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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030620 | Chr4 | 9503923 | 9514632 | - | Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030620.m1 | 94 | 226 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 87.9 | 7.50E-25 |
LITCHI030620.m1 | 96 | 227 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 91.3 | 6.40E-26 |
LITCHI030620.m1 | 230 | 342 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 35.5 | 7.00E-09 |
LITCHI030620.m1 | 234 | 339 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 32.1 | 8.20E-08 |
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>LITCHI030620.m1 ATGGCTTCCACTTATGACCCTTCTATTGGCCCTCCCCAGAGTTGGCAACAGAAGACACCT TCACCAACAGCCTACAATGGATCCATGCTGCCAAAGCCTGCTATACCGCCTGTGGTCACT GCGTATTCTAATGTGCCATCAATTGCTAAACCTTCTTCATCAAGTGGCAATTTAGGGTAT GATAAACCTTTCCCACCACCATCGCCAGGCATTCCATCTGGAAAGTTGCAGAGCACATTT ACTTATGAAGAATTAAAGATGGCAACAGATAATTTCGCTGAAGCAAACCTTCTTGGTCAA GGTGGTTTTGGTTATGTTCATAAAGGGGTTCTTTCGAATGGAATGATGGTAGCAGTAAAA CAACTAAAAGCTGAAAGTAGACAGGGGGAGCGTGAGTTTCAGGCAGAGGTTGATGTTATT AATCGTGTGCATCACAGACATCTTGTCTCTTTAGTTGGATACTGCATATCAGGGGACCAG AGATTGCTTGTATACGAGTTTGTTCCTAACAAAACCTTGGAATTCCATTTGCATGGAAAA GGAAGACCAGTTATGAGCTGGCCAACTAGAATGAAAATTGCTTTAGGCTCGGCAAGAGGA TTGGCGTATCTCCATGAGGAATGTCAGCCCAAGATCATACACCGTGATATAAAGGCAACT AATATTCTTCTTGATGATAGCTTTGAGGGAAAGTTTGTACAGAGTTACCTGGCTCCAGAG TATGCGTCTTCTGGAAAGCTCACTCAGAAGTCAGACACATTTTCCTTTGGGGTTGTGCTT CTGGAGTTGATCACTGGACGTCGACCTTTTGATAAAAATAATTCCTTCCTTTATGATAGC ATTGTCGACTGGGCACTGCCTTTGCTTACACAAGCGCTGGAAGATGGCAACTTCAGTACT TTTGTTGATCCAAGGTTGCAGGAGTATGACTCCACTGAAATGGCTCGAATGGTTGCCTGT GCTGCTGCCTGTGTGCGTCATTCGGCAAGACATCGACCACGAATGAGCCAGATAGTTCGA GCTCTGGAAGGAAATATACCTTTGGAAGATCTGAATGATGGAGTTGCACCAGGGCACAGC AGAGCGTTTAGCTATGGAAGCTCAGAACATGGTTCTAGCCAATACAAGGATGACATGAAG AAATTCAAGAAGTTGGCACTAGAAAGCGTAGAGCTTGGTAGCAGTGGATTCAGTGTGGTC ATCAGTGATGGTGGTCAGAACCCATCAAGCTCTAGTACTGAGGGCCAGCAAACTACTCAA GAGATAGAACTTCAGAAGGCCTGA
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>LITCHI030620.m1 MASTYDPSIGPPQSWQQKTPSPTAYNGSMLPKPAIPPVVTAYSNVPSIAKPSSSSGNLGY DKPFPPPSPGIPSGKLQSTFTYEELKMATDNFAEANLLGQGGFGYVHKGVLSNGMMVAVK QLKAESRQGEREFQAEVDVINRVHHRHLVSLVGYCISGDQRLLVYEFVPNKTLEFHLHGK GRPVMSWPTRMKIALGSARGLAYLHEECQPKIIHRDIKATNILLDDSFEGKFVQSYLAPE YASSGKLTQKSDTFSFGVVLLELITGRRPFDKNNSFLYDSIVDWALPLLTQALEDGNFST FVDPRLQEYDSTEMARMVACAAACVRHSARHRPRMSQIVRALEGNIPLEDLNDGVAPGHS RAFSYGSSEHGSSQYKDDMKKFKKLALESVELGSSGFSVVISDGGQNPSSSSTEGQQTTQ EIELQKA.
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>LITCHI030620.m1 ATGGCTTCCACTTATGACCCTTCTATTGGCCCTCCCCAGAGTTGGCAACAGAAGACACCT TCACCAACAGCCTACAATGGATCCATGCTGCCAAAGCCTGCTATACCGCCTGTGGTCACT GCGTATTCTAATGTGCCATCAATTGCTAAACCTTCTTCATCAAGTGGCAATTTAGGGTAT GATAAACCTTTCCCACCACCATCGCCAGGCATTCCATCTGGAAAGTTGCAGAGCACATTT ACTTATGAAGAATTAAAGATGGCAACAGATAATTTCGCTGAAGCAAACCTTCTTGGTCAA GGTGGTTTTGGTTATGTTCATAAAGGGGTTCTTTCGAATGGAATGATGGTAGCAGTAAAA CAACTAAAAGCTGAAAGTAGACAGGGGGAGCGTGAGTTTCAGGCAGAGGTTGATGTTATT AATCGTGTGCATCACAGACATCTTGTCTCTTTAGTTGGATACTGCATATCAGGGGACCAG AGATTGCTTGTATACGAGTTTGTTCCTAACAAAACCTTGGAATTCCATTTGCATGGAAAA GGAAGACCAGTTATGAGCTGGCCAACTAGAATGAAAATTGCTTTAGGCTCGGCAAGAGGA TTGGCGTATCTCCATGAGGAATGTCAGCCCAAGATCATACACCGTGATATAAAGGCAACT AATATTCTTCTTGATGATAGCTTTGAGGGAAAGTTTGTACAGAGTTACCTGGCTCCAGAG TATGCGTCTTCTGGAAAGCTCACTCAGAAGTCAGACACATTTTCCTTTGGGGTTGTGCTT CTGGAGTTGATCACTGGACGTCGACCTTTTGATAAAAATAATTCCTTCCTTTATGATAGC ATTGTCGACTGGGCACTGCCTTTGCTTACACAAGCGCTGGAAGATGGCAACTTCAGTACT TTTGTTGATCCAAGGTTGCAGGAGTATGACTCCACTGAAATGGCTCGAATGGTTGCCTGT GCTGCTGCCTGTGTGCGTCATTCGGCAAGACATCGACCACGAATGAGCCAGATAGTTCGA GCTCTGGAAGGAAATATACCTTTGGAAGATCTGAATGATGGAGTTGCACCAGGGCACAGC AGAGCGTTTAGCTATGGAAGCTCAGAACATGGTTCTAGCCAATACAAGGATGACATGAAG AAATTCAAGAAGTTGGCACTAGAAAGCGTAGAGCTTGGTAGCAGTGGATTCAGTGTGGTC ATCAGTGATGGTGGTCAGAACCCATCAAGCTCTAGTACTGAGGGCCAGCAAACTACTCAA GAGATAGAACTTCAGAAGGCCTGAGAAAGACACCAATGTCTGATCCAACCATTGGCTGCC ATGCGTTTGCTACACTCTTCCTTAACTGATCCAACCATTCAATTCCAAGATTTTCTCTGT AGTTATATGCCACATGTCAGCAAGTCGAGTACAAAATTAGGACATGCCAATGGTAGGTGT AGTGGATCAAATATTGGAAAAAGACAACGTTAACTATCATTCAGGTTGATGAGATTTTTC CAAGATGTATTATTGTTGAAGACATTTGGTTTTTCAGTTTGTTTCTTTATTGGTATTGGA GATTCATTGGTTTGTAAGTCTCATAAAGTGATAAGGCAGTTTTTATTTGTCAATTTTTAT TCATGAACATTCTGTTTCCTGGTATGAATGTAAAACAATTACAAGACACTTCTATGAGCT TTTGTTTCTTCCATTTATCTAAGGATTAATATGCATAATTTAATGGTAC
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>LITCHI030620.m1 - Up_Stream_Len 2000 GAGATGCGAATGTGATGAAGATTGCATCACAAGACAACCTTGCTGATCCGTTTACTAAGA CCTTAACGGCTAAAGTGTTTGAAGGTCATCTAAAGGGTCTAGGATTACGAGATATGTCCC ATCTACTCTAGGGCAAGTGGGAGATTGTTGGGTTTTGTGCCCTAAGAGCTTGTAATTATG TAAACGGTTTTAATAAATAATAATAAAGTATTTATTCTATTCAATTTATATGTTTTGCAA AAATTGTATATGTCATGAGAAACATCCTTGATTACTGATGTATTTTCAAACTAAGTATAT AAGTGTTATATACAAGCGGATTTAGTTTGAGAGAAGTAATCTAAAGAGTCCGTAGAAAAC AAACGAAGCTGGGTACTTTGTTTGTGGTAAATCTACAGTTGCGGTCCATTTTGTATTCGG TACAATAGTTTTATCCGAGACTATTCATGTAGTGACATGGAAATGGAGGCACCTTATATA ATAAAGATTATATAGGACTGGACCACGATAAATATGAGTTTCTAATTAATATCCGTTAAA CTTAGAGATTTATATTTATCGACTAGATGATCATATATGAATTGATCTTAATCCTGAGTG TATTATGGACTCCTGCTTGTTGAGTTATGTCATTTGATTTACATGGGTGAGATCGATATA GATGCTCGATCAATAACTTCGTACTTTGGGGATATGATTTAGTAAGTAGCTGGGAACATT CTATACAATAGTGGAATCCACTCCTTCTTGCGAGAAGTAGAGAAATAGTTCTCTTAAGGG TTGATTCAGGTCTTGAACAATAAGAGCGCTCAACTTTCTGTTCATATGTAAACAGAAAGA TAAATTCATAAGTTGTTATGAATATATTGTTCATTAGAGAATCAATGGTAATTAAGGATC AAGATATAATTAGAGGGGTATAACGGACATTATGACCTAGCTCTAATTATGAACTATTTG TGGAGGATCAAATCATATGTAGTGATTATATCAATGGACACTGAAAATTTCAGATTGTAT AAAAATATCTATAGTTTTGAGAGTGCAATCTTAGGTTTTTAGTGGAGTAACTCTAAGATT AATAATAGTGAATTATTTAATTAAAGAGTTTAATTAATAATTCCGATATTATTGGAGCTC AAAACTGTAGGTCCATCGGGTCCCCTTGATAGCTCATTTCACTATAAGAAACGTGTATAT AGAATATTGTAATTGGATCGTCCAATTATAGTTGTTACATAAGTAACAAAATATGTGTTC ACTTGATATTTGAATAATATTGATTATTCAAATTATTATTTAGTTAATTATTAATTATGA ATTAATAATTATTTAATTAATTTTATAAGAGGTCTTGAATTCAATTATTAGTTGTGACCG AGTATAAATTAATTATGAATTAATTATAGGTCACAAGTATGATTACAAAATATAACATGA ATTAATTGTGAATTAATTATGTTATATGGGCAAAAGTTTAATTTTAATAAACTTGGGGTT TAATATTAATTTTGATTAATTAAAACCCTAATTGGTTGCCTATAAATAGAAAAGAAATAG TATTCTTTTCTTAACAGAAGTTATATTTAGGTTTTGTTTTACGTTCTTTAAAACAAAAAA CCTATTCTCACCTCTTAGATATATTTTTGTTCTTTTGAGAAAAGAAATCAATAGAAAGTG AGCACAATTCTATATAATTGTGCCCACTCACTTGTTTTTTGGTGTAGAGACATATCAAGG AAGGCAAGGTGGTGAGCAATCCACAGAGATCAATACAAAAGGTATAAGATTCGATCTTTA ATTTAGTTTTATTATTTTATTTCATTGTTTTATGGATCTAGGTTTCTTGAGTTTTCTAAA AAAATTTTAAAACTCAATGTTCCGCAAATCTTTATTTTATAAAAACAATTGTTGTTTTTT TCCCTTCAAGAACTTGCTAAGGATTCTAGTGAAGATTGCATTTATGGTGAGTGTGAGTAG CTGTTCATACAAATTTGAAC
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>LITCHI030620.m1 GenomeSequence - ATGGCTTCCACTTGTGAGTAGCTATGGCTGTTCTAGATGTATTGATGTTGTCTTGTGTGT GTTGTAATGGATGTAAATTTCAAAATTCAGATTTGTGAAATCGTGGTTTGTGTCCTTAGT GATAGGCTTTTTTCATTATGTTATGAAATAGAAGTAGTTTTTGAGGAGTTGAATAGTTGA AGTACTGGTGTGTAATCATAAAGTTAGCAGTTGAACAATATTTAAAACTCTTGAAATAAA GAGCTATATTACCATTAAGCAAACTTCGGATGAGGGAGATAAAGACGTGTTTATTTTTCC TCATTGGGTTTCATCTATCTTTGTCATGAAAAATGATTAGGAGTATTTGCAAAGAAACAC GTGTTAAATATTATGACGCTTAAAACCATAAACTATTAGAAAAGGGCCTAAAATAGTATC CAAGCACTATAATACATTTCCATAGGTGCAAGAACAATGCTTGCCACGTAGCCCAAGCTG AAACACAAACGCATAACAAATTTAAATAATAATTATGTGGGGGTGAGCTTAGGCACATCA ATGGAACAAGGTTAATACCATGTTAAAAACCACTAGACCTAAAAGTTTAAGCTACAAGGA AATAGCCTATACAGTTATAGCCCAACAATTGTATAGAAGCACTCTAACTTAGGCACATCA ATAAAACAAGGTCCCTTGTTCCCTTGCTTCCCTGAGGGTAGAATCTTGATGTTTGTCATA GCTTTATCCTCATGATCAATGGAACTAATGATAAACTTGAATCTATATTGGTCCATGTTT TAATTATCTGAGAGGAAATATTTTAAATGTTGTTTACATGCTTCATATCTCTAACAGTTG ATCTCATTTTTCCTTCTTCATCTTTTTTCTTTTTAAACCCTTTTTTGCTTTAAAAAATCT 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