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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI028998Chr91990438119908158-Shaggy-related protein kinase eta

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI028998.m140324PF00069.28PkinaseDomain223.33.70E-66
LITCHI028998.m143292PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain94.75.80E-27
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>LITCHI028998.m1
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>LITCHI028998.m1
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>LITCHI030932.m1
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TGAGCTCTTCGGGTCAAATAATCAACACCAACATTTTCACAGTCAAGTTAGATTTGACAA
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>LITCHI030932.m2
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TAGACAAAGATAGCATTTGGTCAACATAAAACTTCCATTCCTTTTTCTTCCTCCAAAAAT
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TTTATTATGGGCTTGACTTTGACTACAAATTCTGATCCAGATTCATTTTTCAAACTTCTC
AACCGACAAATCCACTTGCTTTGTCTACTACCATCTACTACTACATAATAAATTACAACT
TACAAAAAGCACATGTGTGTGTGCCAGCTCTTCCCTGATAGATATATCTTATCTTCTCTC
CTTATTTCCACCAAGTTTCCTACAACTTGTTGGCTTCTCTCTATCTATATTCTACCTATC
TCTAATATTTATATATGCAATTCTTGTGATTTGGTTAGATAAGATTTGACGAGCTTGATT
GGATTCACTTGGTCAAGTTGTGACAACTTTTGCTTTGCTAGCTAGCTTTAAAGGGAAGAA
GATCTTACAAGGGAATATTGTCATCAGCAACAACTATATTAATACCAGTAGTAGCAAGCA
TTTTCTTGGCGGCTGTAGCTATGGACTCCTCTGCTTTCTCCTGGAATGATAATAATCTTA
ATACTTCTTTGGATCTTAATGCCAAGCCTCTCCTTCGTTTGAATGATCATCATATTCCTG
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TATTATATATGAATTCTATTTTGTTTCCTGTTGTTGTTTACAGAAGAAAGAGGTTGCAAC
TATTAAGATTCCTGAGTTGGTCAGGACCAAGAATTTTTCTGTCAAAGAAGAGAATGGAGC
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TATTATGTGTGAGAACTACAATGCTTTGAAAAGCCAGTTGGTGGATTACATGAACAAGAC
TAATAATAATAATAATAATAATTCCGACAATAACAACAAGGAGTCCAGGAAGAGAAAATC
CCAAAGCAGCAACAACAACAACACTATTGGAGTTATTGGAAACAATAATGTTTCTGAGAG
CAGTTCAACGGATGAAGAATCATGCAAGAAACCTGCAAGAGAAGAGACGATCAAAGCTAA
GATCTCTAGAGTTCATTTTAGAACCGAAGCATCCGATACAAGCCTTGTTGTGAAGGATGG
ATATCAATGGAGGAAATATGGACAAAAAGTTACTAGAGACAATCCTTCTCCTAGAGCGTA
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GGACCAATTGGTGTTAGTTGCGACCTATGAAGGGGAGCACAACCATCCATGCCCATCACA
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CGCGGCGCTGGCTGCCGCCATCTCTGGAAGAATGTGTCAACCAAACCAAGCTGATAAATG
GTGATCAAATTTGCCATTGTAGAAGAAAAGGGTTCAATGCAATTTGAGGTTTACTAGAGT
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CAACACCAACATTTTCACAGTCAAGTTAGATTTGACAAGTGGACTGTTTCTAATTTCTAT
GAATGAGAACTTTATAATCAACTTTGGTTCTTCCTACCTAGATTTGTATGATTCTCTGTC
ATTCTTTTGAAACCACTAATATTGACTCTATCACACAATTTTATTATTATTTTTTTCAAT
GATTTGAGGATAAAATAGTTAGAAAAATTTGTTAATCTACCATTATTAAAACCTGTTCTA
AGTAAAAACAACATTTTCAACAAACTAC
>LITCHI030932.m3
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AAATTAACTAACAAAACCGAACTCTTCCTGCTGTGATGGAGATTACAATTAGTTAATAAT
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TTTATTATGGGCTTGACTTTGACTACAAATTCTGATCCAGATTCATTTTTCAAACTTCTC
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TCTAATATTTATATATGCAATTCTTGTGATTTGGTTAGATAAGATTTGACGAGCTTGATT
GGATTCACTTGGTCAAGTTGTGACAACTTTTGCTTTGCTAGCTAGCTTTAAAGGGAAGAA
GATCTTACAAGGGAATATTGTCATCAGCAACAACTATATTAATACCAGTAGTAGCAAGCA
TTTTCTTGGCGGCTGTAGCTATGGACTCCTCTGCTTTCTCCTGGAATGATAATAATCTTA
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TATTATATATGAATTCTATTTTGTTTCCTGTTGTTGTTTACAGAAGAAAGAGGTTGCAAC
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GAACAAGACTAATAATAATAATAATAATAATTCCGACAATAACAACAAGGAGTCCAGGAA
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GAAGGATGGATATCAATGGAGGAAATATGGACAAAAAGTTACTAGAGACAATCCTTCTCC
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TACACCTGAAGTGAGGCAGTTTTTGGTGGAGCAAATGGCTTCTTCTTTGACCAAAGACCC
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TTCTCTGTCATTCTTTTGAAACCACTAATATTGACTCTATCACACAATTTTATTATTATT
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>LITCHI000197.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TGATGGCACTTCACCTGGTCTTGATATGCTTCTCAATGCCAATCACTTGCATGTTAAATT
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AAAGTAACAATCTAACTGGCAGGCACGTTTTTTGTTCCCTGAAAAATCTCTTCTCTTGAT
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ACAAGGGTGGTCCAAGAGCTGTAAGCTGAAAATTGAGATATGGAAAATAAGCTTTTATGC
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TGATCCTCTTTTCAGGTTTTTGTCTAACAATAAACTGAATGGTTCCATCGCCAACCTTGC
TGCCACGAACTTCCTCAGCTACTTGTAAGTAGAACAGGTTTACTTAATTTATATGACTAT
ATCTGCTGGCATCATCAGAGTCATTGTATCTACATAGAATTTTCTTGACATCAAATTTCA
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GGCTCCTTCATGGTTTTCAAGCTTGCAGTCTTTAACAACAATGTATGTTCCGGTTCCTGC
CCATTTCCTGCTCTCCAACAATGTAAAACACATAAACAAATAATTTGAGTCAAGATTACA
TTATCCGAACTTGTTGGATCCAATACATCTATTCCTTGAATAATTCTCATATTTTACGTT
TTATTATGACTCCTAAGGCAGTGTATTTCGTGCACTGATGCAAGCAATTCTTTGTGAAAC
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AGTTCCTTCTGTCCTGTTCTTCCGCGCCCGCAGCGGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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GGTTTTACAGAGACTGGATGCAACACAGCTTGAACATATAATTAGTTTGTTGCTTAATCA
GTCTTATTAGTTTTATTTATTTTTTTTTTTTCAACATCCCTGCAGGTTTATAGAGGAACT
CTTCCCACAGGACGGTTGATTGCCATCAAAAGATCTCAAGCAGGATCTAAGCAGGGTGGG
GTAGAATTCAAAACTGAGATTGAACTTTTATCAAGAGTCCATCACAAAAACCTCCTCATG
CAAGAGTCCATCACAAAAACCTCCTCATGCTTTTGGGATTCTGCTTTGAACTTGGCGAAC
AAATGTTGATATATGAGTAA
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>LITCHI000197.m1 GenomeSequence + 
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TTTACGGGATTTTCAGTGTAAAGAGAGTTGATTCGGCCTTTTATTGGAAATCTATCTAAT
CTCTTTTGGCTGGATCTAGCTGAGAACCAGCCACGAGGGCAGATCCCAGTTTCTGATGGC
ACTTCACCTGGTCTTGATATGCTTCTCAATGCCAATCACTTGCATGTTAAATTTATTGAG
GCTTTTAGTTATCTCTCTTACTGTGGTATTGTATTCTAGACTTCAATAGTAATCTAAGAC
TATCCATTCTCTGCAGTCGTTTGGGAAAAAATCAACACTCCGGCGAAATCCCAGAAAAGC
TTTTCAGCTCAGAGATGCATCTGCTGCATGTGTAAGTTTCGTAAAGCTTCAAGTGGACTA
AATCTTCTGATTATTTGACGTCTCTGCTGTGTAATTTAATGCAGAAAATCGTGCAATCAA
ATAGTTGACTTGTGAATTAATTTAGATACGTTGTCAATTTATATTTCTTCTCTTCTCTGT
GTCGGGCTCTTTGAAAACAACGAACTCACTGGCACATTTCCTTCCAGCATTGGAATTGCG
AAAAATTTGGAGGTCATGTAAGTACCTAAATATCATGTTCATCTGAATCTTTCAAAGTAA
CAATCTAACTGGCAGGCACGTTTTTTGTTCCCTGAAAAATCTCTTCTCTTGATCGCAGAC
GCTTTGATAGGAACTCGTTAACTGGTCCTATTCCTCAAACCCTCAGCAATCTTACAAGGG
TGGTCCAAGAGCTGTAAGCTGAAAATTGAGATATGGAAAATAAGCTTTTATGCCTGTTTT
ACGAAAAGTGATCATTATCATTAGCTAATAATTCTACAGTTATGAGTGTTTGGTGATCCT
CTTTTCAGGTTTTTGTCTAACAATAAACTGAATGGTTCCATCGCCAACCTTGCTGCCACG
AACTTCCTCAGCTACTTGTAAGTAGAACAGGTTTACTTAATTTATATGACTATATCTGCT
GGCATCATCAGAGTCATTGTATCTACATAGAATTTTCTTGACATCAAATTTCAATCTATA
ACCAAAGCATCTGTTACAGTGACTTGAGTAATAACAGTTTCAATGCATCAGCAGGCTCCT
TCATGGTTTTCAAGCTTGCAGTCTTTAACAACAATGTATGTTCCGGTTCCTGCCCATTTC
CTGCTCTCCAACAATGTAAAACACATAAACAAATAATTTGAGTCAAGATTACATTATCCG
AACTTGTTGGATCCAATACATCTATTCCTTGAATAATTCTCATATTTTACGTTTTATTAT
GACTCCTAAGGCAGTGTATTTCGTGCACTGATGCAAGCAATTCTTTGTGAAACATGAAGC
ATAATGAGTTACTGTTTTGGCAGAACTATGGAGAATACTCAACTTCAAGGTGAAGTTCCT
TCTGTCCTGTTCTTCCGCGCCCGCAGCGGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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ACTCAAAGTTTCAAAATATCAAGTGACAAAGCTGATTAGTTTCAATCTAATGTGATAAGA
ATACTTGTTTCATCTACTTATAGCATTTTATGGTTAGTGACCATTTTTCTGAAGCCAATG
ATAGTGGAGGTGGCGGCTATGGAAAGGTTTGATCCTCTCTCTCCAGCTCTCCACATTGAG
ATTCAAAAATAAAATTTTGCAACCAAATTGATGGTCAATGTCTAGCCAACATTGGTTTTA
CAGAGACTGGATGCAACACAGCTTGAACATATAATTAGTTTGTTGCTTAATCAGTCTTAT
TAGTTTTATTTATTTTTTTTTTTTCAACATCCCTGCAGGTTTATAGAGGAACTCTTCCCA
CAGGACGGTTGATTGCCATCAAAAGATCTCAAGCAGGATCTAAGCAGGGTGGGGTAGAAT
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CCATCACAAAAACCTCCTCATGCTTTTGGGATTCTGCTTTGAACTTGGCGAACAAATGTT
GATATATGAGTAAATGGTGAATGGTTCTCTGAGGGATAGTCTATCAGGTACCTCCTCCTG
TTTTCTTCACCATCTTCATTCTGCGGACGCATGTAATGACCAATATTGTAAGGCATTAAG
CAGAATGTAGTACATATCACCACGCAAACATTTCAAAAATAAAATTGAATATAGTTGGCT
AAGTAATAAGCTTCATGACGTTTTCATGTTTTACACAAATACGCTTCCCTATTAATGGAA
CAAGCAAATTATTGGGAAAATGTGAATTCTTCACTCGTGATATTGTTCATCCTCTCTGAA
AAAATACCATACTATATGCAGGGAAAAGTGGAATCAGACTTGATTCGATAAGAAGACTTA
AATTAGCACTTGGTGCATCTAGAGGCCTAGCCTATGTGCATGAGCTTGCCAATCCTCCTA
TAATACACAGAGATATAAAATCAACAAATATACTGTTGGACGAAAGGTTAAATGCAAAAG
TTGCTGATTTTGGTATCTCTAAACCAATCGGTGACAGTGAAAAGGGTCATATCAGCACTC
AAGTTAAGGGAACAATGGTGGGTAATGCCAAATATACACTTGCTCGAGCCTAAATATGAC
TCAATTTTTATCTTTTCTCCTTGTAATTAAAAGGTAGACTGAGAAAAAAATCTTACAATG
ACCATGATCATAGGACTCTTTGATTAAGAATATATGCACAAATCAATATGTACCGTATCA
GAAAATTAGCAGAAGATCTTATACCAATGTTACATGCCCTAATATTGGTTTTTTGGGTTT
AGGGTTACTTGGATCCTGATTATTACATGAGCCAACAATTAACCGAAACGAGTGATGTTT
ATAGTTTTGGGCTGCTAATGCTAGAGCTACTGACCGGAAGAAAGCCAATAGAGTGAGGAA
AGTATGTTGTAAGAGACGTAAAGATGGCAATGGATAATAAGTAAAACGACCTATACAACC
TCTCCAAAATTCTTGATCCAACCATCGATTTAGGTACAACACTAAAAGGTTTTGAGAAAT
TTGTGGATCTAGTAGTGAGATGTGTGGAAGAATCAAGAGCTGATAGGCCTACAATGAGTG
AAGTAGTGAAGGAGATTGAATATATTTTGAACCTTGCTGGTTGA