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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028965 | Chr9 | 19538239 | 19543515 | - | U-box domain-containing protein 17 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028965.m1 | 288 | 358 | PF04564.18 | U-box | Domain | 71.8 | 4.20E-20 |
LITCHI028965.m1 | 422 | 460 | PF00514.26 | Arm | Repeat | 30.8 | 2.10E-07 |
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>LITCHI028965.m1 ATGGCCACAGCGGCGATATTTTCGTCTCTGAGGAGGCGTAGATCACCATGTTTGCAGGCG TTTTTGGCTCCTGTTGACTTGACTGATGTGGCACTTGTACAGACACTTGCAGGGATCGCA TCGGAGCTTGTTGGTTTTTTTGCAAACAGAGATTTTCATTTCCAGAAGAGGAACTCTCGG TCTCTGGTGCGGAGGCTGGAGGTGTTTCTGGTGCTGTTGGAGTATTTGAGGGACTCTGGT ACGAGTCTGCCTTCAACTGCTATGTTGTGCTTCAAGGAGCTATATTTGGTTCTCTATAGG TGCAAGATACTTCTTGATTATTGCGGTCAATCCAGTAAGTTGTGGCTTTTGCTTCAAAAC CATATGCTTTCTGGGCATTTTCATGATTTGAATCAAGAAATCTCGACCCTTTTGGATGTT TTTCCTGTTAATGATGTTGAATTGAGTGAGGATGTTAGGGAGCAGATTGACCTCATGCAG AGGCAAGCCAGGAAGGCTAGGTTGTATATAGATAATAATGATGAGTCGTTGAGGGTTCAG TTGTTTTTGTTTCTCGATGAGTTTGAGAAAGGGACTGTGCCTAGTCATGTTGAATTGCGT TCATTTTTTGTGGAGAGTTTGGGGATCAAAGATGTCAGAAGTTGTAGGGCTGAAATTGAG TTTTTGGAGGAGCAGATTGTTAACCATGAGGGGGATGTTGAGCCAACAGCGTCTGTGCTT AATGGGTTTGTTGCGATCACACGATATTGCAGATTTTTGCTGTTTGGATTCGAGGAAAAT GAGGCCGAGCTGGGGATTGGCAATCTGAAGAAGCCGAGAAAAGGGTTGATTACTCAGGAG ATTGCGGAAACGTTTATATCCATTCCTAAGGATTTCTGCTGTCCTATTTCACTGGATTTG ATGCGCGATCCAGTTATAATTTCGACTGGACAGACATATGATAGGAGTTCAATAGCTAGA TGGATGGAGGAAGGGCATTGTTCTTGTCCTAAGACAGGGCAAATGCTTGCCCATACACGG CTTGTTCCCAATCGGGCTTTGAGGAATCTGATTGTGCAGTGGTGCACTGCTCACGGCGTT CCTTATGAGCCTCCAGAGACTGCAGATTCATCTGCCGAATGTTTCGCTGCAGCTTTGCCT AGTAAAGCTGCTGTTGAAGCCAATAGAGCCACAGCGGAGCTCCTCATTCAACAGCTAGCT TGTGGGTCTCAAGGTGCAAAGACTGTGGCTGCTCGTGAGATTCGTTTGTTAGCAAAAACA GGAAGAGAGAATCGGGCTTTCATTGCAAAAGCTGGTGCAATCCCCCATCTCCGTGAGCTG CTTTCATCCGATAACCCTGTTGCACAAGAAAATTCTGTTACGGCGATGCTTAATTTATCC ATTTATGATAAGAACAAAAGTCGAATCATGGAGGAGGAAGGATGTTTAGGATCCATTGTT CAAGTTCTGAGGTTCGGACTCACAACAGAAGCTAGGGAAAATGCAGCAGCGACATTGTTT AGCCTCTCTGCTGTTCATGACTATAAGAAGCGAATAGCAGATGAGAGCGGGGCTGTTGAA GCCTTAGCAGGGCTGTTGAGAGTGGGAACCCCGAGAGGGAAGAAGGATGCTGTTACTGCT TTATTTAATCTATCGACACACACAGACAATTGTCTGAAAATGATAGAGGCAGGGGCTGTT ACAGCTCTAGTTGGGGCTTTAGGAACTGAAGGGGTTGCAGAGGAAGCTGCGGGTGCATTG GCCTTGATTGTTAGGCAGTCTATGGGTGCTGCTGCAGTGGGGCAAGAGGAAATGGCGGTG TCAGGGTTGATTGGAATGATGAGATGTGGGACACCAAGGGGTAAAGAGAATGCAGTTGCG GCATTGCTTGAGTTATGTAGGAGCGGTGGCACAGCTGCAACGGAGAGAGTACTTAAGGCA CCTGCATTGGCAGGTTTGCTTCAGACGCTTTTGTTTACTGGTACAAAGCGAGCAAGAAGA AAAGCAGCATCGCTTGCTAGAGTGTTTCAGAGGTGCGAGAATACATCCTTGCATTTTGGT GGATTGGGGGTTGGATACGCATTTGCAGGCAACTCAACCGCAACTAGGGACTCAGGTTTC TCCGGTGATGTCTCAGTCTCTGTGTCCATTTCTGTGCCTGTTTTGTAA
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>LITCHI028965.m1 MATAAIFSSLRRRRSPCLQAFLAPVDLTDVALVQTLAGIASELVGFFANRDFHFQKRNSR SLVRRLEVFLVLLEYLRDSGTSLPSTAMLCFKELYLVLYRCKILLDYCGQSSKLWLLLQN HMLSGHFHDLNQEISTLLDVFPVNDVELSEDVREQIDLMQRQARKARLYIDNNDESLRVQ LFLFLDEFEKGTVPSHVELRSFFVESLGIKDVRSCRAEIEFLEEQIVNHEGDVEPTASVL NGFVAITRYCRFLLFGFEENEAELGIGNLKKPRKGLITQEIAETFISIPKDFCCPISLDL MRDPVIISTGQTYDRSSIARWMEEGHCSCPKTGQMLAHTRLVPNRALRNLIVQWCTAHGV PYEPPETADSSAECFAAALPSKAAVEANRATAELLIQQLACGSQGAKTVAAREIRLLAKT GRENRAFIAKAGAIPHLRELLSSDNPVAQENSVTAMLNLSIYDKNKSRIMEEEGCLGSIV QVLRFGLTTEARENAAATLFSLSAVHDYKKRIADESGAVEALAGLLRVGTPRGKKDAVTA LFNLSTHTDNCLKMIEAGAVTALVGALGTEGVAEEAAGALALIVRQSMGAAAVGQEEMAV SGLIGMMRCGTPRGKENAVAALLELCRSGGTAATERVLKAPALAGLLQTLLFTGTKRARR KAASLARVFQRCENTSLHFGGLGVGYAFAGNSTATRDSGFSGDVSVSVSISVPVL.
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>LITCHI028965.m1 CCACAATAATAAGAAGAGAAAGGTGTAGAAACAGTTGGGGGGATGTCTTTGGTGTTTTGG AGTTTGCATTTGGTCAACTTGCGTTTTGGACTTTTTAAGTCTGCCATTAAGCTGGCGTTT TAATAGTCAAAGTTGAAAACTTTGCTTTTGTATGCCAATGCCAGTTAGCATATACATATA TAGACATGCAAAAACATCTCCTGCGGCCGCACTCAAAAGAAGGTGACCCGGACCCCCTCT CTCCCTAAATTCCACCGCGCCATGAACTCATCTGGGCCCCCACGTCCTTTATTTTGGTCA ACCCTCTGGAGCAAATCCTATGCACGTTTGCACTTCGCACACGTTACAACACAATACAAT ACAGCCCACTTTCATTTTCTCTTCATTTTCACCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGA AAAGTAATCATCACCATAAGTCTTTGACAATATTTTCAATATACGTGTATGTGCATATAC TAGACATGTTAAATATAGTCACCTACTTTATCTTATCGCCATAGATTGTTTTGTTCTCTC TGATAATCTGGCCTCATGCTAATCTAAAGGAGAGGAAAGAGCTGAAATTTTGCAATTTCA AGACATTAAAAGCAAACCCACCTCCCCTTTTTTTTTTAGATATGGTACTTCCTTTTCGGG ATGTCTAATTTCTGATTTGTGGATATTAATTTATCGTGTTGATACAGCAAATGTTAAAAA AAAAGGTTTGAATAGAAAACCAGGACAGATGCTAATTTGAACCAAGATTTTAATTTGAGA CATACCTATTTTAAAATCCAAGGGCTTTGTGGATACAAAGCAAGATTCGTGTTTGGTTTG TTCACGAAAACAACAAGTTTAGACAGTGATTATTTAAATTAAAAATCATAGAGACCTGTA TATTTAGTGCTTGGTTATATTGTAATAAAACTGTAGGGTAGAAGAAAGAAACGAATGGAC 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>LITCHI028965.m1 - Up_Stream_Len 2000 TATGGGCATACATTAATAACCAAAAACTTAAATAACAATTTATAATTATTATTAGACAAA AATTTCGAATGCATGTCAAAGCTTACATAGAGGAAAAGAGAAAATAGGAAAAGAAAGAAA CTTTTTGTGCAGAGAGGGAAGAAAATTAAAATGTAGGTTAAAAGTATTCTGGTCAAGTAT GGCTAAAGTTGATAAAAAAGGAAAAGCTATTGAGATTTGATAAATTTAAAATTTCAATCA AGTAGAGAGTTAAAGTTAAAATTTTCATAGTATTATTTTAACAAATCAATACACAATTTT TTTATTAAATAATAAACATAACTTCTTATTCAATTTAACATTTCTTATATACTGAGTTTA CAAATCTATACACAATTTTTTTTGTTCTTAACTGATGCTTTAACATTTTTTAAAATGCTC GGTTTGCAAATGTATTATTGATCAAGCGTGTAATAATATATCGTGTTTGAAACAGTGTTC ACTGTAGGAATACAGTAAAAAAGAAAAAGAGACCACAATAATAAGAAGAGAAAGGTGTAG AAACAGTTGGGGGGATGTCTTTGGTGTTTTGGAGTTTGCATTTGGTCAACTTGCGTTTTG GACTTTTTAAGTCTGCCATTAAGCTGGCGTTTTAATAGTCAAAGTTGAAAACTTTGCTTT TGTATGCCAATGCCAGTTAGCATATACATATATAGACATGCAAAAACATCTCCTGCGGCC GCACTCAAAAGAAGGTGACCCGGACCCCCTCTCTCCCTAAATTCCACCGCGCCATGAACT CATCTGGGCCCCCACGTCCTTTATTTTGGTCAACCCTCTGGAGCAAATCCTATGCACGTT TGCACTTCGCACACGTTACAACACAATACAATACAGCCCACTTTCATTTTCTCTTCATTT TCACCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGTAATCATCACCATAAGTCTTTGAC AATATTTTCAATATACGTGTATGTGCATATACTAGACATGTTAAATATAGTCACCTACTT TATCTTATCGCCATAGATTGTTTTGTTCTCTCTGATAATCTGGCCTCATGCTAATCTAAA GGAGAGGAAAGAGCTGAAATTTTGCAATTTCAAGACATTAAAAGCAAACCCACCTCCCCT TTTTTTTTTAGATATGGTACTTCCTTTTCGGGATGTCTAATTTCTGATTTGTGGATATTA ATTTATCGTGTTGATACAGCAAATGTTAAAAAAAAAGGTTTGAATAGAAAACCAGGACAG ATGCTAATTTGAACCAAGATTTTAATTTGAGACATACCTATTTTAAAATCCAAGGGCTTT GTGGATACAAAGCAAGATTCGTGTTTGGTTTGTTCACGAAAACAACAAGTTTAGACAGTG ATTATTTAAATTAAAAATCATAGAGACCTGTATATTTAGTGCTTGGTTATATTGTAATAA AACTGTAGGGTAGAAGAAAGAAACGAATGGACAGAAATCTGGATAATTATCCATCAAAAC CGTACAAGTCATTTTCAACATAAGTGCATTGAATTTTTTAGCAGAGAGAAAGGGCAAGAG CAAAAAAAAAAAAAACCAAAACCAAACCAAACCAAACAAGGCTTGGAAATTCACTCACAT TTTCGTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTGTACGCGGATACGGCACACAAACAATCACATTAAA GAAAACAAAAAAGGAAATTCATGTTCTCATTTTAACTTAAAAAGAAACCCTTTTTGTAGA CCAACGCTTGCCTGCCTCTCTTCCTTCTTCTACCTTTGAAGATTCAAGTCACAAACAAAA AACCAAGAAAACCCAGAAACAGTAAACGTTTTCTTCAAGTCCTTGTTTTTAAGTTTCGAT TTTTATTGTTTCTTGTTATATATTTTGTGTTGTATTGCAGAGAGAAATAAAAAATCTCTA GATCTAAAAAAAGACTATTAGCTATTGCAGATTGAAGGAATTGTGGGGGGGTGTATATAT AAAAAATTGTTGAATTTTGA
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>LITCHI028965.m1 GenomeSequence - CCACAATAATAAGAAGAGAAAGGTGTAGAAACAGTTGGGGGGATGTCTTTGGTGTTTTGG AGTTTGCATTTGGTCAACTTGCGTTTTGGACTTTTTAAGTCTGCCATTAAGCTGGCGTTT TAATAGTCAAAGTTGAAAACTTTGCTTTTGTATGCCAATGCCAGTTAGCATATACATATA TAGACATGCAAAAACATCTCCTGCGGCCGCACTCAAAAGAAGGTGACCCGGACCCCCTCT CTCCCTAAATTCCACCGCGCCATGAACTCATCTGGGCCCCCACGTCCTTTATTTTGGTCA ACCCTCTGGAGCAAATCCTATGCACGTTTGCACTTCGCACACGTTACAACACAATACAAT ACAGCCCACTTTCATTTTCTCTTCATTTTCACCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGA AAAGTAATCATCACCATAAGTCTTTGACAATATTTTCAATATACGTGTATGTGCATATAC TAGACATGTTAAATATAGTCACCTACTTTATCTTATCGCCATAGATTGTTTTGTTCTCTC TGATAATCTGGCCTCATGCTAATCTAAAGGAGAGGAAAGAGCTGAAATTTTGCAATTTCA AGACATTAAAAGCAAACCCACCTCCCCTTTTTTTTTTAGATATGGTACTTCCTTTTCGGG ATGTCTAATTTCTGATTTGTGGATATTAATTTATCGTGTTGATACAGCAAATGTTAAAAA AAAAGGTTTGAATAGAAAACCAGGACAGATGCTAATTTGAACCAAGATTTTAATTTGAGA CATACCTATTTTAAAATCCAAGGGCTTTGTGGATACAAAGCAAGATTCGTGTTTGGTTTG TTCACGAAAACAACAAGTTTAGACAGTGATTATTTAAATTAAAAATCATAGAGACCTGTA 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