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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI028472Chr91265320012660430-Protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 14

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI028472.m1105328PF00856.31SETFamily76.33.80E-21
LITCHI028472.m1410469PF09273.14Rubis-subs-bindDomain22.70.00014
LITCHI028472.m2105328PF00856.31SETFamily76.92.50E-21
LITCHI028472.m3105328PF00856.31SETFamily77.51.60E-21
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>LITCHI028472.m1
ATGGCCATCATCTCTGTCCCTCTTCATCAGCTCTCTCACGCCCTCTTTTCCAATTCCCAG
TTGCAGTACAGCGTCCACCATGGATGGTCAACTAGACCACCACCCAGTTCTACATTCAGC
AGTAACAACAGCCTGAACAAAATCACACCCATCAAAGGTTTGGTGGAGACTTCGTCTTTT
CCTCTCTTTCAAACCCCCGAAGTTGAAGACTCACCAGCCGATGGATTGGAGCCAGCAGAT
CCTGATTTCTACAAGATAGGTTACGCTCGAAGTATGAGAGCGTATGGAGTTGAATTCAAG
GAAGGCCCTGATGGATTTGGAGTGTATGCTACCCGAGATGTCGAGCCACGTCGTCGTGCT
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ATTCATTTGAATTCTTTCTTATCAGTCTTCAATATATCTGGTCTTCCTGAAGAATATTAC
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GCTAGAACACTGCCCACATGGTCAGACGAGGATGTACCTCTGATCCCAAGTGTGGAAAAG
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GCAATCAAGTATCGCTTGCACCGCAAGTTATTCATTGAGAAGGTCATCAAGGCATTGGAC
ATTTATCAAGACCGGATACTGTTTTGA
>LITCHI028472.m2
ATGGCCATCATCTCTGTCCCTCTTCATCAGCTCTCTCACGCCCTCTTTTCCAATTCCCAG
TTGCAGTACAGCGTCCACCATGGATGGTCAACTAGACCACCACCCAGTTCTACATTCAGC
AGTAACAACAGCCTGAACAAAATCACACCCATCAAAGGTTTGGTGGAGACTTCGTCTTTT
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CCCCTTAAAATAAAGCGTCTTGCTTGTGATCCTGAGAGATTTATCTGGGCAGTGAGTATT
GCACAGTCACGGTGTATTAACATGCAAGTTAGGATTGGCGCACTTGTACAAGATTCAAAT
ATGCTGATCCCTTATGCTGACATGCTTAACCATTCATTCCAACCAAATTGTTTTTTCCAC
TGGCGTTTTAAGGATCGCATGCTCGAGGTGATGATAAACGCTGGACAAAGAGTTAAAAAG
GGAGAAGAGATGACTGTCAATTACATGAATGGACAGATGAACAACATGCTTATGCAAAGA
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ATTCATTTGAATTCTTTCTTATCAGTCTTCAATATATCTGGTCTTCCTGAAGAATATTAC
CACAACAGTATGTGTTTGAATTTTCTTGATTTTTGTTTTCATATAAGCTATATACAGCAT
AATCCAGAGATTCTACTTTTAGCATCAATATCCAATATATGA
>LITCHI028472.m3
ATGGCCATCATCTCTGTCCCTCTTCATCAGCTCTCTCACGCCCTCTTTTCCAATTCCCAG
TTGCAGTACAGCGTCCACCATGGATGGTCAACTAGACCACCACCCAGTTCTACATTCAGC
AGTAACAACAGCCTGAACAAAATCACACCCATCAAAGGTTTGGTGGAGACTTCGTCTTTT
CCTCTCTTTCAAACCCCCGAAGTTGAAGACTCACCAGCCGATGGATTGGAGCCAGCAGAT
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GAAGGCCCTGATGGATTTGGAGTGTATGCTACCCGAGATGTCGAGCCACGTCGTCGTGCT
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ATGTTTTTCCCTGACATAATACCAATAGGCCATCCAATATTTGATATTATTAACTCAACC
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CCCCTTAAAATAAAGCGTCTTGCTTGTGATCCTGAGAGATTTATCTGGGCAGTGAGTATT
GCACAGTCACGGTGTATTAACATGCAAGTTAGGATTGGCGCACTTGTACAAGATTCAAAT
ATGCTGATCCCTTATGCTGACATGCTTAACCATTCATTCCAACCAAATTGTTTTTTCCAC
TGGCGTTTTAAGGATCGCATGCTCGAGGTGATGATAAACGCTGGACAAAGAGTTAAAAAG
GGAGAAGAGATGACTGTCAATTACATGAATGGACAGATGAACAACATGCTTATGCAAAGA
TATGGCTTCTCCTCACCAGTGGTATTTGCTCTTTACTTCACCTAG
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>LITCHI008918.m1
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ELLAAEGTVVERNLRVSTAHSNSNSNSPPFSPTLENESPTSALDSPMKSKLNDVPMSSTS
EKKEYPIDPSLPDIKNSIYSTDEFRMYSFKVRPCSRAYSHDWTECPFVHPGENARRRDPR
KFHYSCVPCPDFRKGACRRGDMCEYAHGVFECWLHPAQYRTRLCKDGTNCARRVCFFAHT
PDELRPLYVSTGSAVPSPRSGTSGANAMDFAAALSLLPGSPSSVSVMSPSPFTPPMSPSA
NGMSHSNVPWPQPNVPALHLPGSNLQSSRLRSSLHARDIPAEDYNLLPDFDVQQQQQQQL
LNELSSLSQPSLSSNSLNRSGRLKTLAPSNLDDLFSAESSSPRYSDQALASAVFSPTHKS
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LAQREKQQQFRSLSSRELGSNSAAAAVGSSVNSWSKWGSSNGKPDWAVTTDELGKLRRSS
SFELGNGEEPDLSWVQSLVKESPTEVKEKVATPASGVTAVPSSSEGSNMNPQIDSVDHAV
LGAWIEQMKLDQLVAQQN.
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>LITCHI008918.m1
CTCCTTCAAGTCCGCTCCAGTTAGGACTACCGCACTTGAAGAGACCGGACCCTCTTATTG
GCGGACGCTAGTCCCTCTTTTAAATCCACTTTAATCTCTCACTTGCTGCCTCCTCCGGTT
ACCTCTCTCCACTCGCTTACTTACCTAACCGGTTATTCTTCCTACCTTTCCACCTCCCCA
GCCCGTTCCCGATAACTTCTCCAACCAATCACCACAACCCACGTGCCCACCTCTCGTTGC
CCATATAGGTGGATTCGTACGTCTTTCCAGACACTTCCGAGGGCATTTTGGAAACTAAAA
TTCCGTGATAGTGGACTAGCGGTAACATTATCCAATAAACAAATGCCAGGTGAGTCTGCA
GTAGCATTTAATTAATGAAACCAGATAACACCGGATTGGTCCCCCTCTCAAAATTTAACT
TTCATGTAAGACGAATTTGGGTTGAATTTCCATGAAATTTGACTATGTTTAAATTATTAC
ACGCCCGAGTAATGTTGTCGTTTCCGGTTCCACACCACTTATCTTACCACCGACCAATAC
CGACCTTCCACGTCACCAAAACCAACAATAGAGCATGCCGTGGCGGGATGTGACTGGTGG
CGTAAAAAAGCAAATGAATAATATCAAATCATGCACAATAACTCTCAGTGCGTCCGTCTT
TAATAATTTCTCTCTCTCTCTACTCTATTGGATAGGCGATTTTATCAAAAAACAAAAAAG
GAAAAAAATACCCCACCAAAATAAAAAATTTAAAAAAATAAAAGATTGCATTTCATGTTA
ATTAAATTATTATTTATTTAATTTATTTTTCTGGGTTCTCATGAAACTGAAAGAAAAAGC
AGAGAGCTTAGTAGTTGGAGAGATGATTGAAGAAGAAGCTCTCTATCTCTCTCTTTCTCT
GTCTATCTCTTGAAGTAGATCTGTGACAGTGAAACAATCTCTCAAATGGGTTTTTATGGT
TCTGGTTTCTTCTCTGTTTCCTAGCTGCTAGTTTTTAAGCAAATGAAAGCATGTGCTGTG
GACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCTTTTGACGAAA
GTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGATACTTTTGCAA
GCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCAATTGAGTGTG
ATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGCTCGAAGCAGA
TGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGTATTGATATCA
TTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGCAATGACAAGA
GTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGATGTTGTGAAGT
TGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCATCACCCTGTGG
ATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAAGAACTTCTTG
CTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCACTCTAATTCTA
ATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACATCAGCTTTGG
ATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCGGAGAAGAAAG
AGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCTACTGATGAAT
TCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCATGATTGGACTG
AGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGAAAGTTTCATT
ACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGAGATATGTGTG
AATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGAACTCGGCTTT
GCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACTCCTGATGAAC
TTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCAGGTACCTCTG
GTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCTCCTTCATCAG
TTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCCAATGGCATGT
CGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTTCCTGGAAGCA
ATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCTGCTGAAGACT
ACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTGTTAAATGAGT
TATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCTGGTAGGTTGA
AAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCATCTCCCCGGT
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ATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGTTTTTCACCTA
AGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCAGGGAGGATGT
CTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTGTTAGCTCAAC
GTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCCAACTCTGCTG
CTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCCAATGGGAAGC
CAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCCTCATTCGAGC
TTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAAGAATCACCAA
CTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTCCCTTCTTCAA
GTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTTTTGGGAGCGT
GGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGAAATGAGTTTCACT
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GTGATGGTGTGGATGTGGAAGATTAACAACAGAAACAGCAATGGGAAAGGCAATGCAAGA
AGTCAGTTAGTCTATTGGAAAGGGAAAATTCATTTTCACCATTTATTATTACAACAGAAG
TTAGAAAAAGGGTGAGTAAAACAACAACCTCTGGGTTTTGTAGCAAAAAGACTAGAGCCC
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CCTTTATTATTTTTTTAATCTCATGTGCTACCACTCACTTATTCCATTTCCCTAATCTTC
CCTCTTATCTCAACGGTATTGGTTTTAGCTAGTTGTGGATTCTTGGGATGGCAAACTTGT
GCTTTCATGGATTCCAAATCCCATGAGTGGGATTTTGTGCGTGAAATGTGGATGTGAGAA
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TATTCTACCTTTAGAGAATGATTAAACTTTATGTTAATGGTATATTATTGTTCTCGTTGT
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>LITCHI008918.m1 +  Up_Stream_Len 2000
CATTAAACTAAAATGGAACCTCTCCTTCAAGTCCGCTCCAGTTAGGACTACCGCACTTGA
AGAGACCGGACCCTCTTATTGGCGGACGCTAGTCCCTCTTTTAAATCCACTTTAATCTCT
CACTTGCTGCCTCCTCCGGTTACCTCTCTCCACTCGCTTACTTACCTAACCGGTTATTCT
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TGACTATGTTTAAATTATTACACGCCCGAGTAATGTTGTCGTTTCCGGTTCCACACCACT
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GTGGCGGGATGTGACTGGTGGCGTAAAAAAGCAAATGAATAATATCAAATCATGCACAAT
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TTTTATCAAAAAACAAAAAAGGAAAAAAATACCCCACCAAAATAAAAAATTTAAAAAAAT
AAAAGATTGCATTTCATGTTAATTAAATTATTATTTATTTAATTTATTTTTCTGGGTTCT
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TCTCAAATGGGTTTTTATGGTTCTGGTTTCTTCTCTGTTTCCTAGCTGGTAAGTTCGTCT
CTTCTTCTTCTTGTTCAGATTTCCATGTAAGTTCGAAACTTGTTTGGTTGTTGTTGTTGA
GGATGATGATGATGATGATCAAGCACACGCTTGCTTTGTCTGTTGTCTAGTAGTTATAGG
GACACTTACGTGCACGAGCTAAGTAATGAGTGTGATATGATCACATATGAGAAGATCTTC
TAACACGGGTTTCATTTGTCCAAGATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGT
TTCAGATCTTTTACTAGTTTCTGCTATCTGGGTATGTCTCTGTTTGTATTTTTAACTGAT
GCCTTGTGTTAAGTTTCAATGTCATGGTTTTGACTTTATATTGTTTGTTAGATCGAGTGT
TCTCTGTTTTTCTCTGTTTGGTTTCCGAGAAAATGGGTGTAAGGATAAGCTTCAAGTTAA
TAAATCTCAGTTAATTTATGAAAAATATTCATTTGGGAGATAATTGAAGATATATATTAA
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GAAACAGACAGTTGACCATGAAACTGATGCTGGTTTCATTGGTTGTTAAAGGAATATAAT
GAATTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTTATGGTATTATATACTGTTTG
GTTTGTGGAAATTTTGTAAGAAAGCAAAAGAAAATGATAGATAAGGGAAACTGATTTTTC
TTCTTTTGACAAAATCAAAGACAGACTAGACTAGGTAGTGTTAGAGAATCTAATGAGATT
TGTTTGAGTCATTGTTTTTTCCTATTTATTTCTTGTTAAGGAAATTAGTTTACTATCATT
TATGTGGATTTTTTTTTTTGGTTTTGTTAATTATCTATATGTTTGTGAAAGTTCATTGCA
TCTAATGAGTCTGTTTATCTAGGGGTGATTCTAATTAATGTGTATGCTCTATTTCAGCTA
GTTTTTAAGCAAATGAAAGC
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>LITCHI006311.m1 GenomeSequence + 
ATGCCGGATAACGGCGTGTCAGTCATTTCTAAGTGGTTAATTGCATTTTCAGTATTTTTA
TCAATTGCAATTATTTACTACTGTGCTCTAGTGGCTTTTCACGAGGATATGTGTTGAATG
CGAAGTTTGGGGATTCTAATTTAAGCACTGCAGCTTCAAAACGAAAGAAAGCCCGTAAAT
CAGGAAAGAATAGTGGCAGTGCTGATAAGAATGATAAGCTCATCTCATCTGAAAATGATG
ATGGACACGCTCTCGGTGATGATAGTAACAAACTGTTTACAGACGACCTTAATAGACTGG
TGGATTGTGGTGCTGATGGACGTACAGTTGGTAAGTTATTTGTGACAAATACCGAGATAG
CCAAGGGAAGCAATGGTACCATTGTCTTTGAGGGAATCCATGAAGGTCGGCCAGTTGCAG
TCAAACGCCTTGTCCGAGCTTATCACGATGTGGCTTTTAAAGAAATTCAAAATCTTATTG
TATCTGATAGACATCCCAACATTGTTCGATGGTATGGGGTGGAGAACGATCAAGATTTTG
TGTATCTTGCTCTGGAGCGCTGTACTTGCAGCTTAGATGATTTGATTCAAATTTGTTTAG
ATCCATCCTTTGAGTGTAACCTCCGGTTGGATTCAGTGAAAAGTACCATGCAGGATCTCA
ACTTGTGGAAAGCAAATGGCCATCCCTCACCTCTATTATTAAAATTGATGAGGTTAGTAT
TATAAGTCTTCGTTGATGTGATACCTTTGTACAAACACGAAATTTGCACTAGTATTATTT
TTCTCTTTTTTCTTTTCTCCTTTATTTGGTGGCTCAGGACTTGAGTTGCATATCTAGTCA
TTTGATCTGTCTGTAATGCAGGGACATAGTTTCTGGGCTTGTGCATCTGCATGAGTTGGG
AATAATTCATCGGGACTTGAAGCCACAAAATGTGTTGATAATTAGCGAAGGCAGAGGATC
TTTATGTGCAAAGATTTCAGACATGGGCATTAGCAGGCACCTCCTTGCAGATAAGTCTTC
TTTGAGTAATCATGCTACTGGCAAGTACCCTTTCCAGCTTAATCAACATAATGCAATTTA
CTGTTACTTCCTCGAGATATATTGA