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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028419 | Chr9 | 11969399 | 11976644;11976863 | - | C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028419.m1 | 55 | 171 | PF00059.24 | Lectin_C | Domain | 31.5 | 2.40E-07 |
LITCHI028419.m1 | 258 | 525 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 126.4 | 1.30E-36 |
LITCHI028419.m1 | 259 | 527 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.7 | 5.60E-41 |
LITCHI028419.m2 | 71 | 187 | PF00059.24 | Lectin_C | Domain | 31.5 | 2.50E-07 |
LITCHI028419.m2 | 274 | 541 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 126.3 | 1.40E-36 |
LITCHI028419.m2 | 275 | 543 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.6 | 6.00E-41 |
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>LITCHI028419.m1 ATGATCAGAGCTAATGGCTTACTACTTTGTCTTGTTAGTTTTAGATATCATGTTGAAGCC TCAATTAATTTTATTTTATTTTCTTGTTGGACAGCACCATGCCCTTCTGGTTGGGTTACT AGTCCAGATGAGAGCAAGTGCTTTGGATATATACGGTACGTCAACTCATGGGATAAATCA GAGAGCCACTGTAAAAGCTTTGGTGGACACTTGGCTGCCCCAACATCGTATGAAGAGCTG AACTCCACTCAAAGGTTATGTGGTGAACCTCTTAATGGCTGCTGGGTAGGAGCAAGATAC TTTAACAGTTCTACCACTGGGTTCGGTTGGAAGTGGTCCGATAGTGTGTCAAAGTGGAAT GAATCAATCTCTCCGACCAAACCTTTTCTTTCCAACTGTACTAACGTGTCATGCGGAGTC AATTCTTCAGTTGAGTTGTGTGCTTTGGTGACTAATATATCGACGTCTCTTATGTTTGAG AGATGCAATGCAACACATGCTTCTATTTGCGTGCTTAATTTTGAGAACAGATGTCACCTT CACTTCCACTGCCATAGGGAATACCTTATCATCCTTGGAGTTGTAAGTGGGTTGATCCTC TTCACAACATTTGCTGTTGTAATATGGCTCCTTGCATACAAGCGATGCAAGAGGCGCAGA AAATCTCGCAAATTATCTAATCCAGCGGTTTCGGCATTGGTTCCCCCATCATGGAAGGTG TTCACTAGCGAGGAATTGAGGTCGATTACCAAGAATTTTAGTGAAGGTAATCGCCTTCTA GGAGATGCCAAAACTGGTGGTACATACAGTGGTACTCTACCTGATGGATCAAGGGTGGCA GTCAAGAGGTTAAAAAGGTCAAGTTTTCAGAGGAAGAAAGAGTTCTATTCTGAGATTAGA CGGGTTTCAAGGCTTCATCATCCAAATTTGGTTGCTGTAAAGGGATGCTGCTATGATCAC GGTGACCGCTACATTGTTTATGAGTTTATAGTAAATGGCCCCCTAGATAGATGGCTACAT CACATACCAAGGGGAGGTCGGAGCTTAGACTGGGCAATGAGAATGAAAATAGCTACTACA CTTGCTCAAGGAATAGCGTTCTTGCATGATAAGGTTAAGCCACATGTTGTGCATCGGGAT ATTCGTGCCAATAATGTGTTGCTTGACGAAGAGTTTGGAGCACATTTGATGGGGGTTGGT CTGTCAAAGTTTGTACCATGGGAAGTGATGCAAGAGAGGACCGTGATGGCAGGTGGCACA TACGGATACCTTGCTCCAGAATTCGTCTACAGAAATGAACTTACAACGAAAAGTGATGTT TACAGTTTTGGAGTTTTGCTGTTGGAAATTGTAAGTGGTCGTAGGCCTGCACAGGCTGTT GATTCAATGGGCTGGCAAAGTATATTCGAATGGGCCACACCTTTAGTGCAAACACATCGC TACCTCGAGCTCCTAGATCCTCACATTTCATCAGATATTCCTGAAGCTGGCGTGGTTCAG AAGGTCGTGGACCTTGTGTATGCTTGTACACAGCATGTCCCATCTATGCGGCCAAGAATG TCCCACGTAGTTCATCAGCTGCAACAGTTGGCCCAGCCACCAGTTGTGAAGTAA >LITCHI028419.m2 ATGATGGAAGCAAAGCCAGTTTCTATGCAGTTGGTTCGATTTCTGATTGCTTATATCGTG CTCTCGGTTGTGGTGTCAGCGGCTATTGCCAATCAGTCAAGTAATGCGGAATCAGTTGCT TCCCAGAATAAAGACCTTAAAGCACCATGCCCTTCTGGTTGGGTTACTAGTCCAGATGAG AGCAAGTGCTTTGGATATATACGGTACGTCAACTCATGGGATAAATCAGAGAGCCACTGT AAAAGCTTTGGTGGACACTTGGCTGCCCCAACATCGTATGAAGAGCTGAACTCCACTCAA AGGTTATGTGGTGAACCTCTTAATGGCTGCTGGGTAGGAGCAAGATACTTTAACAGTTCT ACCACTGGGTTCGGTTGGAAGTGGTCCGATAGTGTGTCAAAGTGGAATGAATCAATCTCT CCGACCAAACCTTTTCTTTCCAACTGTACTAACGTGTCATGCGGAGTCAATTCTTCAGTT GAGTTGTGTGCTTTGGTGACTAATATATCGACGTCTCTTATGTTTGAGAGATGCAATGCA ACACATGCTTCTATTTGCGTGCTTAATTTTGAGAACAGATGTCACCTTCACTTCCACTGC CATAGGGAATACCTTATCATCCTTGGAGTTGTAAGTGGGTTGATCCTCTTCACAACATTT GCTGTTGTAATATGGCTCCTTGCATACAAGCGATGCAAGAGGCGCAGAAAATCTCGCAAA TTATCTAATCCAGCGGTTTCGGCATTGGTTCCCCCATCATGGAAGGTGTTCACTAGCGAG GAATTGAGGTCGATTACCAAGAATTTTAGTGAAGGTAATCGCCTTCTAGGAGATGCCAAA ACTGGTGGTACATACAGTGGTACTCTACCTGATGGATCAAGGGTGGCAGTCAAGAGGTTA AAAAGGTCAAGTTTTCAGAGGAAGAAAGAGTTCTATTCTGAGATTAGACGGGTTTCAAGG CTTCATCATCCAAATTTGGTTGCTGTAAAGGGATGCTGCTATGATCACGGTGACCGCTAC ATTGTTTATGAGTTTATAGTAAATGGCCCCCTAGATAGATGGCTACATCACATACCAAGG GGAGGTCGGAGCTTAGACTGGGCAATGAGAATGAAAATAGCTACTACACTTGCTCAAGGA ATAGCGTTCTTGCATGATAAGGTTAAGCCACATGTTGTGCATCGGGATATTCGTGCCAAT AATGTGTTGCTTGACGAAGAGTTTGGAGCACATTTGATGGGGGTTGGTCTGTCAAAGTTT GTACCATGGGAAGTGATGCAAGAGAGGACCGTGATGGCAGGTGGCACATACGGATACCTT GCTCCAGAATTCGTCTACAGAAATGAACTTACAACGAAAAGTGATGTTTACAGTTTTGGA GTTTTGCTGTTGGAAATTGTAAGTGGTCGTAGGCCTGCACAGGCTGTTGATTCAATGGGC TGGCAAAGTATATTCGAATGGGCCACACCTTTAGTGCAAACACATCGCTACCTCGAGCTC CTAGATCCTCACATTTCATCAGATATTCCTGAAGCTGGCGTGGTTCAGAAGGTCGTGGAC CTTGTGTATGCTTGTACACAGCATGTCCCATCTATGCGGCCAAGAATGTCCCACGTAGTT CATCAGCTGCAACAGTTGGCCCAGCCACCAGTTGTGAAGTAA
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>LITCHI028419.m1 MIRANGLLLCLVSFRYHVEASINFILFSCWTAPCPSGWVTSPDESKCFGYIRYVNSWDKS ESHCKSFGGHLAAPTSYEELNSTQRLCGEPLNGCWVGARYFNSSTTGFGWKWSDSVSKWN ESISPTKPFLSNCTNVSCGVNSSVELCALVTNISTSLMFERCNATHASICVLNFENRCHL HFHCHREYLIILGVVSGLILFTTFAVVIWLLAYKRCKRRRKSRKLSNPAVSALVPPSWKV FTSEELRSITKNFSEGNRLLGDAKTGGTYSGTLPDGSRVAVKRLKRSSFQRKKEFYSEIR RVSRLHHPNLVAVKGCCYDHGDRYIVYEFIVNGPLDRWLHHIPRGGRSLDWAMRMKIATT LAQGIAFLHDKVKPHVVHRDIRANNVLLDEEFGAHLMGVGLSKFVPWEVMQERTVMAGGT YGYLAPEFVYRNELTTKSDVYSFGVLLLEIVSGRRPAQAVDSMGWQSIFEWATPLVQTHR YLELLDPHISSDIPEAGVVQKVVDLVYACTQHVPSMRPRMSHVVHQLQQLAQPPVVK. >LITCHI028419.m2 MMEAKPVSMQLVRFLIAYIVLSVVVSAAIANQSSNAESVASQNKDLKAPCPSGWVTSPDE SKCFGYIRYVNSWDKSESHCKSFGGHLAAPTSYEELNSTQRLCGEPLNGCWVGARYFNSS TTGFGWKWSDSVSKWNESISPTKPFLSNCTNVSCGVNSSVELCALVTNISTSLMFERCNA THASICVLNFENRCHLHFHCHREYLIILGVVSGLILFTTFAVVIWLLAYKRCKRRRKSRK LSNPAVSALVPPSWKVFTSEELRSITKNFSEGNRLLGDAKTGGTYSGTLPDGSRVAVKRL KRSSFQRKKEFYSEIRRVSRLHHPNLVAVKGCCYDHGDRYIVYEFIVNGPLDRWLHHIPR GGRSLDWAMRMKIATTLAQGIAFLHDKVKPHVVHRDIRANNVLLDEEFGAHLMGVGLSKF VPWEVMQERTVMAGGTYGYLAPEFVYRNELTTKSDVYSFGVLLLEIVSGRRPAQAVDSMG WQSIFEWATPLVQTHRYLELLDPHISSDIPEAGVVQKVVDLVYACTQHVPSMRPRMSHVV HQLQQLAQPPVVK.
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>LITCHI028419.m1 GTTTACTTGTTCATGCTTGTTGCTGAGAACGAGTGACAAATGAGAAGAAAGTTGAGAGCT TTTTGAATTTTGGATTTGGGTGTCTTTTTTGTCATTCTTTACAGGATTAGTGATTTCATT ATGTTTTTGTGTTCTCTGCTTTTTTTGGGTACCCAGATGGAAGATTAAGGGTTTCATATT TTCCTTTTTGTGAATTTATTATATGAAGAAGATTGATGTTATGTGTTCATGTTATTGCTT TGATTTTGATTGGTTATTGTTAGTATTGCTTAATTAGCTTAATTTGCCCTGCAACAGAAA TATTATGCAAATGCTCTATCAAATATGGTTCACAGCTTAAGTGATAGGGGGTTTTCAGAT TGTTATGATGGAAGCAAAGCCAGTTTCTATGCAGTTGGTTCGATTTCTGATTGCTTATAT CGTGCTCTCGGTTGTGGTGTCAGCGGCTGTAAGATTACTGCATGTTTTGTTTTTGTTTCT GTATGCAAAATGGATGATTTACAGGTGTTACTTGGTTAATTTATGTTTTGGAAATTGTTT TTGGTTTCATAGATTGCCAATCAGTCAAGTAATGCGGAATCAGTTGCTTCCCAGAATAAA GACCTTAAAGGTGTGAATCTACTTGTATATAGTTATAAATGCTTGCTCAATATATATTGG TAATATTATAAATACGTTTTACTTCTTTCAGTTATGGAAATGTTAGAAGGAGATTACAGG ATTATTTCGTTTTAGGTTTGAAAGATATGCCATTGAAATTGTCATATCGACTTAATGAAA TGTTTTAGAGCTTTGACACACATGGATAACTGTTAATATAACCTAAAAAAGGTGCATACA GGTTAATAATGATGGTGAGAAACAGATATGGATATGTGAATAAAAACATGGTTGACATAG AGATAATAAGTTGTTATCTTGATGAGCCTTTATTTGGTTGTAATTGTTCATGAAAAAAAC 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