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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029645 | Chr9 | 27482572 | 27488186 | + | Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 8 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029645.m1 | 38 | 79 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 40.5 | 2.70E-10 |
LITCHI029645.m1 | 127 | 187 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.6 | 6.20E-09 |
LITCHI029645.m1 | 177 | 196 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.5 | 1.8 |
LITCHI029645.m1 | 410 | 679 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 150.4 | 6.60E-44 |
LITCHI029645.m1 | 412 | 681 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 151.4 | 3.10E-44 |
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>LITCHI029645.m1 ATGGCTTTGAAAACCAGAACCGGGTTCTCTTTCTCTTTCTCTATTACCCATCTGCTTACT GAGTTCGTCTTGATCTTGTCTGCTGTCTCTCTCGTTCATTGCAACACTGATTCCAATGAT GTTGAAGCTCTTCAGGTTGTGTACACTTCACTGAACAGTCCATCACAGCAGCTAACTAAT TGGAAAAGTGATGGAGGTGATCCATGTCGAGAGTCATGGAAAGGGGTTACTTGTGATGGA TCAGCTGTTGTTTCAGTTGACATTTCTGGGTTAGGGCTTAATGGAACTTTGGGATACTTG CTTTCAGACCTTACTTCATTGAGAAAACTTGATGTGAGTGGCAACAGCATCCACGACACA ATCCCCTATCAGTTACCGCCAAATCTTACGAGCCTAAATCTGGCAAGCAACAACTTCAGT GGGAATCTTCCATATTCCATTTCTACCATGGGTTCGCTCACTTATTTGAATGTAAGCCGC AATTTACTCACTCAATCAGTTGGAGATGTTTTCGCTAATCTTGTCGGCCTCTCAACCCTG GATCTTTCTTTCAACAACTTCTCTGGAGATCTTCCCAATTCATTTAGTTTATTATCCAAT ATGTCTAAACTCTATATGCAGAACAATCAATTGACTGGTACTCTGAATGTCCTTTCGTCT TTGCCGTTGACTACTCTAAATGTCGCAAACAATCATTTCAGTGGTTGGATACCTCAAGAA CTTAGTTCGATCCCAACTTTTATATCTGATGGGAATTCTTTCGACAATGGTCCTGCTCCA CCACCACCTCCACCTGGTAAATCTCGTAATAATCATTCTCATCCTGGATCGGGCTCGCAT ACACCTTCAGATGGTGAATCATCATCTAGTTCCAACAAGGGATTGTCAGTTGGATCTATG GTGGGCATACTTGTTGGTGCTATTTTTGTGGTAGCCCTTCTGCTACTTGTTCTTTGTTTT TGCGTTCGGAAGAACAAAAGAAAGGTAAGCGGTGCCAGAGCTCCAGCAGCAAGTCTTCCT GTCAGCAGACTTGATGTGAATACTGAGATTCCAGAGCAGAGGGTGAAAAGTGCAGCTGCT ATTACTGATCTGACACCTCCGCCTGTAGAAAAATTGGTGGTTGACAGGGTTTCGAAAAAC GGCTCCTTAAAGAAAGTGAAATCACCTATCACTGCAACTTCATACACGATTGCTTCTCTG CAAACAGCAACAAATAGTTTTAGTCAAGAATTTCTAATTGGTGAAGGGTCCCTTGGTCGG GTATACAGAGCAGAATTTTCCAATGGAAAGATAATGGCTGTAAAGAAGATCGACAATGCG GCATTGTCATTACAAGAGGAAGATAATTTTCTAGAAGCTATTTCTAATATGTCTCGTTTA AGGCACCCGAACATTGTGACGATGGCTGGATATTGTGCAGAACATGGACAACGTCTTCTG GTTTATGAATACATAGGAAATGGTAATCTGCATGATATGCTGCACTTCGCCGATGAAAGC AGCAAGAACCTCACCTGGAATGCACGTGTTAGGGTGGCACTTGGAACTGCCCGGGCCTTA GAGTACTTGCATGAAGTATGCTTGCCGTCTGTTGTACATAGAAATTTCAAGTCGGCAAAC ATATTACTTGATGAAGAGCTCAATCCCCACCTATCAGATTGTGGCTTAGCCGCACTAACA CCAAACACTGAGCGACAGGTTTCCACACAAATGGTTGGTGCATTTGGATACAGTGCTCCT GAATTTGCTTTGTCAGGTATATACACCGTGAAAAGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTAGTG ATGTTAGAGTTGCTGACTGGTAGGAAGCCGCTGGACAGTTCAAGGCCAAGATCAGAACAA TCACTTGTGAGATGGGCCACTCCCCAACTACATGATATAGATGCATTGGCAAAAATGGTT GACCCAGCCTTGAATGGAATGTACCCTGCAAAGTCTCTGTCACGTTTTGCTGATATAATT GCTCTGTGTGTTCAGCCGGAACCTGAGTTCCGCCCTCCAATGTCTGAAGTGGTACAAGCA TTGGTGAGGTTAGTGCAAAGGGCCAGTGTGGTGAAAAGACGTTCCAGCGATGAATCAGGA TTTTCCTACAAGACCCCAGAGCATGAAGCGATCGACACGTCATTTTAG
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>LITCHI029645.m1 ACACAATGCTCTCTCTTCATGACTCGCATAAGCTTCGAATCTCTGTGCGTGTCTGTGTGA GAGAGTCTCTCTCTCTTTTAATGGTGGTATCTCTCACTTCTTGGCCTCCTACCCCAGTTG CTTCTTCTTCTTCCTTAGCTGCTTTACCATGCACCCCGCGTCACTCAAACCTCGTTTTTG AACACCACCACTACCAACAACAATGGCTTTGAAAACCAGAACCGGGTTCTCTTTCTCTTT CTCTATTACCCATCTGCTTACTGAGTTCGTCTTGATCTTGTCTGCTGTCTCTCTCGTTCA TTGCAACACTGATTCCAATGATGTTGAAGCTCTTCAGGTTGTGTACACTTCACTGAACAG TCCATCACAGCAGCTAACTAATTGGAAAAGTGATGGAGGTGATCCATGTCGAGAGTCATG GAAAGGGGTTACTTGTGATGGATCAGCTGTTGTTTCAGTTGACATTTCTGGGTTAGGGCT TAATGGAACTTTGGGATACTTGCTTTCAGACCTTACTTCATTGAGAAAACTTGATGTGAG TGGCAACAGCATCCACGACACAATCCCCTATCAGTTACCGCCAAATCTTACGAGCCTAAA TCTGGCAAGCAACAACTTCAGTGGGAATCTTCCATATTCCATTTCTACCATGGGTTCGCT CACTTATTTGAATGTAAGCCGCAATTTACTCACTCAATCAGTTGGAGATGTTTTCGCTAA TCTTGTCGGCCTCTCAACCCTGGATCTTTCTTTCAACAACTTCTCTGGAGATCTTCCCAA TTCATTTAGTTTATTATCCAATATGTCTAAACTCTATATGCAGAACAATCAATTGACTGG TACTCTGAATGTCCTTTCGTCTTTGCCGTTGACTACTCTAAATGTCGCAAACAATCATTT CAGTGGTTGGATACCTCAAGAACTTAGTTCGATCCCAACTTTTATATCTGATGGGAATTC TTTCGACAATGGTCCTGCTCCACCACCACCTCCACCTGGTAAATCTCGTAATAATCATTC TCATCCTGGATCGGGCTCGCATACACCTTCAGATGGTGAATCATCATCTAGTTCCAACAA GGGATTGTCAGTTGGATCTATGGTGGGCATACTTGTTGGTGCTATTTTTGTGGTAGCCCT TCTGCTACTTGTTCTTTGTTTTTGCGTTCGGAAGAACAAAAGAAAGGTAAGCGGTGCCAG AGCTCCAGCAGCAAGTCTTCCTGTCAGCAGACTTGATGTGAATACTGAGATTCCAGAGCA GAGGGTGAAAAGTGCAGCTGCTATTACTGATCTGACACCTCCGCCTGTAGAAAAATTGGT GGTTGACAGGGTTTCGAAAAACGGCTCCTTAAAGAAAGTGAAATCACCTATCACTGCAAC TTCATACACGATTGCTTCTCTGCAAACAGCAACAAATAGTTTTAGTCAAGAATTTCTAAT TGGTGAAGGGTCCCTTGGTCGGGTATACAGAGCAGAATTTTCCAATGGAAAGATAATGGC TGTAAAGAAGATCGACAATGCGGCATTGTCATTACAAGAGGAAGATAATTTTCTAGAAGC TATTTCTAATATGTCTCGTTTAAGGCACCCGAACATTGTGACGATGGCTGGATATTGTGC AGAACATGGACAACGTCTTCTGGTTTATGAATACATAGGAAATGGTAATCTGCATGATAT GCTGCACTTCGCCGATGAAAGCAGCAAGAACCTCACCTGGAATGCACGTGTTAGGGTGGC ACTTGGAACTGCCCGGGCCTTAGAGTACTTGCATGAAGTATGCTTGCCGTCTGTTGTACA TAGAAATTTCAAGTCGGCAAACATATTACTTGATGAAGAGCTCAATCCCCACCTATCAGA TTGTGGCTTAGCCGCACTAACACCAAACACTGAGCGACAGGTTTCCACACAAATGGTTGG TGCATTTGGATACAGTGCTCCTGAATTTGCTTTGTCAGGTATATACACCGTGAAAAGTGA TGTGTACAGTTTTGGGGTAGTGATGTTAGAGTTGCTGACTGGTAGGAAGCCGCTGGACAG TTCAAGGCCAAGATCAGAACAATCACTTGTGAGATGGGCCACTCCCCAACTACATGATAT AGATGCATTGGCAAAAATGGTTGACCCAGCCTTGAATGGAATGTACCCTGCAAAGTCTCT GTCACGTTTTGCTGATATAATTGCTCTGTGTGTTCAGCCGGAACCTGAGTTCCGCCCTCC AATGTCTGAAGTGGTACAAGCATTGGTGAGGTTAGTGCAAAGGGCCAGTGTGGTGAAAAG ACGTTCCAGCGATGAATCAGGATTTTCCTACAAGACCCCAGAGCATGAAGCGATCGACAC GTCATTTTAGACGCATGCCAACCCTCAATGACCTTAAAATTCAAAGCTTGTGGTTTCAAA AACAACCATGCTAAGGTCTGGAGAAACCAAAGAACACACAGATGAAGAGAAAAAGATGTG GAAGTTATTAAGGTCAGATGATCAGAAAACATGTAATTTTGCCCCATCTACATTCAACCG CAAATTTTCTATCTTACAGTGCAAATTAAGGTATATATATATTTTACCTGAAAATGCTGC CATCTTTTGTATTTTCAAATTTTCTTCGAATGTATTAACGCAAAATCTAGACATTGGGCA GCAAAATAAAGTTATTTCTGTTTCGGTTTTTTCCCATTTCAAGCCAGAGTTCATGTATGA TGTTACAATGAGTTCTCCTTCACCATATAAATGCATAAAATTTCATGCTTTTGTTGCCTA GACTTGAAAGTTTTGAGTCCATTTTCATGCTTTTTACCATGCATTACCAGTGTGATGTGT CATGTGAGGACATTTAGATTGGATGAGGCAAGAAGACAGGTACAATTCCATAAAGACAAA ATGCCCACGTGAGAAAACTTCGTATAGATGTTGAATTTGAACGTGTTAGATTCTGCCACA AAATAATGACAACCTTCATGAATCCAAACAGGTTGTCCCAAGTGTGTCCATTTTTGTGGA TGGTGACGAGGCTCAGTTTGTTATTTTAGCACTTACTTTCTTGTTCATCTGTAGAAGTTA GAGATAGAGGGATGTAAGGTTTGAATCATGATCCATAATCTTATTTATATAATGATAAGA TCTTATTAAGGTTAATCACTATTACGGTCCAACAATAGTAA
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>LITCHI029645.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTGGTATTAACTATCTTTCATCCAAGGTTTTGGTAGACCTCTAATGGAAGAAACGTAACA TTATAAAATTAAATAAGTATCATAAAACATGAATGACTGTTTAAAATTTCACTAAGACAA TTTGTTTTTCCCTTTCTTGGATTACCATCACTATCAAGTAAATCATAACCAAACTTTTTG GACGTGAGGGTGTGATAATTATTGACTCACTCACGAGGTTGTTGCCATCAAAAGAAAAAG CAAAAAATATTTAAATTTACAGCCAAAATAACACTTGGTTTTTGTTTTTTTTTTGGTGTC TGCATCCATGATGATCCCCCTACAACAAAAAAAGAAGGGAAAAGGTCATCATTCATCGAT CCATTAAAAGGTCAATATTAAAAATGAGCAAAGGAGGTCCCATGGCCAGTCTCACAAGTG GACATTTTAGTCATTTTCCCACAAATTCTTCTAAAAATGCTAGTCCCAATCTGTCTGCCA GGTTTGCCCCTGGCCCCCTGCCACACCCTGCTTTAGAGTTCTGTCTCTGACTTCGATTTG GACCCTTTCTACCTGTCTTCATACAAGCACAAAAAGTGGATCGTCAATGGTTTCACCGCA AAAATAGCCCACTTTTAAGGGTAGACTTGACTTTTCAGAGTTTAGTTTTCAGTCCCATTC CATGAGTCCTCAGTTGCCGACTTGATCGTGTTGCATGCACGGGGTGAAGATTGAATTACG ATAAGCAACCACATCTTTACCATCAATGTGGGAAGAAAATATAATATAATCACGAATATA AATAGAAAATGTCTTGTGATAAAAATTGTAAAGGGAAAATGTTTAAAAGTATTATAATCT ATCTGATTTTAAAAATTATTTTTTCTTATCAACACCATCTCATTTGATTTGATTTCGATA AAATCTTTTATGAAATTATTTTATAGCTGATTTGGTGATAAGATAGATAAATAAAATAAT GTTATTTTTTTCTCTTATCTTTCCCACTAATCTTTTATATTTTTTTTACTTTTTCAATTA ATTCATCTTATCAAATCAACTATAACACAGTCTCATAGAAAATTTATTCTTTTCACTTGA TAAGAGAGTTGAGTAGATAAGAGACATTATTATCTAATCAATTTAATATCTAATGGATTA GTATTCAGTATATAACCAAATGAATTCCAATCCATGTACCCATTTCTGTCTAATGTCAAT CATGTGGATCAAATTTGCCCTTCATAGTTTATTCTCAAAGTCTTCAATTTCTCTCTCTAT ATATATCTCTTATATTTAGATTAAAAGCTTAACAATTTAACAACCACTTATACATGACAT GATTATTAAATGCACACCGATAGATTAATTCATTTGCCTTTAATCAAAGATTTAAGATAA AAAGAGTCACTAAGTAATAAATCTTAATTTTACTTTAATAAGTTTTTCTTATGAGATCAT AATAAGTTTGTATATAAAACAACATCCAATTAAATCTCATCTTACTTTATTCACTCACAT TAATCAAACCAAACTTTAGAATACTTAATTACTCTACTAATTATAGAATCATTAACATCA CACTACTCTATTACACACTAACATATAATATTTTTTAGTTAACTGACTCTGTAGAAGTAG AAATTAATCTAAATAAATTCGATCTATAATTTGTATAATATTACTTTTTTTAAAGGTAAA ACTAAAAAACTTGCTTTTATTTTCGTTTTCAAAATTTTAATTTTATTATTTTTTTTCGCC GACACACCCGAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTAAACAATATACACGACACGAC ACAATGCTCTCTCTTCATGACTCGCATAAGCTTCGAATCTCTGTGCGTGTCTGTGTGAGA GAGTCTCTCTCTCTTTTAATGGTGGTATCTCTCACTTCTTGGCCTCCTACCCCAGTTGCT TCTTCTTCTTCCTTAGCTGCTTTACCATGCACCCCGCGTCACTCAAACCTCGTTTTTGAA CACCACCACTACCAACAACA
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>LITCHI029645.m1 GenomeSequence + ACACAATGCTCTCTCTTCATGACTCGCATAAGCTTCGAATCTCTGTGCGTGTCTGTGTGA GAGAGTCTCTCTCTCTTTTAATGGTGGTATCTCTCACTTCTTGGCCTCCTACCCCAGTTG CTTCTTCTTCTTCCTTAGCTGCTTTACCATGCACCCCGCGTCACTCAAACCTCGTTTTTG AACACCACCACTACCAACAACAATGGCTTTGAAAACCAGAACCGGGTTCTCTTTCTCTTT CTCTATTACCCATCTGCTTACTGAGTTCGTCTTGATCTTGTCTGCTGTCTCTCTCGTTCA TTGCAACACTGATTCCAATGATGGTATCTCTCTCTTCTCGTTCTCTTCTTCAAGCTCCTG ATCAGATTCTTCAGTTTCAAAAAGAAATAAAAAGTTTCTTATTTTAGATTTTTTTTTTTT TTTTTTTTTTATTGTAGTTTGTGATTTTTAGTTGTTTTGTTGATTTGATCAACTGGGTTG TGATTGGTTTTCTAATGTGATGGGAAGTTAGTGTTTGGTTGATGTGAATAGAGTGAGCTT TAAGTCAAGTAATGAGCTTTGACTTTGTTTTGTTCAAAGTTGAATCCTTTTTTGTTCTAT TTGGTTTCAAACATTAATGCATGAGATTGATATTTGTAAAGTTGATTTTTTTTTTTTTGG TTTATCATCTTTTGTTTATAATAAAGGGTTGGTTTGATTTTATGTTTATTGTTGTTGTTG CAGTTGAAGCTCTTCAGGTTGTGTACACTTCACTGAACAGTCCATCACAGCAGCTAACTA ATTGGAAAAGTGATGGAGGTGATCCATGTCGAGAGTCATGGAAAGGGGTTACTTGTGATG GATCAGCTGTTGTTTCAGTGTATGTATATGAACGGATAACAAATGTAGGCCTTTTTCATT 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