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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029531 | Chr9 | 26549152 | 26560833 | + | Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029531.m1 | 155 | 467 | PF06087.15 | Tyr-DNA_phospho | Family | 212.5 | 1.10E-62 |
LITCHI029531.m1 | 464 | 575 | PF06087.15 | Tyr-DNA_phospho | Family | 75.1 | 5.20E-21 |
LITCHI029531.m1 | 605 | 663 | PF00240.26 | ubiquitin | Domain | 51.8 | 5.40E-14 |
LITCHI029531.m1 | 693 | 762 | PF00240.26 | ubiquitin | Domain | 38.5 | 7.60E-10 |
LITCHI029531.m1 | 889 | 930 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 32.1 | 1.10E-07 |
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>LITCHI029531.m1 ATGTCTGCAACAAAGATCGGATATCTAGTTCCACTCACTAACCAATACAAAGAAGACACG TCACTCCCCAACCTCCCTCTCTCTCCCGGTCCCAACCTCATCGGCCGCCACAACATTCCC GTCTCTGATAAGCGCCTTAGCCGTAAACACCTCTCTCTCATCGCCGCCCCCGACGGCTCC GCCACTCTCCTCGTCGAAGGAACCAATCCGGTGGTTGTAAAATCCGGTGGTGAGAGGAAG AAAGTGAAATCCAAAGCACACGTGTCGATCGCTAACGGTGATATCATAGAATTGATACCT GGACACCATTTCTTCAAGTACGTGACTACTTTCTCTAGAAACAGCAGTGAAAATGAAGAG CCTAGCAGCAAGAGAATGCGAAAACATGCTGAATGTGAAAACGGGAAGTGTGAGGAGGCG ATTCGTGGTTTTCGTGTGGAGAATGATGAGATAGGTTCAACGTTCAGGTTGTTGCGGGTG CAGGGGCTGCCTGGGTGGGCAAATACTTGCAGTGTGTCTATAAGGGATGTGATTCAGGGG GATGTTCTTATTGCTGTCCTGTCGAATTACATGGTGGATATTGATTGGTTGATGCCTGCT TGTCCGGCCCTTGCAAAAGTACCACATGTGTTGGTTGTTCATGGGGAGGGCGATGGTACA TTAGAACATATGAAGAGTAGGAAGCCAGCAAATTGGATTTTGCACAAACCTCCACTTCCT ATTTCATTTGGGACACACCATTCTAAGGCCATGCTTCTTGTCTATCCTCGAGGAGTGAGA ATTATTGTGCATACTGCAAACTTGATTCATGTAGACTGGAACAACAAAACTCAAGGTTTA TGGATGCAAGATTTCCCCTGGAAGGATCAGAATAATCCAAGCACAGGCTGTGGATTTGAA AATGATTTAGTTGATTATCTTAGTGCACTGAAGTGGCCTGAATTCAATGTTAATTTACCA GCCCTCAGCAACTTCAAAATCAATCCATCTTTTTTCAAGAAGTTCGATTATAGCAGTGCA ACGGTCCGGTTAATTGCATCAGTCCCTGGATATCATACTGGTCCCAATTTGAAAAAGTGG GGGCATATGAAGCTACGTACTGTTCTCCAGGAGTGTACTTTCGACAATGAATTTAAGAAA TCTTCTCTTATTTATCAGTTCTCCTCTCTTGGTTCCTTGGATGAGAAGTGGATGGCTGAG CTGGCATCCTCATTGTCATCAGGTTTTGCAGATGATAAGACACCACTTGGTCTTGGTGAA CCACTAATAATATGGCCTACTGTGGAAGATGTCAGATGCTCTTTGGAGGGTTATGCAGCT GGGAATGCCATCCCGAGCCCACTGAAGAATGTGGAGAAAGGATTCCTGAAAAAGTATTGG GCTAAATGGAAAGCAAGCCACACTGGCCGCTGTTGGTTCTTGCTAACTTCCGCAAATCTC AGTAAGGCTGCCTGGGGAGCACTCCAGAAGAATAATTCTCAGTTAATGATCCGTTCTTAT GAGCTGGGAGTGATATTTCTACCATCAATGAAAAGACGTGGTTGTGGCTTTTCTTGTACA AATAATGGTGGTCCATCCAAGGATCAATGTGGATCGATAGAAAATCCTGAAGTACAGAAA ACCAAGCTAGTTACCCTGACTTGGCTAGGTAGCCGGAACACAGCCGAGTCCTCTGAAGTG ATTTCTCTGCCTGTGCCTTACGAACTCCCTCCTCAACGATATTCCTCTGAAGATGTTCCA TGGTCTTGGGATTGTCAGTACAACCAGAAAGATGTTTATGGTCATGTTTGGCCGCGACAA GTTCAACTACCCTTCTCCATTGAAGTGGGTTTCTTCGACACTGTCCTAGAAATCAAAGAA AAAATTCAAAAGTACCAGGGCATTCCCATACCTAAACAAACCCTAGTTTTCAATGGCCAA GTTCTCCAAGACGACCGCGACGTTGAGTACTGTGAAATCCTCCAGAACTCCCACATTCAG CTCCTGGTTGCCTCCTCGGAATCCGATAAACCCCAACTCATCAAAAACAACAACAATCTT GAACCCACCGTGCCCTCCAAGAAAATCCATCTCAAGATCAACATGCCTTCCTCCAAGACT CATACGTTGCTTGACATGGAAGTTACGGATAATATCCTACATTTGAAAGAAAAGATTCAT GAGATGGAACCTGTCCCGGTTACAAGACTTGTAGTGCAAGCAAACGGTGTAGAATTGTGT GACCATAAATCCTTACGTGACTGTGAGCTCATGGACAATTCCGAGATTGATGTTAACATC AAGCCCTCCCCTACGACTTCAGGCACGGGTTCTACCGGGCAAATGATGATGACAGGTTCG AAGAAGCTGAGAGTGATGGTGCTGCCTAAATGTGGGAACAAGAAGATTCCAGTGGACGTA AACGCTTCGGATAATGTAGGAGAGCTGAGGAAAGAGCTACAAAAGCTGCACCAAAGGTAC CATTTCCATCTCCCACAAGAAGGGTACTTTTTTATATACAAGCAAAATGTGATGGACGAT GATAGGTCCTTCCGGTGGCACCATGTGAGCCAAGAGACCTCTCAAGTCACCTTCAATTCT ACGTATATGGCTGACTCCGAACAGTCCTCTACTGAAGACAATATTGCGGACTCTCAAGAG GAAACAAGTGAAAAACCGAAGCTTGAATTCTCAGAAGATGAGGAAACACTTATCACCAGG ATGTTTAATCTGGTTGGAGAGAGGTGGAACCTTATAGCTGGGAGGATCCCTGGAAGAACA GCAGAGGAAATTGAGAAGTACTGGAATACAAGATACTCAACCAGTGAATAA
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>LITCHI029531.m1 TTATAATATGATTAAAAGATTAACAAATAAAATTATGGCAGCCATGCTAAATCCATTTGG GAATTTGCTTTTTAACAAATAATCAGGATTAAAACGGTGCGTTTTGTCTTCTTACATACT TCGGTCCCCACTCTCTCAGTATACTCAAAATACACACCTCAAAGTTCTCTCAATTTTCAT GCAAAAATTTCAACTTCTTCTTCTTCAATGTCTGCAACAAAGATCGGATATCTAGTTCCA CTCACTAACCAATACAAAGAAGACACGTCACTCCCCAACCTCCCTCTCTCTCCCGGTCCC AACCTCATCGGCCGCCACAACATTCCCGTCTCTGATAAGCGCCTTAGCCGTAAACACCTC TCTCTCATCGCCGCCCCCGACGGCTCCGCCACTCTCCTCGTCGAAGGAACCAATCCGGTG GTTGTAAAATCCGGTGGTGAGAGGAAGAAAGTGAAATCCAAAGCACACGTGTCGATCGCT AACGGTGATATCATAGAATTGATACCTGGACACCATTTCTTCAAGTACGTGACTACTTTC TCTAGAAACAGCAGTGAAAATGAAGAGCCTAGCAGCAAGAGAATGCGAAAACATGCTGAA TGTGAAAACGGGAAGTGTGAGGAGGCGATTCGTGGTTTTCGTGTGGAGAATGATGAGATA GGTTCAACGTTCAGGTTGTTGCGGGTGCAGGGGCTGCCTGGGTGGGCAAATACTTGCAGT GTGTCTATAAGGGATGTGATTCAGGGGGATGTTCTTATTGCTGTCCTGTCGAATTACATG GTGGATATTGATTGGTTGATGCCTGCTTGTCCGGCCCTTGCAAAAGTACCACATGTGTTG GTTGTTCATGGGGAGGGCGATGGTACATTAGAACATATGAAGAGTAGGAAGCCAGCAAAT TGGATTTTGCACAAACCTCCACTTCCTATTTCATTTGGGACACACCATTCTAAGGCCATG CTTCTTGTCTATCCTCGAGGAGTGAGAATTATTGTGCATACTGCAAACTTGATTCATGTA GACTGGAACAACAAAACTCAAGGTTTATGGATGCAAGATTTCCCCTGGAAGGATCAGAAT AATCCAAGCACAGGCTGTGGATTTGAAAATGATTTAGTTGATTATCTTAGTGCACTGAAG TGGCCTGAATTCAATGTTAATTTACCAGCCCTCAGCAACTTCAAAATCAATCCATCTTTT TTCAAGAAGTTCGATTATAGCAGTGCAACGGTCCGGTTAATTGCATCAGTCCCTGGATAT CATACTGGTCCCAATTTGAAAAAGTGGGGGCATATGAAGCTACGTACTGTTCTCCAGGAG TGTACTTTCGACAATGAATTTAAGAAATCTTCTCTTATTTATCAGTTCTCCTCTCTTGGT TCCTTGGATGAGAAGTGGATGGCTGAGCTGGCATCCTCATTGTCATCAGGTTTTGCAGAT GATAAGACACCACTTGGTCTTGGTGAACCACTAATAATATGGCCTACTGTGGAAGATGTC AGATGCTCTTTGGAGGGTTATGCAGCTGGGAATGCCATCCCGAGCCCACTGAAGAATGTG GAGAAAGGATTCCTGAAAAAGTATTGGGCTAAATGGAAAGCAAGCCACACTGGCCGCTGT TGGTTCTTGCTAACTTCCGCAAATCTCAGTAAGGCTGCCTGGGGAGCACTCCAGAAGAAT AATTCTCAGTTAATGATCCGTTCTTATGAGCTGGGAGTGATATTTCTACCATCAATGAAA AGACGTGGTTGTGGCTTTTCTTGTACAAATAATGGTGGTCCATCCAAGGATCAATGTGGA TCGATAGAAAATCCTGAAGTACAGAAAACCAAGCTAGTTACCCTGACTTGGCTAGGTAGC CGGAACACAGCCGAGTCCTCTGAAGTGATTTCTCTGCCTGTGCCTTACGAACTCCCTCCT CAACGATATTCCTCTGAAGATGTTCCATGGTCTTGGGATTGTCAGTACAACCAGAAAGAT GTTTATGGTCATGTTTGGCCGCGACAAGTTCAACTACCCTTCTCCATTGAAGTGGGTTTC TTCGACACTGTCCTAGAAATCAAAGAAAAAATTCAAAAGTACCAGGGCATTCCCATACCT AAACAAACCCTAGTTTTCAATGGCCAAGTTCTCCAAGACGACCGCGACGTTGAGTACTGT GAAATCCTCCAGAACTCCCACATTCAGCTCCTGGTTGCCTCCTCGGAATCCGATAAACCC CAACTCATCAAAAACAACAACAATCTTGAACCCACCGTGCCCTCCAAGAAAATCCATCTC AAGATCAACATGCCTTCCTCCAAGACTCATACGTTGCTTGACATGGAAGTTACGGATAAT ATCCTACATTTGAAAGAAAAGATTCATGAGATGGAACCTGTCCCGGTTACAAGACTTGTA GTGCAAGCAAACGGTGTAGAATTGTGTGACCATAAATCCTTACGTGACTGTGAGCTCATG GACAATTCCGAGATTGATGTTAACATCAAGCCCTCCCCTACGACTTCAGGCACGGGTTCT ACCGGGCAAATGATGATGACAGGTTCGAAGAAGCTGAGAGTGATGGTGCTGCCTAAATGT GGGAACAAGAAGATTCCAGTGGACGTAAACGCTTCGGATAATGTAGGAGAGCTGAGGAAA GAGCTACAAAAGCTGCACCAAAGGTACCATTTCCATCTCCCACAAGAAGGGTACTTTTTT ATATACAAGCAAAATGTGATGGACGATGATAGGTCCTTCCGGTGGCACCATGTGAGCCAA GAGACCTCTCAAGTCACCTTCAATTCTACGTATATGGCTGACTCCGAACAGTCCTCTACT GAAGACAATATTGCGGACTCTCAAGAGGAAACAAGTGAAAAACCGAAGCTTGAATTCTCA GAAGATGAGGAAACACTTATCACCAGGATGTTTAATCTGGTTGGAGAGAGGTGGAACCTT ATAGCTGGGAGGATCCCTGGAAGAACAGCAGAGGAAATTGAGAAGTACTGGAATACAAGA TACTCAACCAGTGAATAAGATACACGAAAGTATCGATGGTGCTTTAACGATCAAGTACGA CGCAACTAGAAAAGAACGTGTTATGTGCTCAATTGATATTTCATTAATCCTGTTTCTGTA CAGCACTTCATGTTATTTGTGTTTTTCTATTTTTAATATCACTTATAGTGGGGGCGATAA CGTTCTTTATCACCAAGCTACATGTACTAGTGGTATGCTATTTATGTATCTGGTGTTTGG AATTCGCAGTTGTAAGAATTTCAAATCAAATGCATATTTATCTTACCACCACATGATGTT CATCTCCACCAGGAAGTTCTGTTCTGTGTACAAACACATTATTCTATGGAAGTGGGTACG AAGTTTAATTATTAAATCAATGTTTTGTCTTAAGTCATGTCCGCGATATTATTTATATAA AAATAAAAAATAAAAAAATCTGTATGGTGTAGTTATTTGTATCTGAAAGAGAATATTCAG GTGGTTCATGTTGTCCTTCTACCCGAAAACCTTGTTATTTGGAATCATTACCTGTCTTGC GGTTACTGGTAAAACAAATACACTGTTTAAC
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>LITCHI029531.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGCAATGAACTTGAACTGCAGATAAAGGGAGCTGAGAAACCCTCCATCTGGGAACTTATT GGTGTCCGTATAGTCCTCCTGCCCTACACCATTGGCAAGGTTAGAAATCCAATTTTCAGT ACAGAATAACTGCACTTTGAATGAAATCAATAACAACGTTGGTCACTGACTGATCCCTTT GTGCAGCTATTACTGTGGAATGGCCGTTGGTGCTGGCGATACAACGTGAAAAAAGCTCCA TATGCCTGGGAAGATGCTGCTTACCTAACAAAAAGATCCCTTAGAGTGCCTCTCGATTCG TGGATGAGTATTGGTAACTGAACTAAATTATTCCACCTCTAATTTCTTAAAAGAACAAAC ATAAGCTTTAATAGGCCAAAGTGAATGGAGGCTCCTAATCTGTAAATCTAGTAATAGGAT ATCTACTCATCTTTTAGACAAACACCAAATATAGCAGAACACCTTTGTTTTGATGGTTGA TATGCCATTTACTTTTGGCTTCAAGAAGGTATGTAGTGCATACCACAATGACCAAAATCT GTCCATTATAAACAATACTTGAGATTTCAACGTACTTCACATGAATTATTGTTTAACTGA AGCAATATACTGCTTGTGTTTCTGTTAGATGAGTCAACCAAGGAAGACCTTGTTCAGAGA CGTTTATGGGAGAAATCTAACTTGGAGAGCTACATGGCAGAAATGCGCAAAGAATCCAAG CGTAGAAGATAGCAGATTTTATGGGTTGCTATCACACGCTCTTGGGATTCTTTTTTGCAG AAGTTGATTACCATACCAAAAGATCATTTGCCCATGTTTTACCGAAATATTTCAACTGTG AAATTTACTTGTAATAGAAAAGACAATACTATAATTCTTGTTACCAATTTCTAAATTATC AATATGTAAACCTCCCAGAAAAAATATGATTCAAATTTATATTATATATATATATATATA TATATGTAAACCTCCAATATGCATAGTACCCGTCGAGTACAGTCTTTTAAAGCCTCGATT GGTGTGTAAGATTGAACAAGTAATGATTGAATGAGAATATAAGGAATTGGATAAATACGG TGTGTTTGATGTATTTGGAATTAGATTAGATTTAATTAAATTAATTTTTAAATAAAAATA TTTGAAATATTTTTAAATATATTTTGTGTAAATAATAAATAATAACAATATTAATTAATT AAATATTATATAATTATAGAACTATTATATATTTATAATTATAAATATATTTAATATTAT AATTATTATTTTTTATTTATTAAAAATTATTAAATAAACATTAAAAAAAATTATAAAAAA ATTCCCGCATGACCGGGATTTCTGATTACTCAGTCTCAAAGAGAAATTGTGTGAAGCCCG CTTGGCGTTGGGAAGGAAAACTTCCCTTGCCAAGCCCAAATGCTGGAATTTGTGGGATGG GTAATTTCTAGTCCCACTCCACAAAATTGCCCGTCCCCAAACGGAATTATCCTTCGACTT TGGTAGTGTTCTCAAGGACCAAAAACTTATAGGTTTTGGTTAGATTCGTTCAATGCGGTT AATGTTGGTTACTGGTTAGTTTTAATCAGCATTGACTTATAAGTTTGGTTAGTGTCAATC AGGACTGGTTGATGACATGAAACCAATGTACTACATTACCGTATTCCTAAAAAATTCAGA TTCTTTGTTATCCTTTTGTTTGTTAATCTCTTAATGACATATAATAAATATAAAAGTGGA TGATCCAGATAAAATTAATTTCTCCCTCTCATTTACTGTCCCAATTTTTGTTCTTATAAT ATGATTAAAAGATTAACAAATAAAATTATGGCAGCCATGCTAAATCCATTTGGGAATTTG CTTTTTAACAAATAATCAGGATTAAAACGGTGCGTTTTGTCTTCTTACATACTTCGGTCC CCACTCTCTCAGTATACTCAAAATACACACCTCAAAGTTCTCTCAATTTTCATGCAAAAA TTTCAACTTCTTCTTCTTCA
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>LITCHI029531.m1 GenomeSequence + TTATAATATGATTAAAAGATTAACAAATAAAATTATGGCAGCCATGCTAAATCCATTTGG GAATTTGCTTTTTAACAAATAATCAGGATTAAAACGGTGCGTTTTGTCTTCTTACATACT TCGGTCCCCACTCTCTCAGTATACTCAAAATACACACCTCAAAGTTCTCTCAATTTTCAT GCAAAAATTTCAACTTCTTCTTCTTCAATGTCTGCAACAAAGATCGGATATCTAGTTCCA CTCACTAACCAATACAAAGAAGACACGTCACTCCCCAACCTCCCTCTCTCTCCCGGTCCC AACCTCATCGGCCGCCACAACATTCCCGTCTCTGATAAGCGCCTTAGCCGTAAACACCTC TCTCTCATCGCCGCCCCCGACGGCTCCGCCACTCTCCTCGTCGTAATCACCAATCAATTC ACCAGTTCATTTAACTCAAAATTTTCTTGTAATTGCTTATTTATTTTTTATGGCTTTGAA TTGAAGGAAGGAACCAATCCGGTGGTTGTAAAATCCGGTGGTGAGAGGAAGAAAGTGAAA TCCAAAGCACACGTGTCGATCGCTAACGGTGATATCATAGAATTGATACCTGGACACCAT TTCTTCAAGTACGTGACTACTTTCTCTAGAAACAGCAGTGAAAATGAAGAGCCTAGCAGC AAGAGAATGCGAAAACATGTACGTCTTGCATGTGTATAGTTAATATGTGTTGTATGCGTA TAGTTAACAACTTGAATTTATTTGTATTGATTTATAATTAATGTATATATAGGCTGAATG TGAAAACGGGAAGTGTGAGGAGGCGATTCGTGGTTTTCGTGTGGAGAATGATGAGATAGG TTCAACGTTCAGGTTGTTGCGGGTGCAGGGGCTGCCTGGGTGGGCAAATACTTGCAGTGT 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