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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028254 | Chr9 | 8167385 | 8171316 | - | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028254.m1 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.4 | 2.00E-14 |
LITCHI028254.m1 | 299 | 385 | PF02362.24 | B3 | Family | 48.6 | 6.40E-13 |
LITCHI028254.m2 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.8 | 1.50E-14 |
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>LITCHI028254.m1 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGTTTTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAAGTATTTGACT CGAGGTGCCAAACATATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATT GGTTGGCACAAAGCTGCATGTTATACCAAAATGGGGTGGAAGGCATTTATGACTGAGATG AAATTAAAGGCTGATGACATCTGTGTGTTTGAGCTAGTCAGGATGGAGGACTTACAGCTG AAAGTTTCAGTGTTTTAG >LITCHI028254.m2 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGGTAAGCTTTTCAAATAAATGTGACCAACAGATTTTC ATATTAGCATTTGTTACATGA
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>LITCHI028254.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAGAAAAAAAAAGTATTAAAAAAAAA AAATTTCAATCCAAATCTTCAAGTTGAAGTTAAGGATCTAGAAGTCTTTAACTATCTCTA TATAAAATTAAAAGGGAATTTATTAAAAAAATATATCACAAAAAAGGAATGAAAATTTTA ACAAAATAAATCCAAAACTTCAAATAAGATCTAGATCGCAGGAAACCTAAAATTTTCTGG ATTTCTAACCACTGGAAACTTAAAAAATGAAGGATTTTTAGTGATCTAGTTCTTCTTTGA AGTACTGGATTTTTATTTTTAAAATTTTTCTTTCCTTTCTTGCAATATATATATATATAT ATATATATTTTTAAATTAATCTCCTTTTAATTTTTTTTTGAAGATAGTTAAAAATTTCCA TATCTTTAACTTCAACTTAAACATCTAGACTGGATTTTCATTTTTTTTTATAATTTTTCA TTTTTTTTGTTCAATTTTTCTTTGACTTCAATTTAAAATTAATCTCCTTTTTTATTTTTT TTATTTTTTATATTATATATATATTGATTTTTTATATTTTTTATTTAATACTATTTATTT TTATTTTTTAATTTTTATATTTTTATGTTATTATATTATTTAAACCAATAGTAAATTCGA CATTTTAATTTTTTTTAACATTTTTATTAAAAAACAAACTATAGAAAAAATTTTGGATAA AAATAAAATTATAGATGATAAAAATGATATTTTTATAAATCATAATAAATTTTTTGAAAT TATCTCTATTTTAATATTAATTAAATCAAAGTTAAATTTGGTATTTTACTTTCATCTAAC ATTTACCTTAAAAAAAGTGACAGTAGATAGAATTTTAGATGAAAATCAAACTAAAATGAA AAAATGGAGGTTTCGACAAACTATGGGTGGTTTTTAAGAATTATCCCTTAAAATTTTGAA AGAAATAAATTTTAACAATAAAAAATAATTTTATTCACGTGCATCTAACTTGTTTGTCTT GAAAATGAATGGTCTAGATCAATTTAAAAAAAATAAAAAATTAATATTTTAAAAAAATAA AAAATTAAAAAAAAAATGAAAATGACAGACCGGATTAGATCTCTGTAGTCTGTCCATCTT AAATATCCCTTGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAGCATATTGGATCTCTACCGTTG AAATCTCCACCGTTGAAGGTAGACGGTAGAGATCCAACATGGGTCTCCACCGCCATCTTT AATCTCCGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAACAGGGACCCATTGAGGTTCTTCACA TTAAGACCCATTGAACTTCAATCACCGACTCTTTTCCACTGACCCTCTGTTGACCACGCC CGTTGAAGTTCTTTCTCCTACCTCCTCTACACAACTCACTGTTTTCGACTCACCGTGCCC AACCACCACCACCAGCACAGTCAACCTGCTTGCCGCCCTCTCCCTCTGCGACCGCTTCCT CTTTCGCCTCCTCTTTGACTCTCTCACTTCCGACTCGCTCCTCTCCTCCGACTCCCCTCG CCTTTCCTTCGCAAATGGAGACCTAAATTTGGGTCTCCATCACGTCGAATAGAGACCCAA ATCGGGATCGACGTTGATGGTTTTTGGCTCTGAAATTGTTTTTGTTTTTTTTTTCCTTCT TTTCCAGATTCGATTGTGTGGGTCTGGTTCCAAGTTGGGTTCGATCGACGTCGATGGTTT TTGGCTTTGAAATTGTTTTTTGTTTCAGATTTGATTGTGTGGGTTGATGATTTTGCAGAT GGTGTTGATGATGATGTTCTTGGGTTCTGTTTGATGATGGCGGCAGTGATTTTTGTTTGT GTTGATGATTGATGACAAAAGATGCTTGTTTGTGTTGATGACTGATGATGATGAACCGTA GTTGATGAACCAGACCTCCGTTGAGGTTGAGGATGGCAGTGATCTCCACTAGCACTTTTC AACTTTTGTGTTAGAAGTCT >LITCHI028254.m2 - Up_Stream_Len 2000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAGAAAAAAAAAGTATTAAAAAAAAA AAATTTCAATCCAAATCTTCAAGTTGAAGTTAAGGATCTAGAAGTCTTTAACTATCTCTA TATAAAATTAAAAGGGAATTTATTAAAAAAATATATCACAAAAAAGGAATGAAAATTTTA ACAAAATAAATCCAAAACTTCAAATAAGATCTAGATCGCAGGAAACCTAAAATTTTCTGG ATTTCTAACCACTGGAAACTTAAAAAATGAAGGATTTTTAGTGATCTAGTTCTTCTTTGA AGTACTGGATTTTTATTTTTAAAATTTTTCTTTCCTTTCTTGCAATATATATATATATAT ATATATATTTTTAAATTAATCTCCTTTTAATTTTTTTTTGAAGATAGTTAAAAATTTCCA TATCTTTAACTTCAACTTAAACATCTAGACTGGATTTTCATTTTTTTTTATAATTTTTCA TTTTTTTTGTTCAATTTTTCTTTGACTTCAATTTAAAATTAATCTCCTTTTTTATTTTTT TTATTTTTTATATTATATATATATTGATTTTTTATATTTTTTATTTAATACTATTTATTT TTATTTTTTAATTTTTATATTTTTATGTTATTATATTATTTAAACCAATAGTAAATTCGA CATTTTAATTTTTTTTAACATTTTTATTAAAAAACAAACTATAGAAAAAATTTTGGATAA AAATAAAATTATAGATGATAAAAATGATATTTTTATAAATCATAATAAATTTTTTGAAAT TATCTCTATTTTAATATTAATTAAATCAAAGTTAAATTTGGTATTTTACTTTCATCTAAC ATTTACCTTAAAAAAAGTGACAGTAGATAGAATTTTAGATGAAAATCAAACTAAAATGAA AAAATGGAGGTTTCGACAAACTATGGGTGGTTTTTAAGAATTATCCCTTAAAATTTTGAA AGAAATAAATTTTAACAATAAAAAATAATTTTATTCACGTGCATCTAACTTGTTTGTCTT GAAAATGAATGGTCTAGATCAATTTAAAAAAAATAAAAAATTAATATTTTAAAAAAATAA AAAATTAAAAAAAAAATGAAAATGACAGACCGGATTAGATCTCTGTAGTCTGTCCATCTT AAATATCCCTTGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAGCATATTGGATCTCTACCGTTG AAATCTCCACCGTTGAAGGTAGACGGTAGAGATCCAACATGGGTCTCCACCGCCATCTTT AATCTCCGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAACAGGGACCCATTGAGGTTCTTCACA TTAAGACCCATTGAACTTCAATCACCGACTCTTTTCCACTGACCCTCTGTTGACCACGCC CGTTGAAGTTCTTTCTCCTACCTCCTCTACACAACTCACTGTTTTCGACTCACCGTGCCC AACCACCACCACCAGCACAGTCAACCTGCTTGCCGCCCTCTCCCTCTGCGACCGCTTCCT CTTTCGCCTCCTCTTTGACTCTCTCACTTCCGACTCGCTCCTCTCCTCCGACTCCCCTCG CCTTTCCTTCGCAAATGGAGACCTAAATTTGGGTCTCCATCACGTCGAATAGAGACCCAA ATCGGGATCGACGTTGATGGTTTTTGGCTCTGAAATTGTTTTTGTTTTTTTTTTCCTTCT TTTCCAGATTCGATTGTGTGGGTCTGGTTCCAAGTTGGGTTCGATCGACGTCGATGGTTT TTGGCTTTGAAATTGTTTTTTGTTTCAGATTTGATTGTGTGGGTTGATGATTTTGCAGAT GGTGTTGATGATGATGTTCTTGGGTTCTGTTTGATGATGGCGGCAGTGATTTTTGTTTGT GTTGATGATTGATGACAAAAGATGCTTGTTTGTGTTGATGACTGATGATGATGAACCGTA GTTGATGAACCAGACCTCCGTTGAGGTTGAGGATGGCAGTGATCTCCACTAGCACTTTTC AACTTTTGTGTTAGAAGTCT
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>LITCHI028254.m1 GenomeSequence - CTTAAATATCCCTTGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAGCATATTGGATCTCTACCG TTGAAATCTCCACCGTTGAAGGTAGACGGTAGAGATCCAACATGGGTCTCCACCGCCATC TTTAATCTCCGATGATGGTTCATCAACAGAAACACTAACAGGGACCCATTGAGGTTCTTC ACATTAAGACCCATTGAACTTCAATCACCGACTCTTTTCCACTGACCCTCTGTTGACCAC GCCCGTTGAAGTTCTTTCTCCTACCTCCTCTACACAACTCACTGTTTTCGACTCACCGTG CCCAACCACCACCACCAGCACAGTCAACCTGCTTGCCGCCCTCTCCCTCTGCGACCGCTT CCTCTTTCGCCTCCTCTTTGACTCTCTCACTTCCGACTCGCTCCTCTCCTCCGACTCCCC TCGCCTTTCCTTCGCAAATGGAGACCTAAATTTGGGTCTCCATCACGTCGAATAGAGACC CAAATCGGGATCGACGTTGATGGTTTTTGGCTCTGAAATTGTTTTTGTTTTTTTTTTCCT TCTTTTCCAGATTCGATTGTGTGGGTCTGGTTCCAAGTTGGGTTCGATCGACGTCGATGG TTTTTGGCTTTGAAATTGTTTTTTGTTTCAGATTTGATTGTGTGGGTTGATGATTTTGCA GATGGTGTTGATGATGATGTTCTTGGGTTCTGTTTGATGATGGCGGCAGTGATTTTTGTT TGTGTTGATGATTGATGACAAAAGATGCTTGTTTGTGTTGATGACTGATGATGATGAACC GTAGTTGATGAACCAGACCTCCGTTGAGGTTGAGGATGGCAGTGATCTCCACTAGCACTT TTCAACTTTTGTGTTAGAAGTCTATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGG TCATTCTTGCTTCTACTCTTGAAGATAAGAAACTGGTACACCCCACAACTTCTATTTCTG ATTTTTCAAGCTTTGTTTTGCTTGAGTTCTACATTGCTGTCCAAATTTTGCTTTGTTTCA TGTTTGGAACTTTGTTTGTGATTTATTGAAGGTATGCACCAACTCTTCCCATTTACGCTT TTTGCTCCGCATCTCATTCTCACATTCATGGTTCAATCTTGAATTGTCAAGATTAGCAGC ACCCCTGTGATTCCTATTAGTGAAACCGCTTATCTGCCTCAAATCTTCATTTTCAATTAC GTCGTGGGGAATCGAATTCTGCTTATCTTTACGCTCTTTAAAATTATAGGGATACTGAAT CTCACAAGTGGTCGTATCAAAATGAGTAATTGAACAAATTTTGTCTGTCCAAATTTTGCT TGGTTTCATGTTTGGAAGTTTGCTTGTCATTTATGATGGATTTTGCTTGTAGTATGGAAG TTTGGTGCTTTACTCCTTTGTGATCAATGAGTTGTAAAAATGAGTGTTGAAAGTGACTAA AGTTGTTAGCTTTGTCTTTGTTGAATGAAACTGATTTATGTGTTTGAAGTAGTGATGAAA TTGACAAATGTGGTATTCGTTTGCATGAAATGTACTACTTGTCAACTTTTAAATGATCTC TTGCGGTTCCTTTATAACAAAATAGAAATGATAATCTCTAGAATTCTGTATTCTGAACTT GGAAATCAGAATATGCTTTGAAACCAAGTAGATTTAAGAAAGCTATAGCAGAGTAATTTA GCTGAGAGAAGTCTTGTTTGTAGCAACATAAATTAAATAATACTGATGAAATCAAAGAGA TCCACTAAAGGATCCGAATAACGGCATAAAAATCTAGAATTATAAGGAATAAGTTTGCAT TGTAGAAATAGCTCCCAAACACCATATATGTATGTAGATTTAAATGCTACACTATGTTTT GCTGTTTATGATGAATTTGTGTGATAAGAAAGTAACTTTCATGATATGGTAGAAGTGATA TTTGATAGCTTTTTTGATGATGTATATACGGATTCTATTTAATATAATTGTTAATAAGTG AAACAGAATGAGCTAGTGAGTTTTCTGTCTTATAATGAAACATATGACTGTAATGTCATG GAATTGTTTGATGTTCACTTCTTTATGAAGTAGATTGTCTAACAGAATTTGTATAATTGC AGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTTTTTGCTACAC TCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGGGGAAAGATTT GGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTTGGATACTTCT TGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGATACGACGGCTT GTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAATTTGATTCCCC ACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAATAGGAATCACA GGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAATGAGATGCAGA GCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCATACGAGTGAAT CAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAATTTGCATCACA GGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTAGCTCAAGACA GGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCGGAAGACACGC ACCCAACTCAAAATGAAGGTAACGAGTTTGAGCTTAAAAAATCTATGCTTCATTATCTTT GTACTCATAGATCCTATTTTGTGTATAGTGACTGAAAATTTATTTATGTTTTAATCCAAT TCCACAATTTGCAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGCAAAGGAATTGCTTT TAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATTTTCAATGTTGCAAA ATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAAAGTCATATCTGTGG CGGTTCTGTGGTAAGCTTTTCAAATAAATGTGACCAACAGATTTTCATATTAGCATTTGT TACATGATTTGTGGCATTTGTTTTTGCTTATGCAGTTTTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCA AGTATTTGACTCGAGGTGCCAAACATATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGC CTGTTCAAATTGGTTGGCACAAAGCTGCATGTTATACCAAAATGGGGTGGAAGGCATTTA TGACTGAGATGAAATTAAAGGCTGATGACATCTGTGTGTTTGAGCTAGTCAGGATGGAGG ACTTACAGCTGAAAGTTTCAGTGTTTTAGGGTCTGAAAGATAACATAACAGATTAGGATG CCTTTTAGTCACTAATCGTTTGACACGAGTAAACAATGTTTTATCTTGTGTAGGTTTCGT CTTAAACTTTTGTTCACATATATGATACGGTTTAATATCATCTATTGGCAATAGGTAGGA CATATAATATTTAAATCGTGATATACATTTAAGAGTACCTATGTGGTTTGATCTTGTTTG TGGATTGGTTCAACATATGTCTTCATTTACTTGCTTTTGCTGGAGATACATATGTTACTT GCAATCTTCTGTGTGTTAGTGGTTTAAGAAGGCAGGCACAATCTAGCATGATTATTATGA CATGATAGATTATGATCCAGCTGAAGTGAAGTAATATTGTAGCTTTGAATTTTGAATTAA AAGAGCAGCATTCCAAGTCATGGTGAGGCTAATGTAAGAAAATCTAGGCTTATAGTGAAA ATCATCTAATTTGGCACCCACTAAATGGTTAGTATTTGCTGCTATTAGAAGTCAACTACA GGTGATTAGGATGTTTGTGTATTGTATTTTTG >LITCHI028254.m2 GenomeSequence - 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