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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030582 | Chr4 | 9123580 | 9133412 | + | Homeobox-leucine zipper protein GLABRA 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030582.m1 | 168 | 223 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 67.7 | 6.40E-19 |
LITCHI030582.m1 | 341 | 561 | PF01852.22 | START | Domain | 187 | 3.10E-55 |
LITCHI030582.m2 | 104 | 324 | PF01852.22 | START | Domain | 187.9 | 1.60E-55 |
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>LITCHI030582.m1 ATGAGTTTAGAGAGCTGGTTTTGTTTTATATCCTTAAATCAAGCATACCCCACCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTTCTATCTCTCTCTATGTGGATTTGAGCTCCATTGCTGGGTCCTTT AAAACAGCCATTTCATCAACCGCAGAAGAAACCCCCCACTACTTTTTTCTCCTTGCCATG GGCGTGGACATGTCTAACAACCCACCCACTTCTCGCACCAAAGACTTCTTTGCCTCTCCT GCTCTCTCACTCAGTCTTGCTGGCATATTTCGAGATGCCGGCACGGCGGCTGCAGCCAGC ATGGAGGTGGAGGAAGGGGATGAAGGGAGTGGAGGAGGCGCCAACGGAGGAGGAGGAGGC TCCTCTAGTAGAAGAGAAGACACTGTGGAGATTAGTAGCGAAACCTCGGGCCCCGCAAGA TCAAGATCGGATGATGAATTTGATGGAGGAGAGCATGATGATGATGATGATGGTGGTGGA GATAAGAACAAGAAGAAGAAAAGGAAAAAGTACCATCGACACACCGCCGAGCAAATTAGA GAAATGGAAGCGCTTTTTAAGGAGTCACCGCACCCAGATGAGAAGCAAAGGCAACAACTT AGCAAGCAATTAGGCCTTGCTCCTAGACAAGTTAAGTTTTGGTTTCAAAATCGTCGAACA CAAATTAAGGCTATACAAGAGCGACATGAGAATTCATTGTTGAAAACTGAAATGGAGAAG CTTCGAGATGACAACAAGGCCATGAGAGAGACCATAAACAAAGCTTGTTGCCCCAATTGT GGCACGGCCACAACCAGCAGAGACACGTCCCTCACCACTGAGGAACAACAACTACGTATC GAAAATGCCAAACTCAAAGCTGAGGTGGAAAAGCTTAGAGCCGCAGTTGGGAAGAGCACA GCAGGAGCAACATCAACAAACTCATGCTCAACAGGAAGTGACCAAGAGAACAGAAGCTCA TTGGATTTCTATACAGGGATTTTCGGGCTGGAGAAGTCAAGAATCATGGAGCTGGTTAAT CAAGGAATGGAAGAGCTCAAAAAGATGGCAACTGCTGGTGAACCACTTTGGGTTAAAAGT GTTGAGACTGGCCGAGAAATACTTAACTATGATGAGTATGTCAAAGAGTTTTCGGTTGAA ATTCCAAGTAATGGCAAGCCTAAAAGGTCCATTGAAGCTTCCAGAGATACTGGAGTTGTC TTTGTAGATCTTCCAAAACTTGTTCAAAGTTTCATGGATGTGAATCAATGGAAGGCAATG TTTCCATGCTTGATTTCAAAAGCAGCTACAGTTGATGTAATTTGCAATGGAGAAGGTCCT AATAGGGATGGTGCTGTGCAATTGATGTTTGCAGAGATGCAAATGCTGACTCCACTGGTG CCAACAAGGGAAGTCTATTTCGTAAGATATAGCAAGCAACTAAGTGCTGAGCAGTGGGCA ATCGTTGATGTCTCCATCGATAAAGTAGAAGAAAATATCGATGCATCTTTAATGAAATGC AGAAGAAGACCATCCGGCTGCATAGTTGAGGACAAATCAAATGGCCACTGCAAGGTTATT TGGGTAGAACACCTAGAATGCCAGAAGACCGCGGTTCATTCGATGTACCGTACCATTGTT AGCAGTGGTCTAGCCTTCGGTGCAAGGCATTGGATGGCAACATTGCAGCTCCAATGCGAA CGGCTTGTTTTCTTCATGGCAACAAACGTTCCTACAAAGGATTCAACAGGCGTTGCGACT CTGGCTGGGAGGAAGAGCATCTTGAAGTTGGCACAAAGAATGACATGGAGCTTCTGTCGG GCAATTGGTGCATCGAGCTACAATACATGGAACAAGTTCTCAGGCAAGACAGGGGAGGAC ATAAGGATTTCTTCCAGGAAGAATTTAAATGACCCTGGAGAACCTCTTGGGGTGATCTTG TGTGCAGTTTCATCCGTTTGGTTGCCTGTGTTGCCACAAGTCCTTTTTGATTTCTTGAGA GATGAAGTTCGCCGAAATGAGTGGGATATTATCATGTCAAATGGAGGTCCTGTGCAGTCC ATTGCAAACTTGGCTAAAGGGCAAGATCGTGGCAATGCAGTAACTATTCAGACTGTGAAA TCAAAAGAGAACGGTATGTGGATACTCCAAGATAGCTGTACAAACTCTTACGAGTCCACG GTGGTCTACGCTCCTGTGGACATCACTGGTATGCAGTCTGTGATCACTGGATGTGACTCA AGCAACATTGCTGTGTTGCCTTCTGGGTTCTCAATTCTTCCTGATGGACTTGAGTCAAGA CCTCTAGTGATCACTTCCAGGCAAGAGGAGAAGAGCACAGAAGGAGGATCTTTGCTTACT ATAGCATTCCAAATCCCAAGTAACTCTCCCACAGCCAGGCCAACCATGGAATCAGTGGAG AATATAAACACACTTATATCATGCACATTGCGAAATATCAAGACGAGCTTGCAATGTGAA GATGCTTGA >LITCHI030582.m2 ATGGAGAAGCTTCGAGATGACAACAAGGCCATGAGAGAGACCATAAACAAAGCTTGTTGC CCCAATTGTGGCACGGCCACAACCAGCAGAGACACGTCCCTCACCACTGAGGAACAACAA CTACGTATCGAAAATGCCAAACTCAAAGCTGAGGTGGAAAAGCTTAGAGCCGCAGTTGGG AAGAGCACAGCAGGAGCAACATCAACAAACTCATGCTCAACAGGAAGTGACCAAGAGAAC AGAAGCTCATTGGATTTCTATACAGGGATTTTCGGGCTGGAGAAGTCAAGAATCATGGAG CTGGTTAATCAAGGAATGGAAGAGCTCAAAAAGATGGCAACTGCTGGTGAACCACTTTGG GTTAAAAGTGTTGAGACTGGCCGAGAAATACTTAACTATGATGAGTATGTCAAAGAGTTT TCGGTTGAAATTCCAAGTAATGGCAAGCCTAAAAGGTCCATTGAAGCTTCCAGAGATACT GGAGTTGTCTTTGTAGATCTTCCAAAACTTGTTCAAAGTTTCATGGATGTGAATCAATGG AAGGCAATGTTTCCATGCTTGATTTCAAAAGCAGCTACAGTTGATGTAATTTGCAATGGA GAAGGTCCTAATAGGGATGGTGCTGTGCAATTGATGTTTGCAGAGATGCAAATGCTGACT CCACTGGTGCCAACAAGGGAAGTCTATTTCGTAAGATATAGCAAGCAACTAAGTGCTGAG CAGTGGGCAATCGTTGATGTCTCCATCGATAAAGTAGAAGAAAATATCGATGCATCTTTA ATGAAATGCAGAAGAAGACCATCCGGCTGCATAGTTGAGGACAAATCAAATGGCCACTGC AAGGTTATTTGGGTAGAACACCTAGAATGCCAGAAGACCGCGGTTCATTCGATGTACCGT ACCATTGTTAGCAGTGGTCTAGCCTTCGGTGCAAGGCATTGGATGGCAACATTGCAGCTC CAATGCGAACGGCTTGTTTTCTTCATGGCAACAAACGTTCCTACAAAGGATTCAACAGGC GTTGCGACTCTGGCTGGGAGGAAGAGCATCTTGAAGTTGGCACAAAGAATGACATGGAGC TTCTGTCGGGCAATTGGTGCATCGAGCTACAATACATGGAACAAGTTCTCAGGCAAGACA GGGGAGGACATAAGGATTTCTTCCAGGAAGAATTTAAATGACCCTGGAGAACCTCTTGGG GTGATCTTGTGTGCAGTTTCATCCGTTTGGTTGCCTGTGTTGCCACAAGTCCTTTTTGAT TTCTTGAGAGATGAAGTTCGCCGAAATGAGTGGGATATTATCATGTCAAATGGAGGTCCT GTGCAGTCCATTGCAAACTTGGCTAAAGGGCAAGATCGTGGCAATGCAGTAACTATTCAG ACTGTGAAATCAAAAGAGAACGGTATGTGGATACTCCAAGATAGCTGTACAAACTCTTAC GAGTCCACGGTGGTCTACGCTCCTGTGGACATCACTGGTATGCAGTCTGTGATCACTGGA TGTGACTCAAGCAACATTGCTGTGTTGCCTTCTGGGTTCTCAATTCTTCCTGATGGACTT GAGTCAAGACCTCTAGTGATCACTTCCAGGCAAGAGGAGAAGAGCACAGAAGGAGGATCT TTGCTTACTATAGCATTCCAAATCCCAAGTAACTCTCCCACAGCCAGGCCAACCATGGAA TCAGTGGAGAATATAAACACACTTATATCATGCACATTGCGAAATATCAAGACGAGCTTG CAATGTGAAGATGCTTGA
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>LITCHI030613.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGAGAGAGTAAGTGAGAAGAGATGAACACGAGAGAAAAGCTAATTAAGCGTTGAATGGA CTGAGATTGCTTGTTTTGAAGGTTCTAATGAATGGCAAAATGAGAAGTTTAACTATTTTA GTACCATAAAATTCATTTTTCAGTTCAATAAACAAAACTCATAATATTTTTAGCTTTATT AGATGATATTATCACTTTTATTATTATTATTATTATTTTGAATTAATACAACCGAAAATT TTTGAATGAAGAAGTAATTAAAATCCACAATCTTATAAACATAAGTGTGAAAAAGTACAA TTTAAGAAAAAAGGTGTAAAAAAGTACAGCACCAATCAATTGATCTTATTATGCAAAGTG GAGTTGGTGCAATATTAAAATGCTACCCCCACCCATACTTCTCTAAGATCATGGGTTCAA GCACATCCCCTACTAATGTATGAGTTTCTTCCCTTACTCTTAATGGGCTGCCCCCCTTTC TTTTTGTAGATTGACCTCTCTCATTCATAGTAGCTAATCTCAGGGACACACCATAATACC TATCGCTATTGATTTCAATTGTAGCATAGACTGGTCTCAATCATCAAAAGAAAAAAAAAC AAAAACAAAAACAAAAACAAAATTAAGGGATAATTATATTTTCCCCTTGTAGTTTGACAT AATACTAAAACACTCCGATATTTCTAGAAATCACTAATAACTCCAATTCGATTCATAAAA TAAATTAAATATCTCTCGTAATTTATGAAAATGTCCAAAAAAATCCCTTGCTATTAAATT TGATTTTGAAAATCAAAGTTTGATTGTTAATATGAAAAAAGGCAAGACTGTAGGGGCATT TTGGTTATGTTGATCATTTCAATAATGACAGTAACAATAAAAGAGAGAATGAGATTCCCT AAAATTACAGGAAAAATTAGTGATTATGTCAAACTACAAAGAGAAAAGAAAGATTATCCC CAAAATCAATTGATCTATTCATTATCTAAAAATCTTATCATTAATTATACAAATAATTAT CAATTAAGTAGATCTTAACGTGGATATCTTCACAACTCAAACAATGATATTTTGGATTAG TTATAAATTTTGGTAGATCTGGACCAATTCAATATAAAGCATCCAAAAGAAGAATGTGAT TTTCTAATTGAATCACTAAACTTACTCCTTAATTTGAAATACTTCGATTGGTTGCAAGAG TAGTTACTGAAACTAATCCAATAATTCCAATTGAGAAGTAAAGCTAATGATTATATAAGG GAACTGTTATCCATAAAGAAAGGCTCAACTCCTACCGTTACGATTGCTCTCCCAAGTCTT TGCATGTTAACAAACATCATCGTCGGACATGAGACGAGTGAAAGTCAACCCACCAAGACA AAAACTTCGATTTTTACAATATTTCACATTGTAAACCTCTTATACAACACACACAAACCA CTAAAAATAAAAAATCCAAACTCTCTCCATCCGGCCATGGAGTCACCAGCGCTGGAATGT TAACAAACATCATCGTCGGACATGAGACGAGTGCAAGCCAACCCACCAAGACAAAAACTT CGATTTTTACAATATTTCACATAGTAAACCTCTTATACAACACACACAAACCACTAAAAA AAAAAAAAAATCCAAACTCTCTCCATCCGGCCATGGAGTCACCAGCGCCGGAATGTTAAC AAACATCATCGTCGGACATGAGACGAGTGCAAGTCAACCCACCAAGACAAAAACTTCGAT TTTTACAATATTTCACATAGTAAACCTCTTATACAACACACACAAACCACTAAAAATAAA AAAATCCAAACTCTCTCCATCCGGCCATGGAGTCACCAGCGCTGGAATGTTAACAAACAT CATCGTCGGACATGAGACGAGTGCAAGCCAACCCACCAAGACAAAAACTTCGATTTTTAC AATATTTCACATAGTAAACCTCTTATACAACACACACAAACCACTAAAAATAAAAAAATC CAAACTCTCTCCATCCGGCC
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