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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI030302Chr445215514527304+PHD finger protein ALFIN-LIKE 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI030302.m122150PF12165.11AlfinFamily231.61.70E-69
LITCHI030302.m1208256PF00628.32PHDDomain40.52.00E-10
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>LITCHI030302.m1
ATGGACGGCGGCGGAGGTGTCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGCTATAATCCG
AGGACAGTGGAGGAGGTGTTTAGAGATTTCAAAGGACGGAGAGCTGGCATGATCAAAGCT
CTCACTACAGAGGTTGAAGACTTCTATCAACAGTGTGATCCTGAAAAGGAGAATCTCTGC
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>LITCHI030302.m1
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>LITCHI030302.m1
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CACCCCAGCCAGGGCAGAGCATATCAAGCAGTACAAGTGTCCTTCTTGCAGCAGCAGCAA
GAGAGCTCGCCCTTGA
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>LITCHI020133.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GTTCCCATTTGTTTCAGAGTTCCAAACTCGTCTGCTCTTCAATCAAGCATTCAGCAGAGG
CCTCCAGATTTCTATGATTCTTGCTGGAAGGAAAGACAAGACGGCAACCAATTGAGATTT
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AAAATGTAAATGAACCTTGAGCGACTCGAATGATAAAGAAACACTCCTTCCATAGATGGA
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CTCCCTTTGTAAGGGGCATGGGTTCGACACCCCTTAAGTCCAATATATATATATATATAT
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TCACTAATTGTGTGGGTCGTCCCCCCACTTTAATGTGAGTCTCTCCCTCACTTTTGTGTG
GGTGGTTTTCTTTCCAATGGGAATAGCCCCTGGGCTCTGCTATCAGTGTCACATCTCGAT
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AAAAAGTAGTTGAAATAGTTGAATATCAATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACATGAA
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AAAAAACAAAAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGAGAA
GAGAGTGATGAAAGGGAGGG
>LITCHI020133.m5 -  Up_Stream_Len 2000
GTTCCCATTTGTTTCAGAGTTCCAAACTCGTCTGCTCTTCAATCAAGCATTCAGCAGAGG
CCTCCAGATTTCTATGATTCTTGCTGGAAGGAAAGACAAGACGGCAACCAATTGAGATTT
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GTTTCTTGTAATTCAATGCTGTATACATGATAGCATTTTAATCATACAATGAATTTACAT
TTCTTAGTTGGAAAATTTGCAAATACATTTTCTGTTATGATTTCTATTGTACAACTATTT
TTTTAATTTCGAAAGGATTAGATGTACTCGTTAAGAGTGTGTATATTATTATTTAAACCT
TACCTGACAGTTGAGCAGTAAATTGTTCAACCGGTAAAGAATTGCCGTGTCATTTGAGCG
AAAATGTAAATGAACCTTGAGCGACTCGAATGATAAAGAAACACTCCTTCCATAGATGGA
CACGGTGCTACTTGTCATTTCTAACAAGCTGCATGTTAGTTGATTGCGGCGAGTGTGACG
AGTTGCATAACTGACAGCAAACAAGATTCACAGCAAGTCTCTTATAATGTAAGCCATGTT
GAACCTTTCTCACAATAGATCACTTAAGGCTGACTTAAGCGTTAGAGGGTGTATACGGTG
CAAACCATCAAAAACATCCTAATGAGCTTGTTCGTTTTACAAGTCTTTAACAGATGTAAG
GGACAACTACAACTGGGACTTAATCAGGAGTGAAACTCACTATCCCATTTCCTAGCCAGT
TTTTGCACCAACATTTTTATCGGTTATCAAAACTTATATTGAAGTAGTGGGTTTAATTCC
AAACTCTTTATTGGGTTGCAATCAAAATCCATGGATTTGAAATTATGTAAGTTTTTCAAT
ATCGGATGGATTTAAATCAAGAGTTGAAATACTTATCTATAAAACCACCATTTAATGTGC
ATTGGCTGAATTTATATTACACTAATCATATACCGATATCCTCACCAAAGCTAATTATTT
TGGTCATTTTCGTGATTTGATATTCATTCAAACTTGCAACTTCTCAAGTATATATTATAT
GAATTTGTTACCATATCAAATTCATATAAATATCATTCACATATAACAATTTCTCCTGTG
TTTTATTATTTCCAACTTTTCAATAATATATATTATATTAGTTTTCCTGTTTAAGAGATT
GCTTACTTGATTTGCTCTTGGAAATAGTTTTTCTATTCTAATTCCATTATAGTGATATAA
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CTCCCTTTGTAAGGGGCATGGGTTCGACACCCCTTAAGTCCAATATATATATATATATAT
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TCACTAATTGTGTGGGTCGTCCCCCCACTTTAATGTGAGTCTCTCCCTCACTTTTGTGTG
GGTGGTTTTCTTTCCAATGGGAATAGCCCCTGGGCTCTGCTATCAGTGTCACATCTCGAT
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AAAAAGTAGTTGAAATAGTTGAATATCAATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACATGAA
AAATGCAAAAACATAGTAATAAAAACATAAATAACGTTATGTTATCTAAAAAATTCGAAT
TTATTATTTTAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGTGCT
AAAAAACAAAAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGAGAA
GAGAGTGATGAAAGGGAGGG
>LITCHI020133.m4 -  Up_Stream_Len 2000
TGCATTGGCTGAATTTATATTACACTAATCATATACCGATATCCTCACCAAAGCTAATTA
TTTTGGTCATTTTCGTGATTTGATATTCATTCAAACTTGCAACTTCTCAAGTATATATTA
TATGAATTTGTTACCATATCAAATTCATATAAATATCATTCACATATAACAATTTCTCCT
GTGTTTTATTATTTCCAACTTTTCAATAATATATATTATATTAGTTTTCCTGTTTAAGAG
ATTGCTTACTTGATTTGCTCTTGGAAATAGTTTTTCTATTCTAATTCCATTATAGTGATA
TAAACAATTTATTCAATTTTTGAGGGTTTCACATAAATATAAAAATGTAAAATCAAAGCA
TCCCAAGTTGAAAGAAGTAGTTGTCAATTGGCTGCTGGCGCAGTGGTAGGCGCAGCATCA
TGCCTCCCTTTGTAAGGGGCATGGGTTCGACACCCCTTAAGTCCAATATATATATATATA
TATATATATATAATACTAATATTATGTAATATAATAATAATAATGATATTAATAATTAAT
TTTTCACTAATTGTGTGGGTCGTCCCCCCACTTTAATGTGAGTCTCTCCCTCACTTTTGT
GTGGGTGGTTTTCTTTCCAATGGGAATAGCCCCTGGGCTCTGCTATCAGTGTCACATCTC
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AAAAAAAAGTAGTTGAAATAGTTGAATATCAATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACAT
GAAAAATGCAAAAACATAGTAATAAAAACATAAATAACGTTATGTTATCTAAAAAATTCG
AATTTATTATTTTAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGT
GCTAAAAAACAAAAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGA
GAAGAGAGTGATGAAAGGGAGGGATGATGATGAGTCAATCTTCTGGATCAGTGACATTTG
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TAACTCACTCACTCCTTTTCGATTCTACGACACACACAAACACAATCAATCATCCATTTC
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GGCCTCGATCGCTGGCCTTATCGCAAGGTAACCTCCGTTGTTTTCTATTCATTCTCTCGA
CAATTGATTTTATTTAGGTTTTTATTTTGTTTGTTGCAGTTCTTATCCGGGAAGAGCATC
GAAGACATTAAAAGATACGCAGCTAGAGAGAGAAACAAACAACTCGCTGACCTCTCTAAG
CTTGCGAGGCAGAGGTATCTATCTATCCACTCTTTTCACTTCTTCTTTTACGTGTTATCA
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ATGTTCCACAGCATCCAGTTAAATATTATTTTCATTTGTTATGTTCCAGACAGTGATCAG
GTTGTTGTAATGATTGATGTTTTCGCATGTCCAAAATTCCTGTTTAGGAAGCACAGTCTT
TACCACCGGTTTGCATATATAGTCCTGGTATTATAGTTGTTGGGAAGAGTCTTTTCCGCG
TGATTGCTGCTGCTCTACACATTCATTGTTTGTTTTTATACAACTCTGCTAAATTTTACC
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TGATAGCAGTCATTGTATAAAAGATTGATATCATTGTGTTCTGATGATTCATGTTTGGTT
TGACAATGTTCAAGTTTTCTGCCTTTGAACTTTGCTTTGTTGTTTGTGAAAGCAGTGGTT
TGCAACCTGTGAACAATGAA
>LITCHI020133.m3 -  Up_Stream_Len 2000
TGCATTGGCTGAATTTATATTACACTAATCATATACCGATATCCTCACCAAAGCTAATTA
TTTTGGTCATTTTCGTGATTTGATATTCATTCAAACTTGCAACTTCTCAAGTATATATTA
TATGAATTTGTTACCATATCAAATTCATATAAATATCATTCACATATAACAATTTCTCCT
GTGTTTTATTATTTCCAACTTTTCAATAATATATATTATATTAGTTTTCCTGTTTAAGAG
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TAAACAATTTATTCAATTTTTGAGGGTTTCACATAAATATAAAAATGTAAAATCAAAGCA
TCCCAAGTTGAAAGAAGTAGTTGTCAATTGGCTGCTGGCGCAGTGGTAGGCGCAGCATCA
TGCCTCCCTTTGTAAGGGGCATGGGTTCGACACCCCTTAAGTCCAATATATATATATATA
TATATATATATAATACTAATATTATGTAATATAATAATAATAATGATATTAATAATTAAT
TTTTCACTAATTGTGTGGGTCGTCCCCCCACTTTAATGTGAGTCTCTCCCTCACTTTTGT
GTGGGTGGTTTTCTTTCCAATGGGAATAGCCCCTGGGCTCTGCTATCAGTGTCACATCTC
GATTAAAGATCTCGGATATCCTCTGAGTTTATTTCAGATATAGTTATTATACTAAAAAAA
AAAAAAAAGTAGTTGAAATAGTTGAATATCAATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACAT
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AATTTATTATTTTAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGT
GCTAAAAAACAAAAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGA
GAAGAGAGTGATGAAAGGGAGGGATGATGATGAGTCAATCTTCTGGATCAGTGACATTTG
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TAACTCACTCACTCCTTTTCGATTCTACGACACACACAAACACAATCAATCATCCATTTC
ATTGTGTTTTGCATTGCAGGTGTCTGCGTCAGTCTTCTCAAGAAAATCTGCCGCGAAAAT
GGCCTCGATCGCTGGCCTTATCGCAAGGTAACCTCCGTTGTTTTCTATTCATTCTCTCGA
CAATTGATTTTATTTAGGTTTTTATTTTGTTTGTTGCAGTTCTTATCCGGGAAGAGCATC
GAAGACATTAAAAGATACGCAGCTAGAGAGAGAAACAAACAACTCGCTGACCTCTCTAAG
CTTGCGAGGCAGAGGTATCTATCTATCCACTCTTTTCACTTCTTCTTTTACGTGTTATCA
CTGTTAATTTAACTCTAATATCCTTTCGACATCATGTTATCACACACCACCCAATGTCAC
CTGGTGGCAGAGAGCGCACATTCAGTCTCGAAGATGTATCTCAAAAGAAGGAAAAAAATG
ATGTTCCACAGCATCCAGTTAAATATTATTTTCATTTGTTATGTTCCAGACAGTGATCAG
GTTGTTGTAATGATTGATGTTTTCGCATGTCCAAAATTCCTGTTTAGGAAGCACAGTCTT
TACCACCGGTTTGCATATATAGTCCTGGTATTATAGTTGTTGGGAAGAGTCTTTTCCGCG
TGATTGCTGCTGCTCTACACATTCATTGTTTGTTTTTATACAACTCTGCTAAATTTTACC
TGTTACATATCTGCCTTTTGCTTTCTTGCAAATTGTTCTTTATTTGTTTTCGACTGTTTT
TGATAGCAGTCATTGTATAAAAGATTGATATCATTGTGTTCTGATGATTCATGTTTGGTT
TGACAATGTTCAAGTTTTCTGCCTTTGAACTTTGCTTTGTTGTTTGTGAAAGCAGTGGTT
TGCAACCTGTGAACAATGAA
>LITCHI020133.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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AATACTTATCTATAAAACCACCATTTAATGTGCATTGGCTGAATTTATATTACACTAATC
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ATATATTATATTAGTTTTCCTGTTTAAGAGATTGCTTACTTGATTTGCTCTTGGAAATAG
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AATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACATGAAAAATGCAAAAACATAGTAATAAAAACA
TAAATAACGTTATGTTATCTAAAAAATTCGAATTTATTATTTTAAAAAAAATTAAAAAAA
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TCTCCGACGCCGCTACTCATCTCGGTACGCTAACTCACTCACTCCTTTTCGATTCTACGA
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TTGTTGCAGTTCTTATCCGGGAAGAGCATCGAAGACATTAAAAGATACGCAGCTAGAGAG
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TCTTTTCACTTCTTCTTTTACGTGTTATCACTGTTAATTTAACTCTAATATCCTTTCGAC
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CCAAAATTCCTGTTTAGGAAGCACAGTCTTTACCACCGGTTTGCATATATAGTCCTGGTA
TTATAGTTGTTGGGAAGAGTCTTTTCCGCGTGATTGCTGCTGCTCTACACATTCATTGTT
TGTTTTTATACAACTCTGCTAAATTTTACCTGTTACATATCTGCCTTTTGCTTTCTTGCA
AATTGTTCTTTATTTGTTTTCGACTGTTTTTGATAGCAGTCATTGTATAAAAGATTGATA
TCATTGTGTTCTGATGATTC
>LITCHI020133.m6 -  Up_Stream_Len 2000
TCCATGGATTTGAAATTATGTAAGTTTTTCAATATCGGATGGATTTAAATCAAGAGTTGA
AATACTTATCTATAAAACCACCATTTAATGTGCATTGGCTGAATTTATATTACACTAATC
ATATACCGATATCCTCACCAAAGCTAATTATTTTGGTCATTTTCGTGATTTGATATTCAT
TCAAACTTGCAACTTCTCAAGTATATATTATATGAATTTGTTACCATATCAAATTCATAT
AAATATCATTCACATATAACAATTTCTCCTGTGTTTTATTATTTCCAACTTTTCAATAAT
ATATATTATATTAGTTTTCCTGTTTAAGAGATTGCTTACTTGATTTGCTCTTGGAAATAG
TTTTTCTATTCTAATTCCATTATAGTGATATAAACAATTTATTCAATTTTTGAGGGTTTC
ACATAAATATAAAAATGTAAAATCAAAGCATCCCAAGTTGAAAGAAGTAGTTGTCAATTG
GCTGCTGGCGCAGTGGTAGGCGCAGCATCATGCCTCCCTTTGTAAGGGGCATGGGTTCGA
CACCCCTTAAGTCCAATATATATATATATATATATATATATAATACTAATATTATGTAAT
ATAATAATAATAATGATATTAATAATTAATTTTTCACTAATTGTGTGGGTCGTCCCCCCA
CTTTAATGTGAGTCTCTCCCTCACTTTTGTGTGGGTGGTTTTCTTTCCAATGGGAATAGC
CCCTGGGCTCTGCTATCAGTGTCACATCTCGATTAAAGATCTCGGATATCCTCTGAGTTT
ATTTCAGATATAGTTATTATACTAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTTGAAATAGTTGAATATC
AATGAATACAAGGGAAAAAAAAAAATACATGAAAAATGCAAAAACATAGTAATAAAAACA
TAAATAACGTTATGTTATCTAAAAAATTCGAATTTATTATTTTAAAAAAAATTAAAAAAA
AAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGTGCTAAAAAACAAAAGATTGAGGATTTGGGG
AGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGAGAAGAGAGTGATGAAAGGGAGGGATGATGA
TGAGTCAATCTTCTGGATCAGTGACATTTGATGAAATCTCAAACTATTTCTCACTTCCTC
TCTCCGACGCCGCTACTCATCTCGGTACGCTAACTCACTCACTCCTTTTCGATTCTACGA
CACACACAAACACAATCAATCATCCATTTCATTGTGTTTTGCATTGCAGGTGTCTGCGTC
AGTCTTCTCAAGAAAATCTGCCGCGAAAATGGCCTCGATCGCTGGCCTTATCGCAAGGTA
ACCTCCGTTGTTTTCTATTCATTCTCTCGACAATTGATTTTATTTAGGTTTTTATTTTGT
TTGTTGCAGTTCTTATCCGGGAAGAGCATCGAAGACATTAAAAGATACGCAGCTAGAGAG
AGAAACAAACAACTCGCTGACCTCTCTAAGCTTGCGAGGCAGAGGTATCTATCTATCCAC
TCTTTTCACTTCTTCTTTTACGTGTTATCACTGTTAATTTAACTCTAATATCCTTTCGAC
ATCATGTTATCACACACCACCCAATGTCACCTGGTGGCAGAGAGCGCACATTCAGTCTCG
AAGATGTATCTCAAAAGAAGGAAAAAAATGATGTTCCACAGCATCCAGTTAAATATTATT
TTCATTTGTTATGTTCCAGACAGTGATCAGGTTGTTGTAATGATTGATGTTTTCGCATGT
CCAAAATTCCTGTTTAGGAAGCACAGTCTTTACCACCGGTTTGCATATATAGTCCTGGTA
TTATAGTTGTTGGGAAGAGTCTTTTCCGCGTGATTGCTGCTGCTCTACACATTCATTGTT
TGTTTTTATACAACTCTGCTAAATTTTACCTGTTACATATCTGCCTTTTGCTTTCTTGCA
AATTGTTCTTTATTTGTTTTCGACTGTTTTTGATAGCAGTCATTGTATAAAAGATTGATA
TCATTGTGTTCTGATGATTC
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>LITCHI020133.m1 GenomeSequence - 
TAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGTGCTAAAAAACAA
AAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGAGAAGAGAGTGAT
GAAAGGGAGGGATGATGATGAGTCAATCTTCTGGATCAGTGACATTTGATGAAATCTCAA
ACTATTTCTCACTTCCTCTCTCCGACGCCGCTACTCATCTCGGTACGCTAACTCACTCAC
TCCTTTTCGATTCTACGACACACACAAACACAATCAATCATCCATTTCATTGTGTTTTGC
ATTGCAGGTGTCTGCGTCAGTCTTCTCAAGAAAATCTGCCGCGAAAATGGCCTCGATCGC
TGGCCTTATCGCAAGGTAACCTCCGTTGTTTTCTATTCATTCTCTCGACAATTGATTTTA
TTTAGGTTTTTATTTTGTTTGTTGCAGTTCTTATCCGGGAAGAGCATCGAAGACATTAAA
AGATACGCAGCTAGAGAGAGAAACAAACAACTCGCTGACCTCTCTAAGCTTGCGAGGCAG
AGGTATCTATCTATCCACTCTTTTCACTTCTTCTTTTACGTGTTATCACTGTTAATTTAA
CTCTAATATCCTTTCGACATCATGTTATCACACACCACCCAATGTCACCTGGTGGCAGAG
AGCGCACATTCAGTCTCGAAGATGTATCTCAAAAGAAGGAAAAAAATGATGTTCCACAGC
ATCCAGTTAAATATTATTTTCATTTGTTATGTTCCAGACAGTGATCAGGTTGTTGTAATG
ATTGATGTTTTCGCATGTCCAAAATTCCTGTTTAGGAAGCACAGTCTTTACCACCGGTTT
GCATATATAGTCCTGGTATTATAGTTGTTGGGAAGAGTCTTTTCCGCGTGATTGCTGCTG
CTCTACACATTCATTGTTTGTTTTTATACAACTCTGCTAAATTTTACCTGTTACATATCT
GCCTTTTGCTTTCTTGCAAATTGTTCTTTATTTGTTTTCGACTGTTTTTGATAGCAGTCA
TTGTATAAAAGATTGATATCATTGTGTTCTGATGATTCATGTTTGGTTTGACAATGTTCA
AGTTTTCTGCCTTTGAACTTTGCTTTGTTGTTTGTGAAAGCAGTGGTTTGCAACCTGTGA
ACAATGAAATGTCGAGATCACATGGTGGTGCTGGTGCGTCTCCTCATTTGCAGCAACAAG
GAGGCAAGAATGCTTCAGTTAGCCAGCCTCACATTTTGCTTAATGCAAACTCGATAAAAG
GACTCATGGCTCTGGATGAATTTAAATATGGATTTCCATCTGATGGGTTATCAGCTACGA
CGAATAAATGGTGGGGTAGCAGCACTTCCGATGATTATGAGCGCGTTCGTGGAGGTGAAG
CTGAAACTGATGAGGAAGATAAACATCAGCCTGAAGAAAAGGCAGATGACAGTGCCACAT
CTACGACAACGGAGGAAAAGGAATCCAGAAATGGGAAACTAGAGAGCAACGTTGATCCTG
AAGGGCTGGGTCTATTGACAGCTATCAGGAAAAGAATTGCGAATGAAGAACGAGAAGCAC
TTAAGCTTGGTGTCTATAAGAGCAGTGGCATCAAGAAGCTAGGGAGGAAAGAAAAGGTGC
TGCTTCTTCGAATGTTCAGTTCCTCATTGCCAAAAGAATGGATATATGACTCTGCCTAAA
TGCAGATCAAGTAAGGCTGTGTGTTGTGTAATACATGATTTGCTTTGTTCGTTACCCAGT
ACAGAACATACAATTGTGATCTATTCTCATTAGGTTTTATTTCCTGTAGTTAATTCTAAA
ATCATTGCATAATATTTTCTCACATGTTTGTCAGTCGTTTCATGATAGTTGGCTAGATTT
AGGAGACTGGAGAGGTAGTTCTGGTCTACCATGCTGTATTGTATCTTTAGGAACTATTTT
TATATTATTTCTTGACAATCACGAGACTTGATTGATTGTTAAGCTCTTAAGTAAATGGTT
TAAGTATGCAATCTCTCGTCTGCTTGATGTCCCTCTTCAGTGTACAAGTGACAATGTAAG
ACCTGATCTTGAAGCTGTATTTCAAAAACCTGAATTTCATATTTTGCATTTGTATCATTT
TCTTTGTATGATCCGTTCTACATATGCAACAATGATCTTGTGGAGTCTTAACTGAATTTT
AAGGGCAC
>LITCHI020133.m5 GenomeSequence - 
TAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACCGGCAGGGCTAGCTGGGGTGGTGCTAAAAAACAA
AAGATTGAGGATTTGGGGAGAAGAGAAGGTGTTGGGTGTAGGAGGAGAGAAGAGAGTGAT
GAAAGGGAGGGATGATGATGAGTCAATCTTCTGGATCAGTGACATTTGATGAAATCTCAA
ACTATTTCTCACTTCCTCTCTCCGACGCCGCTACTCATCTCGGTACGCTAACTCACTCAC
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ATTGCAGGTGTCTGCGTCAGTCTTCTCAAGAAAATCTGCCGCGAAAATGGCCTCGATCGC
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AAGGGCAC