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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030359 | Chr4 | 5371756 | 5373911 | + | Transcription factor bHLH87 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030359.m1 | 370 | 409 | PF00010.29 | HLH | Domain | 25.8 | 8.70E-06 |
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>LITCHI030359.m1 ATGGATGGTATCGAATGGCATGGCTCACAAGTTCTCATCAATCCATCTTCTTTATGGAGC GACCAGTTGCAAGATAACTCTGTGGAAAGCTTCACGGTCTCCAATCCAAATTGCTATGGT GCTTATAGTGGGAAGAATATGGATCTCAATGAAGATATGTTCAATCCAATTCAAGTGCTC CAGAAACCTCAATCATCTCAACTACTGAATTCAAATCCTGAAAGGCCTCAAGAGACTGCA GTTGCAAAATCAGGAGGTGGTGGTGGTGGAGGTTGTGGTGGTTGGAGAGATGGTATAAGT AGTCAGGAATTGTGTTCTTCTTTGATCATGATCAATAGTCCTTGTGTCACATCAATGCCA TTGATCAGTTTAGGGGGTGTTGATGATCAATTTGGCATGGATGATCAGACTCAGATTGTT GATCATGGCTTGAAGAATGGCAAGGTTGGTGGTGGTGTTTCAACGACTTGCTCTCTTGAG TCCCTTGATTGCTTGCTCTCAGCTACTAATAGCAACACCGACACGTCGGTTGAGGATGAT GGGATCTCCATGATTTTCTCTGATTGTAGAAATCAGTTGTGGAATTTTGGTGCCAATAGT ACTACTACTGCTGTTTCTTCAGGAGAGTCCGAGAACAATCCCTCCATTGATGGAAGAAAC AAAGAGCCTGAAGAAACTGTGTCCCAAAGTTCCTCAGATCAGTATTTCAACAATGGAAGA GTGCAAGAGCAAAGGCCTGATTCAACAAAGGGAAGCAGTGATCGAAGGAAGCTCAAGGTT GGCACAAATAAAGGTCAGTTTCATTTTCTTCAAACACCTGATTCTTCATTCATTGAAGGC GGGTTCCGACTGATCTCTGAGAATCCACCAAAACCAAAGAAAGCAAGATCGGATAAGCGT CCAAGCTCATCAAACATCAACTTTCAACAACCAAGTTCATCATTGTCGTCTTCGATGGAG GAGCCTGATCCTGAGGCCATTGCCCATATGAAGGAGATGATTTATCGTGCTGCGGCTTTT AGGCCAGTGAATTTAGGCATCGAAGTGGTGGAGAAGCCTAAGAGGAAGAATGTCAGAATA TCAACTGACCCACAAACAGTGGCTGCAAGGCAAAGGAGGGAGAGAATAAGTGAAAGAATT AGGGTTTTGCAGAGGCTGGTTCCTGGTGGAAACAAAATGGACACTGCTTCAATGCTTGAT GAGGCTGCAAACTATCTCAAGTTCCTGAGATCTCAAGTCAAAGCACTAGAAAGCTTAGGA CACAAGCTTGATCCCATGAATTGTCCTCCCTCTTCAATTAGCTTACCAACTTTCTCCTCT CTACCATTCAATAACCACAGTATTACTTTTCCCATGCAAACCCATCTCTCACTTCGAAAC CCTAATAATCCAAAACCCATTTAG
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>LITCHI030359.m1 MDGIEWHGSQVLINPSSLWSDQLQDNSVESFTVSNPNCYGAYSGKNMDLNEDMFNPIQVL QKPQSSQLLNSNPERPQETAVAKSGGGGGGGCGGWRDGISSQELCSSLIMINSPCVTSMP LISLGGVDDQFGMDDQTQIVDHGLKNGKVGGGVSTTCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDD GISMIFSDCRNQLWNFGANSTTTAVSSGESENNPSIDGRNKEPEETVSQSSSDQYFNNGR VQEQRPDSTKGSSDRRKLKVGTNKGQFHFLQTPDSSFIEGGFRLISENPPKPKKARSDKR PSSSNINFQQPSSSLSSSMEEPDPEAIAHMKEMIYRAAAFRPVNLGIEVVEKPKRKNVRI STDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLRSQVKALESLG HKLDPMNCPPSSISLPTFSSLPFNNHSITFPMQTHLSLRNPNNPKPI.
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>LITCHI023807.m1 AAAACAGATAGTTTTAAAGTGTACATACCAGATTGTGTGTTGGTCATAAGGCAAGAGGAG CGGTGATAAGAACGAGTGAGTCGAGACTAGAGAGTGAATAAAAAAGACTTGTGGAGTTGA GATATGCCCTAATTCACTCCCTGTTCATTTACAATTACCCATTGGTGGGAGACAGACAGA GAGAGACACATATTCGTGTAGACCTATCTATCGTAACCAACTAACTTTTGTTTTTTCCTG TTCCCATGAAGAAGAAACTCGACACTCGTTTTCCAGCTGTTAGAATCAAGAAGATTATGC AAGCTGATGAGGATGTTGGGAAAATTGCCATGGCTGTACCTTTACTTGTTTCTAAAGCTT TGGAATTATTTCTACAAGATTTATGCGACCGAACTCATGAGATAACTGTGGAGAGGGGAG TCAAGACCATGACTTCTTTGCATCTGTAA
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>LITCHI023807.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAGACTGGAGGTTTCAGAAAAATCAAACTCTTTTGCCACAAGTTGTGCTTTGTTTTTAAT AAGGAACCATCTGGATTCCTTGTGATTCTAAACACCCATTTACACCCTATAATTTTCCTG CTTGGAGGAGGAGAAACCAATGTTCAAGTGTTGTTTTTCTACAAAGCTAAGAACAAATTC ATTGCTTGAAGCCATTTTGGATGAGCTAAGGCTTGTTTCATTGTTTTAGGTCTAGTTTCA TCAAAATAAGTTATCCAAGTCTTGGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCCAAGTCTTT GATTTATGGATTCTAGCTTTTGACTTAGTAGTCATAAGACCTATGTTCAAGGTTGGGAAG GCTGAGATTCATTTGACGGATGAAATACTGAATATACAGGGTTAAGAAGGCTGAGATTTA TTTGTTGGATGAAATAACCGATTTGGTTGGAGTTTATATATATAAGCAAATTTTTCTGGC TTAAGTGTTCGACGATCCTCAAAAAAGAATTCAACGATTCTTTAATGTTTCCTTTTATAG AGAGAAAATGTTAGCAAAACATATTTGGACTCAATTAATGCTTAGAAATTCAAATCCAAA ATTCTCAATAACCAAAATCAAGTTACTTCCAATTTTCCCTATCTACATTTACAAAAGTCT TTCATAATTCTATAAAAATCAATGAAAATCTATGAACTCTACAAAAAGTAATCACTTTAA AATATTTCTATAAAAGTCTAAATTAAATTTACCCTCATATATTCATGTATAATGGATTAC TACTTCATTAACCTACATATCTAGTTGTCATCCAATTAATAGATATCATTGATCTCTATA GATAAGATTGCATCCTCCATTCCTACAGGAGAGTTGGATCTCCATTATAATAGAAATTTA GTTTTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTAACATAAATGGAAGCGAACC AAAATTCCATCAACAACAATCTTCTTTGGTAGAGATCGATCACCATCAGAGAAGAATCAT CTTATCCTACACTTTCCTCCAACAATTTTTCTTTTTAATCATTTAATTGTCTTTATAAAA ATCAGTCTTTATTTTTTCAAAAGATCCCTATTGTTGATAAGGAACATGGACAGTTGAGTT CTATTTTTTTTTAATTTCTTATATTTTAAATAAATTATTAAGAAAAGACCAAAAACAATA TGTCTTATTAAAGTTGATTAATAGTATTCCAACTTTCAAGTGTAAAATTCAAATAAGAAA ACTTTATTTAGTCCCTAAAGTTTTAAAAAATATCAGATTTTTAAAACTTTTTTTAAAATA ACTATTTCCATCCTTAATTTTTTTAAAACTTTTCCAAAAAATTCAAACGATCAATTAACT AACGGTTAATATTAATATAATGCATTAAAAAACATTTTTTTTCTTTGATGGTTATCGGTG GTACATAAATTATCAAATTACGTAAATAAAATAATGAATTCATAAGTTAAATTACCTAAA ATACATTAGAAACAATTTAAATTGCTTAAAGTCACTATCGACTATAAATTGATTGACAGT TTTGATTTTTTTTAAAAGATTTTAGAAATATTATGGATAAAAAGAACTACTTTAAAAAGA ATATTAAAAAATTAATATTTTATAAAATTTCAAAGCTTAAAATGAAGTTTTTCCAACTCA AATCTAAAAAAGTACGGTGTTGTTCACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGATCAAGTGA ATGGGACGTGGCAAGAAAACAGATAGTTTTAAAGTGTACATACCAGATTGTGTGTTGGTC ATAAGGCAAGAGGAGCGGTGATAAGAACGAGTGAGTCGAGACTAGAGAGTGAATAAAAAA GACTTGTGGAGTTGAGATATGCCCTAATTCACTCCCTGTTCATTTACAATTACCCATTGG TGGGAGACAGACAGAGAGAGACACATATTCGTGTAGACCTATCTATCGTAACCAACTAAC TTTTGTTTTTTCCTGTTCCC
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>LITCHI023807.m1 GenomeSequence - AAAACAGATAGTTTTAAAGTGTACATACCAGATTGTGTGTTGGTCATAAGGCAAGAGGAG CGGTGATAAGAACGAGTGAGTCGAGACTAGAGAGTGAATAAAAAAGACTTGTGGAGTTGA GATATGCCCTAATTCACTCCCTGTTCATTTACAATTACCCATTGGTGGGAGACAGACAGA GAGAGACACATATTCGTGTAGACCTATCTATCGTAACCAACTAACTTTTGTTTTTTCCTG TTCCCATGAAGAAGAAACTCGACACTCGTTTTCCAGCTGTAAGTTTTTCTTTCTTTTTCT TTACTCTTTATTATCGTTTTTCAGTCATCTGTTAACTCAAAGTGAAAGTGAAAGTGAAAG TGAAAGTGAAAGCACCCAGTTGTACGTACGTACGTACATACATACATACTTGTCTGTCCC TTGCATATGTTAATTTTATTGATCTGTATTCGATTTCATCGATTTTGGGGTTAATTTTTT AATGTCTTAATACACCAATAGCACATACCCTTCGTAATGGTCAGGTTCAGGTGCGTGGTT CCATACGTTTTTTAGGAATTCGAATTAACACCGGCGTAAACTGGATTTATATCAATTAGT TGGATAATTTTGTAGACACGAATGAATTTTTGATTACACAGGTTAGAATCAAGAAGATTA TGCAAGCTGATGAGGATGTTGGGAAAATTGCCATGGCTGTACCTTTACTTGTTTGTAAGT GATTTTTTTTACATTTTTTATAGTCATAAATCGTGTTAGTGAGTCATTCTGTGGTATTTG TATGCTGGGGAATTGTATGTTTGCTTATTCATATTATATGCACATAGTAATGACTTTAAT GAATACCATGTACAGCTAAAGCTTTGGAATTATTTCTACAAGATTTATGCGACCGAACTC ATGAGATAACTGTGGAGAGGGGAGTCAAGACCATGACTTCTTTGCATCTGTAA