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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030577 | Chr4 | 9096378 | 9106199 | + | Homeobox-leucine zipper protein GLABRA 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030577.m1 | 139 | 194 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 67.7 | 6.20E-19 |
LITCHI030577.m1 | 312 | 532 | PF01852.22 | START | Domain | 187 | 2.90E-55 |
LITCHI030577.m2 | 139 | 194 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 68.1 | 4.70E-19 |
LITCHI030577.m2 | 312 | 532 | PF01852.22 | START | Domain | 187.6 | 1.90E-55 |
LITCHI030577.m3 | 2 | 43 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 53.8 | 1.40E-14 |
LITCHI030577.m3 | 161 | 381 | PF01852.22 | START | Domain | 188.5 | 1.00E-55 |
LITCHI030577.m4 | 2 | 43 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 54.4 | 9.20E-15 |
LITCHI030577.m4 | 161 | 340 | PF01852.22 | START | Domain | 141.3 | 3.00E-41 |
LITCHI030577.m5 | 139 | 194 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 68.1 | 4.70E-19 |
LITCHI030577.m5 | 312 | 532 | PF01852.22 | START | Domain | 187.6 | 1.90E-55 |
LITCHI030577.m6 | 139 | 194 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 68.5 | 3.50E-19 |
LITCHI030577.m6 | 312 | 491 | PF01852.22 | START | Domain | 140.1 | 6.60E-41 |
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>LITCHI030577.m1 ATGTGGAATTTGAGCTCCATTGCTGGGTCCTTTAAAACAGCCATTTCATCAACCGCAGAA GAAACCCCCCACTACTTTTTTCTCCTTGCCATGGGCGTGGACATGTCTAACAACCCACCC ACTTCTCGCACCAAAGACTTCTTTGCCTCTCCTGCTCTCTCACTCAGTCTTGCTGGCATA TTTCGAGATGCCGGCACGGCGGCTGCAGCCAGCATGGAGGTGGAGGAAGGGGATGAAGGG AGTGGAGGAGGCGCCAACGGAGGAGGAGGAGGCTCCTCTAGTAGAAGAGAAGACACTGTG GAGATTAGTAGCGAAACCTCGGGCCCCGCAAGATCAAGATCGGATGATGAATTTGATGGA GGAGAGCATGATGATGATGATGATGGTGGTGGAGATAAGAACAAGAAGAAGAAAAGGAAA AAGTACCATCGACACACCGCCGAGCAAATTAGAGAAATGGAAGCGCTTTTTAAGGAGTCA CCGCACCCAGATGAGAAGCAAAGGCAACAACTTAGCAAGCAATTAGGCCTTGCTCCTAGA CAAGTTAAGTTTTGGTTTCAAAATCGTCGAACACAAATTAAGGCTATACAAGAGCGACAT GAGAATTCATTGTTGAAAACTGAAATGGAGAAGCTTCGAGATGACAACAAGGCCATGAGA GAGACCATAAACAAAGCTTGTTGCCCCAATTGTGGCACGGCCACAACCAGCAGAGACACG TCCCTCACCACTGAGGAACAACAACTACGTATCGAAAATGCCAAACTCAAAGCTGAGGTG GAAAAGCTTAGAGCCGCAGTTGGGAAGAGCACAGCAGGAGCAACATCAACAAACTCATGC TCAACAGGAAGTGACCAAGAGAACAGAAGCTCATTGGATTTCTATACAGGGATTTTCGGG CTGGAGAAGTCAAGAATCATGGAGCTGGTTAATCAAGGAATGGAAGAGCTCAAAAAGATG 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