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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028380 | Chr9 | 10989410 | 10992165 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028380.m1 | 61 | 150 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 75.2 | 5.30E-21 |
LITCHI028380.m1 | 271 | 364 | PF10551.12 | MULE | Domain | 81.9 | 3.70E-23 |
LITCHI028380.m1 | 558 | 581 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 30.1 | 2.90E-07 |
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>LITCHI028380.m1 ATGGAGACTGTAGAGTCAGAAATTGGAGATGCTTCTAAGGGGAGTTTGGAGCAGATACTA TGGAAGTCATGTTCTAGTACTTGTTCAAACACTGATGACAACAATGTACACATTCCTCAA GTGAAGCAGGAGTGCAAACCAAGGTTAGGCCAAGAATTTGCTTCCCTTGATGATGTTTAT GATTTTTACAATAAGTATGCGAAAGAGGCTGGTTTTAGTGTAAGAATTAACTCCAGTAGG AAGAATAAGGAGAATAATGAAATTGTTAGGAAAGAGTACGTGTGTTTCAAACAAGGAATT TCGGTTAAAGCGAAAGGGGTGGTTAGTGAAACTAAAAGACATCGGGGGATAACTCGAGAG GGTTGTAATGCAAAACTTGCAGTGGTGAAGTCTAAAGCAGGCACTTATATGGTTAGTATA TTTGTAGAGGGTCATAGTCATGCATTGGCAACTCCTCAAAGAGTGCATCTTCTAAGGTCT CATTGTAAGGAATCAGAAGCCAAAAGATCAGTGTCCCTACAATTATCAGCACAGAACGTT TCTAGACATCATGATTTTAGTGTAGTTGAGATGCAGGTTGGGTGTAAACAATCTGATGGG TGCAGGGAAAAGGATATTTGTAATCGTGAGAGGGATTTGCGTAAGGAGTTGAGTGGACAT GATGCTAATATGTTGTGTGAGTATTTTCTAACGGAACAAGAAAAGAATTCAGATTTCATT TTTGAAATAAACAGAGACAATGAAAATCGAATGACTCATTGTTTTTGGGCCGATGCAATA TCTAGGCAAGCTTATCGATATTTTGGGGATGTGGTTGTATTTGATACTATAAGCAACACT AATCAATATGATATGATATTTGCATCAATGACGGGGATTAATAATCATGGCCAGACTATT GTTTTTGCTTGTTCATTTTTAAGTGATAAGACTGTTGATTCTTTTGTTTGGCTATTTGAG AAATTTAAGAAATGTATGCCTAATTGTTCCCCTAAGATCATTTTTACTGATCAAGAACCA GCAATGGCAAAAGCCATATCCCAAACTCTTCCAGATACGTTGCACACATATTGTAGTTGG CATATCTTAAATAGGTTGTCAGAGCAGTTAAATGAAGTGACCTATAGGGATTATTATAGT GATTTTCAAAAATGCATAGGGGAATCGTGCACTAGAGAAGAGTTTGACTCTAAGTGGAAG GAGATTATTGAAAAATGTAAGTTGACTGATAACATGTGGCTGTATTCAATTTATGAAATT CGTTCAAAATGGGTGCCTGCCTATGTGAATCATGCGTTTTCAGCCGGAATGTTAGGTAGT CAACAGTCTGAAATTTCTCATGCATTCTTCAAAAGTTGTGTTTCTAAAAAAAATTCGCTA GTGGATTTTGTAGTGTTGTTTAATAGGGCCCTTACTTGCCAACGTCGTGAGGAATTAACT GCTGATTTTGTAGACATAAATGAGAAACCTTGCCTGAAATTGCCGGTAGAGATAGAGAAG CAAATGGCTGACATTTATACACGTAATATCTTTTATAAATTTCAAGATGAATTATGGAAC AGCTTGTTGTATAAAATTGATTCTGTCAGAGATAGTGTCAACCACTGTGTGTATACAGCT GAGAAGAAAAATGAAGGTGTCTGTGAATTAAGAGAAATTGTGTATCAGAAGGGCTTGGAT TTAGCTTCATGCAGTTGTAAAAAATTTGAGAGTGAAGGAATTCCATGTAGGCATATCCTG GCATACTTGAATAGAATGCAAATTGCATGTTTGCCAAATCAATACATTATGAAGAGATGG ACTAAAGCTGCTAAGTCTGCTGGAAATTTTGATGATGATGGTTTGGAAATAAATAATTAT TCAGACAAATCATTTTTATTAAGGCGAAGTCAACTGTTTCTACTTGCTTCAACAGTGATT GATAAAGTAGCATTTAGTGATGAGGTGAGTAAGATCTTAGAAGAAGCTTTGGACTATGTA TTGCAGAAGATAAAATCAGTAACGGATGACAAAGGCTTGGTTCACCAACATGTAGCTTAT TGTGTAATTAACTGGAGATGGAGCTATCATTATCAAGAACCATTTGTTTTAGGATTTCGG TCACCTTTGCTTGAAATGCTCAAGCTTTTCACAGAGTTAAGAAAGATTTGGTTTTTTTTG GTATAA
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>LITCHI028380.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTCACTTTTACCAAATTCATAAAAAAAATTTATTTTTAATCTCTCAAACAAACTATTTTC GTGTCATATCTAAGCTTACCAAACTATCATTAAGTGAAAATAGCCCTTTTGCCCTTAGCC GAAATTACCAAAATAACCTTGGTCTTCATACTACCTTTCTTCTTCTCCATCCAAGCTTTG ATTAATACTTCTTCAACCATCTGAGCAAGAATGTCTTCATTCAAGCTTCTTCATTCATTC AAGTTTTTTTGTCTCAAACAAACACACATTCTCTTCAATTGAAGCTTCAAAGGTTTTAGC TTTAAGTTTTGAAGATATATATGTGTTGTTGGTTGTTTTTTAAGTTTTTTGTTCACATTG CTTAATTAAAATTATGTAGATTGATTGTGCTAATGATTCAAATTATATTGAGGTGGATAT AACATTGCATTAGTTAGATCAATTGAAATTGCGGTTTTTGTGTATGCAACCATGTTTAAT GATGTTGAATTGCACATATTAAATTATTTTTGTTTATTTTTTAAGTGGTCAAATAAATTA AAACTACCCAAAAGCAACTTTAAAAATGTTAGACTTCTTAACTTTTAAGTTAATTAAATT ACTTAATGATATTTAAAATATTTTATTACAAGCCTATTTTCTATAAAATAACATATTGTC AATTTTATCATAATTTTATATTATAAATATTTTTCCCTAATACTTATATGACTTTTTTTC TTTTAAAAAAAACTCTCATCCCAAAATTTTTTGAGATTGTACTAATGTATTTTAATTTTA CAATTTAAACACTTATATTTTTCAGTTGCTTTTTAATTCAACTCATAGATAATTTCATTA TTTAGTTAAATATATAAATATAATTAAGTTATACTTTTTAATCATATTTTAATTATAAAA ATATTATAAATAATTAATTATTTATTTTGGTTGTATTATATTAAATAAAATTTCATAATA ATTAATAGTAAAAATGATATAAATATCAATTACTAGGTTCAAACAATTTTAATTTTAAAA AATAAATAATTTTACCGTGCATTTATAGGTGACAAAAAAATATATATATACAAATATATC ATTCAGATTTCAAGTTTCAGTCACTATTCAATCTTTAATAAGTCTTAGCATTGTTTAGTC CTCAAATAAAAAACAAACAACTCCTAAGTTAATTTAATTTTTAATGTTTATTTATTATTT ATATATTTATTTTTTATACAAATTTGTAACCTATTAAAAATTGAATTGTGTTAAATTGAA TCGAGTTTAAGATTGATCACTCCAAAATGTTACACGTTTAAAACAAAAAGTGATGATCCG TTTGCATCATGGGTTGGGTTTAAGGTATCCCACCAAAATATCGTGTTGAGTTAGGGTGAA CTAATACGGTCCTGATCTAACCCATTGTCATCTTCATGTATGGGGAGTGTTTTAAAGATC ATTGTCATCTTCGTTTATGGGGTGTGTGCATATAAAATTTGTACTGAGCCATGATATTTT TAAATGATACAATTTTTTATTATTTAATTTATTATATTTGTTTTTTTTTTCCTTCTAGAT CCCCCCAACACATGTTTCGTGTTTGTGTCTCTCTTGCTTGGATGAAACAGAAACACGCTC TTTTTCTTGTGAGACAAAATCCATTCAACCACATAAATCTTCTGTCTTCTACCTCTCAAA TCTTAAACCCATTTTTGGAATCTTCTTCTTTCCCGTTTCTCAACATCAATATTACATCTT TCTCTCTTCTATATTCAAGCTGCACCACGTAAGTTCTATCAAGTTTTATGATAATTTTGT AGACTAGTGCATGATTTACAGTGAAAATATTGTGCTTTGTGTTATCTCAGATTATCTTGT TTAATGGGTTTGTGATGACAAAATGACAAATGGGAAATTTTATTTTTCTTGTATTTGTTT ATATGCCAATATTATTTTTTGAATGTGTGAAAAAGATGTTGTATTCATTTATCTATTATG CTTTTTCAGTGTTGATTGAA
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>LITCHI028380.m1 GenomeSequence + ATGGAGACTGTAGAGTCAGAAATTGGAGATGCTTCTAAGGGGAGTTTGGAGCAGATACTA TGGAAGTCATGTTCTAGTACTTGTTCAAACACTGATGACAACAATGTACACATTCCTCAA GTGAAGCAGGAGTGCAAACCAAGGTTAGGCCAAGAATTTGCTTCCCTTGATGATGTTTAT GATTTTTACAATAAGTATGCGAAAGAGGCTGGTTTTAGTGTAAGAATTAACTCCAGTAGG AAGAATAAGGAGAATAATGAAATTGTTAGGAAAGAGTACGTGTGTTTCAAACAAGGAATT TCGGTTAAAGCGAAAGGGGTGGTTAGTGAAACTAAAAGACATCGGGGGATAACTCGAGAG GGTTGTAATGCAAAACTTGCAGTGGTGAAGTCTAAAGCAGGCACTTATATGGTTAGTATA TTTGTAGAGGGTCATAGTCATGCATTGGCAACTCCTCAAAGAGTGCATCTTCTAAGGTCT CATTGTAAGGAATCAGAAGCCAAAAGATCAGTGTCCCTACAATTATCAGCACAGAACGTT TCTAGACATCATGATTTTAGTGTAGTTGAGATGCAGGTTGGGTGTAAACAATCTGATGGG TGCAGGGAAAAGGATATTTGTAATCGTGAGAGGGATTTGCGTAAGGAGTTGAGTGGACAT GATGCTAATATGTTGTGTGAGTATTTTCTAACGGAACAAGAAAAGAATTCAGATTTCATT TTTGAAATAAACAGAGACAATGAAAATCGAATGACTCATTGTTTTTGGGCCGATGCAATA TCTAGGCAAGCTTATCGATATTTTGGGGATGTGGTTGTATTTGATACTATAAGCAACACT AATCAATATGATATGATATTTGCATCAATGACGGGGATTAATAATCATGGCCAGACTATT GTTTTTGCTTGTTCATTTTTAAGTGATAAGACTGTTGATTCTTTTGTTTGGCTATTTGAG AAATTTAAGAAATGTATGCCTAATTGTTCCCCTAAGATCATTTTTACTGATCAAGAACCA GCAATGGCAAAAGCCATATCCCAAACTCTTCCAGATACGTTGCACACATATTGTAGTTGG CATATCTTAAATAGGTTGTCAGAGCAGTTAAATGAAGTGACCTATAGGGATTATTATAGT GATTTTCAAAAATGCATAGGGGAATCGTGCACTAGAGAAGAGTTTGACTCTAAGTGGAAG GAGATTATTGAAAAATGTAAGTTGACTGATAACATGTGGCTGTATTCAATTTATGAAATT CGTTCAAAATGGGTGCCTGCCTATGTGAATCATGCGTTTTCAGCCGGAATGTTAGGTAGT CAACAGTCTGAAATTTCTCATGCATTCTTCAAAAGTTGTGTTTCTAAAAAAAATTCGCTA GTGGATTTTGTAGTGTTGTTTAATAGGGCCCTTACTTGCCAACGTCGTGAGGAATTAACT GCTGATTTTGTAGACATAAATGAGAAACCTTGCCTGAAATTGCCGGTAGAGATAGAGAAG CAAATGGCTGACATTTATACACGTAATATCTTTTATAAATTTCAAGATGAATTATGGAAC AGCTTGTTGTATAAAATTGATTCTGTCAGAGATAGTGTCAACCACTGTGTGTATACAGCT GAGAAGAAAAATGAAGGTGTCTGTGAATTAAGAGAAATTGTGTATCAGAAGGGCTTGGAT TTAGCTTCATGCAGTTGTAAAAAATTTGAGAGTGAAGGAATTCCATGTAGGCATATCCTG GCATACTTGAATAGAATGCAAATTGCATGTTTGCCAAATCAATACATTATGAAGAGATGG ACTAAAGCTGCTAAGTCTGCTGGAAATTTTGATGATGATGGTTTGGAAATAAATAATTAT TCAGACAAATCATTTTTATTAAGGCGAAGTCAACTGTTTCTACTTGCTTCAACAGTGATT GATAAAGTAGCATTTAGTGATGAGGTGAGTAAGATCTTAGAAGAAGCTTTGGACTATGTA TTGCAGAAGATAAAATCAGTAACGGATGACAAAGGTGTTCCCGAAAGAAATAGTACTACA TAGCAGCAAGTCTTTATTGGACCCCTTGCCTTTAGGGTTAAAGGGTGTGGTTAAGACTAA ATGATGAAGAAGAAGGCAACAAGAAGCAAGGCATAGGATAAAGGTGGACCTTGTCATGTA TATGGAGAAGTGGAACAGTCCTTTCGCTCAACAATCTGTAAGAATTTGTCCATTTTTTTC CCTTTCGCTGCCTTACTCTTATTTACTCTCCTGCACCAAATTCACTGGACACAGATGATC TAGTTTTACCCTTGTGTCCATTTTCATGTAAATATTATATGCCTTTTTGATAGACCTGTG ACATAGTTTCAATTGATTTTTTCTGTTTTATTTTAGGCTTGGTTCACCAACATGTAGCTT ATTGTGTAATTAACTGGAGATGGAGCTATCATTATCAAGAACCATTTGTTTTAGGATTTC GGTCACCTTTGCTTGAAATGCTCAAGCTTTTCACAGGTGTTAAAAAAATTTGGTTGCTCC TAATGGCCATTACAGGTGCCTTCATTGTCATAATTTGTTTACTTGTGATTTGGACAGCTT TTGTTTCCAATTAAACAGATGGCTTTTCATGCTGAAACAGTGCTTCACATTCATAACTCA GCTTTGTCATAAATTAACATGTATACTCTATGCATCTTTATCACATCCACAAGCTCCCAA ATTTTATTTTGTTTTGGTTTACAGAGTTAAGAAAGATTTGGTTTTTTTTGGTATAA