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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI028254 | Chr9 | 8167385 | 8171316 | - | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI028254.m1 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.4 | 2.00E-14 |
| LITCHI028254.m1 | 299 | 385 | PF02362.24 | B3 | Family | 48.6 | 6.40E-13 |
| LITCHI028254.m2 | 16 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.8 | 1.50E-14 |
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>LITCHI028254.m1 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGTTTTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAAGTATTTGACT CGAGGTGCCAAACATATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATT GGTTGGCACAAAGCTGCATGTTATACCAAAATGGGGTGGAAGGCATTTATGACTGAGATG AAATTAAAGGCTGATGACATCTGTGTGTTTGAGCTAGTCAGGATGGAGGACTTACAGCTG AAAGTTTCAGTGTTTTAG >LITCHI028254.m2 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAGGGTCATTCTTGCTTCTACTCTTGAA GATAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTTGGAGATGAACTGTCGGTT TTTGCTACACTCACCGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCACGTGGGGTTATCCTCAGAGGGG GGAAAGATTTGGTTCCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAGATTCAGTATCCCTATAATTTTAAAAAGCGTAAAGATGAGCAGAAT TTGATTCCCCACGATGAAATCGAAAATGAAGATTTTAGGCAGATAAGTGGTTTCACTAAT AGGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTGACAATTCAAAATTGAACCATGAATGTGAGAAT GAGATGCAGAGCAAGAAGCGTAAATGGGAAGAGTTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT ACGAGTGAATCAAAGCCAGGCCAATCTGAAATGGGTAAACTATGCAGTTCACAGGGAAAT TTGCATCACAGGAAGCATTTGAACAAAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATTA GCTCAAGACAGGGACCTTAAGGTTAAAAAGACCATATTGAAGACAAGCGCTCACAGTGCG GAAGACACGCACCCAACTCAAAATGAAGATGAGAAAGAATTATTGGCATTACTTGCAAGC AAAGGAATTGCTTTTAGTGAAAATTATAGAGTTTCGTCAGCTGAAGAAAGAGAAAAAATT TTCAATGTTGCAAAATCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTCTTCCGGCAA AGTCATATCTGTGGCGGTTCTGTGGTAAGCTTTTCAAATAAATGTGACCAACAGATTTTC ATATTAGCATTTGTTACATGA
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>LITCHI024701.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTACTGCAAATTGTACTAAATTCAAACCTCATAGAAAATATCTATATATAGAGCTTCTA AAATGTTTTACCGGGTTGAAATTTTACTTGATTTGATTTTGGACGTTGGCTAAAAGTTTA ATTTTAGGTATATCTGTTTGCCCGTAATTCAAATATTCGGATGTATTTTTTCTTTATATA TACGACAAATTTATACATATTTGTCAAAATACATGGTGTATATAATTTATTATAAGAGTA GATATCTTTTAGGATGTGAATAAATTTTCAAATTAAATATATTATTTAATTTTAATAGAT TTCAATAGATTTTATAAAAAAAAATTTTTTTAATTATCTTATAATTATTACAAAAATTAG GTTTCATTACAGAAAAAAGCCAAAGACAAATTTCTCTGATCTGTTCAACAATGATAGTTA CAAGCATGCAGATTCAGCTCATTCTAAAACTTACTGGTTTTATACACGCTTAGTTGAAAA CTAGCTAAGATTTATTATAAAATCTATCTCAGTTGGTCAAAAGTACTGTTTATAGAAATG CTTTTTGATAAACTTTCACATCCCATAAATAGTAGTTATATACAAACTTATATCATAAAC ATCAATTGTTTAATATATAAATCCAGAAAATGACATGTTATTCTGGCATCTTACAATCAA ACAATATGTCACTTACATTTCAAAGATAATCTCATACACCCCTTACACTACCCCACTAAA ATTAAACACAACTCTACCCCATTAAAAAAAAATGTCAAATCATTTACATCCCAAATAATA TATTCTCTATTCTTTAAAAAAAAATATATACCTTCGTCTCAATCTCAAATTCCCGTAAAA AACAAACGCAAAACGATAAAAAAAAATAAATTCTATTAATAATAAATTATTTATAATTGA AAAAAAAAAAGATTATTAAAGATTTTGTGGTAACTTTGACCTGAGGCACACCCATGACAC ATGTACTAAATGATAATTGTCAGAGTCGTCCCGGGATGGCTAGTGGGGGGTGGGGTGTGG GGTGTGGGGTCTCAACGTCATTTCAAGTAAATCATAGGGGCAATAAAGTAAAATTACACC GAAACATAAAATATATAATATAAAAAAAACACTTGTAAGTTTGTCGGTATGCGTGCAAAT GAACCACCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATTCCTCACTGTTTCAAGCTCAGACTTAGATCAC TCTTTCTGTCATTCTTTTTCTTCTCTTCTCGTTTTTTTCTGTTCTTCAAGTTATGGTTAG GGTTTTTTCACTACTTCTACCACCACCACCACCAAGCGCTCTCATTTATTTGATGTCTCT GCAAGCTGTTTTTGCTGCTGTACATTAGTGGTAGAACTCTAATGCCACAACATAGTGCTG CTCTCTTTCTTGAGAGAGGGCTTTTTCTTGCTTTCTTGGAACACCCTTTTGGTGGTTTGT GTGTTTTTTGAGTTTTTCAAGCTGGTTTGAGAAGACCCTTTTGGTTTTTTGGTGTCTGTG GTGTCAAAGATTGATACTTTTGTGTATTAGAGCTGAGTTAGTGAGTGAGATCAAGTTTTT TTTTTTTTTGTTTGTTGGTCGGGTTGGTTTTGTGGTGGAGTAAAATATTGAGGGAAAAAG AGAAGAGAGTTGTTTACAGCTTGATTATCAACCAATAAGTGTTTTGTGTATTTGTTGTCT CCCTGTAAAAGTACATCCATTTGGCGGTTTCACTCTTGATATATTACAATACAAGCTCAC TTTGAACATTTTTTTTTCTTACCTAAAACCAAAAGACTCCTGTTTGCCCTTGAAAATCAC AACTTTCATTGGTTTTATTATCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTATATGTTTTTT TCTTCAACTCAGACCAGGAATCTGAGTTTTAGAGGACTCAACCAAAACAAGTGAAGTGAC TAGCACACCCTTTACTCTTTTCTTGTGGTCTCTTGTTTGTGTGTTTTTGGATTCTGGGGT GTTTTGGATTTGGAAGAAAA
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>LITCHI024701.m1 GenomeSequence + ATGGCTATGGTGATGGCGCAGCAACAGAGAGAGAGCAGTAGTGGTAGCATAAACAAGCAC CAGCTTGATAATGGGAAATATGTTCGTTACACTGCAGAGCAAGTTGAGGCACTCGAGAGA GTCTATACAGAGTGCCCCAAGCCCAGTTCTCTTCGCAGGCAGCAGTTGATCCGAGAATGT CCTATTCTCTCCAACATCGAACCCAAACAGATCAAAGTTTGGTTCCAAAATCGAAGGTAA CAAAACAACACCAATTGAAACTGTCACTCAGTGTTTAGTGTTTGATGTCGGAACCCCCTT TTTTTTGGTATTTTGTTGTATTTTCACTTGATCAAGATTCAGTGTTAATTTTGTGATTTT ATATTTGCAAGTGTAGAGTGAACATCTGGGGTATAAAGATTGGGTTTTTCTTTGAATTGT GACTAGTAGGAGAAAAAATGGATTCTGGGGCTGATTTGTTTCTGATTTTAAAGGTTTTGT TTGGAGAAGGTGAATGAGAATGGTGTTGGTTGTGCAGGTGTCGAGAGAAGCAGCGAAAAG AGGCTTCAAGGCTCCAGACTGTGAATAGGAAATTGTCTGCTATGAATAAGCTGTTGATGG AGGAAAATGATCGATTGCAGAAACAGGTGTCTCAATTGGTGTGTGAAAATGGGTATATGC GGCAGCAGTTGCATACTGTAAGTTTATGCTCTCTGTCTTCTTTACGTTGTCATTGTGATG GTTGCGCAATATTTACTGGCGGATTTGTTCAATTTTGATTATGCATAGATAGATATGATG TTGGTATCATTATGTGGTGTTTGTGGCGAAATTGGTTAAATTTTGAATTTTATTCATTTT AGGATCACATGTCACTAGTCATTTTGGAAGGCTAATCTTCTTAGGAGGCAGTCATCTCTG TGTGTTATTGTACGTCTTTATTTGCATAGTGTGACATTGATATGCCAAGAACATCAATGG TACTGAGGTTTTTAGCCAATATGAAACTTTCTAGGCAATTTCTATGCAAAAGATTTAAGT GTTGAGATTTGTTGTTTTGTTGCTTATTATCTGCTTATCTTCCAAATCTACATTTCTGCA GCCTCCAGCAGGTACTGATGCGAGCTGTGACTCTGTGGTGACCACTCCTCAGCATTCACT GAGAGATGCTACTAACCCTGCTGGGTAATCTCGGTTGCCTATGTTCTCAAGCTCTTGTTT TTCTCTGTGAAGTCAAACTTACAGTATGTTTTCTCTGTGCATTTGACAGACTCCTCTCCA TTGCAGAGGAGACCTTGGCAGAGTTCCTTTCAAAGGCTACAGGAACTGCTGTCGATTGGG TCCAGATGCCTGGGATGAAGGTTCATTTGCTTAGACCTCTGAAAATATTATTTGTTTTTG TTTTCATGATTAGTTTTTGAATGTGAATCTTGTTGTTTAGTGCATTTCTCTTTTTATAAT CAGAAGTATATCTGACCTAGTTGTATAATTTCTATCGTTAGCCTGGTCCGGATTCGGTTG GGATCTTTGCCATTTCACAAAGTTGCAGTGGAGTGGCAGCTCGAGCCTGCGGTCTTGTGA GTTTAGAACCTACTAAGGTGAGCAGAATATTCCTGTCAACACAGTTTGTTTGTCTTGTAA TAATGTTTGTAAGGCGTTTGAAATACAATTCGATAATCCTACTAAAATTTTGACAGATTG CGGAGATCCTTAAAGATCGTCCATCTTGGTTCCGGGACTGTCGGAGCCTAGAAGTTTTCA CTATGTTTCCAGCTGGAAATGCTGGAACAATTGAACTTATATACACACAGGTGAGCAGCC ATGGTTGTAATTTTAATTTCTTTTGCTGTTTAATTTTTGAATATCTTACTGTCTCTTTTA GCTGAGTAAATGAAATTGCAATTGCATAGGTGTATGCTCCAACTACTCTGGCTCCTGCAC GGGATTTCTGGACTCTAAGATACACTACGAGTTTGGACAATGGGAGTCTTGTGGTACACA TCTTTCTGTAGTCCTGTCTGTTAGTGTGATCTATTTTGTTTGATTATTTGACAATTTTGA TCAGCACTATGAACAAACAATTAAGAGTTTTAGTAATTCAATCATGATGGACAACTTGAT GTTGCAATCTTTACTTTTAAACCATCTCTTGGTGCTTTATGCCAAAATAATAATGGTTAC CTTTACATGGTTGTAATTCGTAGATACTTAACCAAGCGTGCTAATCCAAAGTTTTTCATA TCAATATCTAAGGTCTGTGAGAGGTCTCTTTCTGGTTCTGGTGCTGGGCCAAATCCAGCA GCTGCTGCTCAGTTTGTGAGAGCTGAAATGCTTCCTAGCGGTTATCTGATCCGTCCTTGT GAGGGTGGAGGTTCAATCATCCATATTGTTGATCACCTTAATCTTGAGGTTTGCATTTTG GCAATTTACTTGTTGAATGTTTCTTATTTGGCAAAATCTTAATTCTTTACATCTTATCGC AGCCTTGGAGTGTGCCTGAGGTTCTGCGGCCACTTTATGAATCATCGAAAGTAGTGGCTC AAAAAATGACTATTGCGGTGAGTTGATCCTAGTTAATTTGAGAATATGGAGTTATACTCT AAAACTCTGTTTCTGAAAGAGAAACATGCTTAGATTACTGGTATTGCCTACTGCATCAAT ATAAGTTGTCTTGGAATATGTAACCAACTTCTGCTATGATTCATTTCCTTTTCGGCAGGA AAATAATATAACCGTTAGGTACTAAATAATCGTTTTATATGTAGGCACTGCGTTATATCA GGCAAATAGCTCAGGAGACTAGTGGTGAGGTAGTATATGGGTTGGGCCGGCAACCAGCTG TTCTAAGAACTTTTAGCCAGAGATTAAGCAGGTAGCTGTATCTTTGTCATGATTTATTTT CGTGGATATATTAACACTTAAAATATTCGGTTGTAGTCATTCACCTATCAGCTTGTGCTG ATTCAAAAATTCTGTATGTTTCTAAGAATAGAGTGTAATATCCTATCTGTTATTTTCTTG TAGAGGTTTCAATGATGCTATCAATGGTTTTAATGATGATGGCTGGTCAGTGGTCAATTG TGGTGATGGTGCTGAAGATGTGATTATTGCTGTTAACTCTACCAAGAGTTTGAGCACCAC TTCAAATCTCGTTAACTCGCTCTCATTCCTTGGAGGTATTCTTTGTGCCAAGGCTTCGAT GTTACTCCAAGTAAGTTCTAAATCTACATTCATAAAATTATAGTTTTCTGAATGGTATTT GCTAGCTGCCCGAGTTACTGACATCATCAGATTTATATGACTCCCCGATTCAAGGAAAAC ATATTAAATTTGGTGAACTGTGGTGAACCTGGGGAAACTATTAAACCGTCTGCACTAAGT ACTATAAGTCCTTTATCATGTCATTGGCTTTTAAACAAATCGGATTAATATATATCCTTT CTTCTGTCAGAATGTTCCTCCTGCTGTGCTTGTTCGCTTTCTGAGGGAGCATCGCTCAGA GTGGGCTGATTTCAATGTCGATGCTTATTCCGCTGCGTCATTGAAAGCTAATTCCTATGC CTATCCGGGAATGAGGCCTACAAGGTTTACTGGGAGCCAAATTATTATGCCACTTGGCCA CACTATTGAACATGAAGAGGTATATATTATTTAGTCCTCACATCTTTCTTATGTTTAGCC TGAAATTAAATTTATTTTTCATTTACTTTTGCAAGCTGGATTTTATCCTTTATGTGAGAG AACCTCCGCACATGATGTTAGCTTTGATAATCTATAATTTTTTAAAGCATGTCATCTGAA TTTAACACTGTACATCACATTTAATTTTGCAGCTACTTGAAGTTATTCGACTTGAAGGGC ACTCTCTTGCACAAGAAGACGCTTTTGTCTCAAGAGACATTCATCTACTGCAGGTGCCTT TCTCTTATTCTGTTTCTGTATAAGCTGTGACATTTTTTCTTTGTATATTATAATAAATTC TCTCATTTTTTCAAATTTATTATTATTATTATTATTTTCATTTGAGAACAGCTGTAATTT CTTATTTGTTGTGGGTTGTTGTCTTTGGTAGATATGTAGCGGAGTTGACGAGAATGCTGT AGGATCCTGTGCTGAACTTATTTTTGCTCCGATTGATGAGATGTTTCCTGATGATGGTCC ATTGCTGCCCTCTGGTTTCCGTGTTATCCCATTGGATTCAAAAACAGTTGAGTTAACCGA ACTTTACCTGGACCTTACATTATCTTTTGACATAATTGAAAATGTTAAACATGTGCATTA TTATATTTGTGATTTTTCTTCAGGCTTTGGATACTGTGTTACTGTATTCTATTGATTGCC CACCATGCTAAAGATGTTGTTTTACAGCCTGATACCCAGGATACAGTGACAGCAAACCGG ACCCTAGATCTGACGTCCAGTCTTGAAGTGGGGCCATTGACAAACCAAGGTTCTGGAGAT GCGCAATCTTGTCATAGCACTCGATCAGTATTGACCATTGCCTTCCAGTTTCCTTTCGAG AGCAATTTACAGGATAATGTTGCAACCATGGCACGCCAGTATGTTCGTAGTGTGATTTCA TCTGTGCAGAGGGTGGCTATGGCCATATCTCCTACAGGGTTAAGTCCAACTATTGGGCCA AAGCTTTCACCAGGCTCCCCTGAAGCACTCACACTAGCTAACTGGATTTGTCAGAGCTAT AGGTAA