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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI030250Chr439416553943284-Transcription factor WER

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI030250.m11057PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain62.92.50E-17
LITCHI030250.m11371PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain46.73.10E-12
LITCHI030250.m163108PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain51.31.10E-13
LITCHI030250.m167119PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain34.42.10E-08
LITCHI030250.m21055PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain52.16.10E-14
LITCHI030250.m21466PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain35.31.10E-08
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>LITCHI030250.m1
ATGGCTACCATGAAAAGGGAAGTGAACAAGGGAGCATGGACAGCTGAGGAAGACAGAAAA
TTGGCTGAGGTTATAGCAATTCATGGTCCAAAAAAATGGAAGACAATTGCAGTCAAAGCA
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>LITCHI030250.m2
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>LITCHI030250.m1
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>LITCHI030250.m2
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>LITCHI030250.m1
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>LITCHI030250.m2
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TCCTCACTCATGGGTTAAAATTGTAAAAGCACTTCATCATTGGTGCCTTATCATTTGACA
TCTGAATTTTCATGGCTGTAAGTGCAACACTGTTTGTCACCATCTTGGCCAAAGTGGAAT
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TTTATATGGTTTTAGAATTCTTCTGATGTCATAATTTTAGTTAAAGATGTATAAAG
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>LITCHI030250.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TAATTTAAGCCATCAAAATCTTTTCATCAACTCACAATTAACGACATTCGAGTCATTAGT
ACTTTCTCTAATTAATGATATAATCATCACTACCATAAAATAGTAATTAATTCGATAATA
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TAAAAGCATCAAAGACTCCCAAAATCAGCCCCCAAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTG
TCTATTTCTCTCTCTATCTA
>LITCHI030250.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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TTCTCGACACTAGAATCCAATCAAAAGGCCATAAACGCTTAATTGGATGGTTATGTAAAT
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TTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTCTTTTTCTTTTGAAGGTTTAAGTAGATGCGGAA
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>LITCHI030250.m1 GenomeSequence - 
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>LITCHI030250.m2 GenomeSequence - 
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GGATTAACAGGTTTCTTGAAACCTGAAGAGGGGTTTTTATGTAAATATGGTTTTTAAAAA
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CTTATCATTTGACATCTGAATTTTCATGGCTGTAAGTGCAACACTGTTTGTCACCATCTT
GGCCAAAGTGGAATAAAATATAGAATGCGTAAATATTAGTTACCATGTGAGAGGTGTCAA
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