Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030302 | Chr4 | 4521551 | 4527304 | + | PHD finger protein ALFIN-LIKE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030302.m1 | 22 | 150 | PF12165.11 | Alfin | Family | 231.6 | 1.70E-69 |
LITCHI030302.m1 | 208 | 256 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.5 | 2.00E-10 |
Download Copy
>LITCHI030302.m1 ATGGACGGCGGCGGAGGTGTCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGCTATAATCCG AGGACAGTGGAGGAGGTGTTTAGAGATTTCAAAGGACGGAGAGCTGGCATGATCAAAGCT CTCACTACAGAGGTTGAAGACTTCTATCAACAGTGTGATCCTGAAAAGGAGAATCTCTGC TTGTATGGCTTTCCTAATGAGCAATGGGAAGTCAATTTACCAGCTGAAGAAGTGCCTCCA GAGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAATTTTGCAAGAGATGGCATGCAGGAAAAGGAC TGGTTGTCTTTAGTTGCTGTTCATAGTGATGCATGGCTGCTGGCTGTTGCGTTTTATTTT GGTTCCAGATTTGGATTTGATAAAGCTGACAGGAAACGGCTTTTTAATATGATAAATGAT CTTCCGACAATTTTTGAAGTTGTGACTGGCGTTGCAAAGAAACAAGTAAAGGACAAGTCA TCTGTCTCAAATCATAGTAGCAACAAGTCCAAGTCAAACTCCAAAGCAGCAAAAGAGGCA AAATATGTTAAGGCATTGCAGCCAAAGGATGAAGAAGAAGAATTGGATGAAGAAGATGAA GATGAGCATGGGGAGACATTGTGCGGAGCTTGTGGTGAGAACTATGCATCGGACGAATTC TGGATTTGCTGTGACATCTGCGAGAAGTGGTTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATCACCCCA GCCAGGGCAGAGCATATCAAGCAGTACAAGTGTCCTTCTTGCAGCAGCAGCAAGAGAGCT CGCCCTTGA
Download Copy
>LITCHI030302.m1 ACACGATCCGCCCTCCCTCCCTCTAGGTTTCGAAATTTCGGACTCAAAACAGTTTTCTCA AATACAGTTTACCCGACAAATAACTCCAGATTCAAATCCGCCCCAAAAACCAAATTTTTC CACCTTTATCCTCAAAATGCCCTTCTAATACTTCCCAAATCCCCATTTTACCCTCGTCTC CTTTATATACATACACAAACGCACAGATCACCTGGCTCTGTTTCAACTCTCAATTTCTCG AATGAAAAAACATAAAGAATTTTAAAAAAATCGTAAAAAAAAAAAATCGAATTTTGATAT TCGAGAGATGGACGGCGGCGGAGGTGTCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGCTA TAATCCGAGGACAGTGGAGGAGGTGTTTAGAGATTTCAAAGGACGGAGAGCTGGCATGAT CAAAGCTCTCACTACAGAGGTTGAAGACTTCTATCAACAGTGTGATCCTGAAAAGGAGAA TCTCTGCTTGTATGGCTTTCCTAATGAGCAATGGGAAGTCAATTTACCAGCTGAAGAAGT GCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAATTTTGCAAGAGATGGCATGCAGGA AAAGGACTGGTTGTCTTTAGTTGCTGTTCATAGTGATGCATGGCTGCTGGCTGTTGCGTT TTATTTTGGTTCCAGATTTGGATTTGATAAAGCTGACAGGAAACGGCTTTTTAATATGAT AAATGATCTTCCGACAATTTTTGAAGTTGTGACTGGCGTTGCAAAGAAACAAGTAAAGGA CAAGTCATCTGTCTCAAATCATAGTAGCAACAAGTCCAAGTCAAACTCCAAAGCAGCAAA AGAGGCAAAATATGTTAAGGCATTGCAGCCAAAGGATGAAGAAGAAGAATTGGATGAAGA AGATGAAGATGAGCATGGGGAGACATTGTGCGGAGCTTGTGGTGAGAACTATGCATCGGA CGAATTCTGGATTTGCTGTGACATCTGCGAGAAGTGGTTCCATGGGAAGTGTGTGAAGAT CACCCCAGCCAGGGCAGAGCATATCAAGCAGTACAAGTGTCCTTCTTGCAGCAGCAGCAA GAGAGCTCGCCCTTGA
Download Copy
>LITCHI030302.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCTCTTGTTCCGGCATCACGACCACCTCCAACAGTGCAGACATCTTCCAGCAGCCGGACT TCAGGTTCTCAGGCTACCCTTCTCGCCTAGGCAGAACCATGCAAGGTTGCTCAGCTGGCA TCAACAGCGGTGGGAACCTGCAGCCGCTCCTCTCCTCGGTCAAAAGATGATTGGAAACAC GCATCTGAGCACTCAGAATCCGGCATCCTCATCAAAAATTCTGGCTGCTACCGTTCCCTT GGGAAGTCATCCTTGGCTCTTTTAGTTTACCTTTGTAATGCTTTTGTTGCTTGTAGTGTC AACTTGTTCGAACACCAAGAACAATGGAGTTGTCAGTTGCCATGTGGTTGGTTTTAATAG GTTCTTGTATGCAACCATGCATTATTATCAGTAAGTCTCTATTTTAAGCAATTGTCTCTT GTAATGGAGATGTGAAATAAGATTAGCAATGTACATTTGGAGCCTAACAATCATTTTTTC GCAGCCAAAATATGGCAATATGAACACAATAAGGTTGTTAATGTAAAGTTATGTAGATTG AATTGATGATGAACAAATTTAGATACAAGTACTAAATCTAAATGTAATTACATGGTAGTT TTCCAATTCAAGATCTCTTGGTAAAATTGGTTTCTATTTGTCTTTTCAGGTATGATTTAA TTCAAAATGTTTAAAGTTTGTGAGTGAGTGGCTTATCAATGATATTGCAAGTTGTTCTGT TTGCTTTTTGTCATGAAAAATGTGTTCTACTTTTTAATTTAATTATCGATACATCAATTC ATATTAGTTTTAGAACTATTTCAACTGATTTGGGATTTCAAATGGAGATACAAGTTGAAG CTACAATGATGTATGCGAATTTCAACATGTCAAATATCCACCCATTTGAGTAACTAACAA TCATGTTTTATCATTTATTCACCACAGGAGGTGTCAATTAGGCTACGCGGGCTGGGCTAG TCTTAAAACGTTTTTGAGGCTCAATCTTGCCTAGAAGTCCTGTTAAGAGCGGGCTTGCCT GTGGGAGCTCACACGGGCCGAACTCATAGTCTCATTAGTATAAATATAAAGAAAAATATT TTTTTTGAATAATTTGGACCAATTCAAGGTACAATCGAGATTAATAGTGATGAAACGTTA TGGTGCAACTTAAGGATCAGTTTTCAGGAACGAGAGGGGATAACCCACAAAGAGTGAGAG GAAAATGCTCACAATATTGTGAGATTTTTAGGTATAGAATCCTCTACCTCTAGAGAGACA TAGAATGATTGATCTAACAATTAAACTACAACACAGATTACAATATAAGGGAAAATATTA CTGGATAAACCTTATCTTGTCAAATATGAATAAATAACAATAATATTCCACATTCGAATT GTTTTACATATATAATATTTCAATATTTAATAATTTCATTATTATAATATGCTATTAAAA TAAACAATTAAAAAAAATAATGATAACAAATGCCTGTCTTATAACATTTATGAAATTCAT TTTTGTTTAAAAACATTTACAAAATCAAATTATATGAATCTTATTACTATCATCTTACAT ATCATGGAATTGGTGTTTTAGATATTAAACAAACAATAAATACTATCACATAATTTTTTT TCTCCATAATCAGATGCCAAATCAAACACCTCCACATCAGCAGCTCCAAAAACCATGACA CCAACCCGACCGCACACGATCCGCCCTCCCTCCCTCTAGGTTTCGAAATTTCGGACTCAA AACAGTTTTCTCAAATACAGTTTACCCGACAAATAACTCCAGATTCAAATCCGCCCCAAA AACCAAATTTTTCCACCTTTATCCTCAAAATGCCCTTCTAATACTTCCCAAATCCCCATT TTACCCTCGTCTCCTTTATATACATACACAAACGCACAGATCACCTGGCTCTGTTTCAAC TCTCAATTTCTCGAATGAAAAAACATAAAGAATTTTAAAAAAATCGTAAAAAAAAAAAAT CGAATTTTGATATTCGAGAG
Download Copy
>LITCHI030302.m1 GenomeSequence + ACACGATCCGCCCTCCCTCCCTCTAGGTTTCGAAATTTCGGACTCAAAACAGTTTTCTCA AATACAGTTTACCCGACAAATAACTCCAGATTCAAATCCGCCCCAAAAACCAAATTTTTC CACCTTTATCCTCAAAATGCCCTTCTAATACTTCCCAAATCCCCATTTTACCCTCGTCTC CTTTATATACATACACAAACGCACAGATCACCTGGCTCTGTTTCAACTCTCAATTTCTCG AATGAAAAAACATAAAGAATTTTAAAAAAATCGTAAAAAAAAAAAATCGAATTTTGATAT TCGAGAGATGGACGGCGGCGGAGGTGTCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGCTA TAATCCGAGGACAGTGGAGGAGGTGTTTAGAGATTTCAAAGGACGGAGAGCTGGCATGAT CAAAGCTCTCACTACAGGTCTTTCCTTGTTTTTTTTAAAACAAAAAATTAAGAAAAAAAT TGTTTTTATTGTTTGTTTGAGTGTTTGTTTTTCTTTTTGTAATTGTTTGTTTCGCGAGAA AATATCTGAGAAAATGAGAGAAAGTTCTATGTTTCAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTTGTA ATTGTTAGTTTGTTTCGTGAGAAAATATTAGAGAAAACGAGAGAAAGTTCTATGTTTGAA GAATTTTTATTTTTATTTATTTTTATTTTTTTAGTTTTTGTAATTGTTTGTTTGTGTGTT TCGCGAGAAAATATCCGAAAAAGTGAGAGAAAGTTTTATGTTTTGAGAATTATTAGTGTT TTTAGTGGTTTGGTTCATGCATGTTTGTTTGTCGAGAATCTGAGTGAACAAAATGAGAGT TTTGGTTTTCAAAAGAGAAAGGTTTTGACTTTTGTGTTTTGATTGCGGAATTTGTTTTTT TGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGGTCTAGAGTTTGTTTGTGATAAGATAGA TTGTGAGAGTTTTGGGTTGTTTAATGTTTTCGAGATCTTTTCGTTTCAGTGAAATGTGGG TTGATTTCAGTTTCAGTTTGTGTTGGCTTCTTTTTCTTGTTTTTTTTGTTTGGTCTGGAG TAGTAGTATGAGAGAGACTAGCTTGTAAGAGTGTTGAGTTTTTGAATTGACATGTTTGTA TGTTGTTTTTGCTTTGGAGATGAAATGTTAAGTGGTATTTGTCTTTTGTTTCTATGGTGT TTTGGTTTGTGAATTGCTGGAAATTGAGTTTCGATTTCCATGTTTGTGGTTTAAAAATAG CATCTTGGAACTGTGTTCTTTCTAGGGTTTATTAACTTGTTTTTGGTTATGATCTTGCAG AGGTTGAAGACTTCTATCAACAGTGTGATCCTGGTAAGTGTTATATATTAGCACTTTAGC AAATGCTTGGTTCTTCTTGGTGTGTTAACTTACACTCACTGTATTCTATTTGTATGCAAT ATGTGTGCTGCTCTTTTGTTGTGGTTTATAAATTGCTTGTCTTCAACCATTATGGTGCGC ATTTTAAAATGGGAAAAAAATTTAACGGCGTGGTAATAATGAGAAGTGTTTTGTGGTGCA TTTCATGGTTTTACATCTTGTAATTTTAGGTTGGTTTGGGGTTCTTGGTAGTGGTCCACG TGCTTAAGTTGTCATTTTCAAGGGATAAATGAACTTGTGTGATGTATCGGTGACCCCTTT TACAGTGAAGTTTATGAAGGACCATTTTTCAAGAACCCTTGCATGTTTATTGAGTTATAT CTTCCTATTTTATGTGAAGTTCATTTGTCTTACATAAAATTAAATAATGCAACTCATCAT TGCAATTGATCTAGAATGTTTGATTTGGTTTAATTGTTTATCTTCAGCTAGGGGTCATCC CACTTAGATTTTTCTTAATTTGTTGTTACTGTAATAAACACTAGATTCTTGTGTCATAAA TTTTTGTCGTTTGCTGCACTTTTGCTATTCTTGCTCCTTGCTTATATTTCTTTAGAGGGG AAGATATTTGTTTTGTTTTGTTTTCTTGTAGAAAGTTTATGACGTGTAAGTCGGTGCTAC AATGTTCATATAAAAGTTGACCATGGGCAATATAGACCTTTATACTGGTTCATTTATAAC GGTCCAGCTCTTTTGGTCTCCAGTGATGCTTCTATCTTCATAGTGTAAAAGTTTTTTATT AAACTGATTTTTGGATATAGCTTTTTTTGTCGGTTTCAGGGAGTCTCAAAATGTGTAAAA TTGCAATTTTTCAAGTAGACATAGGGGGAACCTATTGCTTTTTGCAAATAAAAATTTGAT TTAATGTTTTGAAAGGCGAGGCGCCGCCTCACTGCCTCACCGGTTTTGATGCCTCAAGAC ATCGAGTTTAGGCGAAAATGGTGTAAAATCCTGCCGTGGACGCCTTGAGGTGCCCGCCTC GACTCGCCTTAGACCACCTTACCCTTGAGGTGGTTTGAGGCGAGACCGAGGTGGCCAGAA GGGCAAAAACGGAATTTCAACAAATTTTCCTCTTTAAAAGCCTAGGTAACCGATCACTCC TCTTCTTCTTCGCCGTCTCATGCTTTTCTCTCATTTTGACGAGTTCTGGCGGAGAAAACG CATCGGCAGCAGGAGAAGATGCCTTCCGGTGAGTCGTCGACAAGAGAAGATACTTTCCAT TGAGTTGCCGGCTTGAAAAGTTGCTTTTCGGTGGGTTGCCGGCGAGTGCATGCTTTCTGG TGGTTAGACGCAGCAGAAAAGGGAGGAGTGGGAGGGGGAAAATGACAGTGAGGTGGGTGG CGGCTATCGACTAGGATTAGGTTTTCCAAAGCAAGTTTCATATATATATATATATATATA TACATGTACATTAATAAAAATAATAAATAAGTCCCTAATTTTTTATAAAATTCTCAATCA AAATATTTAGTTTGAAAAATATGTAAAAAAAAAAAAATAACCCTACAATTTTAAAAATTA TAAAAATCCCCAACCTTATGATTTCGTAATATTTTGAGATTTTTTTACAAAAATGTGTGC CCTATATCCTAAAGACGTGCCTTACCCCTCGGGCTCCAAGGCCCTTTATGATTTCATGAT ATTTTGAGATTTTTTTCAATGGTATGAATGATTTTGTAAGTAAGAGATTTTTTTTTTTAA AAATTTTTTTTTTTTCTCATTTTGAGTTGAGATGGTCACCTCAATCGCCTCAAGGTGACT GCCTCGCCTCGCCTTTCGCCTTTTAAAATGTTGATTTGATTAGAACATTTAGAGATATAA TCTGAGTGCACCTTTTGGGAAACACCTGAGGGGCCATTGCTTGGCAAATGGTAGAAGTCT TGGATTGATAAGAACAATCACTTAGATCTGAGTGGTGAGAGTTGCCACTATTTGTAAAAT GCTAGAGGGTACTGCTGTAGCCTAAGTACGTATCCCAGGACCCGGCTTCTGCCTGACCTG CATTTGGTAATGAATAAATGGCCTTTTATGTTTAGGAATCACAAAACTTTAGAGATCCTG TTTTGAGAGTCCTTAGCTTTTTCATGCTAATGATGTTTCAACTTGGCTGCATTGACATAC ACATCACAATTCATTATTCATCAATCAGCATCTCTGTTCAGGGATTTAAAATCATAAATT AAATGCCATATGAATTGTGAAGGATTTAAAAACTTTAGTTGTCTGCACTTGCTCTTGGAT AGGGTTTTGTTTTTGTGTTTAGAGTTTATTATGCTGTAGTGCATAGAGAGAGTTGCGGTG GAGGCTTGATATAGTAGATCTATCATTAGTTGGTAAGTGATATTGTTACTTATTCTGTAA ACTATCCATCGAAAAGGAAGAATTCTACTTTTAGTGTGCTACGTGTGCCAAAGTGTAGAA GAACTTTGAGCATTCACTGCTAAGTTGTTTAGTAGCTAGAGATTTGCAGCATATTTCTCT CTCTAAGTTCAGGATTTACTTTGGTTGTGCTTAAATTGGTCGAGTTGTTGTCTACTTTGG AAAAAAAAAAAAAGTGGATTTGTATGGGTTGGATACTTGTCATTTTCAATGTAGAACTTT CTAAATGATAAATATTGAACTACAATGTAGCACCTGTTTGATGGCTGTCTTCATGTTTAA TCATCCAGTAGCCAATGCTTTATGTTTGTTATATCCCATTTTTGGCTGCCTTCTATTATT AGTTTCAGCTCATATTAATGATTCTGTTTTTTCTACCTACAGAAAAGGAGAATCTCTGCT TGTATGGCTTTCCTAATGAGCAATGGGAAGTCAATTTACCAGCTGAAGAAGTGCCTCCAG AGCTTCCAGAGCCTGCATTGGGTATCAATTTTGCAAGAGATGGCATGCAGGAAAAGGACT GGTTGTCTTTAGTTGCTGTTCATAGTGATGCATGGCTGCTGGCTGTTGCGTTTTATTTTG GTTCCAGATTTGGATTTGATAAAGCTGACAGGTAAATTTCTTACGGTGATAACTTTTATC TGCTGAGGTCATATAAGTATGGTCTATTTAGTGAAACATTTCTACGTGGGGATTAAATTT TGGTTCTAGAGTGGAAATCTTATTTATGTAGTAGGTGAAAAATTCTCTTTGGGGGGTTAA AATTTGTTTAATGTTGAAACCATTGTTGAAAATTTGGAATGATTCCACTCTTTGATTTTC TCTAAGTTGAATGATCTTGCTAATGTTCAGCTTTCTCCTATTTTAGCAAAAGTGGTGTGT ATGTTCGTTAGGTTTGCCTTACTTTTGGGCTGTTAATTAAACCATTGAACAAAATAAATT GATCTTTTTTTATTCCCATGTTGATTAGATAAGAATTTTTCTCTGATCATTTGTTATAAA CTTCTAATCTGAGGTTTGGAAACTCATGGCCTGTTGATCTGGTATGTTTCATTTTTATAC ACTGAATGACTGAGTGTTAAGATTGAATAAATGTTCCTGTTGAGTTGAGGTCAAATTCTC CACCTTTTTAACGGGTTTGATCTCAATCATGTGCTTCTATTGGCACAACCTTTTCAATTT AATTTTACATAAATGTGCTAAAGTAGCATCTGTCTCCTCTTTGTTTAAAAAAAAAAAAAA AAGGCCGTGAGACAAAATGGAAGCAGACATTTAACTCAAATATGCAATTTGTGATTCTTC TTGTGACATACCATGTTGCTGGTTTTTAATGCAATGTTGCTTTATATTTATAATTGTGAT GCAGGAAACGGCTTTTTAATATGATAAATGATCTTCCGACAATTTTTGAAGTTGTGACTG GCGTTGCAAAGAAACAAGTAAAGGACAAGTCATCTGTCTCAAATCATAGTAGCAACAAGT CCAAGTCAAACTCCAAAGCAGCAAAAGAGGTTCTATACACAATCTTTTATGTTGTGAAAA AAAAATTTTATGCAAGTAATGCTGGTGCAATCCAGTTTACTAAATGTTTATTCTCCTTAA ATGCTTTAAGTGAAAGCAAACATTTTTTGTTGATTAATGTGAAATGAGTATTGTATTACT AATTGGTGTATCTTTGCATCCGGGTTTTTGTGGAAACCTCAGGCAAAATATGTTAAGGCA TTGCAGCCAAAGGATGAAGAAGAAGAATTGGATGAAGAAGATGAAGATGAGCATGGGGAG ACATTGTGCGGAGCTTGTGGTGAGAACTATGCATCGGACGAATTCTGGATTTGCTGTGAC ATCTGCGAGAAGTGGTTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATCACCCCAGCCAGGGCAGAGCAT ATCAAGCAGTACAAGTGTCCTTCTTGCAGCAGCAGCAAGAGAGCTCGCCCTTGA