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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030869 | Chr4 | 12790148 | 12794934 | - | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030869.m1 | 80 | 166 | PF01453.27 | B_lectin | Repeat | 66.8 | 2.20E-18 |
LITCHI030869.m1 | 494 | 763 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 152.8 | 1.10E-44 |
LITCHI030869.m1 | 495 | 761 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 183.2 | 6.50E-54 |
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>LITCHI030869.m1 ATGGGTTTGTTTCGATACTGTGGAACTTTGTACTTTTGTTTACTTGTGTTCGAAACCTTT GTTTCTGGCTCCCAACATATTGGCCGGATATATCCTGGTTTTGAAGCATCTCAGACTGAT TGGATCAATACCAATGGGGTATTCTTGTTATCGAACAATTCAGTTTTCAGTTTTGGCTTT TACGCTGCTGTGGATGTTAAGTTGTTCGTGTTGGTTGTCACTCACATTAGCAGTGCGACA GTAGTTTGGACTGCCAATAGAGGCTTATTGATTAGCAATTCTGACAAGTTTGTGTTTGAT AAAAATGGGAATGTGTATTTGCAAAGGAGTGATGGTGTAGCTTGGAGCACAAATACTTCA GGGGCAAGAGTTAGATCGATGGAATTGTGGGATTCGGGTAACTTGGTTTTGCTCGAGGAC ACTGGAAGTATCCTGTGGCAGAGTTTTAGCCATCCCACCGATACCCTTTTGCCTGGTCAG GAGTTTTTGGAAAATATGAGACTAAAAAGTTTTCCAACTGCAAATAACTTGAGTGTCTAT CTTGAAATCAAGTCCGGAGATTTGGTCTTATATGCAGGATATCGAACTCCACAGACCTAT TGGTCCTTGGCATGGGACAACCGAAAAACCGATAACGGTTTAGCTGGCAAGGTCCACTCT GCATCTCTGGTTTCCAATGCGTGGAATTTCTATGATCAGAATAAGGTCTTGCTTTGGCAG TTCATAATCTCTGAAAATTCTGCTCAAAATGGTACCTGGGCGGCAATTTTAGGCTCTGAT GGGGCAATCAGATTTTATAATCTTCAAAAAGGAAAAGCAGTTTATCCTGAGGCAATCAAG ATACCAAAAAATTCATGTAGCGTTCCTGAGCCTTGTTCTCCATATTATGTGTGCTATTTC GAGAATTGGTGCCAATGTCCTAGGCCTCGCAACTCTAATTTCAGTTGCAAATCTCAAATT CCTTGGACATGTAGTAGCTCCAAGAATTCAGCAGATATGGTCTATGTTGGTGAGAAGCTT GATTATTTTGCACTAGAGTTCGTTAGGCCCTTTTCAGGTTATAATCTTGAAGCTTGCAAA AAGGCCTGCCTCCATAACTGCTCCTGTGCTGTGCTGTTTTTCGAAAATAGTGCTCAGAGT TGCTTTCTGTTCGACCAGATTGGTAGTTTGCAACGATCTCAAAATGGATCTTCTAGTTAT ATCTTGTACGTGAAGGAATCAACTGCATATGGTGGGCTAGACTCTAGAAACAAAGAAAGT GAAAATTCGGGGAAAATAATTCTAGTAACTGTATTCATAGTTGTTGGAACCATAATAGTT ATTGCTGGTTTACTGTACGTGGGACTCCGGTACCACTATAAAAATAAAAGATCAGTGGAA TTCCCTCAAGAAAGCTTGGAAGAGGAGGATTTATTGGACAGTTTACCAGGAATGCCTGTT CGTTATAATTATAGCGATCTTTGTATGGCAACTAAAAGCTTTTCAACAAAACTAGGCCAA GGAGGGTTTGGATCAGTCTATCTAGGTGTGCTAGCAGATGGTACCCATTTGGCTGTGAAA AAGTTGGAAGGCATTGGGCAGGGAAAGAAGGAGTTTAGAGCTGAAATAAGTGTAATTGGG AGTGTTCATCATGTTCATCTTGTCAAACTCATAGGCTTCTGCATGGAGAGGGCTCATAGA CTTCTTGTTTATGAGTACATGGGAAATGGTTCCTTGGATAAATGGATCTTCAAAACCAAG GAAGAAAGTCAGTTATTGAGTTGGAATGCAAGATTTAACATTGCACTTGCTACTGCCAAG GGATTAGCTTATCTCCATGAGGAGTGTGAAGCGAAGATCGTTCACTGTGACATAAAGCCT GAAAACGTTCTTCTCGATGACAATTTCACTGCCAAAGTTTCGGATTTTGGTTTGGCTAAG CTGATGAAGCGCGAAGATAGTCTTGTATATACAACAGTAAGGGGTACAAGGGGGTACCTT GCACCGGAATGGATAACAAACAGCCCTATTTCGGAGAAGACTGATGTGTACAGCTATGGC GTGGTCTTGTTGGAGATCATTAGAGGCAGGAAGAGCTATGATATGGGGGAAAATGATTCA GAGAAGGCACATCTTCCAACTTATGTGTTCAAGATGTTGGAAGAAGGGAAACTTAAAGAA ATTCTAGATCCAAGACTAGACTTCAACCCAAATGATATGACAGTTGAGACCGTGATTAAA GTTGCATTGTGGTGCGTACAAGATGACATGCAACTTCGACCGCCAATGACTAAAGTAGTT CAAATGCTTGAAGGTGTCTGTGCTGCACCGCAGCCTGCAGCCCCATCACAGCTTAGTGCT AGAGCTTACTCAGGTTTTCTAAAGTGGAGCAATGAAGAGGGTACTTCATCAGGACAGTGT GATGAAGACAGTGGTGCATGTTTATCCGATATTCGCCTATCCGGCCCGAGATGA
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>LITCHI020253.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTCCTTCTTTTACCCTATTTGTTTAGTTATTTATTTGAAAGACTATACATGATGTAGCAA CAACTTAAAAACAACCAAATTGAATGAATACATTCTACCATCAAATCATAGTTGTTTTAC TAGATTAAATGAATACTTTATACCATCAATTGGATTGGAACCAAATATCTACATTATTTT AAATGCACAGTTGTTTTTTACTAATATAATCTAAAACCATTTCCTTGAATTTTACCGTGT ACTTGAAAATTCTCGCCAGAAATTGTTGATTTTATAATCCCAAAAGTTACCAATAATATC GGACATCTTACCTGTTATATCTCAACTCATAATGTGATAATTGCTGAATGAATATGTTTT TCAAGTGAAATATAAAATCGTTAATAACTATTCATTAATTAATGAACACATCATAAATTT AGATCAAAATGAGATACAAAGAAGAGTTGTGTAGCATTACTTTGTGAGTTAAGCCAGCTA GGAGAGATCACTCTAATGAATAGTGGGAATAATAGAGGGCTGCATAATTTCATTTTCAGT TTGTTTCCTCTATACCAAAAATCATAATTTAAAAAAATGTCGAAAATTATAATGGGGTTT GGTGATAAAGTATACTCATTCAATTCAATCTAGTAATATTTTAAATTCGAATAGCCTCAC CAGCCACCGCAAATAGAACAGAAAAAGAAAAAAGTTGAAGCTTATAATAGCTATCTGATG ATTCTTTTGTCAAGATAATATGGAACCAATTTTGCATATGAAGAAACGTTGTTGCCACGA AAATTTGCCGGTTTCGGTTTCAGCCTCTTAAATAAGTGTCGACTTCCTACGGAACGGGCC TTCAAATGGTCATTTAAGTCCATTAACAAACTTACTATCCTGACTGCTACCAACTGTTCA TATGTTTTTATTTTATGGACTAATGGACTGACCGGCATTTTCCTGCGCTTGAAAAAGACA GGAGTTAAACTCATCAATGAATGACATTAGGCAGACCTCAAAGAAATGCTCCCGTTTGAG ATAAGCCAACATTTGCATTTGGCTTGAAATTGATCATATGAATTTCCAAAATATAAGCAG ATGCAAGGAATCGACCTATAAAATTATGTAGTGATGCATGCCAATAGGCCATGACAGAGC ATAAAAAAATTATAGAAACCCCAAAATCTGAAACTGGACAAAGAAATTGTCCATGTCTGA AGCTTACAAGACGCGACATTATCAAATACTACGAATATGTCATTAACTAATATTTTAAAG AAGGTAATGTGGTTTACCCCATATAGTTATTCTGGTTGATGTTATAACTTATAAGCAGGT TTGGAAGCATTTATTAAAAAAACCAAAACAATGGTTTGGAAGAAATTAGACCTTTTGGTG CAACCCAACCTGTCACCAGCAAGGTACACTCCCTTCTAGCATGTCTTTAATTCACATTTA AGACTCAATGAAAGGCAGTATTTCTCACTGTGCCAAAAAATAAGGTAACGTTTCAAGACA GGAAAGAATAAGATAATTTTATTTGACTGAAAGATTAAGGTAACACACGGAGAAAGAGAG AAAGAGAGTGTTCCATAAACCAAACAAGAAAGTGATGAACATATTTGGACAGTCAATTAC AGTAGGGAGGAAAATTTTCTGTTTATGGTAGACTAATTAATGCACTGTATAGTATATTGA CCTCTGACCGTTTAAAAAATTATTTCTAGATTGACCTTAAATGATACCATAATGAAGAGT GAGGTACCCTTTTTATTTAGTGTCCATAAAAGTGACTCTATATATGGATAAATCACTCAC AGGATGGGGGTAAGGTTCATTATAAAATGGCCTTGATTGTAGAATGGAACGATTAGAGAT TAGGCCCTAATTCATGCCACCGAAAACCTAAAATCTCACATATACGTGAATCTTTTCCTT TGTTTCTCAAGTTCCAAGTGGAACTTTTTTGTCTAAACAGACCTTCTACAAAGATTTTCC TTTGCCAACTGGCAATTGGC
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>LITCHI004254.m1 GenomeSequence + ATGGCTATGCCACAGTTTGAAATCTCTAAGTTGCTCACCGATTCTGATATTACTAAAAAA CTTGTGCTTCCGACTCAAGTTATGGTACATCTTCCTATTATAAAAGGAACACATTTTGTG GATTTACAAGTCATAGACTCAGTGGAACAAGTGTGGAAACTTCGTTACTACACTCGGCCA AAAGGAAACCGAGCAAGTCCCGTCTTCACAGTTGGGTGGCTTCGATTTGTTCGTGCTAAA CGTCTTAAAGCTGGGGATAAGTTCAACTTTTATGGACATCAAATTAGAGATTCTTATGGA GAGTTGCGGATGCAGTATGGGATTCAAGTGACTAGGATAAGTAATGTCACTTATCAAGGT GAGCCTGTTTATCTGGATGTGGAGAACTTTCTTTGA