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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI029130 | Chr9 | 21590956 | 21596601 | - | Receptor-like protein kinase HSL1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI029130.m1 | 21 | 61 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 43 | 4.60E-11 |
LITCHI029130.m1 | 112 | 149 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.5 | 1.20E-07 |
LITCHI029130.m1 | 114 | 152 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 28.8 | 1.30E-06 |
LITCHI029130.m1 | 114 | 134 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.79 |
LITCHI029130.m1 | 137 | 196 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.1 | 1.90E-08 |
LITCHI029130.m1 | 138 | 158 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.4 | 2 |
LITCHI029130.m1 | 683 | 901 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 142.2 | 2.10E-41 |
LITCHI029130.m1 | 684 | 962 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 126.9 | 9.10E-37 |
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>LITCHI029130.m1 ATGGTCTTCCTTTACGTGCTCATTCTCTTCCTGTTCTCTCCACTTCCCAGTCTCTCTCTC AACCAAGAAGGCCTCTACTTGCAGCGCGTAAAGCACACACTCTCCGACCCTAACTCCGCC CTCTCTTCATGGGACAACGACCGCGACGACACCCCATGTTCGTGGTTCGGCGTCAAATGC GACCCACGTGGCCAGTCCGTGACCTCCATCGACCTCTCCAACGCCAACATTGCTGGCCCT TTCCCTTCGTTCGTTTGCCGCCTCCAGCACCTCACTTTCCTCTCCCTGTACAACAACTCC ATCAACTCCACCCTCCCCAACGACCTCGCCACGTGTCGCAATCTCGAGCACCTTGATCTT GCTCAAAATCTGCTCACTGGTACACTACCAGACAGCCTAGCAGACCTCCCCAGCTTAAAG TACCTCGACCTGACAGCAAACAACTTCTCCGGCGAGATTCCCGACAGCTTTGGCCGCTTT CAGAAGCTCGAAGTGATCTCTCTTGTCTACAATCTTCTCGACGGTACGATACCGCCATTT CTGGGGAACATTAGCTCTCTCAGGATGTTGAACTTGTCCTACAACCCGTTTTTTCCGGGT CGGATCCCGGCCGAGTTGGGTAACTTGGCTAATCTCGAGATTCTTTGGCTGACGGAGTGT AATTTAGTTGGTGAGATTCCTGACTCACTGGGTCGACTCGGGAAACTCGTTGATTTGGAC CTGGCGGTGAACAACTTGGGGGGGACTATCCCCAGCTCGCTCTCTGGGTTGACTAGTGTA GTTCAAATTGAGTTGTATAACAACTCGCTGACTGGCGAGTTGCCGACTGGGTGGTCTAAT TTGACCAAGCTGAGACTCCTTGACGCCTCGATGAACGACTTGTCGGGACCGATTCCCGAC GAGTTGACTCGGTTGCCGCTCGAAAGTCTCAACCTTTACGAGAACCGCTTCGAAGGTGAC TTGCCGGAGAGCATAGCTGACTCACCGGGTTTATACGAACTCAGACTATTCAGGAATCGA CTCACCGGTCAACTCCCCAAAAATCTCGGCAAAAAATCGCCGCTAAAATGGCTCGACGTG TCCAATAACCAATTTACCGGCGAGATACCGGAGAATTTATGCGAAAAGGGAGAGCTTGAA GAGTTGCTAATAATATACAACTCGTTTACCGGCCCAATACCGGAGAGCTTGGGCCGCTGC CAGAGCTTGACACGTGTCCGGTTGGGTTATAATCAATTGTCCGGAGAAGTGCCTCCGCTC TTCTGGGGCCTCCCTCACGTGTACTTGTTGGAGCTCATCGATAATTCGTTTTCTGGGCAA ATTGCGAAAACGATTGCAGGGGCTGCAAATTTGTCTCTTTTGATTATATCTAAGAACAAC TTCAGCGGATCATTGCCTGAAGAGATTGGTTTTTTGAAGACTTTGTTTACATTTTCTGGT AGTGAGAATAGGTTTAGTGGGCCCTTGCCTGAAAGTTTGAAGAATCTTGGCGAGTTGGGG ACTCTTGATCTTCATGATAATGAGTTGTCTGGTGAGTTACCGACTAGTGTTCGATCTTGG AAGAAGCTAAATGAGCTGAATTTGGCTAATAATGAGTTTTACGGGTCGATTCCTGATGAT ATTGGGACTTTGTCTGTGTTGAATTATCTTGATTTGTCGAATAATCGTTTATCTGGGAAG ATCCCAGTTGGGTTACAGAATTTGAAGTTGAATCGGCTCAATGTGTCAAATAATAGGCTC TCTGGGGAGCTACCGCCATTGTTTGCTAAAGATATGTATAAGAGTAGTTTTATTGGTAAT CCTGGTTTGTGTGGAGACTTGGAGGGCTTGTGTGGTGGTAGAGAGGGGGAGAAGAATAGG GGTTATGTGTGGTTGTTGAGGTCCATTTTTGTGCTTGCTGCGGTAGTGTTTGTTTTCGGT TTGGTTTGGTTTTATTTGAAGTACAGGAAGTTCAAGAATGCAAGAGCTATTGACAGGTCG AAATGGACATTGATGTCTTTCCATAAACTGGGTTTTAGTGAGTATGAGATCTTGGATGGT CTTGATGAAGATAATGTGATAGGGAGTGGAGCATCTGGGAAAGTTTATAAAGTTGTGCTT TCGAATGGAGAGGCTGTTGCAGTGAAGAAGCTATGGGGAGGAGTGAAAAAGGAGTGTGAA AGTGGTGATCTTGAGAAAGGTCAGGTCCAAGTTCAGGTTCAAGATGATGGGTTTCAAGCT GAGATTGAGACTCTGGGGAAGATTAGGCACAAGAATATTGTGAAGCTATGGTGCTGTTGT ACCACTAGAGATTGCAAGCTTTTGGTCTATGAGTACATGCCGAATGGTAGCTTGGGTGAT TTGCTTCATAGTAGCAAAGGAGGATTGTTGGATTGGCCAACAAGGTACAAGATCATTGTT GATGCAGCTGAGGGACTCTCTTATTTGCATCATGATTGTGTTCCTCCCATTGTCCACAGA GATGTTAAGTCCAACAACATCTTGTTAGATGGGGATTTTGGAGCACGCGTGGCAGATTTC GGTGTAGCCAAAGTGGTTGATGCCTCCGGAAAGCCTAAATCCATGTCCGTTATCGCCGGT TCTTGTGGTTACATCGCACCAGAGTATGCATACACATTGCGAGTGAACGAGAAGAGCGAC ATCTACAGCTTTGGTGTGGTCATTCTTGAGCTAGTAACAGGGAGGCGCCCGATTGATCCG GAGTTTGGAGAGAGAGATTTGGTCAGGTGGGTTTGTACCACTTTGGATCAGAAGGGAGTG GATCATGTAATTGATTCCAAACTTGATTCCTGTTTCAAGGAAGAGATATGCAAGGTCCTC AACATTGGCCTCCTCTGCACCAGTCCCCTCCCTATCAACCGCCCAGCAATGAGAAGGGTG GTGAAATTGTTGCAAGAAGTGGGCGCAGAAAACCAGCCCAAGCCTGCCAAAAAGGATGGC AAATTGTCACCTTACTACTATGAAGATGCCTCTGATCACGGAAGTGTTGCTTGA
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>LITCHI029130.m1 MVFLYVLILFLFSPLPSLSLNQEGLYLQRVKHTLSDPNSALSSWDNDRDDTPCSWFGVKC DPRGQSVTSIDLSNANIAGPFPSFVCRLQHLTFLSLYNNSINSTLPNDLATCRNLEHLDL AQNLLTGTLPDSLADLPSLKYLDLTANNFSGEIPDSFGRFQKLEVISLVYNLLDGTIPPF LGNISSLRMLNLSYNPFFPGRIPAELGNLANLEILWLTECNLVGEIPDSLGRLGKLVDLD LAVNNLGGTIPSSLSGLTSVVQIELYNNSLTGELPTGWSNLTKLRLLDASMNDLSGPIPD ELTRLPLESLNLYENRFEGDLPESIADSPGLYELRLFRNRLTGQLPKNLGKKSPLKWLDV SNNQFTGEIPENLCEKGELEELLIIYNSFTGPIPESLGRCQSLTRVRLGYNQLSGEVPPL FWGLPHVYLLELIDNSFSGQIAKTIAGAANLSLLIISKNNFSGSLPEEIGFLKTLFTFSG SENRFSGPLPESLKNLGELGTLDLHDNELSGELPTSVRSWKKLNELNLANNEFYGSIPDD IGTLSVLNYLDLSNNRLSGKIPVGLQNLKLNRLNVSNNRLSGELPPLFAKDMYKSSFIGN PGLCGDLEGLCGGREGEKNRGYVWLLRSIFVLAAVVFVFGLVWFYLKYRKFKNARAIDRS KWTLMSFHKLGFSEYEILDGLDEDNVIGSGASGKVYKVVLSNGEAVAVKKLWGGVKKECE SGDLEKGQVQVQVQDDGFQAEIETLGKIRHKNIVKLWCCCTTRDCKLLVYEYMPNGSLGD LLHSSKGGLLDWPTRYKIIVDAAEGLSYLHHDCVPPIVHRDVKSNNILLDGDFGARVADF GVAKVVDASGKPKSMSVIAGSCGYIAPEYAYTLRVNEKSDIYSFGVVILELVTGRRPIDP EFGERDLVRWVCTTLDQKGVDHVIDSKLDSCFKEEICKVLNIGLLCTSPLPINRPAMRRV VKLLQEVGAENQPKPAKKDGKLSPYYYEDASDHGSVA.
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>LITCHI029130.m1 TCACGGGTACTAGGAAATTCACAACAATAAAATGTCTTGATTAAAAAGAAAGAAAGAAAG AAAGAAACCAACCATGATATCCTTTGTTTTGTAATCTACAACACCACTCATACAAAAGTG CACAATTTCCAACTGTTCACTTCAAACCAAAATATCTAATCAGATAAATCGAAACTTTAT AGTTTTTACTAGTTTTATTTATTTACAGTCATGGAAAGAACCATTCAAGTCATCACCATG ATCAGACATAAGCCAGAACACAACAATGAGCTCGCATGCAGATTAACATCACTCCACTCT CTCTCTCTCTCTCCCTCTGTATATCTGATACCGTCTTCTCTTTCGAATAATACCACTTCA ACAAACACTACTGACAACACAAACACGCTCTCTCTCTCTGGCTCTCATATATTTCAAGCA CTCCCAACACTTGCCTCTCAAACACTACCATCCAACCAACAATGGTCTTCCTTTACGTGC TCATTCTCTTCCTGTTCTCTCCACTTCCCAGTCTCTCTCTCAACCAAGAAGGCCTCTACT TGCAGCGCGTAAAGCACACACTCTCCGACCCTAACTCCGCCCTCTCTTCATGGGACAACG ACCGCGACGACACCCCATGTTCGTGGTTCGGCGTCAAATGCGACCCACGTGGCCAGTCCG TGACCTCCATCGACCTCTCCAACGCCAACATTGCTGGCCCTTTCCCTTCGTTCGTTTGCC GCCTCCAGCACCTCACTTTCCTCTCCCTGTACAACAACTCCATCAACTCCACCCTCCCCA ACGACCTCGCCACGTGTCGCAATCTCGAGCACCTTGATCTTGCTCAAAATCTGCTCACTG GTACACTACCAGACAGCCTAGCAGACCTCCCCAGCTTAAAGTACCTCGACCTGACAGCAA ACAACTTCTCCGGCGAGATTCCCGACAGCTTTGGCCGCTTTCAGAAGCTCGAAGTGATCT 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>LITCHI029130.m1 - Up_Stream_Len 2000 TACAAGCAAAGTTTCAAAACCACCATGAAACCTGCCCAATAAAGCATTAGCCTAACCCAC CTCATGCCATTAAGACAAGTAGATCAACATTTACATTTCTTGTTCTTGTTTGGTAGACAA CTTTACACTATCATTGTTTACGTCTCACCTGTCTCACCCAAAAACCATACCTGATTTTTA CCATAATAATGCTTCAAGATAACGAAGAGTGTAACAACATTCAAAACAACAGCAGGGTGG TCGTAGTAGTAATTATCTCCTTTACCAAATTTCACTCTCTCTTAATTAAACGACGCCGGT CAAAATCTTTGACTGCTTTGGTCCCTCGGGAGACCTTCGTGCTTAATTCTTATAAAGACA TCATAACCATTGGTTCGTTATATAGTCCAATCTGTCACACCCTACAAAAGTATTTACGCG TGACCAGAGCAGTGATGCTGTCTTGTATAGCATTTGTGTTTGCTCGCTAAATTTTTCTTC TACCTATTATAAATTTTATCTACTTGAATATTATAATTAAATCATAATTTATTAATTTAA AATTTTCGATTTAAAGTGTATTATTATAATACGAGAGTTAGGAGATCTTCAATAGGGGCT TTCAATGTGTATTCATCATCTAAAAAAATGCGTAATCATACACCTTCTTAATATATGTGT TAAATATTATAATCGAGTTTGCATTAAAAAATATATATATATATATATATATTGTAATTG AGTTTGCCGCTTAATTTTTTTTGGTCTTGTGGTTATTTCAAAAAAAAAAAAACTTGAAAC TCATTGAGATGATTTACTCCCGGGCAATACTAGCCGTTGGATTGGGTTGTGATTGTGATC AAAGTCGTTTTAATAACCCTATGAAAAGACAGACGTCAATCTCATATTGGCCAGTTCGCT CTCCCTTGCTGCAGGTCTGATCAGGTGTGCGCACATTGGGAAAAAGCACACCCTTAAGTG GGCAACTTGGGGCTCCCGTCCAGGTTTTAACCACGTAAACTACTAATCGTACCAAAGTCG AAAATTTAATTATCGGCTTTATTTATAATTGGATTTTGTAATTAATAGATACTCATTCAG TGAAACAAATAAGTAATAAACATTTAAAATAAGAATGTAAGACTGCAAGTTGCATTTTCC TTTTTCTCAATGATTTATCCTCTTAATATTTGATCCACTTCACATGTTGTTTCACATTTC ATTTTCTTTACCATTTACACTTTTTCATCTGTCTCACAAAGCAAACGTGACCATAAGGGT GTTTTATCCCCCCAAAAAACAGATTTCAAAAAGGAGTAATCTTGTAAAAAGAACACAATA TTTATAATTCTCTATGTCAAAATAAAATTGTTAAGTAGATAGTAAAAGATTTATTTATTT AAACGTTGAATCAAATGAGTAGTTTTTTTCCTGAGACTAAAGGTCTAATGAAAATCACTA TTTGATCTGTTTGAATATTTATTTTTAACCTCAAGAAATAATTATCCATATAAAAATATA GATTTGAATCATCACTTAAATGAATAGAAACACATGTAATCACGGGTACTAGGAAATTCA CAACAATAAAATGTCTTGATTAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAACCAACCATGATATC CTTTGTTTTGTAATCTACAACACCACTCATACAAAAGTGCACAATTTCCAACTGTTCACT TCAAACCAAAATATCTAATCAGATAAATCGAAACTTTATAGTTTTTACTAGTTTTATTTA TTTACAGTCATGGAAAGAACCATTCAAGTCATCACCATGATCAGACATAAGCCAGAACAC AACAATGAGCTCGCATGCAGATTAACATCACTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGTA TATCTGATACCGTCTTCTCTTTCGAATAATACCACTTCAACAAACACTACTGACAACACA AACACGCTCTCTCTCTCTGGCTCTCATATATTTCAAGCACTCCCAACACTTGCCTCTCAA ACACTACCATCCAACCAACA
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>LITCHI029130.m1 GenomeSequence - TCACGGGTACTAGGAAATTCACAACAATAAAATGTCTTGATTAAAAAGAAAGAAAGAAAG AAAGAAACCAACCATGATATCCTTTGTTTTGTAATCTACAACACCACTCATACAAAAGTG CACAATTTCCAACTGTTCACTTCAAACCAAAATATCTAATCAGATAAATCGAAACTTTAT AGTTTTTACTAGTTTTATTTATTTACAGTCATGGAAAGAACCATTCAAGTCATCACCATG ATCAGACATAAGCCAGAACACAACAATGAGCTCGCATGCAGATTAACATCACTCCACTCT CTCTCTCTCTCTCCCTCTGTATATCTGATACCGTCTTCTCTTTCGAATAATACCACTTCA ACAAACACTACTGACAACACAAACACGCTCTCTCTCTCTGGCTCTCATATATTTCAAGCA CTCCCAACACTTGCCTCTCAAACACTACCATCCAACCAACAATGGTCTTCCTTTACGTGC TCATTCTCTTCCTGTTCTCTCCACTTCCCAGTCTCTCTCTCAACCAAGAAGGCCTCTACT TGCAGCGCGTAAAGCACACACTCTCCGACCCTAACTCCGCCCTCTCTTCATGGGACAACG ACCGCGACGACACCCCATGTTCGTGGTTCGGCGTCAAATGCGACCCACGTGGCCAGTCCG TGACCTCCATCGACCTCTCCAACGCCAACATTGCTGGCCCTTTCCCTTCGTTCGTTTGCC GCCTCCAGCACCTCACTTTCCTCTCCCTGTACAACAACTCCATCAACTCCACCCTCCCCA ACGACCTCGCCACGTGTCGCAATCTCGAGCACCTTGATCTTGCTCAAAATCTGCTCACTG GTACACTACCAGACAGCCTAGCAGACCTCCCCAGCTTAAAGTACCTCGACCTGACAGCAA 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