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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI030485 | Chr4 | 8212509 | 8219808 | - | Casein kinase 1-like protein HD16 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI030485.m1 | 160 | 394 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 56.9 | 2.20E-15 |
| LITCHI030485.m1 | 162 | 325 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 24.6 | 1.40E-05 |
| LITCHI030485.m1 | 272 | 371 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 32.6 | 3.90E-08 |
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>LITCHI030485.m1 ATGCCGGTGCTGCGTAGTGGAGTGCGCAGAGGCCGTGTAGCTGCGAGGAAGGCAGAGGGG GAACGGAGGGAGCCGACGGCGGCGGCGGAGGAGCGTGATCGGAGGCCGGTTCTGGCGGCG GCGGGAGGAGAAGGAGAGGCGATTGCGACTAGGACTAGGAGGAGACGAGCGGCGGCCGCG GCGGTCCCGGTTGCCGTGCCGGTGACGATTGCTGCTGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTGGT GGTGGTGAGGATAATAAGGTGGTGGTGAAGGTGGATGAGAAGTTGGTGGAGGTGAAAGAG GCGGCAGCTGAGGCGGAGGAGAATAATAAGAAGGCGGTGGCGGAGGGGGTTGGTGAGAAG AAGATGGACGAGTTTGATAGCGGTGGTCGGAGTAATGATAAGGCTAACGCCGGCGGCGAG GACGAAGGGAGCACCGCGCCGCTTCCTGAGAAGATTTCAGTTGGGGGTTCCCCTGTTTAT AGACTAGAGAGAAAGTTGGGCAAGGGTGGCTTTGGGCAAGTGTACGTTGGTCGGCGTGTC TCTCCTGTAAATACAAGTGATAGAACTGGCCCGGGGGCTGTAGAGGTGGCCTTGAAATTT GAGCATAGAAGTAGTAAGGGATGTAACTATGGACCACCATATGAATGGCAAGTATACACC ACCCTTGGTGGTAGTCATGGTGTACCACGAGTACACTACAAGGGCCGGCAAGGTGACTAC TATGTCATGGTTATGGATATACTGGGCCCAAGCTTGTGGGATGTTTGGAATAGTAACTCT CATACGATGTCTATTGAAATGGTTGCCTGCATTGCCATTGAAGCAATTTCCATCCTCGAG AAGATGCATTCAAGAGGGTATGTGCATGGAGATGTAAAGCCTGAAAATTTTCTGCTTGGT CCTCCAGGAACACCTGATGAGAAGAAATTATTCCTTGTTGATCTTGGATTAGCTACTAAA TGGCGAGATAGTTCGACTGGTATGCATGTTGACTATGACCAAAGGCCAGATGTTTTCAGG GGAACAGTACGTTATGCTAGTGTACATGCTCACTTAGGTAGAACTGGGAGTAGGAGAGAT GATCTAGAATCTCTTGCTTACACTCTCATTTTCCTTCTTCGTGGTCGTCTCCCTTGGCAG GGATACCAGGGAGAGAATAAAGGATTCCTTGTTTGCAAGAAGAAGATGGCCACATCCCCG GAGGCTTTATGTTGCTTCTGTCCACAGCCTTTTAGGCAGTTTGTTGAATATGTTGTGAAC TTGAAATTTGATGAAGAGCCAAACTATGCAAAATACATTTCTCTTTTCGATGGCATTGTT GGACCAAATCCTGATATCAGGCCAATCAACACAGAGGGTGCACAGAAGCTTATTTATCAA GTTGGTCATAAGAGAGGCCGGCTTACCATGGAAGACGAGGAAGATGAACAGCCAAAGAAG AAAGTCCGTATGGGAATGCCAGCCACACAATGGATTAGTGTTTACAATGCTCGTCGACCT ATGAAGCAAAGGTATCACTATAACGTGGCAGATGCAAGGCTTGCCCAACACATTGAGAAA GGAAACGTGGATGGGTTATTTATTAGCAGTGTGGCTTCATCTCAAAATTTGTGGGCTCTT ATTATGGATGCTGGCACTGGTTTCACTGCACAAGTTTATGAACTTTCGCCTTATTTTCTT CACAAGGAATGGATAATGGAGCAGTGGGAAAAGAACTTCTATATCAGTGCGATAGCCGGA GCCACTAATGGAAGCTCCTTAGTAGTGATGTCGAAGGGGACACAATACTTACAGCAATCC TATAAAGTTAGTGACTTATTTCCTTTCAAGTGGATTAACAAAAAATGGAGGGAGGGCTTC TATGTTACTGCAATGGCCACCTCAGGAGGTAGATGGGCAGTTGTGATGTCTCGTGGTGCT GGATTTTCTGATCAGGTCGTTGAACTTGATTTCCTTTACCCTAGTGAAGGTATTCATCGG AGGTGGGATTGTGGATATCGTATCACAGCAACTGCAGCAACTTGGGACCAAGCCGCCTTT GTCCTTAGTGTGCCCCGGAGGAAGCCTGCTGATGAAACCCAGGAGACACTTCGAACTTCA GCATTTCCCAGCGCACATGTCAAGGAAAAATGGTCGAAGAATCTTTATATTGCATCAGTT TGTTACGGACGAACAGTTTCCTGA
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>LITCHI030485.m1 MPVLRSGVRRGRVAARKAEGERREPTAAAEERDRRPVLAAAGGEGEAIATRTRRRRAAAA AVPVAVPVTIAAGGGGGGGGGGEDNKVVVKVDEKLVEVKEAAAEAEENNKKAVAEGVGEK KMDEFDSGGRSNDKANAGGEDEGSTAPLPEKISVGGSPVYRLERKLGKGGFGQVYVGRRV SPVNTSDRTGPGAVEVALKFEHRSSKGCNYGPPYEWQVYTTLGGSHGVPRVHYKGRQGDY YVMVMDILGPSLWDVWNSNSHTMSIEMVACIAIEAISILEKMHSRGYVHGDVKPENFLLG PPGTPDEKKLFLVDLGLATKWRDSSTGMHVDYDQRPDVFRGTVRYASVHAHLGRTGSRRD DLESLAYTLIFLLRGRLPWQGYQGENKGFLVCKKKMATSPEALCCFCPQPFRQFVEYVVN LKFDEEPNYAKYISLFDGIVGPNPDIRPINTEGAQKLIYQVGHKRGRLTMEDEEDEQPKK KVRMGMPATQWISVYNARRPMKQRYHYNVADARLAQHIEKGNVDGLFISSVASSQNLWAL IMDAGTGFTAQVYELSPYFLHKEWIMEQWEKNFYISAIAGATNGSSLVVMSKGTQYLQQS YKVSDLFPFKWINKKWREGFYVTAMATSGGRWAVVMSRGAGFSDQVVELDFLYPSEGIHR RWDCGYRITATAATWDQAAFVLSVPRRKPADETQETLRTSAFPSAHVKEKWSKNLYIASV CYGRTVS.
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>LITCHI030485.m1 TACTAGAAGAACCTCCCCCATACATTCACTAACCTCCACCACAACATCAATCAATCAAAC AAAATTCCAATCAGCGGCTCCCCTTCACCCTCTCGCAAAACCACTCATACACCTCTCCGC ACCCAACCCACCCCAACCCAACATCAACCCCCTTCTCGTAAATTCAGTCACATCCCTTCC CGTCCCTCGCACAAACCCCTCCATCACCGTCCATCGCCCCCTCCCTCAACGGCCCACATT CCGCCACGCCACACCCCCACCTCCTCTTCCTCCCTATAAAAATAAATATATAAATAAACC CAAACTCTCACTTGTCTCTTAAAAACCAAGTACACAGGCTCTAATAAAATAACAAAAAAA TACAACACAGACACAAAACCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCGTAAAAATAGATCC CTAAATCTTCAAAATCCCTAATTATTTTTTCACAGTCGAAAGATCGATTCCCGGATTCTG TGTCTCTGTTTCGAATTCTGATTCCGATTGATCACTCGCATTACGTGGTTGTCACTCATC GTATCGGATTCGTTAGATTGTTGACAGTTTTTTTTTTTATTTAATTTTTAATTTTTTTGC GAGAGTCTTTGTGTTTGCGTTGTGTGTGTTGTGTGTGTTAGCTGTTTATGTTGTGATGAG AATGATTGAAGGATGAACGATGCCGGTGCTGCGTAGTGGAGTGCGCAGAGGCCGTGTAGC TGCGAGGAAGGCAGAGGGGGAACGGAGGGAGCCGACGGCGGCGGCGGAGGAGCGTGATCG GAGGCCGGTTCTGGCGGCGGCGGGAGGAGAAGGAGAGGCGATTGCGACTAGGACTAGGAG GAGACGAGCGGCGGCCGCGGCGGTCCCGGTTGCCGTGCCGGTGACGATTGCTGCTGGTGG TGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAGGATAATAAGGTGGTGGTGAAGGTGGATGAGAA GTTGGTGGAGGTGAAAGAGGCGGCAGCTGAGGCGGAGGAGAATAATAAGAAGGCGGTGGC GGAGGGGGTTGGTGAGAAGAAGATGGACGAGTTTGATAGCGGTGGTCGGAGTAATGATAA GGCTAACGCCGGCGGCGAGGACGAAGGGAGCACCGCGCCGCTTCCTGAGAAGATTTCAGT TGGGGGTTCCCCTGTTTATAGACTAGAGAGAAAGTTGGGCAAGGGTGGCTTTGGGCAAGT GTACGTTGGTCGGCGTGTCTCTCCTGTAAATACAAGTGATAGAACTGGCCCGGGGGCTGT AGAGGTGGCCTTGAAATTTGAGCATAGAAGTAGTAAGGGATGTAACTATGGACCACCATA TGAATGGCAAGTATACACCACCCTTGGTGGTAGTCATGGTGTACCACGAGTACACTACAA GGGCCGGCAAGGTGACTACTATGTCATGGTTATGGATATACTGGGCCCAAGCTTGTGGGA TGTTTGGAATAGTAACTCTCATACGATGTCTATTGAAATGGTTGCCTGCATTGCCATTGA AGCAATTTCCATCCTCGAGAAGATGCATTCAAGAGGGTATGTGCATGGAGATGTAAAGCC TGAAAATTTTCTGCTTGGTCCTCCAGGAACACCTGATGAGAAGAAATTATTCCTTGTTGA TCTTGGATTAGCTACTAAATGGCGAGATAGTTCGACTGGTATGCATGTTGACTATGACCA AAGGCCAGATGTTTTCAGGGGAACAGTACGTTATGCTAGTGTACATGCTCACTTAGGTAG AACTGGGAGTAGGAGAGATGATCTAGAATCTCTTGCTTACACTCTCATTTTCCTTCTTCG TGGTCGTCTCCCTTGGCAGGGATACCAGGGAGAGAATAAAGGATTCCTTGTTTGCAAGAA GAAGATGGCCACATCCCCGGAGGCTTTATGTTGCTTCTGTCCACAGCCTTTTAGGCAGTT TGTTGAATATGTTGTGAACTTGAAATTTGATGAAGAGCCAAACTATGCAAAATACATTTC TCTTTTCGATGGCATTGTTGGACCAAATCCTGATATCAGGCCAATCAACACAGAGGGTGC ACAGAAGCTTATTTATCAAGTTGGTCATAAGAGAGGCCGGCTTACCATGGAAGACGAGGA AGATGAACAGCCAAAGAAGAAAGTCCGTATGGGAATGCCAGCCACACAATGGATTAGTGT TTACAATGCTCGTCGACCTATGAAGCAAAGGTATCACTATAACGTGGCAGATGCAAGGCT TGCCCAACACATTGAGAAAGGAAACGTGGATGGGTTATTTATTAGCAGTGTGGCTTCATC TCAAAATTTGTGGGCTCTTATTATGGATGCTGGCACTGGTTTCACTGCACAAGTTTATGA ACTTTCGCCTTATTTTCTTCACAAGGAATGGATAATGGAGCAGTGGGAAAAGAACTTCTA TATCAGTGCGATAGCCGGAGCCACTAATGGAAGCTCCTTAGTAGTGATGTCGAAGGGGAC ACAATACTTACAGCAATCCTATAAAGTTAGTGACTTATTTCCTTTCAAGTGGATTAACAA AAAATGGAGGGAGGGCTTCTATGTTACTGCAATGGCCACCTCAGGAGGTAGATGGGCAGT TGTGATGTCTCGTGGTGCTGGATTTTCTGATCAGGTCGTTGAACTTGATTTCCTTTACCC TAGTGAAGGTATTCATCGGAGGTGGGATTGTGGATATCGTATCACAGCAACTGCAGCAAC TTGGGACCAAGCCGCCTTTGTCCTTAGTGTGCCCCGGAGGAAGCCTGCTGATGAAACCCA GGAGACACTTCGAACTTCAGCATTTCCCAGCGCACATGTCAAGGAAAAATGGTCGAAGAA TCTTTATATTGCATCAGTTTGTTACGGACGAACAGTTTCCTGAACTGCTCATTCTTCTGT AAGTTAGGTAGTGCCAACCTGTGTCCGTTGTTCGTACATCCCAATTGAAGGAAGAAGCCA GGAAAGGGGTCACTGAAGTGGGGTTATTTTCTAGGGTTAGGGAAATTTTGATGGGTACAG GCTTTAAAATTAATTGTAATAAGTATAGAAGGTTAGTGATACCGTGGCTGTCCGTGGGGC TAAGTGGAATTTCTCATATGGTGATGTCCATAATCATGGATCTTTTGACCTTGTATAGTC TCTGATGATCAATAAGTTCATGTTTTACCCCATAATTCCTTGAATTTTACATCATTCGCG TTTTACATGTTCTGTTAAAGAAGTAAAATTGTGGACTTGGCAGGTCTTGGTAGGATTCTG ACATAGAAATCGTATGGTATTGCCTTTTAAAAATGGTGATTGAAAATGGCCTTTCCGCAC ATAAATTAGGGAAAAACGAAATGCGATTTAATTCGTGTATAATTCGTCAAATTGTGAATA TCACTACTTTCAAAATAGTTGTTTGAGTTATCATCAGTCAAAAAGAGTTGTGTGATTTGA CGGGTAAAATCATAAATATACATAATATACAAAAAAAGGGG
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>LITCHI030485.m1 - Up_Stream_Len 2000 CAACCCGGAACCTCATATGATGAGGGGAAGCACGTAATTAACTGAAGTAGCAGACGGTGT GTGATTGTGTGAGTGCATATGGTTTTAGAAGGGTGTAAATATTGACGCATGTCCTAAAAA ATAAAATCTCAATTTAAGTCCAAATTATAAAATAAGAAATTTCAAACAGGCCTTGCAGAT GTGGATCTTGACAGCCCAAGTTGGCCCACAGGGTAGCCCATGAAATTATGGAAGTCTGGA ATAGAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAAAATCGCCCACCGTGGGGTTCGAACC CACGACCACAAGGTTAAGAGCCTTGCGCTCTACCGACTGAGCTAGACGGGCTATTTGCCC ACCTTTTCTTTGTTTTTTTTTTATATAAAGAAATATTGATGCTTGTATTGCACATGCACA ACGTAACGTAACAACACAATATCCATGAGTAGTCAAAAGCTAGTCAATATCAATATTTTA TATTGTCCGTTTGTTACAGCTTTTCAGCCCCATAAAAATAACTTTTTTAATTTACAAAAG ATCTTTTTAAGTTTTAACTTTTGTATTGTTTCAGGTGTCATCCAAAACAATTAAAAATAT ATATATTTTTCTTTAAAAAAACTATTTTACATTTATAAGGAAGCGTCAAATTTAACGTCT ACCGGTATAATTTTTATTTTATTTTAAAATATTAAAATATTTTTTAAAAAATTAAAATGT TAAAAATGTTATGATAGTATTTTATCAACATATTACCATCTTTTTAAATCAAAATCTCAA TAAAACTATTCAACCCAATTTTTATATAACACTTTTAATAAATTAACTATACAACAATTC TTTGAAAATTAAACAACCAACCATTCAACAATCTCTCTCTCCCTCTCTCCTTTTTTTGTT TTTAATGATTTTTTGACTTATTAAAACGAGTTTAAGGGACTGTCAAGACTAACCAAAATA GAAAAATTATTAATATGACCTGGACCATAATTATTCCCAATTGGAAGGAATCCATCTATA CGAAAATAGAGAGAGGTCTACACGAAGGTAGGAGATTAATCTACACAGAATGATTATAAA ACTATTATTATGATTATGATTATTATTATTATTATTATTTTATTATCATATGCGTGAATT ATTTGGATTTAGCGGGTGAGTGTCGAACCCATACCACACATAATGAGAGGCATGAGGATT ATTGGCGCCAACCAACGATGCAGTAACCAAAGATATTTAACAATCTCTCCTTAAAAACAT ATTTACAAAAACTTTTATTTCAAACTATTTCAAAAAAAAAAAAACATTTATTTCAAACGT ATACTAGAAGAACCTCCCCCATACATTCACTAACCTCCACCACAACATCAATCAATCAAA CAAAATTCCAATCAGCGGCTCCCCTTCACCCTCTCGCAAAACCACTCATACACCTCTCCG CACCCAACCCACCCCAACCCAACATCAACCCCCTTCTCGTAAATTCAGTCACATCCCTTC CCGTCCCTCGCACAAACCCCTCCATCACCGTCCATCGCCCCCTCCCTCAACGGCCCACAT TCCGCCACGCCACACCCCCACCTCCTCTTCCTCCCTATAAAAATAAATATATAAATAAAC CCAAACTCTCACTTGTCTCTTAAAAACCAAGTACACAGGCTCTAATAAAATAACAAAAAA ATACAACACAGACACAAAACCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCGTAAAAATAGATC CCTAAATCTTCAAAATCCCTAATTATTTTTTCACAGTCGAAAGATCGATTCCCGGATTCT GTGTCTCTGTTTCGAATTCTGATTCCGATTGATCACTCGCATTACGTGGTTGTCACTCAT CGTATCGGATTCGTTAGATTGTTGACAGTTTTTTTTTTTATTTAATTTTTAATTTTTTTG CGAGAGTCTTTGTGTTTGCGTTGTGTGTGTTGTGTGTGTTAGCTGTTTATGTTGTGATGA GAATGATTGAAGGATGAACG
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>LITCHI030485.m1 GenomeSequence - TACTAGAAGAACCTCCCCCATACATTCACTAACCTCCACCACAACATCAATCAATCAAAC AAAATTCCAATCAGCGGCTCCCCTTCACCCTCTCGCAAAACCACTCATACACCTCTCCGC ACCCAACCCACCCCAACCCAACATCAACCCCCTTCTCGTAAATTCAGTCACATCCCTTCC CGTCCCTCGCACAAACCCCTCCATCACCGTCCATCGCCCCCTCCCTCAACGGCCCACATT CCGCCACGCCACACCCCCACCTCCTCTTCCTCCCTATAAAAATAAATATATAAATAAACC CAAACTCTCACTTGTCTCTTAAAAACCAAGTACACAGGCTCTAATAAAATAACAAAAAAA TACAACACAGACACAAAACCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCGTAAAAATAGATCC CTAAATCTTCAAAATCCCTAATTATTTTTTCACAGTCGAAAGATCGATTCCCGGATTCTG TGTCTCTGTTTCGAATTCTGATTCCGATTGATCACTCGCATTACGTGGTTGTCACTCATC GTATCGGATTCGTTAGATTGTTGACAGTTTTTTTTTTTATTTAATTTTTAATTTTTTTGC GAGAGTCTTTGTGTTTGCGTTGTGTGTGTTGTGTGTGTTAGCTGTTTATGTTGTGATGAG AATGATTGAAGGATGAACGATGCCGGTGCTGCGTAGTGGAGTGCGCAGAGGCCGTGTAGC TGCGAGGAAGGCAGAGGGGGAACGGAGGGAGCCGACGGCGGCGGCGGAGGAGCGTGATCG GAGGCCGGTTCTGGCGGCGGCGGGAGGAGAAGGAGAGGCGATTGCGACTAGGACTAGGAG GAGACGAGCGGCGGCCGCGGCGGTCCCGGTTGCCGTGCCGGTGACGATTGCTGCTGGTGG 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