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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI030301Chr445174774520550+Nuclear transcription factor Y subunit A-3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI030301.m1211266PF02045.18CBFB_NFYAFamily91.63.70E-26
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>LITCHI030301.m1
ATGACAATGCAAAGTTTGGGTGAGAAAGATTCTGGCATAAGTTCTGCTCATTCAACATCA
CTGTATGACGTGAGTTGCCCATCGTGGGGGGTAAGTTCATCTGAATCTTGTGTGCAACAA
TCATCCTTGTCTGAAAGTCTATACTTGAAGATGGGAGTCCCTCCGCAACGATTTCTCAGC
ACTAAGCAATTCCATGACCAAGAGTCGTCGTCAACTCAATCGACTGGTCAATCTTGCCCT
AAAGAGGCTAGTATAAAATATAGCAATCCAAATGGTCAAATGATTTCAACATCATCAGGA
TTTAACGGCACTCAAGGGAAGCCAGAGGGAGGTCAGACTAAATTAGCCTCATCAACTGCA
CCTCAGGAATTCGCAATCCAACCTTCTCATGTTGACTATAATCAGTCAGTTGCTCCCTTT
ACATTCCATTGTGCTGAACCATATTTTGGTGGCATAATGACTGCCTATTATGGTCCCCAA
CCACTAGTAAAATATGACTACACCTCGATGTGTCTTCTTTGTTACCAGTTGATGAGATAT
TTATTCTTCAAATGTCAACAGATTCATCATCCTCAACTGATGGGGATGACTTCTGGTCGT
GTGCCATTACCTCTTGATGTTACAGCGGATGAGCCCATTTATGTCAATGCAAAACAGTAT
CGAGCAATTCTGAGGCGGAGACAGTATCGCGCCAAGCTTGAAGCTCAAAACAAACTCACC
AAAGGCCGCAAGCCATATCTTCATGAGTCGCGGCATGTTCATGCAATGAAGAGGGCAAGA
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GACAATGAACCAGACGGGTCAGGCTCTGCTGATATGCATTCGTCTGTCAATGTGTCAGAA
TCCAAAGCTCAACCAGCCAACTACTACAAAGATGCTGCTTCCACCACCTCTTGTTCCGGC
ATCACGACCACCTCCAACAGTGCAGACATCTTCCAGCAGCCGGACTTCAGGTTCTCAGGC
TACCCTTCTCGCCTAGGCAGAACCATGCAAGGTTGCTCAGCTGGCATCAACAGCGGTGGG
AACCTGCAGCCGCTCCTCTCCTCGGTCAAAAGATGA
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>LITCHI030301.m1
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TKQFHDQESSSTQSTGQSCPKEASIKYSNPNGQMISTSSGFNGTQGKPEGGQTKLASSTA
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LFFKCQQIHHPQLMGMTSGRVPLPLDVTADEPIYVNAKQYRAILRRRQYRAKLEAQNKLT
KGRKPYLHESRHVHAMKRARGSGGRFLNTKKLQESKPLPTDNEPDGSGSADMHSSVNVSE
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NLQPLLSSVKR.
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>LITCHI030301.m1
ATGACAATGCAAAGTTTGGGTGAGAAAGATTCTGGCATAAGTTCTGCTCATTCAACATCA
CTGTATGACGTGAGTTGCCCATCGTGGGGGGTAAGTTCATCTGAATCTTGTGTGCAACAA
TCATCCTTGTCTGAAAGTCTATACTTGAAGATGGGAGTCCCTCCGCAACGATTTCTCAGC
ACTAAGCAATTCCATGACCAAGAGTCGTCGTCAACTCAATCGACTGGTCAATCTTGCCCT
AAAGAGGCTAGTATAAAATATAGCAATCCAAATGGTCAAATGATTTCAACATCATCAGGA
TTTAACGGCACTCAAGGGAAGCCAGAGGGAGGTCAGACTAAATTAGCCTCATCAACTGCA
CCTCAGGAATTCGCAATCCAACCTTCTCATGTTGACTATAATCAGTCAGTTGCTCCCTTT
ACATTCCATTGTGCTGAACCATATTTTGGTGGCATAATGACTGCCTATTATGGTCCCCAA
CCACTAGTAAAATATGACTACACCTCGATGTGTCTTCTTTGTTACCAGTTGATGAGATAT
TTATTCTTCAAATGTCAACAGATTCATCATCCTCAACTGATGGGGATGACTTCTGGTCGT
GTGCCATTACCTCTTGATGTTACAGCGGATGAGCCCATTTATGTCAATGCAAAACAGTAT
CGAGCAATTCTGAGGCGGAGACAGTATCGCGCCAAGCTTGAAGCTCAAAACAAACTCACC
AAAGGCCGCAAGCCATATCTTCATGAGTCGCGGCATGTTCATGCAATGAAGAGGGCAAGA
GGATCTGGTGGGCGTTTTCTCAACACAAAGAAGCTCCAGGAATCCAAGCCTCTTCCAACT
GACAATGAACCAGACGGGTCAGGCTCTGCTGATATGCATTCGTCTGTCAATGTGTCAGAA
TCCAAAGCTCAACCAGCCAACTACTACAAAGATGCTGCTTCCACCACCTCTTGTTCCGGC
ATCACGACCACCTCCAACAGTGCAGACATCTTCCAGCAGCCGGACTTCAGGTTCTCAGGC
TACCCTTCTCGCCTAGGCAGAACCATGCAAGGTTGCTCAGCTGGCATCAACAGCGGTGGG
AACCTGCAGCCGCTCCTCTCCTCGGTCAAAAGATGATTGGAAACACGCATCTGAGCACTC
AGAATCCGGCATCCTCATCAAAAATTCTGGCTGCTACCGTTCCCTTGGGAAGTCATCCTT
GGCTCTTTTAGTTTACCTTTGTAATGCTTTTGTTGCTTGTAGTGTCAACTTGTTCGAACA
CCAAGAACAATGGAGTTGTCAGTTGCCATGTGGTTGGTTTTAATAGGTTCTTGTATGCAA
CCATGCATTATTATCAGTAAGTCTCTATTTTAAGCAATTGTCTCTTGTAATGGAGATGTG
AAATAAGATTAGCAATGTACATTTGGAGCCTAACAATCATTTTTTCGCAGCCAAAATATG
GCAATATGAACACAATAAGGTTGTTAATGTAAAGTTATGTAGATTGAATTGATGATGAAC
AAATTTAGATACAAGTACTAAATCTAAATGTAATTACATGGTAGTTTTCCAATTCAAGAT
CTCTTGGTAAAATTGGTTTCTATTTGTCTTTTCAGGTATGATTTAATTCAAAATGTTTAA
AGTTTGTGAGTGAGTGGCT
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>LITCHI030301.m1 +  Up_Stream_Len 2000
CTCTCTTATTGTAACTCGGAACCCCTCAGGCCATAATCAACTCATTTTCAAAACCAAAAT
CATAACTTTTTCAATTCTAGTCAACAACAACACAAATTAGGAGTCAAATTAATCTCTTTT
GTCATAATTGGAAGCCCCTCGAACCATAACCAACTCATTTCCAAAACCAAAATTATAATG
TGCCCCATTTTCAATTTTAATCCAACTACGATAACATTTAGGAATCGAATTAATGTCTCT
TGTCGAAACTCGAAACCCCATTCCATAACAAACCTAATTCCAAACCAAAACCGTAACGGA
CCCTCATTTTCAATTCTAGTGAAACATTATAAAATTTCTCATATATTCACCACAATATAT
ATTAATTTAATTGATGTTATAATGACCTTCAAAATGTAAAAAATAAAAATAAACAAATAA
AATAGCATGTCAACAATGCGAAGGCGCGTGTGGGAAAGTAAGTACAGGTGAAAAAACTCG
TAGGGACTGAGACACAGAGGAGTAGTTAGAAACTTGTTTAATGTCTGCAAATTTGAGTGT
AAGAATTTAATGAGCATTACCACAACACGACAAAACTAGAATGCAAACAACCCAACTTCT
ACAATTTTATATTATAAAAGAAAAATAATATAAAATTCAGTAACATTTGTTTATATGTAC
ATATAATATTATATATCAAATGATGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGATAGGA
AGATGGGGTTGAAGAAGGTGGTGGGGTGGTGGTGTTAATGAACATGGTGGTGTGTTTGAG
AGATTCTTAGAGATAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGCGGTTGTGGAGATAATATG
TGTCTTGAGAGAGAAAAATGAGTTCTTGAGAGAGATAGATGAGGAAGTCAGTGGTTAGAA
GAATACCCTTTTGTTGTTTGTCTTCATTTCAACTATCTTGAACAAAGGTTTGTGTTTTTG
GTTCCTTTTCTCATCTGGGTTTGTTGGTTTGTTTGTTTCAGTGGTGGTTTTATGTGAGTT
TGTTTGTGAAAGTTTGTTCCTTGATGTTTTGTTTAATGTTTTTGTGGTTGAGAATCCGGT
GAAGCGGTGGCTGGCATTTGGAGGTTGAGAGGTGTTTGAGAGATGGTCTTGGTTTTTTGT
TAAAAAAATGATGGGGCTTTTTCGGTTTTGGACTGGAGTTTGTGTATGTTCTTTTAATGA
TTTGTGAATGTTCTTGTTTTGTTTTATAATTTATATAGGAGTTGAATTAAGGGGTGGTGT
TGGTTTCGGGATCTTATATCTGTGTTTGCATGTATGAATTGCTTTCAAGTTTGAGCTTGG
ATTGTTGTGACTGAAACATGCTACCTATTATGTTCTTGTTTTTGCGTTCTTATTTTATGA
TTTTATTTATTTATTTATTTGATTATATATGTTTATCAATGATTCATGTGCTTTTGTAAC
TTGTGCATTCTAGTATTGAGATGCTCAATAGTTAAATTCAGCTTCTGTTATTGAGCATGA
CATATGCTAGTTTCTCTTCCAAATATAGTGTTCTGTTTTTGGTTCTTTGATTGCTAATGG
TTTTGCCAATTGATTGCTGGAAATTGGCTTCTTTGTCTGAATCTAATAAGATACGCATAT
TTGATTAAATTTGCTAGTTTGTTTTTTAACTTACTGTGAAAAACTGTATGTTTGGATTGT
GTATCGATTAATGTCATAGTAAAGCCTACAAGAAGTTAGTCTGTCGAGCTTAGTGACAAA
GGAAGTGCCTATACTTAATTTTCATTGAAGATGAGTATTTATTTTGATGATACTATGATG
TTGAGGGTGCAAGTTTTTCTCGTTCTTATAGAAGTGTTGTAAATTTTTGTTGCTGTTGCA
TGTCACTTGAAGCACAGTGACGTTGTGGCAGCTGAAACTCAGTTGGATTGCTGATAAGCA
GGTGGCTAAATACATGCTAAGGCTCATTTTCTTTTATATTTTAAGATCGAAGTGAACATA
TCATAATCTGAGACGCTTGT
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>LITCHI008136.m1 GenomeSequence - 
GGCTGTTTAACAAACACAAGACACATGTATAAATACTACTTCTAGTGCTCCTATTTCTTT
CTAACTTGGTCATCTCATCTCTCTCTCCATCAATACATTTCAATACCACCCATCATCAAC
CCTCTCTCATTCTCTCTATTTGTGTCTGTCATATTCTCTCTCCCTCACTATCTCCTCCTA
GCTAGCTTCCTCCTCTAGCTTCAACTATATACATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAC
AAAGATTATTATTTGGTTGAATTTGTGTTTATAATATTAGAAGTTGAAATTACAAATATG
GGAAGGCAACCATGTTGTGACAAAGTTGGATTAAAGAAAGGTCCATGGACTGCTGAGGAA
GACAAGAAACTCATCAATTTCATCCTCACCAATGGCCAATGCTGCTGGAGAGCTGTTCCT
AAGCTTGCAGGTTATAATCTCTCCCTCTCTCTAAATATTTTCATTTTGATATCAACATAA
AACAACCATCCTCCTATGCATTAATTTGTTATTTCTTGAATTCGGTTAAAGGGGTTGTTT
TTTTTTTTTCTTTTTTGTGGTTTTTAATTTTGGTTTGATATATATTGACTTCCACTAAAG
TGGAAATATGAGAGTTGGGCTAATGATGGTGCTGGAATGAAATAATAGGGGGGTAGAGAA
GGCATGAACAAGAAAAAGGCTGACCACTAAGATGGATGATGATTTCTTAAAACAAAATCA
TGAAAAGTGTTTTCCATTTTTTATAATGCCAAAAATGAGACACAACACAAACAAAACAAC
AATCACTCATGTACATGGTTATTATAATAAAATATTTATCATGTTTAATTGCTTTGCAGG
CCTTTTGAGGTGTGGCAAGAGTTGTAGGCTCAGATGGACAAATTATCTCAGGCCAGACTT
GAAAAGAGGTCTCCTTTCTGAATATGAAGAGCAAATGGTCATTGATCTCCATGCTCAACT
TGGCAACAGGTCCCTCCTTTTTTTTCTTTTTTTCTGTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATCA
GTCTCAACGTTACAAGAAAAATTACCAATCTTTGTGATGATATTTCTATAAATGTCAACA
TTGTGGACTAAGTCACATCATTTAGCACTATTTTTTTCTATAATCTCAACTAGGCATCGA
ATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAGGACCGCTAATGAGTCCTCTAAGATAAAACAAACTTTTG
ACAAAATCTTGTCAGAAAATAATTAGTGCTTTGAACTATTCTCATTAGTGTAACTATTAT
TATTTAAATATAACTTTTTTATTTTAATTAACTGACTTAGTAGCGATTATTACAGATGGT
CCAAGATTGCTTCACATCTTCCTGGAAGAACTGATAATGAAATCAAGAACCATTGGAATA
CTCACATCAAGAAGAAGCTAAAAAAAATGGGAATTGATCCTCTCACTCACAAACCAATTT
CAATAACAACAACAGAACCACAACAACAACAAAAAAATGACCAAAACCAAGTAGTACCTC
AACAAGTTACCACACCACCACCACCACCACCTATGATGTCTGAAAAAAATGATGATAAAA
AGATTGAGGAGTTGGTTACACTAGAGAGAACTACATCAATTAAAAGCATGACAACCACCC
CAGAAATGGAAACAACTGATTTTTGCACTGATGATGTTCCTTTGATTGAGCCACATGAGA
TTTTGGTACCTAACAATTGTGTTGCTACTACTAATATTGTCACACTACTACCATCAACTT
CTATTGCTACAACTTCATCTTCAAGTGCTTGTTCTTCTTCTTCTTATTCTGACCATTCAT
CCAATTACAAGCTCCTTGATGATCATGATCATGAATGGCAATTTCCTGAGTTGGAGTTGG
AGTGGCCTACTACTACTACCACTACTAGTAGTGTTTATTACCATGATCATGAAAATAATA
TTAACAACAATTACAACATGGGGCTGTGGGACTATGACTTGAGCAGCAGTTGGGAAGATT
TGATGATTTTCAATGGTGATCATATTGGTGATGATGGTGAAACAAAAAGGCTTGGCTTTG
TTGATCCTGATCCACTCATCAATCAGTGCCCAAGAATGGTTTTGGATAAAGATTCTTGGT
GATTTGGTCTCTTGTGATTTGATACATTTTGTTTTTTGGTCTTGTCTTTTTTATGTGGTT
AGTTGTCACACAAAAGAGAACAATAAATCAAGAATCTGGGAGAACCCCATCTTCGAATTA
AGAATTTATTTTTTTCTTTTTTGTTTATATAAGATAGTGTTTAATTACCCAAAAAAAAAA
GGAGACAATAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTAAATGATTAATGAAAGTATTACTG
ATATGGATTGTTAATTCAATTACTCTTTTAATTACATTTTTTGTTGTCTTGTAAACGGAT
AATTGCGTGCATG
>LITCHI008136.m2 GenomeSequence - 
GGCTGTTTAACAAACACAAGACACATGTATAAATACTACTTCTAGTGCTCCTATTTCTTT
CTAACTTGGTCATCTCATCTCTCTCTCCATCAATACATTTCAATACCACCCATCATCAAC
CCTCTCTCATTCTCTCTATTTGTGTCTGTCATATTCTCTCTCCCTCACTATCTCCTCCTA
GCTAGCTTCCTCCTCTAGCTTCAACTATATACATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAC
AAAGATTATTATTTGGTTGAATTTGTGTTTATAATATTAGAAGTTGAAATTACAAATATG
GGAAGGCAACCATGTTGTGACAAAGTTGGATTAAAGAAAGGTCCATGGACTGCTGAGGAA
GACAAGAAACTCATCAATTTCATCCTCACCAATGGCCAATGCTGCTGGAGAGCTGTTCCT
AAGCTTGCAGGTTATAATCTCTCCCTCTCTCTAAATATTTTCATTTTGATATCAACATAA
AACAACCATCCTCCTATGCATTAATTTGTTATTTCTTGAATTCGGTTAAAGGGGTTGTTT
TTTTTTTTTCTTTTTTGTGGTTTTTAATTTTGGTTTGATATATATTGACTTCCACTAAAG
TGGAAATATGAGAGTTGGGCTAATGATGGTGCTGGAATGAAATAATAGGGGGGTAGAGAA
GGCATGAACAAGAAAAAGGCTGACCACTAAGATGGATGATGATTTCTTAAAACAAAATCA
TGAAAAGTGTTTTCCATTTTTTATAATGCCAAAAATGAGACACAACACAAACAAAACAAC
AATCACTCATGTACATGGTTATTATAATAAAATATTTATCATGTTTAATTGCTTTGCAGG
CCTTTTGAGGTGTGGCAAGAGTTGTAGGCTCAGATGGACAAATTATCTCAGGCCAGACTT
GAAAAGAGGTCTCCTTTCTGAATATGAAGAGCAAATGGTCATTGATCTCCATGCTCAACT
TGGCAACAGGTCCCTCCTTTTTTTTCTTTTTTTCTGTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATCA
GTCTCAACGTTACAAGAAAAATTACCAATCTTTGTGATGATATTTCTATAAATGTCAACA
TTGTGGACTAAGTCACATCATTTAGCACTATTTTTTTCTATAATCTCAACTAGGCATCGA
ATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAGGACCGCTAATGAGTCCTCTAAGATAAAACAAACTTTTG
ACAAAATCTTGTCAGAAAATAATTAGTGCTTTGAACTATTCTCATTAGTGTAACTATTAT
TATTTAAATATAACTTTTTTATTTTAATTAACTGACTTAGTAGCGATTATTACAGATGGT
CCAAGATTGCTTCACATCTTCCTGGAAGAACTGATAATGAAATCAAGAACCATTGGAATA
CTCACATCAAGAAGAAGCTAAAAAAAATGGGAATTGATCCTCTCACTCACAAACCAATTT
CAATAACAACAACAGAACCACAACAACAACAAAAAAATGACCAAAACCAAGTAGTACCTC
AACAAGTTACCACACCACCACCACCACCACCTATGATGTCTGAAAAAAATGATGATAAAA
AGATTGAGGAGTTGGTTACACTAGAGAGAACTACATCAATTAAAAGCATGACAACCACCC
CAGAAATGGAAACAACTGATTTTTGCACTGATGATGTTCCTTTGATTGAGCCACATGAGA
TTTTGGTACCTAACAATTGTGTTGCTACTACTAATATTGTCACACTACTACCATCAACTT
CTATTGCTACAACTTCATCTTCAAGTGCTTGTTCTTCTTCTTCTTATTCTGACCATTCAT
CCAATTACAAGCTCCTTGATGATCATGATCATGAATGGCAATTTCCTGAGTTGGAGTTGG
AGTGGCCTACTACTACTACCACTACTAGTAGTGTTTATTACCATGATCATGAAAATAATA
TTAACAACAATTACAACATGGGGCTGTGGGACTATGACTTGAGCAGCAGTTGGGAAGATT
TGATGATTTTCAATGGTGATCATATTGGTGATGATGGTGAAACAAAAAGGCTTGGCTTTG
TTGATCCTGATCCACTCATCAATCAGTGCCCAAGAATGGTTTTGGATAAAGATTCTTGGT
GATTTGGTCTCTTGTGATTTGATACATTTTGTTTTTTGGTCTTGTCTTTTTTATGTGGTT
AGTTGTCACACAAAAGAGAACAATAAATCAAGAATCTGGGAGAACCCCATCTTCGAATTA
AGAATTTATTTTTTTCTTTTTTGTTTATATAAGATAGTGTTTAATTACCCAAAAAAAAAA
GGAGACAATAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTAAATGATTAATGAAAGTATTACTG
ATATGGATTGTTAATTCAATTACTCTTTTAATTACATTTTTTGTTGTCTTGTAAACGGAT
AATTGCGTGCATG