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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029876 | Chr9 | 29489339 | 29495838 | + | Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029876.m1 | 32 | 72 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 38.8 | 9.00E-10 |
LITCHI029876.m1 | 121 | 181 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 37.3 | 1.80E-09 |
LITCHI029876.m1 | 414 | 683 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 141 | 4.90E-41 |
LITCHI029876.m1 | 415 | 685 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 142.9 | 1.10E-41 |
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>LITCHI029876.m1 ATGGTGGAGAAATGGAGGAGTGTGTTTTTGTTGGTGTTGTTTACAGTCTGCATTCTGGGG TGGCAACCCAGCTGCATCAATGGTGCTACAGATCCGTCTGATGCTTCTGCTCTCAGAGTT ATGTTCACCAGCTTAAATTCACCTGGTCAGCTAACTGGGTGGAATGCAAATGGCGATGAC CCGTGTGGGCAGTCTTGGAAAGGGGTTACTTGCTCTGGCCAACGAGTCACAGAACTTAAA TTATCAAATCTTGGACTCTCTGGAAACAACTTAGGGTACCAGCTTTCAAGTTTAACAGCA TTAACCAACCTAGATGTGAGCAACAATAATCTTGCTGGCGATGTTCCTTATAATCTACCG CCAAACTTGGAGCAATTAAATCTTGCCAACAATAGATTTACTGGCAATGTCCCTTATTCC ATTTCCCAAATGGCTCCGCTTAAGTACCTAAATCTTGCTCACAATCAGCTACAGGGACAA CTGAATGACATGTTCGGAAAGCTTAATTCTCTCTCGACATTGGATCTCTCTTTCAATACT CTGTCAGGTGATATCCCTGAGAGTTTTAGCACCCTTTCAAGTATAAAGTCAATGTACTTG CAGAACAACCAGTTCACTGGTACCATTGATGTTCTTGCTAATCTTCCCCTTGATAATCTG AATGTTGGAAATAACCGTTTTACTGGCTGGATTCCTGAACAATTGAAAAATATTAATCTG CAGACGGATGGTAATTCGTGGAGCTCTGGACCTGCCCCTCCGCCTCCACCAGGTACACCT CCAGCCAACAGAAATAACCGAAGACACAAACCTGATGGTGACAATAGCCCATCCGATAGT GGTGGTAGCAAGAAATCAGGCATAGGGGGTGGTGGCTTAGCAGGAATAATCATCTCTATC ATAGTCGTTGGGGCAATAGTAGCATTCTTTTTGGTTAAGAGAAGATCCCGAAAGTCATCC TCAGATATAGAAAAGCTTGATAACCAGCCCTTTGCTCCTCTTGCTTCTAGCGAAGTACAA GCAGAAATGAAATCTGTACAGACTTCCTCGGCAATCAACACAAAGACGCTTGACACTTCT GCCCCAATAAATTTACGTCCTCCACCAGCTGATCGTCATAAATCATTTGATGAAGATGAT TTTTCAAACAAGCCCATTATTGTCAAGAAAACTGTTACTGCTCCAACAAATGTGACATCG TATTCAATAGCCGACCTGCAGATGGCTACTGGCAGTTTCAGCATTGAAAACCTTCTTGGT GAGGGCACTTTTGGACGTGTGTATCGAGCTCAATTTGATGATGGAAAGGTTTTTGCGGTG AAAAAAATAGATTCATCTGCTCTTCCCAGTGAACTGTCTGACGATTTTATAGAGATAGTT TCAAACATATCCCGGTTGAACCACCCAAATGTGATGGAGCTGGTGGGTTATTGTTCAGAG TATGGGCAACACCTTCTGGTCTATGAGTACCACAAAAATGGTTCACTGCATGACTTCCTC CATCTGTCAGATGAATACAGCAAGCCACTAATATGGAACTCCCGTGTGAAGATTGCTTTG GGAACTGCACGTGCTTTGGAGTACCTGCATGAAGTTTGCTCACCCTCAGTTGTACACAAA AATATCAAGTCAGCCAATATATTATTGGACTCAGAGCTCAATCCTCACCTTTCAGACTCT GGGCTGGCGAGTTTTATGCCAAATGCAGATCAGTTGCTGAATAATAATGCAGGTTCTGGA TACAGTGCACCTGAGGTTGCCATGTCTGGTCAGTACACTTTAAAGAGTGATGTCTACAAT TTTGGGGTTGTCATGTTGGAGCTTCTGACTGGACGTAAACCATTTGATAGCTCGAGGCCA AGGACTGAGCAATCTTTGGTTCGATGGGCAACACCTCAGCTCCATGACATTGATGCTCTT GGTAAAATGGTTGATCCAGCACTCAAAGGGCTTTATCCCGTCAAATCTCTCTCTCGGTTT GCAGATGTCATTGCACTTTGTGTCCAGCCTGAGCCCGAGTTTCGACCACCCATGTCAGAA GTGGTTCAAGCATTAGTCCGGTTGGTGCAGCGAGCCAACATGAGCAAAAGAACAAGTGGA AATGACCAAGGAGTAACAACCCCGCGTGCTGACAATAACCCAGATACAAATGACTACATG TGA
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>LITCHI029876.m1 MVEKWRSVFLLVLFTVCILGWQPSCINGATDPSDASALRVMFTSLNSPGQLTGWNANGDD PCGQSWKGVTCSGQRVTELKLSNLGLSGNNLGYQLSSLTALTNLDVSNNNLAGDVPYNLP PNLEQLNLANNRFTGNVPYSISQMAPLKYLNLAHNQLQGQLNDMFGKLNSLSTLDLSFNT LSGDIPESFSTLSSIKSMYLQNNQFTGTIDVLANLPLDNLNVGNNRFTGWIPEQLKNINL QTDGNSWSSGPAPPPPPGTPPANRNNRRHKPDGDNSPSDSGGSKKSGIGGGGLAGIIISI IVVGAIVAFFLVKRRSRKSSSDIEKLDNQPFAPLASSEVQAEMKSVQTSSAINTKTLDTS APINLRPPPADRHKSFDEDDFSNKPIIVKKTVTAPTNVTSYSIADLQMATGSFSIENLLG EGTFGRVYRAQFDDGKVFAVKKIDSSALPSELSDDFIEIVSNISRLNHPNVMELVGYCSE YGQHLLVYEYHKNGSLHDFLHLSDEYSKPLIWNSRVKIALGTARALEYLHEVCSPSVVHK NIKSANILLDSELNPHLSDSGLASFMPNADQLLNNNAGSGYSAPEVAMSGQYTLKSDVYN FGVVMLELLTGRKPFDSSRPRTEQSLVRWATPQLHDIDALGKMVDPALKGLYPVKSLSRF ADVIALCVQPEPEFRPPMSEVVQALVRLVQRANMSKRTSGNDQGVTTPRADNNPDTNDYM .
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>LITCHI029876.m1 AAGAAAACAGGATGTTAAATAGCGAGAAACCCGTGAATATCTTTCCTCATCAGATCTGGA CTGGACCCATTAATATATAACAATCATTCAATGTATTGAAGTAATCCAAAGAAAATGCCA CCAAGTCATCACCAGTGAAAGCTACACCTGCACCTACACTACGACCACACCCCTTAAGCC TCAACCATTTTCTCATTATTTCATCATAATTATTGTTATATCAATCAAATTCAAACCGTC TCTAATCGTCGTTGAAAGCCACTAGTCTTCTGTTTGTTTCCATAATTACAAGTTTTTTAT AGTAAGGAAACCTTTTTGGTATATTTTACAGTATATACAGTAGATACACCTAACAAAGAT CGTATTTTTATTTTGTTTTACTCCTACTTCTCCTCATATATACATATAAAAAAAGCTTTG AATTTTGTTGATAAATATATATAAAGAGAGAGAGTGTGTGTATGTGTATGTGTGCATTCT GTGGCTTTGGATTCTTCTGGCAAATGGTGTCTGCCAGCTTTCACTTTGATATGGCTTAAC TACTATTTTTTTTTTTTTGAATTTCATTTTTATATATTTGAAGGGAAAAAAAAAAAAAAA TTAAAGGTTGGGACTCGTAAAGCCTTTTTTGGCTTTCTGGGTGTGACAAACTTGTGGTTT TGAGGGAGAGAGAGAGAGATGGTGGAGAAATGGAGGAGTGTGTTTTTGTTGGTGTTGTTT ACAGTCTGCATTCTGGGGTGGCAACCCAGCTGCATCAATGGTGCTACAGATCCGTCTGAT GCTTCTGCTCTCAGAGTTATGTTCACCAGCTTAAATTCACCTGGTCAGCTAACTGGGTGG AATGCAAATGGCGATGACCCGTGTGGGCAGTCTTGGAAAGGGGTTACTTGCTCTGGCCAA CGAGTCACAGAACTTAAATTATCAAATCTTGGACTCTCTGGAAACAACTTAGGGTACCAG CTTTCAAGTTTAACAGCATTAACCAACCTAGATGTGAGCAACAATAATCTTGCTGGCGAT GTTCCTTATAATCTACCGCCAAACTTGGAGCAATTAAATCTTGCCAACAATAGATTTACT GGCAATGTCCCTTATTCCATTTCCCAAATGGCTCCGCTTAAGTACCTAAATCTTGCTCAC AATCAGCTACAGGGACAACTGAATGACATGTTCGGAAAGCTTAATTCTCTCTCGACATTG GATCTCTCTTTCAATACTCTGTCAGGTGATATCCCTGAGAGTTTTAGCACCCTTTCAAGT ATAAAGTCAATGTACTTGCAGAACAACCAGTTCACTGGTACCATTGATGTTCTTGCTAAT CTTCCCCTTGATAATCTGAATGTTGGAAATAACCGTTTTACTGGCTGGATTCCTGAACAA TTGAAAAATATTAATCTGCAGACGGATGGTAATTCGTGGAGCTCTGGACCTGCCCCTCCG CCTCCACCAGGTACACCTCCAGCCAACAGAAATAACCGAAGACACAAACCTGATGGTGAC AATAGCCCATCCGATAGTGGTGGTAGCAAGAAATCAGGCATAGGGGGTGGTGGCTTAGCA GGAATAATCATCTCTATCATAGTCGTTGGGGCAATAGTAGCATTCTTTTTGGTTAAGAGA AGATCCCGAAAGTCATCCTCAGATATAGAAAAGCTTGATAACCAGCCCTTTGCTCCTCTT GCTTCTAGCGAAGTACAAGCAGAAATGAAATCTGTACAGACTTCCTCGGCAATCAACACA AAGACGCTTGACACTTCTGCCCCAATAAATTTACGTCCTCCACCAGCTGATCGTCATAAA TCATTTGATGAAGATGATTTTTCAAACAAGCCCATTATTGTCAAGAAAACTGTTACTGCT CCAACAAATGTGACATCGTATTCAATAGCCGACCTGCAGATGGCTACTGGCAGTTTCAGC ATTGAAAACCTTCTTGGTGAGGGCACTTTTGGACGTGTGTATCGAGCTCAATTTGATGAT GGAAAGGTTTTTGCGGTGAAAAAAATAGATTCATCTGCTCTTCCCAGTGAACTGTCTGAC GATTTTATAGAGATAGTTTCAAACATATCCCGGTTGAACCACCCAAATGTGATGGAGCTG GTGGGTTATTGTTCAGAGTATGGGCAACACCTTCTGGTCTATGAGTACCACAAAAATGGT TCACTGCATGACTTCCTCCATCTGTCAGATGAATACAGCAAGCCACTAATATGGAACTCC CGTGTGAAGATTGCTTTGGGAACTGCACGTGCTTTGGAGTACCTGCATGAAGTTTGCTCA CCCTCAGTTGTACACAAAAATATCAAGTCAGCCAATATATTATTGGACTCAGAGCTCAAT CCTCACCTTTCAGACTCTGGGCTGGCGAGTTTTATGCCAAATGCAGATCAGTTGCTGAAT AATAATGCAGGTTCTGGATACAGTGCACCTGAGGTTGCCATGTCTGGTCAGTACACTTTA AAGAGTGATGTCTACAATTTTGGGGTTGTCATGTTGGAGCTTCTGACTGGACGTAAACCA TTTGATAGCTCGAGGCCAAGGACTGAGCAATCTTTGGTTCGATGGGCAACACCTCAGCTC CATGACATTGATGCTCTTGGTAAAATGGTTGATCCAGCACTCAAAGGGCTTTATCCCGTC AAATCTCTCTCTCGGTTTGCAGATGTCATTGCACTTTGTGTCCAGCCTGAGCCCGAGTTT CGACCACCCATGTCAGAAGTGGTTCAAGCATTAGTCCGGTTGGTGCAGCGAGCCAACATG AGCAAAAGAACAAGTGGAAATGACCAAGGAGTAACAACCCCGCGTGCTGACAATAACCCA GATACAAATGACTACATGTGA
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>LITCHI029876.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAACTTTTGTAATTATATTCCCAATGAT ATGCACCCTCAAAGTTCCGCTTAAGCATCTAATAAAAATTCCAAAACCTCTTTATTATTA AAAAAATTATAATCACGTTTATTTATAGGAATTCAATGAATATGTACATGCACACCACAA TTCTTAATAGTCAAAATAATTAAGATGTTAGGATTGAATTTACATTAACTACATTATAAA AATTTGTAAGAGTAACTATCTTTGTTATTTAAGTTGTGTAATATTAAATTATGAGAATAA ATATTCGAGTCACATTATTAATATTTGATCTTAGTAAATTTCAACAATTTTTTGACAAGT TCATATCAACTTAAATAAATTATATTGAATGCATTTTTTTTTTCATGTGAGCAATGATAG GCATTTTAAAGTTTTTAGTCGATGTGACATGTAAGTTATCAACATCTTATGATAAATAAC TAATACGATGTTAACAACTTACATAACATATCATTTAGGTTTGGATATGGATAAAAAATT TAGAAAGGCTTTTATTACTTATTTTATATATGTGATAATGACTTGAATCTTATCATATAA AGAGTAAATTTTCGAAGGGTTTTAATTTTGATGAATATGATGGATTCTTTTAAGGGTTAT ATTAACTATTGATGCAAATGAAAATAAGGATAAATTTTATTGTCGTCTCTATATTTAAAA AAAAAAATCAAATTTTTATCTATGTTTTGAAAACGCATCAAATCTTCCCTAAAGTTTCAA AAAAAAAAAAAAATTTAATTATTTTCGTTAGTCAACTAACCATTAAACCTAATGGATGGA ATGATAGATATGAGTAATTTTGTCATTTGAAATTATAACTCAAGATATTGACATGTGTCC GAGCAAAATAATTTAAAATGATAATTTAATTGTATCTAATTATTAGATACCAGATCAATG ATTATCTAGTATTTTGTTAGTTTTTATTTTTTTTGAATTTTTTTATATTTATATTTATAT TTTTAAGTTTATTTTAATTATGATTGATTTAAATTTTGTTTGTTTTTAAATTTTTAAATA TTATTTAAATTTTTATTTTTATTTTGAAGATGGTGACAAAACAATCTTTTTATGTTGTCC ATTAGGTTTGATTAATTGATGGAAGAGATCAATTTAATATTTTTTCGAACTTTTAGGAGA GATTTAATGTGTTTTTAAAATAAAGTTAAAAATTGGATATTTTTTCGAAATATAAAGATG TAAATAAAATTTACCCTCAAAATATCAAGAGAAAATAAGAAAGAAGGATTAAAAGAGAAA GAAAGAAAACAGGATGTTAAATAGCGAGAAACCCGTGAATATCTTTCCTCATCAGATCTG GACTGGACCCATTAATATATAACAATCATTCAATGTATTGAAGTAATCCAAAGAAAATGC CACCAAGTCATCACCAGTGAAAGCTACACCTGCACCTACACTACGACCACACCCCTTAAG CCTCAACCATTTTCTCATTATTTCATCATAATTATTGTTATATCAATCAAATTCAAACCG TCTCTAATCGTCGTTGAAAGCCACTAGTCTTCTGTTTGTTTCCATAATTACAAGTTTTTT ATAGTAAGGAAACCTTTTTGGTATATTTTACAGTATATACAGTAGATACACCTAACAAAG ATCGTATTTTTATTTTGTTTTACTCCTACTTCTCCTCATATATACATATAAAAAAAGCTT TGAATTTTGTTGATAAATATATATAAAGAGAGAGAGTGTGTGTATGTGTATGTGTGCATT CTGTGGCTTTGGATTCTTCTGGCAAATGGTGTCTGCCAGCTTTCACTTTGATATGGCTTA ACTACTATTTTTTTTTTTTTGAATTTCATTTTTATATATTTGAAGGGAAAAAAAAAAAAA AATTAAAGGTTGGGACTCGTAAAGCCTTTTTTGGCTTTCTGGGTGTGACAAACTTGTGGT TTTGAGGGAGAGAGAGAGAG
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>LITCHI029876.m1 GenomeSequence + AAGAAAACAGGATGTTAAATAGCGAGAAACCCGTGAATATCTTTCCTCATCAGATCTGGA CTGGACCCATTAATATATAACAATCATTCAATGTATTGAAGTAATCCAAAGAAAATGCCA CCAAGTCATCACCAGTGAAAGCTACACCTGCACCTACACTACGACCACACCCCTTAAGCC TCAACCATTTTCTCATTATTTCATCATAATTATTGTTATATCAATCAAATTCAAACCGTC TCTAATCGTCGTTGAAAGCCACTAGTCTTCTGTTTGTTTCCATAATTACAAGTTTTTTAT AGTAAGGAAACCTTTTTGGTATATTTTACAGTATATACAGTAGATACACCTAACAAAGAT CGTATTTTTATTTTGTTTTACTCCTACTTCTCCTCATATATACATATAAAAAAAGCTTTG AATTTTGTTGATAAATATATATAAAGAGAGAGAGTGTGTGTATGTGTATGTGTGCATTCT GTGGCTTTGGATTCTTCTGGCAAATGGTGTCTGCCAGCTTTCACTTTGATATGGCTTAAC TACTATTTTTTTTTTTTTGAATTTCATTTTTATATATTTGAAGGGAAAAAAAAAAAAAAA TTAAAGGTTGGGACTCGTAAAGCCTTTTTTGGCTTTCTGGGTGTGACAAACTTGTGGTTT TGAGGGAGAGAGAGAGAGATGGTGGAGAAATGGAGGAGTGTGTTTTTGTTGGTGTTGTTT ACAGTCTGCATTCTGGGGTGGCAACCCAGCTGCATCAATGGTGCTACAGATCCGTCTGAT GGTCAGTCTTTCCTCGTCTCATCACTTTGTTTTTGTTTCGTTTAGATGTGAGAGATTTGC ATGTCATGGTCTTCACCTAAATCTGCGTTCTTGTTCAAACTTGTAGTGCTCTTTTGTTTG 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