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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030614 | Chr4 | 9412376 | 9414358 | - | Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030614.m1 | 36 | 90 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 34.4 | 1.60E-08 |
LITCHI030614.m1 | 39 | 79 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 27.3 | 2.10E-06 |
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>LITCHI030614.m1 ATGAAAATTGCTCTAGGCTTAGCGAGAGGATTGGCATATCTGCATGAGGATTATTTTAGA TTTGCTAAGTTTTCTTTAGGTTCAAACTCTCATGTCTCCACTCGAGTCATGAGAATATTT GGTTACTTGGCTCCAGAATATGCATCTTCTGGAAAGCTAACTGAGAAATCAGACACATTC TCCCTTGGGGTTGTGCTTCTAGAGTTGATCACTGGACGTCAACCTTTTCCTAGAAATAAG TGCAATCTTGATGATAGTATGGTTGACTGGATATGTTCTTGTGCACTTGTGGGTACTATC TCTTATATAATTGAACATGTACTCAGCAAAATGACTTATATCACTATGAATTTTAGGCAA AGCCTTTGCTTACACAAGCTTTGGAAGATGGCATCTTCTATATATGCTTTTGTTGATCCA AATTTGGAAGAGTATGATTCTAGTGAAATGAAACAAATGGTTGCCTGTGCTGCTATCTGT GTACGTCATTTGGCTACACATAGGCCACGGATGAACCAGATGGTTCGAGTTCTAGAAGGA ACTATTTCTCTGGAAGAATTGAATGAAAGAGTCACATCAGGGCATAGCAAAGCATCTAGC TATGGAAACTCAGAATTTGATTCTAGCCAATACAAGGATGACATGAAGAATTTCAAGAAA TCGGCACGAGAAAGTGGAGAGCATGGTAGTATTTCAATTCACTACTGA
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>LITCHI030614.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTCTTAAAATACTAGGGATTAAAAGGAAGTTTCCTTTTAAATTTTGGATAATTATCATTT GTTTGTTGTCTTGTTTTCTATCTGTAGCTTTGCATTGAATACAAGGGTTGACAAAATGAG CAAAGATTCTTTATTATTATTATTATTTTTATTTTTATTTTACTAAACTTTTGATATTCT AGTGAAACATTAACACAAAAATAGTGGATGACCAAGATTATTACATTTTTATTCTCTTAT AAATCACATAAATTTAAGTTTTTATTATAAAAAACTTAAATAAAAAATTAATAGGGAATC TTTACTCTACACAAACAAAAAATTAACATAAAATCATTGCTCTGACAGAATATTTGTTGT CTTTTGTGATTTATGATTTCCTATTGTTTGAAAATATAGATGTTCTAATTAATGTATGAG TTTAGTTCAATAATTAATGCAGATGTTCAAATATTCACTCAATTTTGTAGTCGATTAAGG TGACCATATACCGTATGAACAGTGGCGGACCCAGACATTTATTTTAGGGGGGGCACCTTA TAACAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGATAAAAATAATTATAATTTATATAA GTTTTTTTAAGTATAGTTCATATGATTTTTTTTTACTTATAAATTTTATCATGTAAAATA ATTTATGTAGAAGAAAAATAATTCATGATATATTTTTATCATCTTTTTTTATAGTTCAAA CCTATATATGATGTATTTTTTAGAAAAAAAAAATATTATGTATTATGGTGGGGAATAAAA CCGTACACAGCGCATATTTTTTTTTAAAAATAAAAAGAGAGAAAAAATTATGTGTTATTA TAATTTTGAAAAAAAAATTATCTATTATGGTGGGGAATTGAACCATAATGATACATAAAA AGGAAGATCAAACCTTATGGCACCAACACTTTTTTGTATTTGTCATCTAATTTACTTTAA AAGTTATATATGAAATAACATAGTGTATTTTTGTAGAAAAAAAACTTGGGAAAAAATTTT TGTTTTGCGGGGGGTATCGAACCTGTAACAAGTACTAAAAAGGCGAGCCTCATACCCATT GCACCATCTTCTGACAGTGAGCATGTTTACTTTAAATTTTATATATCACATGACCATGGT GCTTCTTTTGAAAATAAAATAAGAAAAATGTATATGTTGTGGTGGGGGAGCGAACCAGTA CCAGGAGAGTAAGAAAGCACGCCTCAAGCCAGCGACGCTGGTTACGTAAAATAATCTCTT TTTCCTTCAAATTATATATATAATATATTTAAAGATTTAACAATTAATATTATTAATTTA ATTAATTTTCAAAAAATTTCAGGGGAGGCACGTGCCCCCCTGCCCCTAAGGTAGGTCCGC CCCTGCGTATGAACAAAATTAATTGGAGTTCGATGTGACAATATCTGCTGACAATACTTT CTGTTGGTCTATATTATTCTCTCCAGATGACCCACCACCATCCCCAAGCCCTCCAATTGG AAATTTGCAAGGCTCATTTACTTATGAAGAACTAAAGATGGCAACGGATAATTTCTCTGA AGCAAACCTTCTTGGTCAATGTGGTTTTGGTAATGTCCATAAAGGGATTCTTCCAAATGA AAAGGTGGTAGCAATCAAACAGCTAAAAACCGGAAGCCGACAAGGGGAGCGTGAGTTTCA GGTAGAGGTTGACATAATTACTCGTGTTTATCATAGACATCTTGTCTCTCTGGTTGGATA TTGCATGTCCCAGGAGCACAGGTTGCTTGTATGTGAGTTTGTTTTTAACAAAACCTTGGA ATTCCATTAACACGGTTAGTCCTTTCAGGAACTGGATTTCATTGACTCTATGACCTTGCC AAAAAGAAAAAAAAAATTGAAAAGGGGTTGTTTGATAAGTGCATAACATTTTGCAAATCT TAAATCAAGATACTGTGGTCTTACCAAATTGATACAATATCACAGGGAAAGGAAGAGCAG TTATGAGTTCGCCAATTAGA
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>LITCHI030614.m1 GenomeSequence - ATGAAAATTGCTCTAGGCTTAGCGAGAGGATTGGCATATCTGCATGAGGATTGTGAGTAT TCTGTGCGTTCTATTTTATCAACTGAAACTATATGTATCTCGGAGTTTCACTCTTTTTGG GGCAAATGTATCTTCAGGTAACCCTAGGATCATACATCATGATATTAATGTAGCTAATAG TCTTATTGATGAGAGCTTCAAAGCAAAGGCATGATTTTTATTCTTTTCGCATTACTTGTA GTTTACATATGGAACTATTCTTTACGCATCTATATAGTTTATGTAGGAGTTTGTAAGTGA GTTACAAAGTCTGATCAGTTTAGATTTTTGTAAATTTCATATTCTCTCCTTGCTTGCTAA AAGGGAGGGTGTCTCTGTTAGTGAGTTTGGTGTTCTGTGTCTGGTTGTGGTAGGATGAAA TTTTGTTCCTCTTATCTCTTCCAAGAATTTAAGAAAATCTCACATCGCAAGTCATAGTAC TATAAACATCATCTTAATTTTCACCCTAATGCTCGTTCCAATAATAAATGAAATATCTTC ACTAAATATCTTTGCTAAGTGTTGATTTGTTATTTATAAATATCAAAAGGATTCTTTTAC AACACACACATCCAAAATCCAAAACTAATGTAAAATTTATATTTATTTTTTCAATATATC AATTAAACTATTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTTTTTCTTTATGTTTTCAATCCTTATACA CAGATTAACATAGTCCATTTAGAACCTTTTAATAGGTATTGCATGGCATTTGCAAATGCA TCCATTAGTTGGAGTTGCCAAATTTAAACTTAGTTTATCTATGTGAATTAACAGAATTGT GAGGAAGTATAATAAATTTATCTACGTGAATTAACAGAATTGTGAGGAAGTATAATAAAT TATATCTTAAAACTATAAATGTTGTGTACACTAGTATGACATAGATTTGTTTGAAAATGT TGTGAAAGATACCTTTCTTATTTGAGATTGAACCTCATTTCAATTTATTATTTGAGATTG CAGATTTTAGATTTGCTAAGTTTTCTTTAGGTTCAAACTCTCATGTCTCCACTCGAGTCA TGAGAATATTTGGGTAAATTACGTTTTCTTGATTATTATGTATAGTTGCCATACTTCAGT AAATGCAATTAGTTATCACATGCATCTTGATCAACCAATCCTTTGTCACTTCTGATGCAA CATTCACCAAATGTAGTTACTTGGCTCCAGAATATGCATCTTCTGGAAAGCTAACTGAGA AATCAGACACATTCTCCCTTGGGGTTGTGCTTCTAGAGTTGATCACTGGACGTCAACCTT TTCCTAGAAATAAGTGCAATCTTGATGATAGTATGGTTGACTGGATATGTTCTTGTGCAC TTGTGGGTACTATCTCTTATATAATTGAACATGTACTCAGCAAAATGACTTATATCACTA TGAATTTTAGGCAAAGCCTTTGCTTACACAAGCTTTGGAAGATGGCATCTTCTATATATG CTTTTGTTGATCCAAATTTGGAAGAGTATGATTCTAGTGAAATGAAACAAATGGTTGCCT GTGCTGCTATCTGTGTACGTCATTTGGCTACACATAGGCCACGGATGAACCAGGTACTTC ACCAAATGTTATAAACGTAATTTTGGTTTTAAGTTCATAAACCAATATTTAATCATATAT TGTTAGTAGTTTGACAAAATTGAATGATTTAAATGTGACTTATGCTAGAATGCTAATTAT GAAATCTATACTTGTATAAATATAATCCTTTTATCATGTAACCATGTTAAGCAGATGGTT CGAGTTCTAGAAGGAACTATTTCTCTGGAAGAATTGAATGAAAGAGTCACATCAGGGCAT AGCAAAGCATCTAGCTATGGAAACTCAGAATTTGATTCTAGCCAATACAAGGATGACATG AAGAATTTCAAGAAATCGGCACGAGAAAGTGGAGAGCATGGTAGTATTTCAATTCACTAC TGA