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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI028254 | Chr9 | 8167385 | 8171316 | - | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI028254.m1 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.4 | 2.00E-14 |
| LITCHI028254.m1 | 299 | 385 | PF02362.24 | B3 | Family | 48.6 | 6.40E-13 |
| LITCHI028254.m2 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.8 | 1.50E-14 |
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>LITCHI028254.m1 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGTTTTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAAGTATTTGACT CGAGGTGCCAAACATATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATT GGTTGGCACAAAGCTGCATGTTATACCAAAATGGGGTGGAAGGCATTTATGACTGAGATG AAATTAAAGGCTGATGACATCTGTGTGTTTGAGCTAGTCAGGATGGAGGACTTACAGCTG AAAGTTTCAGTGTTTTAG >LITCHI028254.m2 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGGTAAGCTTTTCAAATAAATGTGACCAACAGATTTTC ATATTAGCATTTGTTACATGA
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>LITCHI010238.m1 MASYNHVPGLSYQREGFSTPYPPSHPGHVPMYANQTPSVGPYSQILSGSSLPPNSCVDIP SAGGRNEMVFIPPPSDAVSLPPIDGQSNTGTGNSVAGDSQVIPRTQPNILDGEQNFSCQG LSLSLGTQMTSPVSMPSLQYQYQNLSFSSCLSTHLPVSGKGTIPCEGDESDKLKGFRNLS GSEMDASCNPQCSGSYKEMHPNMYQYEQIGYANTILKSKYLRAAQQLLDEIVNVRKALKQ TNSNKDQSLQGTGVDDSKTTESISNSFSELSPTERQDLQNKKTKLLSMLDEVDRRYKQYY YQMQTMVTSFDMVAGHGAAKMYTALALQTISRHFRSLRDAISGQIQVIQRSLGEQETSAN GQGGAIPRLRFVDHQLRQQRALQQLGVMRNAWRPQRGLPESSVSILRAWLFEHFLHPYPN DSEKLMLAKQTGLTRNQVANWFINARVRLWKPMVEEMYKEEFGVDPEVNSKSSSETAAKP CNENSSASEDRREEFKDTWESTIGDTINLRQVHGLKAEHNTPDVEKNRPITRSEFQNGAD GDFFSNYGMMKLQDDQRENTGAHKLYSGEMIPHNQNGNDPLMGATATFGISELSGFAIGN QVSLALGLQHRESEAFSASAGTHNGGNNTVASVGHDTVDYHCMDPGNQQDRFGNPHLLHD FVV.
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>LITCHI003174.m1 GTCTTCACCGCTATAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAATTGAAAACCCATTTTTTAACTG GGCATCCCGCGCAAAGGAAACCAAGAACCCATCCGCGTTTCTCCAAACGTCAAAACTTTT CCATCATCTGCGTCTCTTCCTTTCATATGCACTCTGCATTTCCACCCAAATTAATGATGA ATAATTCTGAAAGTAGGCAAGGAAAAGAAATTGAAAGAGCTGAATCGGAGAACTCGCCAC CCCAGCCCACATCAGATCCCAGCACAATCAAGGATGGACAGGATGAATTTTGGCTGTTCT CAGGGAAACCATACTTTGACATAATTGTTGAAAAAACCCATTTGCGTCAAATGGGGATCC CATCTAAAATCCGTTCTCTACTTCCTGCACGAGATATCCCTACTGTTCTCTCGTACAAGG GCAATGAGTGGAATATGGTTTATATAGGAAAAGGTAATAAATGCCGTAAAAGGTTTGATT CGAGTTGGAAAACATTTGTCGTGGACAATAATCTGAAGGTTGGAGATGCATGTGTATTTG AACTTATGGAATCAAGCAACGAGAAAATCAGATTCAGAGTTCAAATTCTGAGAGGTGATA TTCCATTTAAATTTAAAGACAGTGAAGATGGTGAGAGTGCGGACACACCTATTTTTATTG GATGAGATTGCCTACTTTATATCTTTTTACTTGGTGATATTATTTACTGGAAAATACTAT TCTTCTGGTTTCAATGTTCTCCAGTAGAACTTGTTACAGTGTCAGAGTGTAATTAAGCTG GATTGCAATGTCTGTTCTACTTGTAATGCCCTATGTAATACTGTTAAATTTGTATCTGGT GCGTGCCAGCATGGATATACCATCTTTTCAACTTAGTTGTCCATATGATGCCTGCTTTTT GTACAAATTCAAACAGGAACTTGGATTGCGTACATATCACACCAACTAGACTGGATGAAT 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>LITCHI001641.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTATACTTTTAGTATTTAAAATATCTATTATATTTAAAAATAAGGGCATGGGCAAAAGTA GCATATTTAAGTATTGACTTAACATTTATGTCCCTTTTGAGAAAATGTAACAGTTGAGTC ACAAGTGATATGTAAAAGTATCAATATACCCTTCCAATAAAAATATGTAATAGTAGTTGG GTTTTGAAAAAAACTTGTTCCCTCCAAAATCAAAAGCCTATGCATTTTGAAAACTTGAAA AAGCTTATTCCCCCCAAAATCAATAGCCTCTACCTCCCCCAAAATCAACGGCCTCTGTCT CCCCCAAACCTCCGCCTTTGTTGGTCGCGACTGTCTCTTCCTTTCGTCTAGTGTTTTCGT TATTGGTTTTTTCCATTTACCCATGGCACCACTAGTCACACCACACCGGTATTACTAACA ATATCTTAGTGTGACTAGTGTTTTCGCTACTGGTTTTTTCATCTACCCATGACACCACTA GTCACACTAAGGCCACTGGTATTACTAACACTCAATACTTTGGTGTGACTAGTGTTTTCA CTACTGGTTTTTCCATCTACCCATGGCACCACTAGTCACACCGAGACCATTGATATTACT AACATCCTCATGGTGTGGTGTGACTAGTGGTTAGGTCACTGTTTTGATACAAAGCCTTAA GAATGTGACTCTCTTTAATAAAAAGATCACCGAACACATACACAAACTAGTTTATTACAA TAAATGAAGATAGTTTTGCATTTGTTACAAATAAAAGCAACGATATTTCAACATACTAGT TTTGAAGATGGTGGATGGAAAGAATGGAAGTGGTTGTGAAGAAGAAAATGAAGATGGATC CTGGAATTCATAGTACAGAAGAGAATGAAGATCGATGGTGGATGGTGGCTGTGAAGATGA AAATGAAGAGAAGAAAATAGAATGACGTGGATGGTGATATGGTTGTGAAGAAGAAAATAA AGATGAATGGTGGCTGGTAGTGCAAAAGAGAACAATGTGGATGGTGAATGGTGGCTGGAA TTTGTAGTGCAGAAGAGAAGGAAGGTGGATGGTGGATGGTGGATGGTGCAAAAATGAAGA GAAAAACCAGAGAGAAAATATAAAAGAGGAAAGAGGAAATGTCAGCAGTTTTAATTTTTA AAAATGGTATTTGTGTCCAAAAAAATAAAACTTGAGACTCAATTGTTAACTTTATTGAAA TGAGATAAAATTATCAATCCAATAATTGAAAATGTCATTCGCTGACATTTCTTTAAAAAT AAAAAAAACCTTATGTAGAGTGGCCCATAAATTGAAAAGTAAAAAATGTGGTAATTTGGC AAAAAAAAAAAAAAATCTGCCACAGCAAACACAGGTATCCATTCCACTTCTCTTCTACGT GTGGAACTCAACAGTCACCAAAGATGACAACGTACGAAGAATGGCGCAGACAGAGACTGG AAGAGAACAAGAAAAGAATGGAAGAGCTGAACCTCACCAACCTCTCTCGCTCTCTCAAAC CCACCAGGCCATCTCTGGTAACCAACTCACTCACTCACTCCTCAACCATTATTCATTCAT TCTATATACATTTCATTAATGGGTTGTCCTTCTCTTTTCTCTTCATGTCAAACTCAAGAA GCGGCCTCCAAAACAGCAGGTGGAGGTGGAGCAGCCCAGAAGGTCCACTCGTGTCGCCAA CAAACCCCCTCCCAACTACACAACTGTCTGTGAACCCTTCTATCACTTTCTGTAATCTAT TTGTTTTTTCATTTTCAATATGGGGTTTTTAATGAGTGCAAATGCTATTCCTTCAAATCA ATTCCTGATTAATAAACGCGCCCTAGGGGACTTGTTTCACTTCTAAAAGTGTTTCTCTTT AAAGGGTTGTGGATATTTTGATCAAATAGGCTTTCAGTAAGCTCTGTTTGAATATAGATT TTTGAATAGTTGTAACTGGTTTGAGCTAGGATTTAAGTTGTTTATGTCACATACAGAGCA ATCCGAACCGAGTTCATGCA >LITCHI001641.m2 - 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