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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029947 | Chr4 | 33216 | 36826 | + | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029947.m1 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 144.8 | 1.30E-42 |
LITCHI029947.m2 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 145.8 | 6.50E-43 |
LITCHI029947.m3 | 28 | 153 | PF04934.17 | Med6 | Family | 145.8 | 6.50E-43 |
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>LITCHI029947.m1 ATGGCCACGCCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCG CCGGGTACAGACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCT CTGGACCGCAACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGC AACAACGAACAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAA ATGACAGGCATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGT AAGCAAAAGAGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGAT GGTTCGATATACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCC CTTTATCATATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATAT GTTGATGCTGAAAATGAGGGTCCAACTCTTGACTCAAAGGTCAGTAAAGAGACAATTGAC TTTAAAGAAGTCAAGCGAATAGATCATATTCTTGCCTCCTTACAGCGCAAGTTACCACCA GCCCCTCCAGCTCCACCATTTCCTGACGGTTATACGCCTCCAACAACAGGAGAAGCTGAG AACGGCTCTGAAACCCAACAAACAGGAGAGGCGCAACCTCCGCCGATTGACCCCATCATC GATCAAGGACCAGCTAAGAGAATGAAATTCTGA >LITCHI029947.m2 ATGGCCACGCCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCG CCGGGTACAGACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCT CTGGACCGCAACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGC AACAACGAACAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAA ATGACAGGCATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGT AAGCAAAAGAGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGAT GGTTCGATATACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCC CTTTATCATATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATAT GGTATCAAAGTGTTTTTTAACCTCTTTTTATGTTTTTTTTTACCCATAAATTTCTCCCGT TTATTCATCAATAGCTCAAACTGTCTGGCAGTAAGAGTGTAA >LITCHI029947.m3 ATGGCCACGCCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCG CCGGGTACAGACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCT CTGGACCGCAACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGC AACAACGAACAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGAAA ATGACAGGCATAGAATACATGCTAAGTGAAGTTATGGAACCTCACCTCTTTGTTATCCGT AAGCAAAAGAGGGATGGCCCTGAGAAAGTCACACCGATGCTGAGTTATTATGTATTGGAT GGTTCGATATACCAAGCACCACAGCTTTGCAATGTATTTGCTGCTAGAATTGGGCGAGCC CTTTATCATATACAGAAGGCTTTTACTACTGCTGCATCAAAGTTGGAGAAGATTGGATAT GGTATCAAAGTGTTTTTTAACCTCTTTTTATGTTTTTTTTTACCCATAAATTTCTCCCGT TTATTCATCAATAGCTCAAACTGTCTGGCAGTAAGAGTGTAA
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>LITCHI029947.m2 + Up_Stream_Len 2000 GACTAATTTGATACTTTTTCGAAAAGTTAGGGTCCATTTTGTCCCTTTTTGAAACATAGT TAAAAATTTGATCCTTTCCCAAAAGTAAGGGACTAAAATGATCTTTCCCCTTTATTTTTT ATTGGAACCATTAAGTTTCTTGTCAGTTGTCACAGTGATAGATGAGGACTGGCTTTGAAT TTCTCACATCCCCGACATGAAAAGTTTGGTTGATACAAGCAAACAGGAGATGGCCATTGA ATTGATAGATGATTTATTTTTAACTGTCATTGACTCACAGGTAATTTAATTTCTAAATTT TCTCCTCCATCAGTCAACTGTTCAAATTTTTAAACAACATTTATATGCGACTACCCCCAG ATTATTTGACAATGGAAGTGTATCATTTTGCAGAAGCAGAATGTGATATATAAACAAGCA GGTGATATCACATATCTAACGTTTTATGCAAAGAGAAGACAAACAAGATAGACTGAGAAT GGAATTGTGCAAATAACATATAGACAGAAGTTGCTTAAATTGCTCTATCTAGTTCTCAAA AAGTTGTTCAAAAGGTAACAACTAAAATGTAACAGCTATATATTAAGTCCATTATGTATT GTAGAAACTGGCTTGATTTTCATGTCCAAGTCGTTCTCATTCTCTTAATGTTACAGGATC TAAAATACAACTAAGAAGTCCTGGTGCAACCAGTTTTATATTGAAGTTGTCAGAGACATA CACCTTGTGTGCACGGTGGGGCCGCTATATATCGCTATATATAGAGTCCAATACAGAGTT CAAAGAGCATCTCAGGCCCTGCATGGACAACAGCAAAATTGATCTTCACTAGCCAACTGT GATGGCCACTTGCCATTTATTGTCTACAAAGTTGATAGTAAACTGCAATTATTGAGGTTT 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>LITCHI029947.m2 GenomeSequence + AAAATCTCCAAACGCAACATTTTCTTTTCACTTGAAAACAAAACGAAATAGATGGCCACG CCACCGCCGGGAGCCAACTTCGAGGCTGCACCACCGGCGCCGGTGGCGCCGCCGGGTACA GACATGACAGGGATATGCTTCAGGGACCAACTGTGGTTGAACTCGTACCCTCTGGACCGC AACATGGTGTTTGACTACTTCGCTCTGTCTCCATTCTACGACTGGACTTGCAACAACGAA CAGCTCCGGATGCGGTCCATACACCCTCTTGATATCTCTCACCTCTCGTAAGTTTCGTCT TATTTGTGCATATTAAAAATGCCCACTTCGTGTTTTTGCTTGTTCTTGTGGTTTTTTTGT TGTACCATCTGCTGGTTTTGTTTTAAATGTTTGTGTGTTGTTTGTTTGTTGGTTTGGTGA TTTTTTTTTTGGTTGTTTTGATGGAATGATGAACTGGGTTGGATGAAATTTTGGATTTTG TTCCGGTTTTCAGGTAAAGATTGGATTTTTATGTTGTGTATAATTTTACTAGTTTGTGTT GCATTTTTATCATGAACATGGGATTAGTTTCAGTTGAATTGCGGATAATTTTAGCTTGAT GAAGTGAAATTGCGAGTTGGGTTGTAGGAAAATTTGAGTTTTTTTGAAGTAAAGATTTGG ATTTTTCATTGGTCCTCTGACTCTGTGTTTGGTTGTGATTGCTTGATGATATAGAAAGGA ATGATGTTTGGATTTCTGGAGCAATGAGACGTTTTTATGTTTGGAAGGACATATGAGGGA ACGAGCATTAAGACCACAGAAGGGAGATATATAGAAGTAACTGAGTGTCGATACGTTCTG AGTTCTTGGAGAATTTTTGAAGACTAGTTTTGTTTGAATTAACTTTGCAGTCTTTAAATA 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