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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI029947 | Chr4 | 33216 | 36826 | + | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI029947.m1 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 144.8 | 1.30E-42 |
| LITCHI029947.m2 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 145.8 | 6.50E-43 |
| LITCHI029947.m3 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 145.8 | 6.50E-43 |
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>LITCHI016561.m1 ATGTCGAAAATGAAGCATCTACTGAGAAAACTCCACATCGGCGGCGAGCATCAGAGGCTG GCTGAGGCGACACCAGCCGTTGTAAATACAAGCCCTACACAGAATCCGTCAACATCGTCT TCGCCTTCAGGTTCGACTACAATGGGGAGAATCGTTGAATCGCCGGCGGCTGATCCCGCC CCTTTGGATTTCAATTTGTTGGAGGAGGAGTTCCAGGTCCAATTGGCTTTAGCTATAAGC GCCTCCGATCCAGACGCCAGAGAGGAGGCCGAGTCCGCTCAGATCGATGCCGCCAAGCGG ATGAGCCTCGGCTGCCGCTCCGCTTCCGTCACCGAAGCTGATGCACTCGTCGAGTTGCTC TCGCTTCGATATTGGAGCTATAATGCTGTAAATTATGATGAAAAAATTATGGATGGATTC TATGATGTGTACGGAATTACCTCAAATTCGGCTTTGCGAGGGAGGATGCCATTGTTGGTG GATCTACAAGCAATATCTCTTTCAGATAACTTAGATTATGAATTTGTTTTGGTAAACCGT TTGATAGATCCCAAACTTCAAGAGCTTGAGGAAAAAGCGTATAACGTATCAGTGGAGTGC CAACTTCATGAGCTTGGTTTGGTTTTAAGTGGCTTGATTCAGAAAGTTGCTGACATCGTT GTTGAGAGAATGGGTGGTCCAGTCGGCAATGCTGAAGAAATTTATGGAAGGTGGATTGCA AGACGTACTGAGTTACGGGATTCTCTGAATACAAACATTTTTCCTCTTGGGTGTCTTGAT GTTGGACTTTCACGTCATAGAGCCTTACTTTTTAAGGTGCTTGCTGATAGAATTAATCTT CCGTGTGTGCTGGTCAAGGGTAGCTACTACACTGGCACTGATGATGGTGCTGTGAATTTG ATCAAAATTGATGACGGGAGTGAATATATTATTGATCTAATGGGCGCTCCTGGCACATTA ATTCCTGCTGAGGTACCCAGCAGTCATCTTCAGACTGCTGGGCTAGATTTAAGAGGGTTT CCATCTGAAACCTCCTCGGGTTCTTGTTTGGTGCTCAACAAAGGCACTGAAGCTGTGGCT GTTTCACCAGTCCTGGATAGCATCCCTGAGGTTTGCTGCTCAAGGTTGGAGGAGGTGTCA TTCGTAGGTAAGCAAACAAACCAGGATGATTTGAACCTTGCTAATGAAAATCGATCTGAG AGATTTGAGCATGAATTTGGAAAACTTTTCCCTTCATTAGATAAGCAAAATGAAATATCC TCTAGCACTCCTGGGAGACAGTCATCTGCGCAAAAGAAGAAAGTTAAAAATGTGTCCAAA TATGTCATTAGTGCTGCTAAAAACCCTGAATTTGCACAGAAGTTACATGCTGTTTTGTTG GAGAGTGGTGCATCTCCTCCCCCAGATTTGTTTATGGACATTAACCCACAGGATCTGGGG GAAGAGCACGTCCATCTAGCAAATGGGAAAAATGTAGGTGATGGTGTTCACCGTCAATCA GATAAGTTGTTGTCAAGCTGTAAACAGTCCCTTGTATCCTCCATTGGGGTGGCATCTTCT AAGAATGTTAATTATGAGAATTACTGGAAACAGCCAGCCCAGATTTTCGGTGAACAACAA ATAGAAGTTGAAGCAGATGTCATTAAATCTGATCTTTCTTTTTCCTCTGATACTATGGGA GATGGTTTTGTTATTGTCGGTAACAGAGCTGATGAACCAATACCAACTTATACTACAGGT GTAAATACTGTTCCTGTTAACCCGCCGGGAATTGTTGCTAAAGCTTCATATGAAAAACAA ATTCATGGGTCACCTTTGCTCTCTTCTGCTGAGATTTACCATGCACAACTTGAAAGTGCA TTTGTCAATGATAACAGATTGATTAGGAGGAATTCTGATTACAATGAGTCGGGTACAGAA TCTGCTGGGGAATTGAAGGAAATGACCGATAATGCTCTGCATGTCCCTTGCAATGGTCTC ACTGATGGGATAAACCCAATGTTGGGGGATGTTGCAGAATGGGAAATCCTGTGGGAGGAT CTTCAAATAGGTGAACGCATTGGTATTGGCTCATATGGTGAGGAAGTTGCTGTGAAGAAA TTTTTGAATCAAGATTTTTCAGGTGATGCATTGTTGCAGTTCAAATGTGAAGTTGAGATC ATGTTGAGGTTGAGACATCCTAATGTTGTTCTTTTCATGGGAGCAGTTACTCGGTCTCCA CATTTCTCGATACTTACAGAGTTTCTCCCTAGGGGAAGTTTATATAGGTTACTGCATCGT CCCAATCCTCAACTTGATGAAAAGAAGAGAATGCGGATGGCTCTTGATGTGGCCAAGGGG ATGAATTACTTGCACACAAGCCATCCTACTATTGTGCATCGAGATCTGAAGTCTCCTAAT CTTCTTGTGGACAAGAACTGGGTTGTGAAGGTCTCTGATTTTGGGTTGTCGCGCATGAAG CACCATACTTTTCTGTCTTCGAAGTCAATGGCTGGAACGCCTGAATGGATGGCGCCAGAA GTTCTAAGGAATGAACCAGCCAATGAGAAATGTGATGTGTACAGTTTTGGTGTGATATTG TGGGAGTTGGCTACCTTAGGTATCCCATGGAAAGGATTGAACCCAATGCAGGTCGTTGGT GCTGTTGGATTCCAGAATAGACGTCTTGAGATTCCAGAGGACATTGATCCAGCAGTTGCA CAGATAATATGTGATTGTTGGCAAACGGAGCCACATTTACGTCCTTCTTTTGCACAGCTG ATGTCCCGCCTCCGACTTCTTCAACGTTTGTATGTAGATAGATCAAACTCGCCAAATCAG TTCTCAGAGTGA >LITCHI029947.m2 ATGGCCACGCCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCG CCGGGTACAGACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCT CTGGACCGCAACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGC AACAACGAACAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAA ATGACAGGCATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGT AAGCAAAAGAGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGAT GGTTCGATATACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCC CTTTATCATATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATAT GGTATCAAAGTGTTTTTTAACCTCTTTTTATGTTTTTTTTTACCCATAAATTTCTCCCGT TTATTCATCAATAGCTCAAACTGTCTGGCAGTAAGAGTGTAA >LITCHI029947.m3 ATGGCCACGCCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCG CCGGGTACAGACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCT CTGGACCGCAACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGC AACAACGAACAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAA ATGACAGGCATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGT AAGCAAAAGAGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGAT GGTTCGATATACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCC CTTTATCATATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATAT GGTATCAAAGTGTTTTTTAACCTCTTTTTATGTTTTTTTTTACCCATAAATTTCTCCCGT TTATTCATCAATAGCTCAAACTGTCTGGCAGTAAGAGTGTAA
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>LITCHI016561.m1 MSKMKHLLRKLHIGGEHQRLAEATPAVVNTSPTQNPSTSSSPSGSTTMGRIVESPAADPA PLDFNLLEEEFQVQLALAISASDPDAREEAESAQIDAAKRMSLGCRSASVTEADALVELL SLRYWSYNAVNYDEKIMDGFYDVYGITSNSALRGRMPLLVDLQAISLSDNLDYEFVLVNR LIDPKLQELEEKAYNVSVECQLHELGLVLSGLIQKVADIVVERMGGPVGNAEEIYGRWIA RRTELRDSLNTNIFPLGCLDVGLSRHRALLFKVLADRINLPCVLVKGSYYTGTDDGAVNL IKIDDGSEYIIDLMGAPGTLIPAEVPSSHLQTAGLDLRGFPSETSSGSCLVLNKGTEAVA VSPVLDSIPEVCCSRLEEVSFVGKQTNQDDLNLANENRSERFEHEFGKLFPSLDKQNEIS SSTPGRQSSAQKKKVKNVSKYVISAAKNPEFAQKLHAVLLESGASPPPDLFMDINPQDLG EEHVHLANGKNVGDGVHRQSDKLLSSCKQSLVSSIGVASSKNVNYENYWKQPAQIFGEQQ IEVEADVIKSDLSFSSDTMGDGFVIVGNRADEPIPTYTTGVNTVPVNPPGIVAKASYEKQ IHGSPLLSSAEIYHAQLESAFVNDNRLIRRNSDYNESGTESAGELKEMTDNALHVPCNGL TDGINPMLGDVAEWEILWEDLQIGERIGIGSYGEEVAVKKFLNQDFSGDALLQFKCEVEI MLRLRHPNVVLFMGAVTRSPHFSILTEFLPRGSLYRLLHRPNPQLDEKKRMRMALDVAKG MNYLHTSHPTIVHRDLKSPNLLVDKNWVVKVSDFGLSRMKHHTFLSSKSMAGTPEWMAPE VLRNEPANEKCDVYSFGVILWELATLGIPWKGLNPMQVVGAVGFQNRRLEIPEDIDPAVA QIICDCWQTEPHLRPSFAQLMSRLRLLQRLYVDRSNSPNQFSE. >LITCHI029947.m2 MATPPPGANFEAAPPAPVAPPGTDMTGICFRDQLWLNSYPLDRNMVFDYFALSPFYDWTC NNEQLRMRSIHPLDISHLSKMTGIEYMLSEVMEPHLFVIRKQKRDGPEKVTPMLSYYVLD GSIYQAPQLCNVFAARIGRALYHIQKAFTTAASKLEKIGYGIKVFFNLFLCFFLPINFSR LFINSSNCLAVRV. >LITCHI029947.m3 MATPPPGANFEAAPPAPVAPPGTDMTGICFRDQLWLNSYPLDRNMVFDYFALSPFYDWTC NNEQLRMRSIHPLDISHLSKMTGIEYMLSEVMEPHLFVIRKQKRDGPEKVTPMLSYYVLD GSIYQAPQLCNVFAARIGRALYHIQKAFTTAASKLEKIGYGIKVFFNLFLCFFLPINFSR LFINSSNCLAVRV.
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>LITCHI016561.m1 CACCTGTAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACGCAGCTGTACAATTGGTGAATACACGT AGTGATGGTAGTACAAGTACAATAAAAAATAATAATATAAAAATGGGAAAGTCACATTAA CATTAAGAGAGAGAGAGTGTATTGGAGGGAATGGGTGAGCGGTTAAATTAAGTGTCTCAA GGGGGGTAGTAGCTTGAGGAAGAAGGGTGCGCACGTTAAGCGAATCTGCCTTTATGTATT TTTCTTACTAGTGGGCGTAGGTTAAGGCAGAAGCGATAGATAAGAAGAAGGAGAAAACAT AACAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCGATCAACAAGTCGTTGATGATCAGCGATGTCG AAAATGAAGCATCTACTGAGAAAACTCCACATCGGCGGCGAGCATCAGAGGCTGGCTGAG GCGACACCAGCCGTTGTAAATACAAGCCCTACACAGAATCCGTCAACATCGTCTTCGCCT TCAGGTTCGACTACAATGGGGAGAATCGTTGAATCGCCGGCGGCTGATCCCGCCCCTTTG GATTTCAATTTGTTGGAGGAGGAGTTCCAGGTCCAATTGGCTTTAGCTATAAGCGCCTCC GATCCAGACGCCAGAGAGGAGGCCGAGTCCGCTCAGATCGATGCCGCCAAGCGGATGAGC CTCGGCTGCCGCTCCGCTTCCGTCACCGAAGCTGATGCACTCGTCGAGTTGCTCTCGCTT CGATATTGGAGCTATAATGCTGTAAATTATGATGAAAAAATTATGGATGGATTCTATGAT GTGTACGGAATTACCTCAAATTCGGCTTTGCGAGGGAGGATGCCATTGTTGGTGGATCTA CAAGCAATATCTCTTTCAGATAACTTAGATTATGAATTTGTTTTGGTAAACCGTTTGATA GATCCCAAACTTCAAGAGCTTGAGGAAAAAGCGTATAACGTATCAGTGGAGTGCCAACTT 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AGGAATGAACCAGCCAATGAGAAATGTGATGTGTACAGTTTTGGTGTGATATTGTGGGAG TTGGCTACCTTAGGTATCCCATGGAAAGGATTGAACCCAATGCAGGTCGTTGGTGCTGTT GGATTCCAGAATAGACGTCTTGAGATTCCAGAGGACATTGATCCAGCAGTTGCACAGATA ATATGTGATTGTTGGCAAACGGAGCCACATTTACGTCCTTCTTTTGCACAGCTGATGTCC CGCCTCCGACTTCTTCAACGTTTGTATGTAGATAGATCAAACTCGCCAAATCAGTTCTCA GAGTGA >LITCHI029947.m3 AAAATCTCCAAACGCAACATTTTCTTTTCACTTGAAAACAAAACGAAATAGATGGCCACG CCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCGCCGGGTACA GACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCTCTGGACCGC AACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGCAACAACGAA CAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAAATGACAGGC ATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGTAAGCAAAAG AGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGATGGTTCGATA TACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCCCTTTATCAT ATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATATGGTATCAAA GTGTTTTTTAACCTCTTTTTATGTTTTTTTTTACCCATAAATTTCTCCCGTTTATTCATC AATAGCTCAAACTGTCTGGCAGTAAGAGTGTAACTTGTTCATTTGTTATTACAGCTGTAG 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>LITCHI016561.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGAATATATTTTCATCAAAAGATCTCATAGTAGTTTGAAAAGGAATTTAAAGACAACCAT ATATATTAAAAAATAGGAAAACTTTATATATGGAAAAATTTTACTTTTACTCAAAAACAA ATGAAAAAATTTGTTTTTACTCAATTTTTTTATACAAAAATTATTTCTAGCTCCTTAAAT AAATTATTTTCATTTTATATCCAAGTTTATCAAACTACCCTCAACATGTAAAATACGGTT ACTAATTGAGTTTTAATGAGATTGGTTTTTAAGTGGACTTAAAAACGCATCATCTATTTT TAATGGGTATTATTTTTTAAGTGAATTTAAAAATCAATTCTACCTGGACATCGTCTTGAC ATTGTATCTCATTAGAAATCTTCATTTTCAAGCTAAATCCAACTAAATTTAACTCAAAAC ATTAATACCTAACATCTAAAACATAAATACTCGAAAAATCACAAAATAAAGTTAATAATT GGTTTTTAAGTCCACTTACAAGCTGATATAATCCAATTGTCATTTTTATCACCGAAAACC ACCATTTTCAAGTCAAATGCAATCAAATCTAACCAAATCTAACTCTAAACATCAATACTT AACATTTAAAACATAAAAAAACTCGAAAAAAAAAAAACTCAAAAAATCTCAACTAAACCC AAACAATCAACAAAAGAGGTCAAATATCTTATATCATAAACAATGGAGGAGGAGAATAAG ATATGTAAGGATAATTTAAGTAATTTGAGTATAGATTGCAATTAATTTATTTGAGGGGTT AAAAATAATTTTAAAAAGGGTAAAAACATTATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAGTGGATAA AAATCAATTTTCCTTTTCTATAATAGTCATTGTTTGTAATTTCCACTAAAGGTTATGGAG 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