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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028660 | Chr9 | 15571295 | 15576981 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g20940 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028660.m1 | 22 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 36.1 | 6.40E-09 |
LITCHI028660.m1 | 143 | 201 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.7 | 5.70E-09 |
LITCHI028660.m1 | 191 | 211 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.9 | 1.4 |
LITCHI028660.m1 | 291 | 307 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.4 | 2.1 |
LITCHI028660.m1 | 291 | 305 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.3 | 1.4 |
LITCHI028660.m1 | 360 | 376 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 11.6 | 0.27 |
LITCHI028660.m1 | 406 | 465 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 37.8 | 1.30E-09 |
LITCHI028660.m1 | 453 | 467 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 8.8 | 2.1 |
LITCHI028660.m1 | 478 | 537 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.7 | 1.10E-07 |
LITCHI028660.m1 | 502 | 561 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.5 | 1.80E-10 |
LITCHI028660.m1 | 782 | 982 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 99.2 | 2.50E-28 |
LITCHI028660.m1 | 782 | 981 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 89.4 | 2.70E-25 |
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>LITCHI028660.m1 ATGAAGCTGTTTAGGCTTTTGGTGTTGTCTCTATTAGTGTTTTCTGTTGTGGGGCAGCTG CCTTCTCAGGACATTTTAGCTTTGCTTGAATTCAAGAAAGGAATCAAGAATGACCCCACT GGTTATGTACTTGATTCATGGAATGAGGAATCCATAGACTTTAATGGCTGCCCTTCTTCT TGGAATGGAATTTTTTGTAATGGTGGGAATGTTGCTGGTGTTGTTCTTGATAACTTAGGT CTATCTGCTGTTGCAGATTTGAGTGTGTTTTCGAATCTTACAATGCTTGTGAAACTGTCT ATGTTGAACAACTCCATTTCGGGCACCATACCTGACAATATAGGTGACTTTAAAAGCCTT GAGTTTCTTGATGTCTCGGATAATCTGTTTTCTTCGACATTACCACCCGGAATTGGTAAA TTAGAGAACTTGCGAAACCTCTCATTGGCTGGGAACAACTTCTCGGGCCCGATTCCGGAT TCAGTGTCAGGATTTGTTTCAATCCAGTCATTGGACTTAAGCCGCAATTCCTTTTCTGGG TCACTGCCGGCATCATGGACTAGGCTGAATAACTTGAGGTATCTAAACCTATCTTCCAAT GGGTTTATCAAGAGTATCCCAAGAGGGTTTGAGCTGATTTTAGGTCTTAAGGTGCTTGAC TTGCATGGTAACTTGTTTGAGGGGCATCTTGATGGGGAATTTTTCCTTCTGACAAATGCC AGTTATATTGATTTTAGTGGTAATATGTTGGTGAGCTCTAGTTCAGGGAAATTGCTACCT GGTATCTCTGAGAGTGTCAAGTATCTAAATCTTAGCCGCAACCAGCTTACTGGGTCATTG GTGAATGGAGGTGCGCTGAAGCTCTTTGAAAACTTGAAGGTATTGGATCTGAGCTACAAT CAGTTGTCTGGAGAACTGCCTCAATTCAACTTTGTTTACGACCTTCAGGTCCTTAAACTC AGCAACAACCGATTTTCAGGGTTTATCCCTAATGATCTGTTGAAAGGAGATTCTTTGCTT TTAACTGAACTGGATTTAAGTGCCAACAATCTGTCAGGGTCAGTAAGTATAATTCTATCG ACGACACTTCACACGCTAAATCTCTCTTCCAATCAACTCACCGGTGAACTTCCTTTGCTG ACTGGTAGCTGTGCTGTGCTTGATCTTTCAAATAACCAATTTGAAGGAAACTTGACCAGA ATGGGGAAGTGGGGTAACATTGAATATCTTGATCTTAGCCAAAACCGTTTGACAGGGTCC TTCCCTGATGTAACACCACAATTGTTGCGTTTAAATTATCTCAATCTCTCCCGCAATTCA CTTAGGAGTTCTTTGCCCAAAGTTATCATCCATTATCCAAAGCTCAAAGTCCTTGATCTC AGTTCCAACCACTTAGATGGATCTTTTCTAAATGATCTGCTTAACTCGTCCACATTGCAA GAAATTCACCTTGGGGATAATTTATTCACTGGTGCTATTGAATTCTCTCCCCCCAGTGAA TCGACTCTTCAGGTCCTTGATCTTTCTCATAACCGGCTTAATGGCTATTTTCCTGATCGA CTTGGATCGTTGACAGGACTTCAAGTGCTCAATCTTGCAGGAAATAATATATCCGGTTCT CTTCCGACTTCTATGGCTAATGTGAGCTCTTTAAGGTCGTTAGATATATCCCAGAATCAT TTTGCTGGTCCTTTGCCTGACAACTTGCCTAACAGTCTGGAATACTTTAATGTTTCATAC AATGATTTTTCTGGAGTTGTTCCTGAAAATCTGAGGAAGTATCCTAGTTCTTCTTTTTAT CCTGGAAATGCCAGATTACGCTTTCTTGGTGGTCCTCCTGGATCAGACAATTTTCCTAAT GGTAGTTCCAAGAAGAAACCAATCAATAGTCTTGTAAAAGTCATTGTGATAGTTTCGTGT GTACTTGCTGTTATCATCCTTATTCTGCTTGCTATCTTTGTGCACTACATTCGTCTATCG AGGAGACTGCCTGCAGAACATGGAGCAGAAAAAAATATTCGCAGATATGCTCAAACAAAC CAGTCTGGCACAACTGGAACGGTCAGTGGCGGTCCTTTGGTTGTTTCAGCTGAGGATCTT GTGGCTTCGAAGAAAGGATCATCATCTGAGATTATAAGTCCTGACGAGAAAATGGCAGCA GTAACTGGCTTCTCACCATCAAAGAACAGTAATTTGTCTTGGTCACCAGAGTCTGGGGAT TCATTTACAGCTGAAAACATTGCAAGATTGGATGTGAGATCACCAGATCGATTGGTTGGT GAACTATATTTTCTCGATGATACGATCAGTTTGACACCTGAGGAGTTATCAAAGGCCCCA GCTGAAGTATTAGGGAGGAGCAGTCATGGGACTTCTTACAAGGCAACACTGGAGAATGGA GTGTTCTTGACTGTGAAGTGGTTGAGAGAAGGGGTGGCAAAGCAGAGAAAAGAGTTTGCT AAGGAGGCTAAAAAATTTGCAAATATCAGGCATCCAAATGTTGTGGGTTTGAGAGGATAT TATTGGGGGCCAACACAGCATGAGAAGCTCATTCTTTCAGATTATATCTCACCTGGAAGT CTTGCAAGCTTTCTTTATGATCGACCAGGAAGAAAGGGTCCCCCGATGTCATGGGCCCAG AGACTCAAAATAGCGGTTGATGTTGCACGTGGCCTGAACTATCTCCATTTTGATCGTGCT GTTCCACATGGCAATCTAAAAGCATCTAATGTTCTATTAGATGGGCCTGATCTTAATGCC CGTGTTGCTGATTACTGCCTCCATCGTCTCATGACCCAAGCTGGAACCATTGAACAGATT CTTGATGCTGGGGTCTTGGGTTATCGGGCACCAGAACTGGCTGCTTCCAAGAAACCACAT CCCTCCTTTAAGTCAGATGTTTATGCATTTGGTGTGATACTATTGGAACTTCTAACTGGT AGGTGTGCAGGTGATGTGATCTCTGTTGAAGGAGGGGTTGATTTGACAGATTGGATGCGA ACGAAGGTGGCAGAAGGTCATGCCTCGGATTGCTTCGATGCTGCATTGACTGCTGAGATG GGGAATCCAGCTGCTGAAAAGGGAATGAAGGAGGTCCTTGGAATCGCTTTAAGATGCATA CGGTCTGTCTCTGAAAGGCCAGGTATCAAGACTATATATGAAGATCTATCATCCATATAG
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>LITCHI028660.m1 CAAATAACGAAAACAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAGCCCTAACATTTTCCCGCTATCTT TTGTCTTATACTGACACCAATCCCTCAAAAGAATGCACAACTACAACAACTTTTTATTTT TACTTTTTCTTTTTCATATTTTAATTAACTTGTCCAAATGCTCTTTCTTTTGAGTCTTCA CATGCTTTTCTGATACAGAGAAAAAAGACAAAACCCATTTCTTGTTGTTATTGCTATTAG AGTGCAATTAGGGTTTTTGTCATGTTTAATGTAGCTAAAATGTACTCTTCTTGGGGTTTT ATTTTTACAGCCAGAGAATTTCTGGGGTCCCTGTCATTTATTACATTCCAGTTGTGCCAC TTAACACTCATAGAACACACCCATATCTTCTCCTTCAGTTGGTTTGTTTGATATTTCAAA ACCGCCTTTTGAAGCCAAACTATAACCACCCATGTGTGTTTTCGTTGCAAAACCTCTTGT GCTTTGAAAAGTTTTAGTCTTTTGTAGTGTCACCTACTAGTGAGCTTACATTGTTGATGA AAAATGAGATCTTATTAAGAAATTACTGTTTTTGGAAGCTGAATCTGTGCTTTCATGTTC TAGACTAGTCTATCATCATGATTGTGTACATGATCAGGTATTATATTTTTCAGTTGGCAC ACACATTTTCCTGTTTCTAGACTAAATGTGTATCTGTTAGTTACTTTTAATGCTTTGAAT GTGCATTATGTTTTTGTAGTTGTACTGTAAAAATGGTTGCAACTTAGTTTAATGTGTTGA ATCTGAGGTAAAGTTGCTGTTGGAGATAAAGTTATTATCATATATGGGGTTGGATATAGT CAGGGGCAGTGGTGTTGACATTTAGGTTGGGTTGAAGGCAGTGTGTGTGTGTTGGGTAAG TATGAAGCTGTTTAGGCTTTTGGTGTTGTCTCTATTAGTGTTTTCTGTTGTGGGGCAGCT GCCTTCTCAGGACATTTTAGCTTTGCTTGAATTCAAGAAAGGAATCAAGAATGACCCCAC TGGTTATGTACTTGATTCATGGAATGAGGAATCCATAGACTTTAATGGCTGCCCTTCTTC TTGGAATGGAATTTTTTGTAATGGTGGGAATGTTGCTGGTGTTGTTCTTGATAACTTAGG TCTATCTGCTGTTGCAGATTTGAGTGTGTTTTCGAATCTTACAATGCTTGTGAAACTGTC TATGTTGAACAACTCCATTTCGGGCACCATACCTGACAATATAGGTGACTTTAAAAGCCT TGAGTTTCTTGATGTCTCGGATAATCTGTTTTCTTCGACATTACCACCCGGAATTGGTAA ATTAGAGAACTTGCGAAACCTCTCATTGGCTGGGAACAACTTCTCGGGCCCGATTCCGGA TTCAGTGTCAGGATTTGTTTCAATCCAGTCATTGGACTTAAGCCGCAATTCCTTTTCTGG GTCACTGCCGGCATCATGGACTAGGCTGAATAACTTGAGGTATCTAAACCTATCTTCCAA TGGGTTTATCAAGAGTATCCCAAGAGGGTTTGAGCTGATTTTAGGTCTTAAGGTGCTTGA CTTGCATGGTAACTTGTTTGAGGGGCATCTTGATGGGGAATTTTTCCTTCTGACAAATGC CAGTTATATTGATTTTAGTGGTAATATGTTGGTGAGCTCTAGTTCAGGGAAATTGCTACC TGGTATCTCTGAGAGTGTCAAGTATCTAAATCTTAGCCGCAACCAGCTTACTGGGTCATT GGTGAATGGAGGTGCGCTGAAGCTCTTTGAAAACTTGAAGGTATTGGATCTGAGCTACAA TCAGTTGTCTGGAGAACTGCCTCAATTCAACTTTGTTTACGACCTTCAGGTCCTTAAACT CAGCAACAACCGATTTTCAGGGTTTATCCCTAATGATCTGTTGAAAGGAGATTCTTTGCT TTTAACTGAACTGGATTTAAGTGCCAACAATCTGTCAGGGTCAGTAAGTATAATTCTATC GACGACACTTCACACGCTAAATCTCTCTTCCAATCAACTCACCGGTGAACTTCCTTTGCT GACTGGTAGCTGTGCTGTGCTTGATCTTTCAAATAACCAATTTGAAGGAAACTTGACCAG AATGGGGAAGTGGGGTAACATTGAATATCTTGATCTTAGCCAAAACCGTTTGACAGGGTC CTTCCCTGATGTAACACCACAATTGTTGCGTTTAAATTATCTCAATCTCTCCCGCAATTC ACTTAGGAGTTCTTTGCCCAAAGTTATCATCCATTATCCAAAGCTCAAAGTCCTTGATCT CAGTTCCAACCACTTAGATGGATCTTTTCTAAATGATCTGCTTAACTCGTCCACATTGCA AGAAATTCACCTTGGGGATAATTTATTCACTGGTGCTATTGAATTCTCTCCCCCCAGTGA ATCGACTCTTCAGGTCCTTGATCTTTCTCATAACCGGCTTAATGGCTATTTTCCTGATCG ACTTGGATCGTTGACAGGACTTCAAGTGCTCAATCTTGCAGGAAATAATATATCCGGTTC TCTTCCGACTTCTATGGCTAATGTGAGCTCTTTAAGGTCGTTAGATATATCCCAGAATCA TTTTGCTGGTCCTTTGCCTGACAACTTGCCTAACAGTCTGGAATACTTTAATGTTTCATA CAATGATTTTTCTGGAGTTGTTCCTGAAAATCTGAGGAAGTATCCTAGTTCTTCTTTTTA TCCTGGAAATGCCAGATTACGCTTTCTTGGTGGTCCTCCTGGATCAGACAATTTTCCTAA TGGTAGTTCCAAGAAGAAACCAATCAATAGTCTTGTAAAAGTCATTGTGATAGTTTCGTG TGTACTTGCTGTTATCATCCTTATTCTGCTTGCTATCTTTGTGCACTACATTCGTCTATC GAGGAGACTGCCTGCAGAACATGGAGCAGAAAAAAATATTCGCAGATATGCTCAAACAAA CCAGTCTGGCACAACTGGAACGGTCAGTGGCGGTCCTTTGGTTGTTTCAGCTGAGGATCT TGTGGCTTCGAAGAAAGGATCATCATCTGAGATTATAAGTCCTGACGAGAAAATGGCAGC AGTAACTGGCTTCTCACCATCAAAGAACAGTAATTTGTCTTGGTCACCAGAGTCTGGGGA TTCATTTACAGCTGAAAACATTGCAAGATTGGATGTGAGATCACCAGATCGATTGGTTGG TGAACTATATTTTCTCGATGATACGATCAGTTTGACACCTGAGGAGTTATCAAAGGCCCC AGCTGAAGTATTAGGGAGGAGCAGTCATGGGACTTCTTACAAGGCAACACTGGAGAATGG AGTGTTCTTGACTGTGAAGTGGTTGAGAGAAGGGGTGGCAAAGCAGAGAAAAGAGTTTGC TAAGGAGGCTAAAAAATTTGCAAATATCAGGCATCCAAATGTTGTGGGTTTGAGAGGATA TTATTGGGGGCCAACACAGCATGAGAAGCTCATTCTTTCAGATTATATCTCACCTGGAAG TCTTGCAAGCTTTCTTTATGATCGACCAGGAAGAAAGGGTCCCCCGATGTCATGGGCCCA GAGACTCAAAATAGCGGTTGATGTTGCACGTGGCCTGAACTATCTCCATTTTGATCGTGC TGTTCCACATGGCAATCTAAAAGCATCTAATGTTCTATTAGATGGGCCTGATCTTAATGC CCGTGTTGCTGATTACTGCCTCCATCGTCTCATGACCCAAGCTGGAACCATTGAACAGAT TCTTGATGCTGGGGTCTTGGGTTATCGGGCACCAGAACTGGCTGCTTCCAAGAAACCACA TCCCTCCTTTAAGTCAGATGTTTATGCATTTGGTGTGATACTATTGGAACTTCTAACTGG TAGGTGTGCAGGTGATGTGATCTCTGTTGAAGGAGGGGTTGATTTGACAGATTGGATGCG AACGAAGGTGGCAGAAGGTCATGCCTCGGATTGCTTCGATGCTGCATTGACTGCTGAGAT GGGGAATCCAGCTGCTGAAAAGGGAATGAAGGAGGTCCTTGGAATCGCTTTAAGATGCAT ACGGTCTGTCTCTGAAAGGCCAGGTATCAAGACTATATATGAAGATCTATCATCCATATA GTTTTGATTGAATCTGGTTTATCTGGGACTTGGAATTCATGGGAACTTAATATCTCATTG GTTCCCTATTTTGAATATGTAAGTTTGGCATTTTAGTGCCATCAGCCGGCTCTATTAACA ACATTTTGTTGTAAAAATGGAGCATATTTTGAATGGATAGGAAATTTCGCTAAGTTATGA TATGACAACCCATTTTCGAAGACTTTTTACCTTCCAATGGCAGGTAATATGGTTTGGGAA AATACTCTCATGCGCCTACAGAACCACTTGCCTTCATTGAACTACTTTACTCTTGCTCCA ACTTCTCAGTAATATACGCAACAGGATCTTGTTTGAGATACAAATTATTATAAATTATAT TTGGGA
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>LITCHI011901.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCGTCAACAATTTTCAACATCATCAACCCATAATTCATCATCATCAACTCATAATTCATC AATATCATCAATCCAATTTATCAACATCATTATCTCCCACAACAACATCATCAACAATGT CAAAACATTAAAACATGAACAAAAAAATAAAAAGACAAAAAAGAAAAAATCATAATAGAG GATTCTGATTGAACCCAGAATCAGATAGTTCTAGGTTCATTGATGAACTCAGAATACATT TGTGTTCTAGGTTCATCAATCTAAGTTCAACGAACCCAGAAAGCTAGAACCCATTGTTCA CAATCATAAAAAAAAAAAAAAATGAAGGTCAGATGAAGAAAAAGAATTGGGATATGAGAT GAGAAAGAGACAGTTTGTGGAGAGAGACAAAGACGATGAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAA TCCTATGAACTTGAGATATGGCAAAGACATTATTCAGCTTGGGATTTCATTTCCCAAGTT GAGTGGGAATGGAGATGAGCCAGCGAATGAAACATTCATTCCCTTCCCTGCCTCAAACAT GAGCCAAACATGGAATGTGGGAGGATGGAAAAAAATAAATCTCAATGTCATCCTATTTTC CATGCACCAAACATTGTCATTCAGACATAGACAAGCAAATTAATTTTGTTGCCTATAATT GATAACTAGATAACTAAATATTGTCACTCATCATGCTTGGATGTGTCATCATTAAAAATC ATAGCGACGTGTTATACAACTAAAAAAACTTATTATATATATTTTTAAGTTATTAAGACT AGTTCAGTAAACAATCGGAACTATGCTGGTAGGACATTGATGCCATAGCTCGGATAAGTG GCTCCTATATGACTAAAAGCCTTCTACATTTGGATGAGAGATAATTCATATACATAAGAG AAAATCTCACAATTTTATTTAAAAACAAAGTGCACAATTTTGAACCCATGACTTGTCATA GGAAGGGGAGCAGTTTTTATCCCTCAACTGACTTCCTTTGTGTGAAAAATCTTATCATAT TGAGATGTCAAACATCGACCTTTTAATTAGTTCATTAGAGCATACATTAAAATTTTGAAA ATTCGGCACATACGTACTAAAAACTACATCAAATCTTACAAAATCCTTCGCATTTTTTAT TTTGCTTTTTACGACATAAAGATTAATAACCATTAAAAGAAACACACACACACACACACA ATCTTTTGTTGAAAGCCAATTGTTCATCTCTTGCTCTATTCCCAAATTTCTCCACCATTG TTAACAAAAAAAAAAACTCAATCAAAACCACAATTGCATAAATGGATTTGGGTTTACCTG ACACAACAGCTTTGGGTATTTCTAACATTCGATTTTTGTCCTTTATTATTATTATTGTTA TTGAATTTCCAATGATTATTTTGAGAAAAATAATCATTTGTGGTGTACTTTCAATTTTTT TTTTCAAGTGTACTTTTTTTTTTGGAAGGATTTTTCAAGTGTACTTACAAATAACGTTTA ATCGAGTGTAAATGCATATCGTTCGGCCAATTCTTCAGAAATTGGGTCTGTCCTTACAAA AGCCACGGCCCATTGCAAACCCTAATACAAAGCCCAGCACAACAACAGCCCACCGCCTTC CCATGGACCCCACACTTCTCTCATGGTCCCCATCTGCAAGTCTCCCGTGTGACTGAGTCA TTTCTCCAAACCAAAACCAAATTTATTATTATTTTTTTAAATCCAAACACTTTTTTTAAT TTAAAAAAAAAAAATAAAACATCTAATAGAAAAACAAATTCCAAAAAAAAAAAAAAACTC GACACAGAGAAAGGGAGAGAGAGGAAGAGACCAAAAACAAAAACAGAGACGAAGAAGAAG AAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATACACAACATCTTCCAATTCCTCTCCAACAAATACATCA CATTTTCAAATATTTTTTTTTTTCAATATATACTTTTTATAAAATTTTTAATTTCGATTA CAATTTTTTATTTTTAAAAA
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>LITCHI011901.m1 GenomeSequence + TCCCCATCTGCAAGTCTCCCGTGTGACTGAGTCATTTCTCCAAACCAAAACCAAATTTAT TATTATTTTTTTAAATCCAAACACTTTTTTTAATTTAAAAAAAAAAAATAAAACATCTAA TAGAAAAACAAATTCCAAAAAAAAAAAAAAACTCGACACAGAGAAAGGGAGAGAGAGGAA GAGACCAAAAACAAAAACAGAGACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATACAC AACATCTTCCAATTCCTCTCCAACAAATACATCACATTTTCAAATATTTTTTTTTTTCAA TATATACTTTTTATAAAATTTTTAATTTCGATTACAATTTTTTATTTTTAAAAAATGTCT CTGAACATGAAAACCCTCACTCAAGCCCTAGCTAAGACGGCCGCAGTGATCGAGAAGACG GTTCAAACCACCGTCCAGGAGGTGACGGGGCCACGGGCTCTGCAGGACTACGACCTGCTC GACCAGATCGGTTCGGCCGGTCCCGGTCTTGCCTGGAAACTCCACTCCGCGAGGGCGCGT GACGGCACGCGCCAAGGCCAGCAGTATCCAGTGGTCTGCATCTGGCTGCTCGACAAGAAG GCGCTGTCGGAGGCGCGTGCGCGTGCGGGTCTGTCGAAGGCGGCGGAGGACGCGTTCCTC GATTTGGTGCGTGCGGACGCAGGGAGGCTGGTGCGGCTGCGGCATCCTGGAGTCGTCCAC GTGGTGCAGGCGCTGGATGAGAACAAGAACGCGATGGCGATGGTCACAGAGCCGCTCTTC GCGTCTGTGGCCAACGCGCTGGGGAACCATGAGAACATCTCGAAAGTGCCGAAGGAGTTG AGAGGATTGGTATGTATGTTTGTGAGAGCTGCATTTTCGATCGTTTCGATTTCAATATCC 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