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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029988 | Chr4 | 643949 | 648388 | + | Histone-lysine N-methyltransferase setd3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029988.m1 | 60 | 285 | PF00856.31 | SET | Family | 42.7 | 8.20E-11 |
LITCHI029988.m1 | 334 | 454 | PF09273.14 | Rubis-subs-bind | Domain | 61.4 | 1.50E-16 |
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>LITCHI029988.m1 ATGGCAGCTTCAAAGATAGTAGTGTCCTCGCTAACCCAAATTCGCCCCATAAAATGCGCT GCCTCTTACCATACGCGGGTAGTCCCACACCCACCAGACCTGCTCAAGTGGGTCAAGAGG GAAGGCGGTTTTATCCACCAGGCGGTCAAGATAGCACCACAACAACCTGACAACTGGGGT CTTGGATTGCTCGCCTCTCATGATATTCCAAAAGGGTCTCTCCTCATTTCTCTTCCTCTT CATATACCACTCAAGTTTGAAGCGGATGCTGTAAATAGAGCTGATTCTGTTCTTCTCAAT TTGGCTCGCCAAGTTCCCGAGGAATTATGGGCAATGAAATTGGGTTTGAAGCTTCTGCAA GAAAGAGCAAATGTGGGAAGTTTCTGGTGGCCGTATATCAGCAATCTCCCCGAAACGTAC AGCGTACCCATCTTTTTTCAGGGGGAGGACATTAAAAACTTGCAATATGCCCCTCTTCTT TACCAGGTAAACAAACGGTGCCGTTTTCTTCTTGATTTTGACCAAGTGGTCAGACGTACC CTTGAATGTCTGGAATCAAATGATCATCCTTTTGGGGGCCAAGAAGTAAATGCATCGTCT CTTGGATGGGCGATGTCAGCTGTCTCATCCAGGGCATTTCGTTTGTATGGGAAAAAGTCT GCAGATGGGACTCGCAATGACATACCCATGATGCTTCCTCTCATCGATATGTGCAACCAT AGCTTCAAACCGAATGCCCAAATTCTGCAGGAAGAAGATCTAGGAAATGAGAATTCACAA ATAAAGGCAGGTTTTCTAATTGTTGTAGCAGAAACAGAGATCAAACAAGATAATCCTTTG CTTCTTAACTATGGGTGCCTAAGCAATGATCTTTTCTTACTGGATTATGGATTTGTGATT CCTTCAAATCCTTATGACACCATTGAACTCAAATATGATGGTGTACTTCTAGATGCTGCT AGTATGGCAGCTGGAATTTCTCAGCTGAACTTCTCTTCACCTGCTGCATGGCAGCAGCAA ATTTTATCCCAGCTGAACTTAGTTGGAGAAGCTCCTATTCTCAAGGTAACATTAGGAGGC CCGGAAATCATAGAGGGACGCTTGCTGGCAGCCTTAAGAGTATTACTTGCAAATGATGCG GAAACTGTACAGAAGCATGATTTGAACACACTCAAATCTTTATCAGCTGAAGCCCCCCTG GGAATCGCGAATGAAGTTGCTTCTTTTCGCATCATTATTGCCCTATGTGCTATTGCACTG GAGCATTTTCCTACAAAAATAATGGAAGACGAATCCCTGCTGAAACAGGGAGTTTCAGCT GCCTCGGAATTGGCCATTCAGTTCAGAATCCAAAAGAAATCCCTGATCATAGACGTAATG AGAAATCTTTCAAGGAGAATGAAGTTATTATCATCTAAGGAGGCAGCCTCTGCTCAAGGC TGA
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>LITCHI029988.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTCTGATAACGAAAGCCCCTAACAGAGATTTGAAATCTCCTCTGCATCCATTACCACAGA ACGAGACAGCACAAGAAAAGCCTACTCTCACCCGCGAGAGACACTCTACCTCAGAAGAAT ACGATACCTCCACTAATTCTCTTACTCGAAGAACCAGACAAGAGATGAGAGGAAAAAATT TTAACTTGCTCACATTAAGTCTTGCTTTTTTCGAAGAAACAGAAACAGATGGCAACACCA AATGCTGAAAATTAGATACAATAAAATTCAATAATATCCAATTTCATTCACAGTGAAATA GTATAAGAAAGTGCACTTCAAAATTTTGAATTTTACTTTTGGATTGGACAAAAACAAATA TAGTGTGTACATGAAGCCATACAGTTTGAACATAACAGTCAATTCTATAAGCAGTACAAG GTTTCCATATTTGCTGTCAAGCTGTATAGATTTTCTTGGCTCTTTGGCCTGCCTTTCCAC GTTTATATCTTAAACACGTGTAGACACATTCTTAATAAATTCAACCAATAGAACACTAGT TTTGACGAATAGAATATTAGGGCTTATAGTTAGCGGTAGTAATTCATATGGGTATATAAA ATAATGTTTCTTTTATTCTTTCAAAAAAGAACAATTCTTTTACAATGAATAATTATCCTC ATTTAAGTAATTTAGTCTATGAGTGTTTAAGTAATGAAATTGTTTTATTATAGACAGGAG TCGTGAAAATTATTTTGGGTGGCAACGAAACCCCTACTTTTAGAAATATAACATTTGTCA ACATAAAAATTATTACATTTAAAAATTAAAAACTGAATAATATATAAATGGATCTAAAGA TCTATATGGAGAATGAGTGATGGAGATAGAGAGAGGTCTCCATCGAGCATGAATGAGTTT TCATAAGTCATAACGTGGTAGAGATCGCTGTGGACTTTTGTCGAGCCATAGGGAACCATT TACCTTTGTCATCAAGGAGATTCTTAATGAATCTCCATCAATTGATTAAGATTCTCGATC AATTTTTGTCTAACTATGTATCTCCATCTCTACATATGATGGCAGATATCCATGGAGATC TATCGACCATCTCCACCAGTGCTGTGGTTTAGTGGAGATATTAGATTTGATGGACAAAAA TCTCAACCTCCTAACCTTTTTTCTGTCCATCAAATCGAATAGATAGTTAAGATTTTTTTA TCCTAATTTTTTTAAAGTTATGAGACACTGACTGTAGAATCACTATATATAATTTTAGTT ATTTTAATTAATTCTTTAATGTTCAAGTTTCAATTTTATCAATTGATTCCTAGAATTTAT TGTGTTTCTTTTTTTTTTTTTGAAACTCAATTTAATGTATTTGAATTTATTTTTTAGACC AATTTTTAATGTTTTTTAGATTTTGCAAAATATATAATATATTTATATTTGTTTAATTTT AATAATTCATTTTTATTTTTATTTCGATTACATTCATTACATATATCATTATTTAAAGAT TGTAGGGGTGAAAAACACCATTTTAACTCAATCGATCAAAAGAAAGGATATAAGAGCAGA ATGAAAGGATATAAGAGCAGGGTGAGTTGCCACAGATCTTTGCCTTACTTTTAACAGTAA GTGCAAGATTTAAATACTTCGAGCCACATTTGTGGTAATTTTCCTATCACTATTTGTGAG ATGCCCCTTTTCACTCTTTGTAAGTTAAACCCTCCCATTCTTAGGAATTGGTCCTAAACC ATACCACAGAGCCTACTATTGCTAATTTTAATTGTATTTTAAACTGATTTCGGTCATTAA AATAAAATAAAATAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAC ACAAACAAAAGCACAAAAGTGATATACACTCACAAAATGAATGTATCAATGGTAATTTAG TCATTTCAACAAAACCCCAAAGTTTTGTCCAACAGAGCAACTGAAGCTGATAGCATTAGT GCCTGTTCCTCCGCGAAGCC
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>LITCHI029988.m1 GenomeSequence + CAAAAGTGATATACACTCACAAAATGAATGTATCAATGGTAATTTAGTCATTTCAACAAA ACCCCAAAGTTTTGTCCAACAGAGCAACTGAAGCTGATAGCATTAGTGCCTGTTCCTCCG CGAAGCCATGGCAGCTTCAAAGATAGTAGTGTCCTCGCTAACCCAAATTCGCCCCATAAA ATGCGCTGCCTCTTACCATACGCGGGTAGTCCCACACCCACCAGACCTGCTCAAGTGGGT CAAGAGGGAAGGCGGTTTTATCCACCAGGCGGTCAAGATAGCACCACAACAACCTGACAA CTGGGGTCTTGGATTGCTCGCCTCTCATGATATTCCAAAAGGGTCTCTCCTCATTTCTCT TCCTCTTCATATACCACTCAAGTTTGAAGCGGATGCTGTAAATAGAGCTGATTCTGTTCT TCTCAATTTGGCTCGCCAAGTTCCCGGTATTTGTTCTTGTTCTGTTTTAATGCCTTTGTT GAGAGTTAACGTTCAATTTTGCACCCTTTGACTGTATTGGTATTGATTTTGATTTAAAAA ATGTGCTATTGGTTTTGAATGTTTGTGTTTAACAGAAGAAAGAATAGAGAAAAGTGGGTT TGAATTTGTACGTTGTTGTTGATTATTTGTGTTAAGTTTAATGGGAATTTATCTTGATCT TTTATTGTATGAGAGTCCTAGTAGGTGTTCATGATATTAAGACTTAATAGTCATGATACA TTAACATGTTTCCTCACGTGCAACGTGGACAAGTGTTAAACGCTCGTTAGCGTATAACAT GTGCAATCAGAATTTTAGATAAAAAGAGAAGAGAGGGTTAGAGGTCTTCGCTCCCTACCG TATAATATGTGCAATCAGAATTTCAAATAAAGATGGGAAAGAAAGTTTGAATCAGAAACC TCTAGACTCTGATACTAAGATAGTTACCACCAGACCCAAAAGCTTAAACTGATAGGAAAT AACTCAACTATAGTATTTATGATTTGAGGTTATGATACATTAATATGTTGTATGAAAGTC CTAGTAAGTGTTCATGATATATTAATGATGTCTTCACATGATAATGCTAGAAGTGTTTCT AATGTCGATTGGCACATGTAAGGTGGTACTTCAAATAATAATATTACGTTACACATTAAT GATTTCTGGCATAAAGGAGGATGAGCTCGTATGTGGTATAGTCTAGCGGTATTGACATAT GGTGTAATTGTTTTGTATTTGGAAGTAGAGTGCTTGAGTTGTTAGTTTAGTACTTGATGG TGTGATACAATATCCAGAAGATGTATGGACTATGTCAATAAACTGATAATGTGCACTTCA GGGTTCTTTCTAGGCAGCTTCATCCTTTCAAATCTCAATGTCCCAGAATAGTTATTGCCA ATTGAAATTATAGAGCTCTTTGCAAGACCGTTGAATTCTGTAAAACTTTATTTTAGAGAA TCTGAGCTATGTGAAGGTATATTGAGTCAGTAGAGTCATGATGACTGGTTGTGTATTTAT CTATGTGTGATCTTTTCACATGTTTTGAAGTGTCATGGAAAGGGGTTGAGGAGTGATGGT AAATATGGTTGAGGAAAGGAAATGAATTAGAGAATCTTTTCTTGTGCATATGTTTGTTTT GTGTGGAATGCTAAAAGTTAAACGCTGTTGGTGTGACATTCATAGTTAAGTATGTTAGTA TGATATTTAAATTTAAACAAGCATCTTTATCTTATCGTTCGTGTACTTTATGTACCTCTA TTTTTTTGTACAGATCAAGTTCTCATTAGGAGTAACTGCATCATAAGGTAGAGCACACCT AGTTAATATTCATGGGATTTTTTTCTTGTAGTAAATGTTCTGTTCAAATCTTTTGATCAT GTAGAACACTGCTACTGTATGATGTCACATAAATTTACTCTACTCAGTAGAGGTTGGTAA CTTTGAGTTTTGTAAATTAGGCTGTTTAAGAGTTTTTAATATGAGTAAAGGACACTGTGG GAGCATTTGGCAGAGGAATTATGGGCAATGAAATTGGGTTTGAAGCTTCTGCAAGAAAGA GCAAATGTGGGAAGTTTCTGGTGGCCGTATATCAGCAATCTCCCCGAAACGTACAGCGTA CCCATCTTTTTTCAGGGGGAGGACATTAAAAACTTGCAATATGCCCCTCTTCTTTACCAG GTATTGACTCTAAACTAAGAACGTTTGTAATATCTTTTCCCTTAAAATTACTGCAAAAAT CTCTTGTTTTGTTCCCACTGGGAATTATCCTAGCCAGGCCAGTTGGAGGGACTATAAAAC TCTTGTTTAGAATTTAGATTTCTAAACTTTCTTGATTTGCAATTAGCTTTGAAGGTAATA GTTATGTCTAGCTTTATTCTCTTAAACCAGGTAAACAAACGGTGCCGTTTTCTTCTTGAT TTTGACCAAGTGGTCAGACGTACCCTTGAATGTCTGGAATCAAATGATCATCCTTTTGGG GGCCAAGAAGTAAATGCATCGTCTCTTGGATGGGCGATGTCAGCTGTCTCATCCAGGGCA TTTCGTTTGTATGGGAAAAAGTCTGCAGATGGGACTCGCAATGACATACCCATGATGCTT CCTCTCATCGATATGTGCAACCATAGCTTCAAACCGAATGCCCAAATTCTGCAGGAAGAA GATCTAGGAAATGAGAATTCACAAATAAAGGCAGGTTTTCTAATTGTTTCTTATATTCTT CAATCCCTTGTATTTTCTAAAAGAAAGTTACCCATTACCCTTATTAAACACTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTTGCAAATAGGTTGTAGCAGAAACAGAGATCAAACAAGATAATCCTT TGCTTCTTAACTATGGGTGCCTAAGCAATGATCTTTTCTTACTGGATTATGGATTTGTGA TTCCTTCAAATCCTTATGACACCATTGAACTCAAATATGATGGTGTACTTCTAGATGCTG CTAGTATGGCAGCTGGAATTTCTCAGCTGAACTTCTCTTCACCTGCTGCATGGCAGCAGC AAATTTTATCCCAGCTGAACTTAGTTGGAGAAGCTCCTATTCTCAAGGTTTGTACCAGTT TTTATCTTGTTAAATTACTTGTTTTTCTTTTAATAAATCAAACGGCACTCATCCTTGTTT ACGTTCCTTATGGATAATGCCATTTTTATTTTGTTTCCTCTGTGCACTCCCAACTCCTGG CAAGAAACTTCATTTTCATTATGGTTTGGCCTTTTGGTTTAGTGAGTGAGAGAGGGTTTT CTTTTTTTTTATCAACACATTAGATCCAAAGCTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGA AAGAGATCCAAATCTTTTTATACTTAATAGCTAAATGGTAAGAATTTAACCAAGGTGCAT TTAACTCACTGTTCTGAATCTATTTCAAGAAATTGGGAAAACACTGCACACAAGGAGCAT CTCAATGTCGATGGACAATCATCTTCAGTGGCTTTACTTTAGTGGAAGAAACAAATCCAT ATGATTTCTTTGTTTTTATAGAATTGTTTGACACGCTACCCTTGTTTCACATGCAAAAAA TGACTGGTCCCTGGAAGTCTGACTCAACTCTCTACTCCAACCATTTTAGGATGTATGCAG CCGGCAACATCTTACGAGCCATACATACTACTAAACAGAATTTGCTGTCAAATTGTTTTA CCTTAGTTTGAATACATATCCTATCATGTTATTCCACCTTACCCTTTATTGCCTTTTTTT TTTTTCTTTTTAAATCCTAACAGGTAACATTAGGAGGCCCGGAAATCATAGAGGGACGCT TGCTGGCAGCCTTAAGAGTATTACTTGCAAATGATGCGGAAACTGTACAGAAGCATGATT TGAACACACTCAAATCTTTATCAGCTGAAGCCCCCCTGGGAATCGCGAATGAAGTTGCTT CTTTTCGCATCATTATTGCCCTATGTGCTATTGCACTGGAGCATTTTCCTACAAAAATAA TGGAAGACGAATCCCTGCTGAAACAGGGAGTTTCAGCTGCCTCGGAATTGGCCATTCAGT TCAGAATCCAAAAGAAATCCCTGATCATAGACGTAATGAGAAATCTTTCAAGGAGAATGA AGTTATTATCATCTAAGGAGGCAGCCTCTGCTCAAGGCTGATACGTGATGCCGAGCGAGC AACTTGTTTGCCTACTCAACTTCACCCAGTTCTTTTCTCATCTATGTTGTCATTGTTGTG GTTCCGTTTCAACGTTTTTCCTTAGTTAAATATTTATGTTTATTCAAAATTTTGACTGGT ATACCAGTTGGTATGCTACCCCTATTATGGATTTAGTTAAATATTTATGTTTCTTCAAAA TTTTGACTGGTTTACTAGTTGGTATACCACCCCTATTATGGATTTCTGTATTGACTTTAT ATCATAGTTGAACTTTAAAAGCAAAAGAATTTAATTATTTTATTTTGTACTTATTTCAGA