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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI030302 | Chr4 | 4521551 | 4527304 | + | PHD finger protein ALFIN-LIKE 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI030302.m1 | 22 | 150 | PF12165.11 | Alfin | Family | 231.6 | 1.70E-69 |
| LITCHI030302.m1 | 208 | 256 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.5 | 2.00E-10 |
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>LITCHI025686.m1 ATGGGGCTTCAGTGTTCTAAACTCCCGCTGTGTTGCTGGGGCTCACAGTTCAATGCATCA GTTCTAGAAGCTCCTGATGTTGAGAATGATGAGAAGAGTGAAGTTGATCGCCTGCCTGTG TTTCGTGAATTCACCTTGGAGCAACTGAAAAATGCCACCTCTGGTTTTGCTGTAGAGAAT ATTGTGTCTGAGCATGGGGAGAAGGCTCCAAATGTTGTTTATAAAGGGAAGCTGGAGAAT CAGAGGAGGATCGCTGTTAAACGGTTTAACAGAATGGCTTGGCCCGATACACGACAATTC TTGGAAGAAGCAAGATCAGTTGGCCAGCTAAGAAACCACAGATTGGCAAATTTGCTTGGC TGTTGCTGTGAAGGTGAGGAGAGGTTGCTAGTGGCAGAATACATGCCTAACGAAACGCTT GCCAAACACCTATTTCATTGTAAGGCTAATATCTCGCCCCCTTGCATGCCTTTTAATTTT CGAATATCTGATCAATTACCTGCAGTTGGCTTTAGATGTGAATCATGTGAGTGTTTTGGT CTCATTGTTGATTCTCTATTGGGGTTTAGATGGAAAGGGACACACTGGGAAACACATCCT ATGAAATGGGCAATGCGATTAAGGGTTGTTCTTCATCTTGCACAGGCTCTAGAATACTGC ACAGGCAAAGGGCGTGCACTCTATCACGATCTAAATGCCTATAGAATTTTGTTTGATGAC GATGGTAATCCAAGACTATCAACTTTTGGCCTGATGAAGAATAGTAGGGATGGAAAAAGT TATAGCACAAATTTAGCATTTACTCCTCCTGAATATCTGAGAACTGGAAGAGTAACTCCT GAAAGTGTAATATATAGCTTTGGGACTCTTTTACTTGACCTTCTCAGTGGGAAGCATATA CCCCCTAGCCATGCCCTCGACCTGATACGGGACAGGAATCTTCAGATGCTGACAGATTCC TGCTTGGAAGGACAATTTTCCGATGATGATGGGACTGAGTTAGTACGCTTGGCTTCTCGG TGTTTACAGTATGAACCCCGAGAACGCCCAAATCCTAAATCATTGGTGGCTGCTTTGACT CCTCTTCAGAAGGAAACTGAGCTTCCTTCTCATGTTTTAATGGGTATTCCACACAGTGCT TCATTCTCCCCTCTTTCCCCTCTTGGTGAAGCTTGTTCAAGAAGAGACTTGACTGCCATA CATGAGATCTTAGAGAATATTAGTTACAAAGATGACGAAGGAGTGACAAACGAGCTCTCA TTCCAGATGTGGACTGACCAAATGCAAGAAACTTTAAATTCAAAGAAAAAGGGTGATGTT GCTTTCCGGCAAAAAGATTTTAGAGAGGCAATTGAGTGTTACTCACAGTTTATTGATGTT GGAACCATGGTTTCTCCAACGGTTTACGCACGGCGTAGTCTGTCTTATCTCATGAGCAAT ATGCCTCAGGAGGCTCTGCATGATGCAATGCAAGCCCAAGTCATTTCCCCAGTATGGCAT ATTGCATCTTACCTTCAGGCTGCTGCCCTTGCTGCTCTTGGAATGGAGAATGAAGCTCAA GTGGCCTTAAAGGAGGGTTCAACTCTTGAAGCCAAAAAGAATGCATCCGCTGGACAGAAG TGA
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>LITCHI025009.m2 MGARCSKLSLCWYPSNLKSNLHDSTSDLENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIV SEHGEKAPNVVYRGKLVDGDRWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGC CCEGEERLLVAEFMPNETLSKHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHD LNAYRILFDQDGNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTL LLDLLSGKHIPPSHALDLIRGKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERP NAKSLVAALTPLQKETEVPSYVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEK AGYKDDEGIANELSFQMWTDQIQETLNSKKRGDAAFRAKDFVTAIDCYTHVSPLFNRLLI QKW. >LITCHI025009.m3 MWVVFVFVENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIVSEHGEKAPNVVYRGKLVDGD RWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGCCCEGEERLLVAEFMPNETLS KHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHDLNAYRILFDQDGNPRLSCFG LMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDLIR GKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNAKSLVAALTPLQKETEVPS YVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEKAGYKDDEGIANELSFQMWTD QIQETLNSKKRGDAAFRAKDFVTAIDCYTHFIDGGTMVSPTVFARRCLCYLLSDMPQEAL GDAMQAQVVSPEWPTAFYLQAAALFSLGMNNDAQETLKDGTNLEAKKHRN. >LITCHI025009.m4 MWVVFVFVENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIVSEHGEKAPNVVYRGKLVDGD RWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGCCCEGEERLLVAEFMPNETLS KHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHDLNAYRILFDQDGNPRLSCFG LMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDLIR GKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNAKSLVAALTPLQKETEVPS YVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEKAGYKDDEGIANELSFQMWTD QIQETLNSKKRGDAAFRAKDFVTAIDCYTHVSPLFNRLLIQKW. >LITCHI025009.m5 MPNETLSKHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHDLNAYRILFDQDGN PRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTLLLDLLSGKHIPPS HALDLIRGKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNAKSLVAALTPLQ KETEVPSYVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEKAGYKDDEGIANEL SFQMWTDQIQETLNSKKRGDAAFRAKDFVTAIDCYTHVETSTKTSTTFNKEKKKEKKKNL Q. >LITCHI025009.m6 MWVVFVFVENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIVSEHGEKAPNVVYRGKLVDGD RWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGCCCEGEERLLVAEFMPNETLS KHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHDLNAYRILFDQDGNPRLSCFG LMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDLIR GKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNAKSLVAALTPLQKETEVLR NIKYFNISQALHGLI. >LITCHI025009.m7 MGARCSKLSLCWYPSNLKSNLHDSTSDLENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIV SEHGEKAPNVVYRGKLVDGDRWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGC CCEGEERLLVAEFMPNETLSKHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHD LNAYRILFDQDGNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTL LLDLLSGKHIPPSHALDLIRGKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERP NAKSLVAALTPLQKETEVPSYVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEK AGYKDDEGIANEVSNVFLI. >LITCHI025009.m8 MWVVFVFVENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIVSEHGEKAPNVVYRGKLVDGD RWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGCCCEGEERLLVAEFMPNETLS KHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHDLNAYRILFDQDGNPRLSCFG LMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDLIR GKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNAKSLVAALTPLQKETEVPS YVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEKAGYKDDEGIANEVSNVFLI. >LITCHI025009.m9 MGARCSKLSLCWYPSNLKSNLHDSTSDLENGSGDDLPGFTEFGLDQLRAATSGFCTDNIV SEHGEKAPNVVYRGKLVDGDRWIAVKRFNRMAWPDSRQFLEEARAVGQLRSERLANLIGC CCEGEERLLVAEFMPNETLSKHLFHWENQPMKWAMRLRVALYLAQALEYCSSRGRALYHD LNAYRILFDQDGNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTLESVVYSFGTL LLDLLSGKHIPPSHALDLIRGKNFLMLMDSCLEGHFSNDDGTELVRLASRCLQYEPRERP NAKSLVAALTPLQKETEVPSYVLMGIPHGIPSTKQTVTLTPLGEACSRLDLTAIHEILEK AGYKDDEGIANELSFQMWTDQIQETLNSKKRGDAAFRAKDFVTAIDCYTHFIDGGTMVSP TVFARRCLCYLLSDMPQEALGDAMQAQVVSPEWPTAFYLQAAALFSLGMNNDAQETLKDG TNLEAKKHRN. >LITCHI029324.m1 MGRAPCCDKNGLKKGPWTPEEDQKLTDYIQKHGYGNWRTLPKNASLQRCGKSCRLRWTNY LRPDIKRGRFSFEEEETIIQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMG IDPVTHSPRLDLLDLSSILSSSLYNPSQMNISRLLGVQPWVNPELLRLATSLMSSQRENQ HQHQNQNQNGFLVHQNVQDQNQLCNPQYTTQQQQLVVQPDYSNQQYQLCTTLINDNTTTT SPSCVSFSNEATTQLMDPQVEQFQVSFTNFSNENSQLHEWQSNGVPSNFTHQEDYVSIPP CNNYCYYGSDQTVMDPSSVTSNNFSFTSVLSTRSSSPTPLNSNSTYMSTEDERESYCSEM LKFEIPDILYAS.
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>LITCHI029324.m1 CCAAATCTCCGTTTACCCAATCTCTCTCTCTCAAACAGAACCCACTACCCCACTATTTTT AACCAAACATCAAGGTTTCCAAGAACAAAAAGGCAGCTAACCACCATGGGGAGAGCACCT TGTTGTGATAAAAATGGCCTGAAGAAAGGTCCTTGGACGCCTGAGGAAGATCAGAAGCTT ACAGATTACATTCAAAAACATGGTTATGGCAACTGGAGAACTCTTCCTAAAAATGCCAGT CTTCAAAGGTGTGGAAAGAGCTGCCGTCTTCGATGGACTAACTATCTTCGACCTGATATC AAAAGAGGCAGATTTTCGTTTGAAGAAGAAGAGACAATAATTCAACTACATAGTATATTA GGGAACAAATGGTCTGCAATTGCCGCTCGGTTGCCTGGAAGAACAGATAACGAAATCAAA AACTACTGGAACACCCACATTAGAAAAAGGCTTCTTCGGATGGGAATCGATCCGGTCACT CACAGTCCTCGTCTCGATCTTCTCGATCTCTCTTCGATTCTAAGCTCTTCTCTTTACAAT CCCTCTCAAATGAACATTTCGAGACTGCTCGGGGTCCAGCCTTGGGTGAACCCGGAGCTC CTTAGACTTGCAACCTCTCTCATGTCATCACAACGTGAAAACCAACACCAACACCAAAAC CAAAACCAAAATGGTTTCCTTGTTCATCAAAATGTTCAAGACCAAAACCAACTGTGCAAC CCTCAGTACACGACACAACAACAACAACTAGTAGTCCAACCAGATTATAGTAACCAGCAG TACCAGCTTTGCACTACATTGATTAACGACAACACAACAACGACTTCTCCTTCTTGTGTT TCGTTTTCTAATGAGGCTACCACACAACTAATGGACCCCCAAGTCGAGCAATTCCAAGTC AGTTTTACCAACTTTAGTAACGAAAATTCTCAACTACATGAGTGGCAAAGCAATGGGGTG 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