACTCTTTCCTTTTTGAT TGTTAGTATGTTAGGCTTTGCATTGACAATGTAGCTTTTGCTTCTCTCAGGGTGAAGTGG ATTGTCCATTCTACTTGAAAACTGGGAGGTGAATATATGAATATATGCCCATTGATGTTT AATGTTTTAGATACATATAAAGGAAGTGACAGAAGATGCTTAGATGTCTTTCATGTTTTG TGTATCAGTTGCAAATATGGCTCCACTTGTCGCTACAATCATCCTGACAGGAATGGTATG CTTGGAATTAAGAATAATTGTTCAATCTTCTCAAATGTCAATTTCAACACTTTTTTTTCT TTAAATTTCATTGCTCAATGTGTGCAGCAATTAATCCTCCTGCTGCTGCAATAGGTCACC CACTTATAACCTCTCCAGCAGCTAGTCTGAACATTGGTGTTGTTAATCCAGCTGTCTCAA TATACCAGACTATGGACCCCAGATTGGCACAGCAAACTGTAAGTGTGGTTTTTCCCTGCC TCTAAAACAACCATTTTGTTGTGATTATACCCAAACAAAATGGCCAGTTATTTCCAGGTT TTCTCTTGACACTCTGGCTATAAATAAAGTAACTTTGTGGTCATATTTGAGACGTGATGT TTTCTGTTGTTTGCCTTTTGCAGCTTGGAGTTGGCCCAAATATCTATCCTCAACGCCCTG GGCAGATGGAATGTGATGTGCGCATTTATTTAATTTAATATTCTTCTAGTAGCAACTTAT CCTATTGCCATTATCTTGTCACTGATTCTGAATTACTGAGACTTGGGGAATTTTCCTTAA CCTCTTTTCATACTTGTACATTAATTTTGTTCAATTACATTTGGGGGTGAATTTTCTAGT TTCTTTTGCTGTACAATGGATGAAAACTTCCTTGTGGCTAAGCTCTTTTTGTCAAGACAC CTCTTATTAGATTTAGTGCACCCTTAATGACTTATTTTTCTATTGTATTTTGTATTTTAC ATGCTGTAGTACTATATGAAGACTGGGGAGTGTAAGTTTGGCGAAAGATGCAAGTTTCAT CACCCTATTGATCGGTCAGCTCCTACATTGTCAGCAGCTGAGCAAACTTTTCTAGAGCCT GTTAAGCTCACTCTTGCAGGATTGCCTAGGAGAGAGGTATCAAATTCCTTTTGA