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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI030250Chr439416553943284-Transcription factor WER

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI030250.m11057PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain62.92.50E-17
LITCHI030250.m11371PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain46.73.10E-12
LITCHI030250.m163108PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain51.31.10E-13
LITCHI030250.m167119PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain34.42.10E-08
LITCHI030250.m21055PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain52.16.10E-14
LITCHI030250.m21466PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain35.31.10E-08
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>LITCHI030250.m1
ATGGCTACCATGAAAAGGGAAGTGAACAAGGGAGCATGGACAGCTGAGGAAGACAGAAAA
TTGGCTGAGGTTATAGCAATTCATGGTCCAAAAAAATGGAAGACAATTGCAGTCAAAGCA
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>LITCHI030250.m2
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GTGGATGAATTCTTTGATTTCTCCAATGAAGATCCTCTAAACTTAGAATGGATTAACAGG
TTTCTTGAAACCTGA
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>LITCHI030250.m1
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>LITCHI030250.m2
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QKSENKQIEVSTREKTIEKRRVVEEETTSGEKTLKEENKSCTGDEEEEEEESSNNGINFN
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>LITCHI030250.m1
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CTGAGAATAAACAAATTGAAGTTTCAACAAGAGAGAAAACCATTGAAAAGAGAAGGGTAG
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>LITCHI030250.m2
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ATGTGTGCATATGTAACTATTATACATATATAAGTGGTAGTTGAGTCTCTTCTCCCCCAC
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AATTATCTAAGACCAAACATCAAAAGAGGAAATATTTCTGACCAAGAAGAGGACTTAATT
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AAATCTGAGAATAAACAAATTGAAGTTTCAACAAGAGAGAAAACCATTGAAAAGAGAAGG
GTAGTGGAGGAGGAGACCACCAGTGGGGAGAAGACATTGAAAGAAGAGAACAAGTCTTGT
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GATGAATTCTTTGATTTCTCCAATGAAGATCCTCTAAACTTAGAATGGATTAACAGGTTT
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TCCTCACTCATGGGTTAAAATTGTAAAAGCACTTCATCATTGGTGCCTTATCATTTGACA
TCTGAATTTTCATGGCTGTAAGTGCAACACTGTTTGTCACCATCTTGGCCAAAGTGGAAT
AAAATATAGAATGCGTAAATATTAGTTACCATGTGAGAGGTGTCAAGTAGTTACTATAGA
TTTATATGGTTTTAGAATTCTTCTGATGTCATAATTTTAGTTAAAGATGTATAAAG
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>LITCHI030976.m1 -  Up_Stream_Len 2000
CTTAATTGAATTTGTTACCTTATTACTCTAAAATCTTTTGTTAGCTTTGAACCATATGAT
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TGAATAAAAGAATCGAACTTCGGTTTCGTTTGGTACAACTTCTCAAAATAAGTCTTTTAG
AAATAAATTATTTTGGAAGTAGATCTTTTGAAAATGGATATTTTGAAATAAAGTTATTGG
TTGTTTGGTTATCAAATAAAAAACTTTTTTAAATTATAGACGGTTTGGTTAATATTTTTT
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ATAAGATTACAAGGAATAGAGATATTAATAAAATAAAATAGAGATAAATTAGATATTTTA
ATTTTTAAAAAATAGTTTTAAAATACCTATTTGAAAAAACTCAAAATTTTTGAACTGTTT
TTTAAGTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACAAGTAGATTTTTTTAACCAAGGTTCTT
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AGAATAGTTGGAGACTATTGTATTACTAAGGAAACATCCATTAACTGCTTCCTCGCCATC
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CCCTCTACCCGTTTTCTTTTTTAAAAAATCCTATACCTAAAAGCTTCATCACCGTCTGCT
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GATCGACCGCTTCATCTTCGGAAACCTCCAGAACTTCTCCGTTTCTGTCCCTCCATGGCC
AACATGTCCAAAGCTCCGAAACCAGTAACTGCTTTCTCTGTTTCTGTTACTGGGTATTTG
TTTTTTTGTTTGTTTATACTGTTTTCTCACAAGAGGAGCTTGAAGTGAAGGGCAAAGAGC
AAGAGAAGCTTCAAATGGAGTTGAAGAAGTTGCAGAAAATGAAGGAGTTCCAGCCTAACA
TGGTAATGTTTTTGTCTTTGTTTTGGTCTGATTCTTGATACCTGTTCTTCTTGATATCTT
TTTCTGTTTTGAAACATGGATTGATTTTGCTTTTGGGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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GAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGCTGTCGTGAGAAGAAAAGGCCGTGTTCAACTTACAGCTT
GTGGCTGAAAGATCAATGAA
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>LITCHI014934.m2 GenomeSequence + 
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AGGCAAAACCGAACCTGAAACTCCCAAGACTACTGGGAATAAGAGAGGCTTCTCTGAGAC
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AGTTTATGTCATACATAGTTAGAGTTACATATTCTTCATTAATTAATTAATAATTATTTA
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ACAAGGATGGTGACTGGATGCTCGTGGGTGATGTTCCGTGGAAGTAAGTTTCCAATCCAT
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GTCACTTCACAAGATTGAAACTTTGCATGGTTTATGACATTAAATAATTATATAAACTCC
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TTGTTTAATTTTCAGCTCCTAGAGCAATGGAGAAATGCAAGAGCAGAACCTGAACTATGA
TTGTAGTGGGTTTGCTGGTCTTTTCAAGTTCCATGCAAAAGAAAATTACTTAAAAGCACT
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AAGAAGCAATAAACTTAACCTGCTATTGTCTGGCTTGTTTATTACTAATGGCTTTTTTCT
AGTAATCACCTAATTTTTTTTGCTATTCTTAATGTTATCCTTGCTGTCACAGTTGTTGTG
TGTTTTATTCCTTCAAATTTAAAATTTAAGGCTACTTTTCTTTTCCCATGAAGG
>LITCHI014934.m1 GenomeSequence + 
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AGGGGCAAATCGAGATTTGAACCTGAAAGAGACAGAACTGTGTCTGGGACTGCCTGGTGG
AGGCAAAACCGAACCTGAAACTCCCAAGACTACTGGGAATAAGAGAGGCTTCTCTGAGAC
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CAACTCTTCCACAAAGGAGAAGAACCTCCTCCCTTCTTGCACCAAAGATCCCGCTAAGCC
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CGAGCTAGGTAATTAAATGTGTGTGGGGGGTTCTTCAGAGCTCAGGTTGTGGGTTGGCCA
CCAGTTCGATCATATCGTAAGAATATAATGTCTCAGAAGAACCCTACTGAGGAGGGTGAC
AAGGCAGGTAGCGGCAGCAGTGCAGCGTTTGTCAAGGTTTGCATGGATGGTGCACCGTAT
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AAGATGTTCAGTTCCTTCACCATGGGTAAGTAGAAAAATAATTATATGCTACCTTGAAGC
GGATAAAACAATTAATTCTTGTAAGTAGGTAGTAAAATATATATTTTACTAGAGATCTGC
AACCTGCATTCAAGTTTGTTGAAGGCTAAAAGAAGTAATAAAGTTTAAATGAGAGGTAGT
ACTAAAAAAATGGTTTGTTTAAAATTCTAGTGTACTAGAAATTTCCAACTTAGCTTGTTC
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ACAAGGATGGTGACTGGATGCTCGTGGGTGATGTTCCGTGGAAGTAAGTTTCCAATCCAT
CCCTCTATATATAAACCCTAAAATATTGATAGCGATAAAAGCAGTCTACCATGCTAGGCT
GTCACTTCACAAGATTGAAACTTTGCATGGTTTATGACATTAAATAATTATATAAACTCC
AACTTGGTGAAAATTATCACTCATGGCATTGTTCTTTAATTTCTCTTTACAGTATGTTTG
TTGCTTCATGCAAGCGATTACGCGTAATGAAAGGATCAGAAGCAATTGGACTTGGTAAGT
AGCATTTTTTCATTTAATTTATGGATTTAATTTTTTTTCCCCCCTTGGATAACCTTAATT
TTGTTTAATTTTCAGCTCCTAGAGCAATGGAGAAATGCAAGAGCAGAACCTGAACTATGA
TTGTAGTGGGTTTGCTGGTCTTTTCAAGTTCCATGCAAAAGAAAATTACTTAAAAGCACT
TGCGCAAGATGGATTGAGCAAGCGATGGAGGGTGGTGTCACTATGGATGTGTTTTCTTTC
TTCTCTGTATTTTAATTTGATGGTATATAGCTATCAAAGATCTAGACACTTGTAATGGAC
AAGAAGCAATAAACTTAACCTGCTATTGTCTGGCTTGTTTATTACTAATGGCTTTTTTCT
AGTAATCACCTAATTTTTTTTGCTATTCTTAATGTTATCCTTGCTGTCACAGTTGTTGTG
TGTTTTATTCCTTCAAATTTAAAATTTAAGGCTACTTTTCTTTTCCCATGAAGG