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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028945 | Chr9 | 19256996 | 19267242 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RFK1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028945.m1 | 402 | 584 | PF11721.11 | Malectin | Domain | 131.8 | 2.60E-38 |
LITCHI028945.m1 | 658 | 925 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 169.9 | 7.40E-50 |
LITCHI028945.m1 | 660 | 927 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 171.7 | 1.90E-50 |
LITCHI028945.m2 | 402 | 584 | PF11721.11 | Malectin | Domain | 132.6 | 1.60E-38 |
LITCHI028945.m2 | 658 | 742 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 62.6 | 3.90E-17 |
LITCHI028945.m2 | 660 | 742 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.8 | 1.30E-16 |
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>LITCHI028945.m1 ATGTTCGTCTCCTTCAAATCTTTGCTTGTTTTATCGCTTCTGTCTTTGACTTGCTTTGGT ACACAGTTTCTGGTTGCTGCTGAGCTTCCTCAATCTGAAGTTGATGCACTCAATCAAATT GCCAAAACAATGGGAGCTACTAAGTGGACTTTTGATGCCAATGCTTGTCAAGTTAGGAAG ATACCAGTTTTCCAAACAGATCCCACCGCCAACATTACTTGCACCACTGTCAATAGTACA AGCCACGTTATAGCCATAAAATTCAAGCGTTGGAGTCTTCCAGGAGTGCTTCCACCTGAG CTGGTCCACCTGCCCTACCTCGAGGAAATTGATTTTTCCTACAACTACTTATATGGGTCA ATACCGGTTGAATGGACTTCTACTCGGTTGAAGTTCCTCGCTGTTTTTGCAAACAGATTA TCAGGCAACATACCACTGCATTTGGGGAAAATCACCAGTCTCACATATTTGGACCTTGAA GCAAACCAATTTTCTGGGACGGTCCCTGCACAGCTTGGGAAGTTAGTCAACTTGAAAACA CTGAGGCTGTCATCTAATAGGTTGAGTGGGAATTTGCCAAAGGAACTCACTGAGCTGAAA AATTTAACAGACTTTAGGATTAATGACAACAACTTCAATGGGAGCATTCCAGATTTTATT CAGAGCTGGAAGGAACTCAAGAGACTAGAAATTCAAGGTAGTGGACTAGAAGGACCTATT CCGTCATCAATCTCTGTTTTGAAAAACCTTGCTCAATTGAGGATTAGTGACATAAGTGGA AAAAGTCAGGCCTTTCCTGAGCTTTCAAATATGACGGTCCTTAGACGGATAATTTTAAGG AACTGTAGTATCTCCGGAGAGATACCTCTGTATATATGGGGAATAGATAATCTGCGACTC ATGGATCTCAGTTTTAACAACCTAATTGGGGAACTTCCCAATGTCCCACTCCCTGGGAGT 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>LITCHI028945.m1 MFVSFKSLLVLSLLSLTCFGTQFLVAAELPQSEVDALNQIAKTMGATKWTFDANACQVRK IPVFQTDPTANITCTTVNSTSHVIAIKFKRWSLPGVLPPELVHLPYLEEIDFSYNYLYGS IPVEWTSTRLKFLAVFANRLSGNIPLHLGKITSLTYLDLEANQFSGTVPAQLGKLVNLKT LRLSSNRLSGNLPKELTELKNLTDFRINDNNFNGSIPDFIQSWKELKRLEIQGSGLEGPI PSSISVLKNLAQLRISDISGKSQAFPELSNMTVLRRIILRNCSISGEIPLYIWGIDNLRL MDLSFNNLIGELPNVPLPGSLRFIFLNDNSLSGTIPESILKKGTNVDLSYNKFTRPSFEQ PACREMPNLNLNLFRSSTAGSNLGRVLQCQNNLKCTQYWHSFYINCGGDNVKVNGSTFEG DAGIGGGSATYHLHNGANWGFSSTGDFLDDDDEQNTRYIAVSNSSRMSELYTNARIAPVS LTYFGYCLKNGNYLVTLHFAEIYITKDSTYSSLGIRIFDIYVQGKLIKKDFNIEAEASGV LKPVSKVYNVSVDNNILEIRFHWAGRGTMTVPIKGAYGPLVSAISVVDPNFKPRKKNIAP NVAGVVTGSCIVILVLGILYWRYYCRTKSRKQTDLEGLDLQTSLFTLKQIKAATNDFDSQ NKIGEGGFGPVYKGLLSDGTIIAVKQLSSKSKQGNREFLNEIGMISCLQHPNLVKLYGCC IEEDQLLLVYEYMENNNLARALFGRGQSQLKLDWPIRQKICLGIAKGLAFLHEESRFKIV HRDIKATNVLLDRDLNAKISDFGLAKLDEEEKTHISTRIAGTIGYMAPEYALWGHLTHKA DVYSFGIVALEIVSGKSNTSYVANDNCICLLDWACHLHQNGKLMEIVDVKLESEFDKEEA ERMLKISLVCTNASPSQRPTMSEVVGMLEGTTNIPDIIHQPGNYSQDIRFKSIREHRGSM HSQSSVGSQVFDPSSVGSQACCPSSVGNSHSFSSTSGQELCEVNEESYLRFKAIRDSHEQ KKT. >LITCHI028945.m2 MFVSFKSLLVLSLLSLTCFGTQFLVAAELPQSEVDALNQIAKTMGATKWTFDANACQVRK IPVFQTDPTANITCTTVNSTSHVIAIKFKRWSLPGVLPPELVHLPYLEEIDFSYNYLYGS IPVEWTSTRLKFLAVFANRLSGNIPLHLGKITSLTYLDLEANQFSGTVPAQLGKLVNLKT LRLSSNRLSGNLPKELTELKNLTDFRINDNNFNGSIPDFIQSWKELKRLEIQGSGLEGPI PSSISVLKNLAQLRISDISGKSQAFPELSNMTVLRRIILRNCSISGEIPLYIWGIDNLRL MDLSFNNLIGELPNVPLPGSLRFIFLNDNSLSGTIPESILKKGTNVDLSYNKFTRPSFEQ PACREMPNLNLNLFRSSTAGSNLGRVLQCQNNLKCTQYWHSFYINCGGDNVKVNGSTFEG DAGIGGGSATYHLHNGANWGFSSTGDFLDDDDEQNTRYIAVSNSSRMSELYTNARIAPVS LTYFGYCLKNGNYLVTLHFAEIYITKDSTYSSLGIRIFDIYVQGKLIKKDFNIEAEASGV LKPVSKVYNVSVDNNILEIRFHWAGRGTMTVPIKGAYGPLVSAISVVDPNFKPRKKNIAP NVAGVVTGSCIVILVLGILYWRYYCRTKSRKQTDLEGLDLQTSLFTLKQIKAATNDFDSQ NKIGEGGFGPVYKGLLSDGTIIAVKQLSSKSKQGNREFLNEIGMISCLQHPNLVKLYGCC IEEDQLLLVYEYMENNNLARALFGKFSLVKSCD.
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>LITCHI028945.m1 TGCAACTTGTGGGAACTCTAGAGCCCCACTTCACTTCTCTAGGGTCCAGCTTCTACTTTC TATAGACTCACAACCAAGTTGGCTTGGCTGTCTTGTTTATTTGGGTTGATCGGCTACCAT TTTTTATTCTGGGTTCTTGAAGATGTTCGTCTCCTTCAAATCTTTGCTTGTTTTATCGCT TCTGTCTTTGACTTGCTTTGGTACACAGTTTCTGGTTGCTGCTGAGCTTCCTCAATCTGA AGTTGATGCACTCAATCAAATTGCCAAAACAATGGGAGCTACTAAGTGGACTTTTGATGC CAATGCTTGTCAAGTTAGGAAGATACCAGTTTTCCAAACAGATCCCACCGCCAACATTAC TTGCACCACTGTCAATAGTACAAGCCACGTTATAGCCATAAAATTCAAGCGTTGGAGTCT TCCAGGAGTGCTTCCACCTGAGCTGGTCCACCTGCCCTACCTCGAGGAAATTGATTTTTC CTACAACTACTTATATGGGTCAATACCGGTTGAATGGACTTCTACTCGGTTGAAGTTCCT CGCTGTTTTTGCAAACAGATTATCAGGCAACATACCACTGCATTTGGGGAAAATCACCAG TCTCACATATTTGGACCTTGAAGCAAACCAATTTTCTGGGACGGTCCCTGCACAGCTTGG GAAGTTAGTCAACTTGAAAACACTGAGGCTGTCATCTAATAGGTTGAGTGGGAATTTGCC AAAGGAACTCACTGAGCTGAAAAATTTAACAGACTTTAGGATTAATGACAACAACTTCAA TGGGAGCATTCCAGATTTTATTCAGAGCTGGAAGGAACTCAAGAGACTAGAAATTCAAGG TAGTGGACTAGAAGGACCTATTCCGTCATCAATCTCTGTTTTGAAAAACCTTGCTCAATT GAGGATTAGTGACATAAGTGGAAAAAGTCAGGCCTTTCCTGAGCTTTCAAATATGACGGT 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