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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028949 | Chr9 | 19297668 | 19306579 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RFK1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028949.m1 | 295 | 312 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.2 | 1.1 |
LITCHI028949.m1 | 399 | 583 | PF11721.11 | Malectin | Domain | 142.5 | 1.40E-41 |
LITCHI028949.m1 | 627 | 693 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 40.5 | 2.20E-10 |
LITCHI028949.m1 | 628 | 695 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 45 | 8.80E-12 |
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>LITCHI028949.m1 ATGTTGTTCAAATCTCTACTGCTTGTATCAGTTCTATGTTTGGATTGGTATGGAGGGCAG TTCTTCGTTGCTGCTCAGCTTCCTCAGTCTGAAGTTGATGCACTCAACCAAATAGTGAAA ACAATGGGAGCGACTAATTGGACTTTCAATGGTAGTGCTTGTGACAATAGCAAGATAACT GTTTCTGAATCATATCCCACCACCAACATTAGTTGCACCACTCTTAACGATACACGCCAC ATTGTAGCCATAAAATTCAAGCGTTGGAGTCTATCAGGAGTGCTTCCACCTGAAGTGTTC CGGCTTCCCCATCTCCAGGAAATTGATTTTGCCTACAACTACTTAAATGGGTCAATACCA GTTGAATGGGCTTCCATGCAATTGAAGTTCATCTCTGTATTTGGAAATAGATTGTCAGGC AACATACCAAGCCATTTGGGGAATATTACCAGTCTCACATATTTGGACCTTGAGGCAAAC CAATTTTTCGGGACGGTCCCCGCTCAGCTAGGGAAGTTGGTTAATTTGGAAACACTGAGG CTATCATCCAATAACTTGACGGGAAATTTGCCAATGGAACTTGCTGAGCTGAAAAATTTA ACAGACTTTAGGATTAATGACAACAACTTCAATGGGAGTATTCCAGATTTCTTCCAAAGC TGGAAGGCACTCAAGAGACTAGAAATTCAAGGTAGTGGACTGAAAGGACCCATTCCATCA TCCATCTCTGCTTTGGAAAGCCTAGAACAATTGAGGATCAGTGACATAAGTGGAACAAAT GAGGCCTTTCCTAACATCGAAAACTTGACAGCTGTTAGCCGGATAATTTTAAGGAATTGT AGTATTTCTGGAGAGATACCTCCTTATATCTGGGGAATTAATAGTCTGCGAATTCTGGAT CTCAGTTTTAACAACCTAACTGGGGAAATTCCCAATATCCAGTTCTCTGGGAATTTGAAA TTCATCTTTCTAACTGGCAACTCTCTCAGTGGGACTATACCAGAATCCATCTTGAGGAAG GGAACTAATGTGGATCTTTCATACAATAATTTTAGCTGGCCAAGCTCTGAGCAGCCTGCT TGTCGGGAAGCACCGAATCTAAACCTGAACTTGTTCCGAAGTGCACTAGTGAAAAATAAC TTGAGTGGAGTTCTTCCATGCCAGAACAATTTCAAATGTGATCAATATCAGCATTCCTTT CATATTAATTGCGGTGGACAAGAGATAAAAGTAAATGGCAGCACATTTGAAGCAGATAAT GAAGTTGGTGGTGGTGCTGCAACCTACCATTTAAATGAGGGATATGGAAAGTGGGGATTT AGTAGCACTGGAGACTTTACAGATGATGATGATGAACAGAACACAAATTATATTCCAAAT TCAGATTCATCACCCATTTCTGACTTATACAAAAATGCACGCATTGCTCCTCTTTCACTT ACTTATTTCGGATATTGTTTACAAAATGGAGATTATCTAGTGACTCTACACTTTGCAGAG ATTCTTTTTACAAATGATAACACCTTTTACAGTCTTGGAAGACGTATATTTGATATTTAT ATTCAGGACAAATTAGTTGCGAAGGATTTCAATGTAAAGGATGAAGCTTCAGGGGCTCTT AAGCCTGTTTCGAAACCATATAATGTCACTGTTGAGAATAACATCTTAGAGATACGTTTC AACTGGGCCGGGAAAGGAACTACAACAATTCCTAGAAAGGCAGTCTATGGCCCCCTTGTA TCAGCTATTTCTGTGGTGGATCCTAACTTCAAACCTGGAAAGAAGAATGTTGCATCTATT GTTGTTGGTGTTGTTGCAGGATTCTGCATCATAGTCTTGGTTCTGGGCATCCTCTACTGG AAATACTATGGTCAACTAAGCGATGGGACCGTAATTGCTGTGAAGCAGCTTTCATCAAAA TCAAAGCAGGGAAATCGTGAATTCTTGAATGAGATAGGAATGATTTCATGTTTGCAACAT CCAAATCTCGTGAAACTGTATGGCTGTTGTATTGAAGGGGATCAGCTATTGCTGGTTTAT GAATACATGGAAAACAACAGTCTTGCCCGAGCGTTGTTTGGTAAGTTGAATCTAGCCTGT CATGTACAACAAAATGGAAAACTGAAGGAACTAGTGGATCCAATGTTGGGATCAGAATAC AAGGAGGAGGAAACAGAAAGGATGATTAAGGTATCTCTCCTATGCACCAATGCTTCACCA TCACTAAGGCCAACCATGTCTGAAGTGGTTGCCATGCTGGAAGGAGCAACTAAAATACCA GATGCCATACCTGAAGCAGGTAGTTATAATCAAGACTTGAGGTTCAAAGCTATAAGAGAC CAACGTCGTTTGATGCACAATCAGAGCTTGTTAGGAAGTCAGGCCAGTCAATCAACATTA GCCGGCGCCTCTACTTCTGATCAAGACCTCTATGAAGTTAATGAAGAGTCATATTTGAGG TATAAAGCCATGAGAGACGGTTATGGACAGATTGATAATGAGAGTTCAATGTCAGAGCTC CAACTTTCGACCTCAATCCCTTCTTGGACCGGCTCGTCAACATCTGCTCGTGATCTTTAT AGCAACAATTTGAGTTCCAAGTAA
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>LITCHI028949.m1 MLFKSLLLVSVLCLDWYGGQFFVAAQLPQSEVDALNQIVKTMGATNWTFNGSACDNSKIT VSESYPTTNISCTTLNDTRHIVAIKFKRWSLSGVLPPEVFRLPHLQEIDFAYNYLNGSIP VEWASMQLKFISVFGNRLSGNIPSHLGNITSLTYLDLEANQFFGTVPAQLGKLVNLETLR LSSNNLTGNLPMELAELKNLTDFRINDNNFNGSIPDFFQSWKALKRLEIQGSGLKGPIPS SISALESLEQLRISDISGTNEAFPNIENLTAVSRIILRNCSISGEIPPYIWGINSLRILD LSFNNLTGEIPNIQFSGNLKFIFLTGNSLSGTIPESILRKGTNVDLSYNNFSWPSSEQPA CREAPNLNLNLFRSALVKNNLSGVLPCQNNFKCDQYQHSFHINCGGQEIKVNGSTFEADN EVGGGAATYHLNEGYGKWGFSSTGDFTDDDDEQNTNYIPNSDSSPISDLYKNARIAPLSL TYFGYCLQNGDYLVTLHFAEILFTNDNTFYSLGRRIFDIYIQDKLVAKDFNVKDEASGAL KPVSKPYNVTVENNILEIRFNWAGKGTTTIPRKAVYGPLVSAISVVDPNFKPGKKNVASI VVGVVAGFCIIVLVLGILYWKYYGQLSDGTVIAVKQLSSKSKQGNREFLNEIGMISCLQH PNLVKLYGCCIEGDQLLLVYEYMENNSLARALFGKLNLACHVQQNGKLKELVDPMLGSEY KEEETERMIKVSLLCTNASPSLRPTMSEVVAMLEGATKIPDAIPEAGSYNQDLRFKAIRD QRRLMHNQSLLGSQASQSTLAGASTSDQDLYEVNEESYLRYKAMRDGYGQIDNESSMSEL QLSTSIPSWTGSSTSARDLYSNNLSSK.
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>LITCHI028949.m1 GCTTTTTGTAAGTCTTACTAGCAGCCATCAGCGAATTGTCAACTGTGAAAACTACAAACT ATGAATAACAACCTTACAAGTTAAAATAATCATAATTAGGCAATCGATTGAGTTGACATG ATCCAATTCACTCTAGATTAAGTAGCGATCCAGATTAGTTAGACACTCATTTACGCTTCA TTGTATCCACGTGCTTTTGACTTGGTATCTTCAGCCCTGCATAACATTCAATCTTCCTGC ATGCTTTACTCTCTAAAAACATTAGAACTAACATATTGAATTTCAAGTAGCCTTTTTAGT TTTCTGTTTTCTCAATTCCGGGGTATTCGCAGATGTTGTTCAAATCTCTACTGCTTGTAT CAGTTCTATGTTTGGATTGGTATGGAGGGCAGTTCTTCGTTGCTGCTCAGCTTCCTCAGT CTGAAGTTGATGCACTCAACCAAATAGTGAAAACAATGGGAGCGACTAATTGGACTTTCA ATGGTAGTGCTTGTGACAATAGCAAGATAACTGTTTCTGAATCATATCCCACCACCAACA TTAGTTGCACCACTCTTAACGATACACGCCACATTGTAGCCATAAAATTCAAGCGTTGGA GTCTATCAGGAGTGCTTCCACCTGAAGTGTTCCGGCTTCCCCATCTCCAGGAAATTGATT TTGCCTACAACTACTTAAATGGGTCAATACCAGTTGAATGGGCTTCCATGCAATTGAAGT TCATCTCTGTATTTGGAAATAGATTGTCAGGCAACATACCAAGCCATTTGGGGAATATTA CCAGTCTCACATATTTGGACCTTGAGGCAAACCAATTTTTCGGGACGGTCCCCGCTCAGC TAGGGAAGTTGGTTAATTTGGAAACACTGAGGCTATCATCCAATAACTTGACGGGAAATT TGCCAATGGAACTTGCTGAGCTGAAAAATTTAACAGACTTTAGGATTAATGACAACAACT TCAATGGGAGTATTCCAGATTTCTTCCAAAGCTGGAAGGCACTCAAGAGACTAGAAATTC AAGGTAGTGGACTGAAAGGACCCATTCCATCATCCATCTCTGCTTTGGAAAGCCTAGAAC AATTGAGGATCAGTGACATAAGTGGAACAAATGAGGCCTTTCCTAACATCGAAAACTTGA CAGCTGTTAGCCGGATAATTTTAAGGAATTGTAGTATTTCTGGAGAGATACCTCCTTATA TCTGGGGAATTAATAGTCTGCGAATTCTGGATCTCAGTTTTAACAACCTAACTGGGGAAA TTCCCAATATCCAGTTCTCTGGGAATTTGAAATTCATCTTTCTAACTGGCAACTCTCTCA GTGGGACTATACCAGAATCCATCTTGAGGAAGGGAACTAATGTGGATCTTTCATACAATA ATTTTAGCTGGCCAAGCTCTGAGCAGCCTGCTTGTCGGGAAGCACCGAATCTAAACCTGA ACTTGTTCCGAAGTGCACTAGTGAAAAATAACTTGAGTGGAGTTCTTCCATGCCAGAACA ATTTCAAATGTGATCAATATCAGCATTCCTTTCATATTAATTGCGGTGGACAAGAGATAA AAGTAAATGGCAGCACATTTGAAGCAGATAATGAAGTTGGTGGTGGTGCTGCAACCTACC ATTTAAATGAGGGATATGGAAAGTGGGGATTTAGTAGCACTGGAGACTTTACAGATGATG ATGATGAACAGAACACAAATTATATTCCAAATTCAGATTCATCACCCATTTCTGACTTAT ACAAAAATGCACGCATTGCTCCTCTTTCACTTACTTATTTCGGATATTGTTTACAAAATG GAGATTATCTAGTGACTCTACACTTTGCAGAGATTCTTTTTACAAATGATAACACCTTTT ACAGTCTTGGAAGACGTATATTTGATATTTATATTCAGGACAAATTAGTTGCGAAGGATT TCAATGTAAAGGATGAAGCTTCAGGGGCTCTTAAGCCTGTTTCGAAACCATATAATGTCA CTGTTGAGAATAACATCTTAGAGATACGTTTCAACTGGGCCGGGAAAGGAACTACAACAA TTCCTAGAAAGGCAGTCTATGGCCCCCTTGTATCAGCTATTTCTGTGGTGGATCCTAACT TCAAACCTGGAAAGAAGAATGTTGCATCTATTGTTGTTGGTGTTGTTGCAGGATTCTGCA TCATAGTCTTGGTTCTGGGCATCCTCTACTGGAAATACTATGGTCAACTAAGCGATGGGA CCGTAATTGCTGTGAAGCAGCTTTCATCAAAATCAAAGCAGGGAAATCGTGAATTCTTGA ATGAGATAGGAATGATTTCATGTTTGCAACATCCAAATCTCGTGAAACTGTATGGCTGTT GTATTGAAGGGGATCAGCTATTGCTGGTTTATGAATACATGGAAAACAACAGTCTTGCCC GAGCGTTGTTTGGTAAGTTGAATCTAGCCTGTCATGTACAACAAAATGGAAAACTGAAGG AACTAGTGGATCCAATGTTGGGATCAGAATACAAGGAGGAGGAAACAGAAAGGATGATTA AGGTATCTCTCCTATGCACCAATGCTTCACCATCACTAAGGCCAACCATGTCTGAAGTGG TTGCCATGCTGGAAGGAGCAACTAAAATACCAGATGCCATACCTGAAGCAGGTAGTTATA ATCAAGACTTGAGGTTCAAAGCTATAAGAGACCAACGTCGTTTGATGCACAATCAGAGCT TGTTAGGAAGTCAGGCCAGTCAATCAACATTAGCCGGCGCCTCTACTTCTGATCAAGACC TCTATGAAGTTAATGAAGAGTCATATTTGAGGTATAAAGCCATGAGAGACGGTTATGGAC AGATTGATAATGAGAGTTCAATGTCAGAGCTCCAACTTTCGACCTCAATCCCTTCTTGGA CCGGCTCGTCAACATCTGCTCGTGATCTTTATAGCAACAATTTGAGTTCCAAGTAACATA TAAGGGATTTTCTCCGTGTATAATTTTCTATGAGAGTGAGGAAATTGTTAGGAATATAGA AGTTGACTTGGATGAAAAGATAGCATACATGATATCGACATACAGATAATGTGTTAATAA CTTGAATTTTTATCTAAATTCTTAAGAGCCAATACTTGAAAGGGAGATGCGTGTGTCTAT GTGTGATTATATCAAATAAATAAAATTTGAGGAGATATATCCTTTCATAATATGAAGTGT ATTAAATCTACTTCTATAACAATAGTAGATATTTATATTTATGTATGAGAGAAAATTCAA TTGGGACAGGTGGAAATCTACATTCTATGACATTAAGTGACATATACTTCAAAATCTGTC ATAACC
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>LITCHI028949.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTTTGAAAGAATATTTTTTTTCTTTTACTAATAAAAGTTAAAAATAAAAATTTTCTCAA ATGAACCATTTATCATCCGGGTAAACCATTTGAGAGTTTTTCCTTGTAAGTTAAGAGGTA TCTTTAAAACATTGGATAATCTTAAAATTAATATTGAATGGATGTAATTGCTCACAGATA ACTATTCATTACTGGATATTTCTTGGGGCTTCATTAATTGATTAATTAAACTCATTTCGA CCAAATGGCCTGATTTTATTTGTCAAAGCTATTTCAAGGCTCTTTATCAAAACCCGTGAA GTTTGAAATACTACTACCGACAGCTGTAAAGTCTGTGTTTCCAATTTCCAAACAATATCC CTTTTTTTTTTTTTTTTAATACAAAAACTATATCCAAAACGAATTTAAAGAACTATCGAA ACCAATTAAGGTAGAACATTAATAACATCATTTAAAAAACTAACTCTAATTAAAAAGATT CATCCACATAAAAATAGAAAGAGATCCATATAAAGATGGAAGATCAATCTACATAAACAA TAGAAGATCTATTATTATTATTATTATAAATATTATAAGTATTATTATTATATTATATAT AATATATATATATATATATATATATATATACATCTGAATTTTTACAGGATAGGATATCGA ATTCATGTCTCTTACAAAGGGAGACATGGGAGTTACTGGCGCCAACCTACAGGGTTAGCA ATCAATGACAAATGGTATCTTTTTCTGATCCTTAATTAGAGAAGCTTTTTAATACACTAA ACAAACTTCAGTTTGCTTTTATTGTTATTATTATCAATTAATTTTCAGAAAAAATTTAAA ACTATTTAGAAAAAGCTATTTCCGAACATTTATAAAATTTTAAATTGCTAAAACACCTTT ACATAAAAAATCGTCTTATATACATTTAATTTGTACTTATAACATTCATGTATTTTGTAA GCATGTGTCTACCGATCAAAAATTTCTCTTACATGTATCTTTTTCCTCGATTTATTAATT TGAAAAACATTTTATCATTCTAAGTTTTGAAATTTCCAATTGCTACAGTAGATATGACCA AACACAAAACAATAAAGAAAATTTGTTTGTAACTTTCCTTTTAAAAGTATACTTCATAAA AAGAAATCCAAGATATTCTCAAAATAATAATAATAATAATAATAAATAGCTTGCTTATAA GTGATGCAGTTGGCACCACTCTCCCTCTCTTTGCACACGTTCGAACATTACTTCCCACTT GTGTGTGGGTTTACGTTTGTGGTAATTGTTTCATTTGTGTGAGTCTTTTTTTTTTCAGTT TATGAGAGTTTTGTTCGTAGTTATGTCTTAAAATATACATCAAAAAGTTCTGACTGTGAT ATTTATACTTGTAATATGTATTATATTAATAATAAAAATAGAGTGATATTAAACTTTTTA AATATTTTACTTAAAATCATAATCAAATGATATGATATATAAATTGTCAAAATCTTATTA ATTATCATACTGTCTTATAAATTATAAGATTTTAACAACTTATATATCACATCATTTGAG TGTAATTTAGATAAAATATTTAAAAAACCTAACATTACTAATAATAATAATAATAAATCT AAGATTAATTGTTCCAAACACAGGCTTACTTGTCACAAACACAGGCTTGCTTTTTGTAAG TCTTACTAGCAGCCATCAGCGAATTGTCAACTGTGAAAACTACAAACTATGAATAACAAC CTTACAAGTTAAAATAATCATAATTAGGCAATCGATTGAGTTGACATGATCCAATTCACT CTAGATTAAGTAGCGATCCAGATTAGTTAGACACTCATTTACGCTTCATTGTATCCACGT GCTTTTGACTTGGTATCTTCAGCCCTGCATAACATTCAATCTTCCTGCATGCTTTACTCT CTAAAAACATTAGAACTAACATATTGAATTTCAAGTAGCCTTTTTAGTTTTCTGTTTTCT CAATTCCGGGGTATTCGCAG
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>LITCHI028949.m1 GenomeSequence - GCTTTTTGTAAGTCTTACTAGCAGCCATCAGCGAATTGTCAACTGTGAAAACTACAAACT ATGAATAACAACCTTACAAGTTAAAATAATCATAATTAGGCAATCGATTGAGTTGACATG ATCCAATTCACTCTAGATTAAGTAGCGATCCAGATTAGTTAGACACTCATTTACGCTTCA TTGTATCCACGTGCTTTTGACTTGGTATCTTCAGCCCTGCATAACATTCAATCTTCCTGC ATGCTTTACTCTCTAAAAACATTAGAACTAACATATTGAATTTCAAGTAGCCTTTTTAGT TTTCTGTTTTCTCAATTCCGGGGTATTCGCAGATGTTGTTCAAATCTCTACTGCTTGTAT CAGTTCTATGTTTGGATTGGTATGGAGGGCAGTTCTTCGTTGCTGCTCAGCTTCCTCAGT CTGAAGGTACATGTATATTTGACTGATCATTTGTTTCTTTCCTCTGTTGTTAACTTATTG TTTTTGTTTGCTTTGTTTTTTATTCTCAATTTGTCATTCTTTGTTGATTTTAATTCATCA GAAAAAACTTCTCTTTATCTTTTGCTATACTTTGTTTTTACCATACTTTGTTTTTACCAA TAATAATCTATCTAGTAGCTAGCAACCAGGAGGAGCCTGGAAATGATTATATTATCTTCA TTATTTTAAATTATGTTCATTCTAATAAATTTAAAAAATATGAAAAATGAAAACGGATTA TTGTATGGGCCTCATTTACATCAGAACTTATGCTTAGGCCCAGTAAATTGACAAATGTGG TCATTTCATGTGGAGTTGTTCATGCTTTTTACTAAATGCACTCTCCATGCAAATTTCAAA ATTCATCAATTATGTTCAATTTCTACTACTTAAAGATACTCCAATTTTATGAAGGACTCT 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