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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029134 | Chr9 | 21650832 | 21661263 | + | Homeobox-DDT domain protein RLT1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029134.m1 | 43 | 99 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 60.3 | 1.30E-16 |
LITCHI029134.m1 | 553 | 608 | PF02791.20 | DDT | Family | 62.9 | 2.70E-17 |
LITCHI029134.m1 | 733 | 800 | PF05066.16 | HARE-HTH | Family | 62.3 | 4.70E-17 |
LITCHI029134.m1 | 942 | 984 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 31.8 | 7.80E-08 |
LITCHI029134.m1 | 1123 | 1205 | PF15613.9 | WSD | Family | 39.7 | 5.80E-10 |
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>LITCHI029134.m1 ATGGAGGCAGATTCGGAGGCGGAGAGAAGTAATGAAAGTAAGAAGATTGTTGTTGGTAGT AACAGTAATCATCATCATCAGCCATCCAATGAAGGTGTTGGTGGTGGTGGAGGTCAACAG AGCGCCAAGCCGAAGCGCCAGATGAAGACGCCTTTTCAACTCGAAACCCTAGAGAAGGCC TATGCTTTGGAGACATACCCATCTGAGGCAACGCGGGCCGAGTTATCTGAGAAGTTAGGG TTGTCTGACCGGCAGTTGCAGATGTGGTTTTGTCACAGAAGATTGAAGGATAAGAAGGAA AAGGACAATCAACCCAAAAAGCAACGGAAAAGTGTGACTGCAGTGATGCCAGAATCTCCC ATAGATGACTTGAGGTTAGAAGCTGAACCAGGGAGTGATTACGGTTCTGGCTCAGGGTCG GGCTCAAGCCCGTACCTGATGGAGATGAGGAATGCAGCGGGGTCGTCATCTCGGGCTTTA ATGGATGATGTGCCAATTGTACGGAGGTCTTTTGAGTCGCAGCAGTCAATTATGGAGCTT AGAGCAATTGCCTGTGTGGAGGCACAGTTAGGAGAGCCATTGAGAGAGGATGGACCGATA CTTGGAATGGAGTTTGATCCCTTGCCACCTGATGCCTTTGGAGCACCAATAGCTACTGCT GAGCAGCAGAAACGGTCTGGGCATCCTTACGAGAACAAAATATATGACCGACATGATATG AAATCAAGCAAAGTCTCTTGTGCTCTCCATGAATATCAGTCTCTCCAAGAGCAGCCTTAT TTTCATGGTTCACCGGTTGATGGTCCAAGGGCTCGAACATCCTTTGTGCATGGAAATGAA TCGTCATTAAAAGTTCATTCTTCCCAAGGTCATGTGGCTCGTGTTCGTGTTTTGTCTCAA CAAGACAAGCCAGGACTCATTTTTTCATCACCTAATGGGGTTGAAGAAATTTTACAGCAT 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>LITCHI029134.m1 GenomeSequence + GAACGAACCCGACCTTCCAAAAACAAAACCAAAAGAGAAACAAAAAGAACACGCACATGA ACCCAAACCAAGTTGTGTACTAAACAATACAAAGCAAAAAAACATTTTTTTTTTTAACAT AAAAACTAACAAGAAGAACCGATTAAGAAAATTAAATAAAAAAACAACGAATAAGCCTCT CAATGGGCACATGACAAATTAAAATAAAAAAAAAAAAAATAAAAACCTCAAATTCCATAT TTTTCTTTTCCTTTCGTAAAGAAAGCCCACATAAACAAAACGCACACGCAGCACAACACA CACACACACATACAACACACATACGCAAAAAATTCCAATAAAAACAAAACCAAAATAGAC ATTAAACAAAAACATTAATTTTTTTTAAAAATGGAAATTGTTGTAATTAGAGTCAAGGAA GACTACTACTATTCTTCTGTTGTTGATTTCGCCTTTTACTATTTTCACTCAATAATAATA ATAATAATTAAAAAAACGAAAGCAAAATTTATTATCAATAGAAATAGAAATAATTTTAAT TTCAATTTTAATTTTATTCATCTCTCGTCTCAATCTCTCCTCTTATCATCACATTCATTA AATTTTCTCTCAACAATCTCCCTTTTCTTCACTTTCGTCTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAATCGAAATAAAGGTTGATTCTTTAGGTTTTGGAGGA AACCCTAGATTTTGATTGCTTGGTGATTGGAGAGAAAGAGAAGTCGTGATCTGGGTCGGG TCAGGGGGTCCGATGGAGGCAGATTCGGAGGCGGAGAGAAGTAATGAAAGTAAGAAGATT GTTGTTGGTAGTAACAGTAATCATCATCATCAGCCATCCAATGAAGGTGTTGGTGGTGGT 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