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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI030144 | Chr4 | 2982939 | 2988438 | + | Casein kinase 1-like protein 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI030144.m1 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 89.8 | 2.00E-25 |
LITCHI030144.m1 | 10 | 267 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 55.7 | 4.70E-15 |
LITCHI030144.m1 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 34.8 | 8.60E-09 |
LITCHI030144.m2 | 3 | 121 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 54.9 | 8.60E-15 |
LITCHI030144.m2 | 5 | 162 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 25.5 | 7.90E-06 |
LITCHI030144.m2 | 12 | 100 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 34.5 | 1.10E-08 |
LITCHI030144.m4 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 91.1 | 7.80E-26 |
LITCHI030144.m4 | 10 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.1 | 1.80E-15 |
LITCHI030144.m4 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 35.6 | 4.70E-09 |
LITCHI030144.m5 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 90.6 | 1.10E-25 |
LITCHI030144.m5 | 10 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.6 | 2.60E-15 |
LITCHI030144.m5 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 35.3 | 5.90E-09 |
LITCHI030144.m6 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 91.8 | 4.80E-26 |
LITCHI030144.m6 | 10 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.8 | 1.10E-15 |
LITCHI030144.m6 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 36 | 3.50E-09 |
LITCHI030144.m7 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 91.4 | 6.40E-26 |
LITCHI030144.m7 | 10 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.3 | 1.50E-15 |
LITCHI030144.m7 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 35.8 | 4.20E-09 |
LITCHI030144.m8 | 10 | 227 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 91.1 | 7.80E-26 |
LITCHI030144.m8 | 10 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.1 | 1.80E-15 |
LITCHI030144.m8 | 108 | 206 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 35.6 | 4.70E-09 |
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>LITCHI006915.m1 ATGTGGGATCTCAATGACTCGCCTGATCAGCGAAGAGACGAGGAATCCGAGGGCTGTTCT TCCCAGAAGACCTCCATGGACGGCGATGATGAGAAGGGAAAACGGGTGGGATCCGTCTCC AATTCAAGCTCTTCAGCTGTGGTAATCGAGGACGGATCCGATGAAGAAGATGGAGCTGAG AGGGGACTAAGCTTGAAGAAACGTAGCAGCAAAATATTTGGGGTCTCTTTGTCTCATGAG GAGGACAGTGACCCACCGGTGACCCGGCAGTTTTTTCCGGTTGATCAAGACCCGGAAATG GGAGCAACATCAGGTGGAGCTGGACCTGGCTTCCCTCGGGCCCAATGGGTTGGGGTCAAA TTTTGCCAACCGGAGCCTCTCGGGACTGGAAAATCAGTTGAGGCCTCGCCGCCGATAAAG AAAAGCAGGCGTGGACCCAGGTCTAGGAGTTCTCAATATAGAGGTGTAACTTTTTACAGA AGAACTGGTAGATGGGAGTCTCATATATGGGATTCTGGAAAACAGGTTTATTTAGGTGGA TTTGACACTGCACATGCAGCTGCTCGTGCATATGATAGGGCAGCTATCAAGTTCCGGGGA GTGGAGGCAGACATAAACTTTAGCATTGAAGATTATGAGGAAGACTTGAAACAGATGAGC AACCTAACCAAGGAAGAATTTGTCCATGTGCTTCGCCGACAAAGCACTGGTTTCCCTAGA GGAAGCTCCAAGTATAGAGGAGTTACTTTGCACAAGTGTGGCAGATGGGAAGCTCGAATG GGCCAATTTCTAGGCAAAAAGTACGTGTATTTGGGTTTGTTTGACACTGAGATTGAAGCT GCAAGGGCTTACGATAGGGCTGCTGTCAGGTGCAATGGCAAAGAGGCTGTCACTAATTTT GATCCCAGCATCTATGAAGAAGAACTGGCAGCTGCTGCAGAATCTTCAGGTAATAATAAT 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>LITCHI006915.m1 MWDLNDSPDQRRDEESEGCSSQKTSMDGDDEKGKRVGSVSNSSSSAVVIEDGSDEEDGAE RGLSLKKRSSKIFGVSLSHEEDSDPPVTRQFFPVDQDPEMGATSGGAGPGFPRAQWVGVK FCQPEPLGTGKSVEASPPIKKSRRGPRSRSSQYRGVTFYRRTGRWESHIWDSGKQVYLGG FDTAHAAARAYDRAAIKFRGVEADINFSIEDYEEDLKQMSNLTKEEFVHVLRRQSTGFPR GSSKYRGVTLHKCGRWEARMGQFLGKKYVYLGLFDTEIEAARAYDRAAVRCNGKEAVTNF DPSIYEEELAAAAESSGNNNGADHNLDLSLGSSAPKQSSVDHVSRRQNVGMDRHSASLQF EADWRTRGLRPKQGDHNGPQRRDGYGETETMQLLSQTHIQSPTSFRRPGEAHVLHMIPPA FNSSNYQTSQYFPSSSARGRIGSELSLSSTNDNQQLRWQSGPHQSTSFANAAASSGFAPQ IRPSHQNWVQKNGFHSLMRPS. >LITCHI030144.m2 MLADQMINRVEFVHSKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIP YRDNKNLTGTARYASMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYE KISEKKVSTSIEALCRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDY VFDWTILKYQQSQIPSPARALGPVAGPSFAVPPTGANTGGGEEVRLNGWSSADPSRRRNS GPLTSSANLTSKQKGLLPNDPTHSKEAMASGYNFLRTTGSSRRAAISSSRDAAVVGSEAD PSHPRTADVSTGLLQKISSGQRSSPVVSSENRHTSGRSTTNIKNFESTLRGIESLHFSTD ERVHY. >LITCHI030144.m3 MNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEALC RGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDYVFDWTILKYQQSQIP SPARALGPVAGPSFAVPPTGANTGGGEEVRLNGWSSADPSRRRNSGPLTSSANLTSKQKG LLPNDPTHSKEAMASGYNFLRTTGSSRRAAISSSRDAAVVGSEADPSHPRTADVSTGLLQ KISSGQRSSPVVSSENRHTSGRSTTNIKNFESTLRGIESLHFSTDERVHY. >LITCHI030144.m4 MEPRVGNKFRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNEEVAIKLENVKTKHPQLHYESKLYKILQ GGTGVPNVKWFGVEGDYNVLVIDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVH SKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIPYRDNKNLTGTARYA SMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEAL CRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDYVFDWTILKYQQSQI PSPARALGPVAGPSFAVPPTGANTGGMWLSSSYWCFTS. >LITCHI030144.m5 MEPRVGNKFRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNEEVAIKLENVKTKHPQLHYESKLYKILQ GGTGVPNVKWFGVEGDYNVLVIDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVH SKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIPYRDNKNLTGTARYA SMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEAL CRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDYVFDWTILKYQQSQI PSPARALGPVAGPSFAVPPTGANTGGGEEVRLNGWSSADPSRRRNSGPLTSSANLTSKQK GLLPNDPTHSKEAMVSRFIEH. >LITCHI030144.m6 MEPRVGNKFRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNEEVAIKLENVKTKHPQLHYESKLYKILQ GGTGVPNVKWFGVEGDYNVLVIDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVH SKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIPYRDNKNLTGTARYA SMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEAL CRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGLNIVICSCCPVI. >LITCHI030144.m7 MEPRVGNKFRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNEEVAIKLENVKTKHPQLHYESKLYKILQ GGTGVPNVKWFGVEGDYNVLVIDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVH SKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIPYRDNKNLTGTARYA SMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEAL CRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDYVFDWTILKYQQSQI PSPARALVSWQCISIFHCLDC. >LITCHI030144.m8 MEPRVGNKFRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNEEVAIKLENVKTKHPQLHYESKLYKILQ GGTGVPNVKWFGVEGDYNVLVIDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVH SKSFLHRDIKPDNFLMGLGRHANKVYVIDFGLAKRYRDTATHQHIPYRDNKNLTGTARYA SMNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEAL CRGYPTEFASYFHYCRSMRFDDKPDYAYLKRLFRDLFIREGFQYDYVFDWTILKYQQSQI PSPARALGPVAGPSFAVPPTGANTGGMWLSSSYWCFTS.
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>LITCHI030144.m2 CCCTTCGATTGGATCAAAGCCCACAAGTCCAAAAACAAATAACAAACGCCACCACCCACC ATCACAACCATCTCCCAACACCAACACCAACACCAACACCAAACAAACAAACATACAAAC AATGCTTCTTCTCCTTCCTCCTCTCTCTCAGTCTCTCTCTCTCCTCACAGAGTGAGAAAG TTCCCTCCCTTATCACCACTAGCCTCCGATCTCCACAAAAGTCCGCCGCCTAATTCATCA CCTACCCACCAATCAAAACACACCAACCTTCTCCTCTAGCCTCCAATTTCACTCGGCAGT CTCTGTTTTTTTATTATTTTTTCAGTTTCTCATCTGGGTCGGCGGGTTTTTTTTTTTATT TTTATTTTTTATTTTTTGTAAATTAAGGGGGGGAGAGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTTGTG GAGGAGAAAATGGAGCCTAGAGTTGGGAACAAGTTCCGGCTTGGTCGAAAGATCGGTAGT GGGTCCTTTGGAGAGATCTATTTGGGTACTAATATTCAAACTAATGAGGAAGTTGCTATT AAGTTGGTGAGTATTGATGGAGTTTTTGGTATTTTGGTGGATTGGGGTCTGGTTTTAGTT GAAGTTTTGATTCTTTATTGTGTTTTGGGTTGTTCGATATGTGGGTATGTGTGGGGTTTT ATTGTGTGATTGTGTTTGAAGAATTCAAGCTTGTTTAATGAATGGAAGTGGTTGGAATTC GCTCTAGAGAGAGCGAATGAGCTTGGTTTGGAAAATTGGAGCTTGGTTTAGAAATTGAAG CGGTTGGAGTTAACTTTTGAGAGAGAAATAAATGTGCTTCCATTTGTTGTTACTGTGTTT TGAATGTATGGAAAGTGGGTTTTGTTAAGCTTTGTTTTGGTTTTGATATGGTATTTGGTA CTTGTTTTTCATGCATTGATAGCTTCATTGTGCGATTTGTTATTGGATTTTGTGTTGTTT 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