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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI030485Chr482125098219808-Casein kinase 1-like protein HD16

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI030485.m1160394PF00069.28PkinaseDomain56.92.20E-15
LITCHI030485.m1162325PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain24.61.40E-05
LITCHI030485.m1272371PF17667.4Pkinase_fungalDomain32.63.90E-08
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>LITCHI030485.m1
ATGCCGGTGCTGCGTAGTGGAGTGCGCAGAGGCCGTGTAGCTGCGAGGAAGGCAGAGGGG
GAACGGAGGGAGCCGACGGCGGCGGCGGAGGAGCGTGATCGGAGGCCGGTTCTGGCGGCG
GCGGGAGGAGAAGGAGAGGCGATTGCGACTAGGACTAGGAGGAGACGAGCGGCGGCCGCG
GCGGTCCCGGTTGCCGTGCCGGTGACGATTGCTGCTGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTGGT
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GTTGGTCATAAGAGAGGCCGGCTTACCATGGAAGACGAGGAAGATGAACAGCCAAAGAAG
AAAGTCCGTATGGGAATGCCAGCCACACAATGGATTAGTGTTTACAATGCTCGTCGACCT
ATGAAGCAAAGGTATCACTATAACGTGGCAGATGCAAGGCTTGCCCAACACATTGAGAAA
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ATTATGGATGCTGGCACTGGTTTCACTGCACAAGTTTATGAACTTTCGCCTTATTTTCTT
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TGTTACGGACGAACAGTTTCCTGA
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>LITCHI030485.m1
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TACAACACAGACACAAAACCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCGTAAAAATAGATCC
CTAAATCTTCAAAATCCCTAATTATTTTTTCACAGTCGAAAGATCGATTCCCGGATTCTG
TGTCTCTGTTTCGAATTCTGATTCCGATTGATCACTCGCATTACGTGGTTGTCACTCATC
GTATCGGATTCGTTAGATTGTTGACAGTTTTTTTTTTTATTTAATTTTTAATTTTTTTGC
GAGAGTCTTTGTGTTTGCGTTGTGTGTGTTGTGTGTGTTAGCTGTTTATGTTGTGATGAG
AATGATTGAAGGATGAACGATGCCGGTGCTGCGTAGTGGAGTGCGCAGAGGCCGTGTAGC
TGCGAGGAAGGCAGAGGGGGAACGGAGGGAGCCGACGGCGGCGGCGGAGGAGCGTGATCG
GAGGCCGGTTCTGGCGGCGGCGGGAGGAGAAGGAGAGGCGATTGCGACTAGGACTAGGAG
GAGACGAGCGGCGGCCGCGGCGGTCCCGGTTGCCGTGCCGGTGACGATTGCTGCTGGTGG
TGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAGGATAATAAGGTGGTGGTGAAGGTGGATGAGAA
GTTGGTGGAGGTGAAAGAGGCGGCAGCTGAGGCGGAGGAGAATAATAAGAAGGCGGTGGC
GGAGGGGGTTGGTGAGAAGAAGATGGACGAGTTTGATAGCGGTGGTCGGAGTAATGATAA
GGCTAACGCCGGCGGCGAGGACGAAGGGAGCACCGCGCCGCTTCCTGAGAAGATTTCAGT
TGGGGGTTCCCCTGTTTATAGACTAGAGAGAAAGTTGGGCAAGGGTGGCTTTGGGCAAGT
GTACGTTGGTCGGCGTGTCTCTCCTGTAAATACAAGTGATAGAACTGGCCCGGGGGCTGT
AGAGGTGGCCTTGAAATTTGAGCATAGAAGTAGTAAGGGATGTAACTATGGACCACCATA
TGAATGGCAAGTATACACCACCCTTGGTGGTAGTCATGGTGTACCACGAGTACACTACAA
GGGCCGGCAAGGTGACTACTATGTCATGGTTATGGATATACTGGGCCCAAGCTTGTGGGA
TGTTTGGAATAGTAACTCTCATACGATGTCTATTGAAATGGTTGCCTGCATTGCCATTGA
AGCAATTTCCATCCTCGAGAAGATGCATTCAAGAGGGTATGTGCATGGAGATGTAAAGCC
TGAAAATTTTCTGCTTGGTCCTCCAGGAACACCTGATGAGAAGAAATTATTCCTTGTTGA
TCTTGGATTAGCTACTAAATGGCGAGATAGTTCGACTGGTATGCATGTTGACTATGACCA
AAGGCCAGATGTTTTCAGGGGAACAGTACGTTATGCTAGTGTACATGCTCACTTAGGTAG
AACTGGGAGTAGGAGAGATGATCTAGAATCTCTTGCTTACACTCTCATTTTCCTTCTTCG
TGGTCGTCTCCCTTGGCAGGGATACCAGGGAGAGAATAAAGGATTCCTTGTTTGCAAGAA
GAAGATGGCCACATCCCCGGAGGCTTTATGTTGCTTCTGTCCACAGCCTTTTAGGCAGTT
TGTTGAATATGTTGTGAACTTGAAATTTGATGAAGAGCCAAACTATGCAAAATACATTTC
TCTTTTCGATGGCATTGTTGGACCAAATCCTGATATCAGGCCAATCAACACAGAGGGTGC
ACAGAAGCTTATTTATCAAGTTGGTCATAAGAGAGGCCGGCTTACCATGGAAGACGAGGA
AGATGAACAGCCAAAGAAGAAAGTCCGTATGGGAATGCCAGCCACACAATGGATTAGTGT
TTACAATGCTCGTCGACCTATGAAGCAAAGGTATCACTATAACGTGGCAGATGCAAGGCT
TGCCCAACACATTGAGAAAGGAAACGTGGATGGGTTATTTATTAGCAGTGTGGCTTCATC
TCAAAATTTGTGGGCTCTTATTATGGATGCTGGCACTGGTTTCACTGCACAAGTTTATGA
ACTTTCGCCTTATTTTCTTCACAAGGAATGGATAATGGAGCAGTGGGAAAAGAACTTCTA
TATCAGTGCGATAGCCGGAGCCACTAATGGAAGCTCCTTAGTAGTGATGTCGAAGGGGAC
ACAATACTTACAGCAATCCTATAAAGTTAGTGACTTATTTCCTTTCAAGTGGATTAACAA
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TGTGATGTCTCGTGGTGCTGGATTTTCTGATCAGGTCGTTGAACTTGATTTCCTTTACCC
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TTGGGACCAAGCCGCCTTTGTCCTTAGTGTGCCCCGGAGGAAGCCTGCTGATGAAACCCA
GGAGACACTTCGAACTTCAGCATTTCCCAGCGCACATGTCAAGGAAAAATGGTCGAAGAA
TCTTTATATTGCATCAGTTTGTTACGGACGAACAGTTTCCTGAACTGCTCATTCTTCTGT
AAGTTAGGTAGTGCCAACCTGTGTCCGTTGTTCGTACATCCCAATTGAAGGAAGAAGCCA
GGAAAGGGGTCACTGAAGTGGGGTTATTTTCTAGGGTTAGGGAAATTTTGATGGGTACAG
GCTTTAAAATTAATTGTAATAAGTATAGAAGGTTAGTGATACCGTGGCTGTCCGTGGGGC
TAAGTGGAATTTCTCATATGGTGATGTCCATAATCATGGATCTTTTGACCTTGTATAGTC
TCTGATGATCAATAAGTTCATGTTTTACCCCATAATTCCTTGAATTTTACATCATTCGCG
TTTTACATGTTCTGTTAAAGAAGTAAAATTGTGGACTTGGCAGGTCTTGGTAGGATTCTG
ACATAGAAATCGTATGGTATTGCCTTTTAAAAATGGTGATTGAAAATGGCCTTTCCGCAC
ATAAATTAGGGAAAAACGAAATGCGATTTAATTCGTGTATAATTCGTCAAATTGTGAATA
TCACTACTTTCAAAATAGTTGTTTGAGTTATCATCAGTCAAAAAGAGTTGTGTGATTTGA
CGGGTAAAATCATAAATATACATAATATACAAAAAAAGGGG
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>LITCHI005206.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TGCCGAGGGACAGGAGCACATCGTGTTCGGAGAAGTTATTAGGAAAGGGTTCTTTTTAAC
CATCACCTTCTTTTTGGCTGTGAGAATATAGAGCATTTTCGGAGAAGTTAGTTGGGAGTA
ACATATTTGAGGTTTTAGGGTATGAATGTATAGACATCGAAGTGGTTGCCGTGTAATGAT
TTTGTGATTTGATCTTTCCAACTACGAAATGCTTTAAATGCATAATTTAAAGTTTTGTTT
GTGTTGAATCTACTTTCATTTGTACTACTTTAATAGCATTTTTTGAAGGCCAAAATTATC
TTGGGCTTGGTCACCGCTACGTTAAGACTAAAAGCTTGGAAAGAATTCATAGTTCTTAAG
AAAGGGAGTGCCCCTAATTACTTAGGTAAATGCTGTTGGCGCGTCATGTCATGTCCAGCA
ATTTATTACAATATACTATCTAAAGTTTTGATTTGTATAATATGATATATTTATTACCAT
CAGATGTGATTTCATAGTATGAATATTCATCTAACTTGATAATATTTGAGGTTTGAATAG
TTATATTACATATAATATTTTAAAATGTATATATATATATATATATATATATATATGCAT
GTGTGAGAGGGGCGGAGAGATAAAATGGCTGTCCATGAAAATACTCTCTGCTCAACCGAA
TTCTGTTAATACTTTATGCAGATTCTACTTCAGTGTAGAATTTATCAAATTATTTTTCTG
CCTCAGATGATCAGTTGAAACTAACTAATTATACATAACACCATTGTAACTCTACAGTAC
ATGACCTGAACTTACTAATAAGCAAGAAATTTAGATTATAAAAAGGATTTGACTATCTTA
TTTAATCGTTAAGCTTACCTCTAGACTCGTAATTAATTAGTGATAATGAACTGGGACTTG
TAAAGGATTAGAGAATTAAAGCCTAGGCCTGTCTCAGAATGGCTAAGAAAGAATTTTCAG
TGTCTGGTGTCTGTCTGTTGTTTCCTGTTGTAATATAATTGATTTCCTGAAACTGACGCC
GTTTACAATAAATTTTGTGCGTCAGTTATTACGTAAATATTTCAATTGTGAGTTTTTAAA
CATAGAGATGCCAATTTGAACATAAATATCAAATAAATAAATAAGTTTAAAACGATTTTA
TTTTAATGGAGGAAAACCTTAATAATTAAGAATTTTATCTTATATTATATATTTTATGAA
CCTAACAACAAGCCTTTAGAGGTTTATTAGACTTTATCAAAATCAATTATTTTGTCCATC
ACTTGAATATATTAATGTTGAGGATTTATTGTCCCAATAAAATGCATTAAAAAGTTAAAG
GGTAACTAGCACAAACACACTTGGTATTTGGTGAAATTGTGCGTAAATAAGAGGTTTAGG
TGTAATTACATGTGAGCTATTTGAATTTTCAAAAATTCAACAATAGTAGTTTATTGTTAG
TGAGTTGTTAAAGAGCTATTGTTAAATCCACAACATCAGTTGAAGATGACGATGAAGAAT
TAGTTATTTTAAGATGAGGAAATCTGTTTGTAGTGGATGAATTGTAGTTTATTTTCTTAT
TTTTAAATTGAGTTTTTGTTTTTAAATAAATAATATATCTAAAATGCATTGAATACATTA
TCATAAAAATATTCATTACCCATTATTATACCTCACAGCACACCTGCATAAGCCACTTTA
CCTTGACACATTATGGATTTAATGATAACTCTTTAATGAGTTATTTAGTGCTGGAGGTAC
CCTTGTTAAAATTTTAAACTTCTTGTGTAATTATCCCAAATCTCTTATATGTGTAATTTC
ATATAATAATAGAGTTGTTTTTGCAATTTGCGTATTATAATAAAGCATCCCCAAATAGCC
GTTGCCGTTAAAGGGTATATGAATAGAAACGGTAAAAATATTGTATGAGAAAAATATGAC
CGTTACAAAACCCCAATTTTAAATCTACACTTGAGCCAAACACAACAGCAACGAAAACAG
AAAGAGACCATCAATCAATC
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>LITCHI005227.m1 GenomeSequence + 
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AATTATCAGAACCACAAGCTATGAAAACACGAAATTATCCATTCTCGACTCAATGAGTGT
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GAATCCCCTCAAAAATCTAACAAACAAACCACTTCTCGGCTTCAAAAACAAACCTTTCTC
TGTAACTTGTCTCCACTCAACAAGTAATGAGAGTGCAGCACCACCAGTACCACCAGAGGT
TGACACATTCTGGGAATGGCTCTGCGAGCAGGGCGTGGTCTCTGCCGATTCTCCTGTAAG
GCCAGCTATCGTAACCGAAGGTCTGGGACTTGTTGCTCAGAGAGACATTGCTGAAAACGA
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GATAGGAAGTGTGTGTAGTGAATTGAAGCCTTTGATAGCAGTGGCTCTGTTCTTGGCTAG
AGAGAAGAAGAGGGAGGATTCTCCGTGGCGGGTTTATCTTGATATTCTTCCAAAGTACAC
AGACTCCACCGTGTTTTGGTGGGTTTAGCTTCGTTTTCCTTGTTTGATTCTTTTTTCACT
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AAGAGGAGCTACTCGAGCTTCAAGGTGGGTAAAATTTTTGTTTACATATTTGGAAGTGTG
AGTGCATTGTCACACTTTTGACACTATTAGAATGTGTTTGCCGTATCCAAAATTTGTCAA
TATTTTAGCATACGGCAACTTAAAAACTTCATTTAAATAATGTTTAACGTGTCATAACAT
CCTTGAAATTCTAGATTAAGTTTACATGAGGAGAAAACTTCGGTGATTCTTTGTTGAAGC
ATTATTCCGGGCCATGTTGAAGGAAACATAGGTTTTTCATACTTTGGATACTTATTGGGC
GATTCTAAGTCTCTTGTTGTCTATATTTGAGATTGATCAAATTGATGCAGGAACCCAACT
ATTGAGCACAACTTTAGATGTGAAAGAATATGTCAAGAATGAATTTATAAAACTGGAAGA
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GTGGGCCTTTGGGATGGTTAGATCTAGAGCATTTTCACGCCTCCGTGGACAAAACCTTGT
TCTGATCCCTCTAGCAGACTTGGTAAGATCTTTCACTTCTTTCTTCAAGTACCTATCTGT
TTGAGATTATTGTTGAGTCGAGCCATTTTCAACCATGTCCTTTTTGTTCCTCATGTACAT
ACCTTTCACTTCAAAAGTTGACTTTCTAAACCTGGGTTGTCAATCAGATCAACCACAATT
CAAAGGTTAACACAGATGAGTATGCAGAGATTAAAGGAACAGGTCCTTTCTCTAGGAATC
TCCTATTTTCTTTGTGGGCTCCCTTTGCTGTCAAGGCTGGTGAGCAGGTGAAGCTTTTCG
ACCTCTAACAATTATTGTTTTATTACTCCAGTAATTCTGTTTCAAAAATGTATCACAAAA
TTATTTTTCAGCATACATAGACGATTTGTGTTCCTATCAGATTGGTTCATATGTTGTTGC
TGACTTGAGCAGTTGTTCATCAGGTCTTCATCCAATATGACTTGCACAAGAGCAATGCCA
AGTTAGCTCTGGACTATGGATTCACAGAATCAAACTGGGATCGTGATGCATATACCTTAA
CATTTGAGATTTCTGAGTCAGATCCATTTTTTGAAGACAAACTTGACATTGCTGAGTCAA
TTGGTTTGAGTGAGACAGCATACTTTGACATTGTATTCGGCCATCCTCTTCCCCCAACAA
TGTTCCCATATCTGCGCCTGGTAGCACTTGGGGAAACTGATACTTTCCTCTTAGATTTAA
GTTTCAGAAGCACTATCTTTGGTTACCTTGATTCGCCTGTCAGCCGTGCAAATGAGGAGC
TCATATGCCGAATGGTCAGGGATGCCTGCAAATCTGCCCTATCTGCTTATCACACTACAA
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GAAGAGGGAGTTGAAATTGGATGAGTTGGAATATTACCAAGAACAGCATTACGGTACAGC
TCACTGAGAATTGAGTTAGCACTGTTCCATGCTGAATGGGATGTTTTGATACAAAATCTC
AAGCGAGCATGCAACTTCTGTGGTTGGTTTACCATGTACAAGCAATGTGCAATTAAATTG
ATTCCTTCCATCATCTCTTCACCTTCCATGAGCAAATATCCATTTGAAATTTTCCTGAAA
GCAAACTGAAGGTCTGATAATTTAGTTGTATAAAACATGGTTGCTGCCTTCCAAGTACTT
TTAAGTAATGTAATATACAGTTTCACACACGCGTCATTTGTATTTTCAGAGACTCTAAGC
TAGACATGATTAAAATCAGTTTAACATTCAGTCCTTGAGCATTGCATCTGAACTATGTCT
TTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTCTGCTTCTGGATAATATTCGAGAAGTGA
GAACAAAGACATTCTGCAATATCTGCATGATAAATTATGAAATTATGTGAACAGCACTGA
ATACAAATGAACAGGACAGCAGGGAAAAAAATAGACAAAATAATTATATTAACAAAATAA
TTGAAGACCAAGCTTAAAAAAAGGCAAGATGGGAAAAGCAAGAAATATTTGCTGCCGTTT
CTTACAAAACTCTAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAATGAGGCCCTCTCATCATGAAG
GTGACATAATTTAATCACCACATGACTTGTAAACACTGTGGCATGCCATCACAAGACAAG
TTAAATCTGTAGCTTGTGATCACTGTACTTGGGTTGAGTTACCACAGTTTGTTCTCTCAC
AAAGGCACTCTTCAGGATTTGCGTAGAAATAATCTTCCTCCTTAGGTTTATCTGCTATTA
CTCTACGATGCATTGGCTGTCCCATTCTTTTATTATGGGCTAGCTGTACAGCATCTGCAA
ACTCACTCCATGAAAGTGTACCATTCTGATGCATATCGACCAACCCTACAAGTCTTCTTC
GATCTAGTAGGATGGATCTTTTGTAACCAAGATACCTGCATGAGATCAAAATCAAGTAGC
TTCAAGAATTCTTTCAAGTAAATAGAACTTTGTTTTCTCCAGAACTCTCGCCACAAGTAT
AAATACCTGCGGTGACCTTCCACTAGCTTTGCCATGTTCCCATCATATGTGGGAACGAAA
ACATCACTGGCTGTACAAACCATGAAATCCAGGGCTGCCATTTGAGATGAATGATTCTGA
AATTGCTGTAGCTCTGCTGCATCTAAAAGCATTTCCTTTTTGACCTGAAATCACAATTTA
AGTAATGATATCAAAAAGAATTATAATAAGCTAACATATATATATGTATGAAAGCATTTC
CCTTTTCACCTGAAATCACAATTTAAGTAATGATATCAAAAAGAATTATAATAAGCTAAC
ATATATATATATATATATGTATATATATGTATGTATGTATGTAAGTAAGAAGAGGAAGTA
GTAGTTTAGAGGCTTCAAGTGAAAACTGAAAGGATAGATGAACAATTAAATTAGTAACAA
TATCAAGATTTTCAGTCCCCAACCATTAAGGGGCCTTATTAGGTTCTCCAGCTCACATGA
GGATGTAAGAATTGTTTAAAATGATACTTTTGTCATTGTATGTACAATTTTGACACATCA
TTTCCAACGTCCAAAGGGCATTTAGAGCCACATCAGCCAATTTTCTTTGAGGCAGACTCA
ACAAAGCAAAATATTTTTAGCCCCTGGAATGAGGCCATAAGCACCAAGTGAGTCAGAACC
TTCAAGATGTCTTGAATGATAATTTTCTCAACAAAGCAAATATTTTTAGCCCTCTGAATG
AGGCCATATGAACCAAGTGAATTGAGAGAGAGCATTCAACGAGGAGCAGTCCTAGGCTTC
TCGTAGATTTTACAGAAATAAAAATCACTGAATGGTAATGAACTCACAATTCGGGGAAAT
GCAGCTCTTAGTGCTGCCAGTCTCTTTTCACCACCGTAAATCTCACCAGCTGCAATATAG
ATCTGCATATCCTTCTTAAAACCTAATGCTTGTAAAATCAGTGCTGCCTCCTCTGGTGTT
AGAGGACACAGACCCTGTGATCTTCTCTCTTCGGACACTATCTCTTTTTCTCTCCACCAT
GGGTATGCATACCTGAAATATAGGAGCAAAGCAATCATGATTTTCAAAGAATGTCATATC
TCCATGTATGCCACAGCAAAAACTACTTTAACCATTCAATGCTTCATAACATAGAGTGCA
AAAGATACAGATGCGCTTTGGGACAGAATTAAGTCTTGCCCCCAACAAAGTCTGAGCATT
AAACATATGACAAAACTCAGACAAATGAAGCAAAAGCCACCAATATTATGCCAAATTTTG
CCTGATTTTATTATTTCTGATGATCAACAATTCCAGATGGCGAGTACTTTACAATATTAG
GAGGCAAATAATATAGTAAGGTCTTTTGATTGCTTGGCTATGACTTATGACCGGATCATA
TAATAGGATCTTCATGAATAATACCCAAAATTAATGTATCAACTTTCAAACTTAACAAAC
CTCAACCGCTTTAGCTCCTCAGCTTCTTCCACAGAGCAGCCATGAGTGCAACCTGAGAAA
GACAACATGTCCATCTCATATCTTAGATGCAAAGCCACAAAAGGTCCCTTTTCTTGAAGA
ATACGAACCAATTTGTAACCCAAAGTCTCAATCTGAGGAGTGAATTTCAGTCCCTGGAAA
TTGACTCGGCACCTAAGTTTTTGAAGATCAAGTGGGATCCCATTGTTTGCAAGACGGGTA
TCTGTTCTGTTGAAGTGCAACACCTTATACTTGCTGAAAATTGGCAGA