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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028236 | Chr9 | 7316629 | 7318651 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028236.m1 | 83 | 172 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 67.9 | 1.00E-18 |
LITCHI028236.m1 | 294 | 388 | PF10551.12 | MULE | Domain | 89.7 | 1.40E-25 |
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>LITCHI028236.m1 ATGGATGAAAAAAAGGGCATTTATTTGAGTCACCAGTGGTTTCCGGATGTTAATAACGAT ACCTTCCATGTATCGCCCTCTGGAGACCAATGTACACGAATGTCGTCGCTTTCCCAGAGC ACTGGTAATGCTGATGCTGCTGATGGAGGTTGCAAAAGTCCGTTAGACGCTCCTAATAAC TTCTGTTGTTTAAGTACATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCATTTCTGTTGATGATGCA GAAGCATTTTACCATAAATATTCAGTTGTGGTTGGTTTTAGTGTGCGTAAGGACATGCTA CGAAAGGATGCAAATGGGTTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCCAAGGAGGGGTTC ATACAGAAAAAGTACTTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGCGAGTCAAAAGGCATAACTCGG GAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGTATGTGGGTTGTG AACGAGTTCGTAACGGAACATTGTCATCCCTTAGCGACTCCAAACCAGGCGCAGTTTCTT CGTTCGCATCGTCATGTTCCGCCTGCCAACATTGCACAAGCTGAATCGTGGAAATATATT GGGGTTCGCACCTCTCAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAAGCAGGCAGTCATGCAGCT GTTGGTCACACTCGTAAAGACTTACAAAATGGGTTGGATTCCAAACATAGGTGTACCTCA ACCAATGGGGATGCAGACGCAGTTATTGCGTACATGACAGGAAAACAACAAATGGATGGT AATTTTTTTTTCAAGTTTACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATTTTTTGGGCC GACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTCGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCGACG TACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTCGGCGTGAATAACCATAAC AAAACAACAGTTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACATGG GTCCTCAAAACATTTCTGGAAGCAATGCAACATAAGCATCCTGTAGCTGTTGTGACGGAT GGCGATATTGCGATGCATAAAGCACTAAAGACAGTAATGCCTGGGGCAACTAGGCGATTA TGTGCATGGCATCTGGAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTTGCCTTCACTAGG GAGTTCACGACCTGCATGCTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAACAGTATTGGTCG ATGATGGTTGCAACGTATAAATTAGAGGATAACGCTTGGGTTAGAAAGTTGTTTGGCAGA CGAAAGCAATGGGCAGAAACGTTTTTGAGAACCACTTTCTTTGGGGGCATGCGAAGCACG CAACGTTCTGAGAGTATAAACCGTTTATTTAATAAATATTTGAACCGTCGTCTGAAGTTA TTCGAGTTCGTCAGCCAAACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGCCACAATGAGGCAAGA GACAACTTTGAGAACATTAATTCGCAGCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTGCAAATAGAG ACACATGCATCAGAAGTTTATACTCGCAACTTATTCTTAAAAGTAAGGGATGAAATCAAT TCAGAAGCAACGCTAAGCATCGTAAATTGTGCCACTGATATGACACAACAAATATTTACA TTTAAAAAGTTTGCGTGTGGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAACTGAAAAT AGCTTCCTATGCTCATGCAAATTGTTTCAGACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTC AGTGCAATGAAAGCTATGAACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATATTGCGTCGGTGG ACAAAGAATGCAAAGGCCGACGACGACGTTGATAAGGTGGTGCAAATGTTGTTCACATGG CACGGCTACGCGGCCACGTTCTAG
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>LITCHI028236.m1 MDEKKGIYLSHQWFPDVNNDTFHVSPSGDQCTRMSSLSQSTGNADAADGGCKSPLDAPNN FCCLSTSDVMGKEFISVDDAEAFYHKYSVVVGFSVRKDMLRKDANGLITCRRWVCSKEGF IQKKYLERRDRQRESKGITREGCRAAMRIKFNREKSMWVVNEFVTEHCHPLATPNQAQFL RSHRHVPPANIAQAESWKYIGVRTSQVMEHMVHQAGSHAAVGHTRKDLQNGLDSKHRCTS TNGDADAVIAYMTGKQQMDGNFFFKFTITEDGSLGNIFWADSQSRIDYHYFGDVVSFDST YKTNAYNRPLVIFVGVNNHNKTTVFGFCLVVDETIATYTWVLKTFLEAMQHKHPVAVVTD GDIAMHKALKTVMPGATRRLCAWHLERNVQTNICNVAFTREFTTCMLTYMTELDFQQYWS MMVATYKLEDNAWVRKLFGRRKQWAETFLRTTFFGGMRSTQRSESINRLFNKYLNRRLKL FEFVSQTHRVMERLRHNEARDNFENINSQPMLETHLLQIETHASEVYTRNLFLKVRDEIN SEATLSIVNCATDMTQQIFTFKKFACGETTWDVVYNPTENSFLCSCKLFQTLGIPCCHIF SAMKAMNIDCLPESLILRRWTKNAKADDDVDKVVQMLFTWHGYAATF.
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>LITCHI028236.m1 ATGGATGAAAAAAAGGGCATTTATTTGAGTCACCAGTGGTTTCCGGATGTTAATAACGAT ACCTTCCATGTATCGCCCTCTGGAGACCAATGTACACGAATGTCGTCGCTTTCCCAGAGC ACTGGTAATGCTGATGCTGCTGATGGAGGTTGCAAAAGTCCGTTAGACGCTCCTAATAAC TTCTGTTGTTTAAGTACATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCATTTCTGTTGATGATGCA GAAGCATTTTACCATAAATATTCAGTTGTGGTTGGTTTTAGTGTGCGTAAGGACATGCTA CGAAAGGATGCAAATGGGTTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCCAAGGAGGGGTTC ATACAGAAAAAGTACTTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGCGAGTCAAAAGGCATAACTCGG GAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGTATGTGGGTTGTG AACGAGTTCGTAACGGAACATTGTCATCCCTTAGCGACTCCAAACCAGGCGCAGTTTCTT CGTTCGCATCGTCATGTTCCGCCTGCCAACATTGCACAAGCTGAATCGTGGAAATATATT GGGGTTCGCACCTCTCAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAAGCAGGCAGTCATGCAGCT GTTGGTCACACTCGTAAAGACTTACAAAATGGGTTGGATTCCAAACATAGGTGTACCTCA ACCAATGGGGATGCAGACGCAGTTATTGCGTACATGACAGGAAAACAACAAATGGATGGT AATTTTTTTTTCAAGTTTACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATTTTTTGGGCC GACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTCGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCGACG TACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTCGGCGTGAATAACCATAAC AAAACAACAGTTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACATGG GTCCTCAAAACATTTCTGGAAGCAATGCAACATAAGCATCCTGTAGCTGTTGTGACGGAT GGCGATATTGCGATGCATAAAGCACTAAAGACAGTAATGCCTGGGGCAACTAGGCGATTA TGTGCATGGCATCTGGAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTTGCCTTCACTAGG GAGTTCACGACCTGCATGCTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAACAGTATTGGTCG ATGATGGTTGCAACGTATAAATTAGAGGATAACGCTTGGGTTAGAAAGTTGTTTGGCAGA CGAAAGCAATGGGCAGAAACGTTTTTGAGAACCACTTTCTTTGGGGGCATGCGAAGCACG CAACGTTCTGAGAGTATAAACCGTTTATTTAATAAATATTTGAACCGTCGTCTGAAGTTA TTCGAGTTCGTCAGCCAAACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGCCACAATGAGGCAAGA GACAACTTTGAGAACATTAATTCGCAGCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTGCAAATAGAG ACACATGCATCAGAAGTTTATACTCGCAACTTATTCTTAAAAGTAAGGGATGAAATCAAT TCAGAAGCAACGCTAAGCATCGTAAATTGTGCCACTGATATGACACAACAAATATTTACA TTTAAAAAGTTTGCGTGTGGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAACTGAAAAT AGCTTCCTATGCTCATGCAAATTGTTTCAGACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTC AGTGCAATGAAAGCTATGAACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATATTGCGTCGGTGG ACAAAGAATGCAAAGGCCGACGACGACGTTGATAAGGTGGTGCAAATGTTGTTCACATGG CACGGCTACGCGGCCACGTTCTAG
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>LITCHI028236.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATCAGAAGTTCACTGTCGAGTATGCATTCTGGTGTACCTTTGCTTCACACAATCTCCTTC CAAGTAAACACTTCACCAAAATCAGGGAACCCAGAGCGAGACTTGTACATGCTATTGGCA CTAACCGACCCATCAACGTTGGGAAGTGTATTTTCACGGCAATATATGATGCCGGCACTG CTACGAGGTATGGATTCCCTTTTCCTGCCCTTATAACTCAATTTTGTTTGAATGCTGGTG TTCCAACGGAGGTGGGCGATTTGTGGGTGTCTCCACCCAAGCCAATAGATGGCGTCACAT ATGATACCTTGCACGACCGCATTATGAATGGTAACAAACCGAATGCAGAGCGGAAAGCAA AGAAAATCCGTAAGGACAGTTGCCCGTCAACATGTAGCAATGAGGCACAACCACCTGCTT GGGTTTCTGATATTTTTGCTGCAGTTAATGCTATACAGGAGCGTCAAGAACAAGCCATTG CAAACCTTAAGGCACAGCAGGAGAAATTGTTCGCATCAATGTGCTCCCAACTTACGAGTC ATGGACAGTCCCTTACTCATGTTACGCAGCTACTGCATGAGGCAAAAACACCTGCCACAA AAGAAACAACTGTGCAGCAGGGCGATGTACTGGGTGAGGGATAACATGTATGGTGGATGT TATATAGGTGTCAGTTGGATGCAGATTGTAAGGTACATATCAGGTGGCAAAATTGAAGTT ATGACAACAGTTGTATTTAAACCAAACACTGTCGGCGCTTTTGGTTTTAAGTGGATGGTC CACGGTGACGGCTTATGGTTGCTGTTTTTGTTTTCGCAGTGACTGTACTGACTTTGTATT TGTCCGTTGCAAGTGTAAGCATGTGGTGATAGGCATGGTGCAGTGCTACCATGTATGAAC TTATTGTTTGGTAATGTTAATAGAATTTTATTTGCTGCTTGTTTTGCGGATGTACGGAAT GCCATGCAACTGCATCTAATTGCCATTCACCATCTCGATGCTGATAGTTGATAGGAGTTG AAGTTGCAAACTGGTGTGGTTAAAATACCTCATCAGGGATAGTTACATATATAACTATAT GTATATTTGACCTACTGTGTGTGTTAGTAATTAACTGTTCGCGCATCCAATGTAATGCAC ATTTAATCTTTTTTTAACAAGTATGTTTTTTTTTAAGGTTGATGCCATGTATATTATCAT ACTATTGACAATTTCGTTTATGTCATTTTATGTTGACATAGATAAAACTTTAAAAATTTC AGGAGATTGATTTACAAATGTGAAAACAATGTTCCCGGCATATAGGGTATCATTTCACAT TCAAGATATATGTAGTCAACGTCGATTTTTGGAAGTTACAAGCTGAAATTCCCTTAACAA ACTGTTTAACCAACCCCCTCTTAATGTTGTGAACAAACCTTTTAACCAACCACCTCCTCC TTTGCTTATGTCTTCAATTATGAATGCAAACCTTTTAACCAACCACCTCCTCCCTTGGTT ACGTGGGCAAATGTCTCATAAATGGATTTATATCAACCACCAACCACTTTCCCTAAAACA ACAACATATTAAGTCTTATACAGCTCCCTTTTGCCTATTTCCTGCAACATCCAACTTGGG TCAAACAACACCAACAACGGTTGCAGTTGCTTCATACAAGCTGCAGAGGTCATGATCAAG TGTCCCACAAAGGCATAGGTAATAATATATGTGCTGGTGGTGTAGTTGCTTTGCAAGTAA ACAAAATGTGGGTGTACTCTGGTATTGGTTATATGCATGAACCTTGACACAGAATAACAC AGTGGTCATCATACACCCAGATATATATACACAGACACATATATATGCTTGTGTATATAT ATATACTTATACGCACACAGACACACATACATATATATATATGTATCTATGACATCAACA TATAATAATACATGTACCACCGTAGCTAGATCGATACATTCCACAGTAAGTGACCTTTAT TTTGTTTGGATCGTGCAGGG
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>LITCHI028236.m1 GenomeSequence + ATGGATGAAAAAAAGGGCATTTATTTGAGTCACCAGTGGTTTCCGGATGTTAATAACGAT ACCTTCCATGTATCGCCCTCTGGAGACCAATGTACACGAATGTCGTCGCTTTCCCAGAGC ACTGGTAATGCTGATGCTGCTGATGGAGGTTGCAAAAGTCCGTTAGACGCTCCTAATAAC TTCTGTTGTTTAAGTACATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCATTTCTGTTGATGATGCA GAAGCATTTTACCATAAATATTCAGTTGTGGTTGGTTTTAGTGTGCGTAAGGACATGCTA CGAAAGGATGCAAATGGGTTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCCAAGGAGGGGTTC ATACAGAAAAAGTACTTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGCGAGTCAAAAGGCATAACTCGG GAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGTATGTGGGTTGTG AACGAGTTCGTAACGGAACATTGTCATCCCTTAGCGACTCCAAACCAGGCGCAGTTTCTT CGTTCGCATCGTCATGTTCCGCCTGCCAACATTGCACAAGCTGAATCGTGGAAATATATT GGGGTTCGCACCTCTCAAGTGATGGAGCATATGGTCCACCAAGCAGGCAGTCATGCAGCT GTTGGTCACACTCGTAAAGACTTACAAAATGGGTTGGATTCCAAACATAGGTGTACCTCA ACCAATGGGGATGCAGACGCAGTTATTGCGTACATGACAGGAAAACAACAAATGGATGGT AATTTTTTTTTCAAGTTTACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGGAACATTTTTTGGGCC GACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTCGGCGATGTTGTATCTTTCGATTCGACG TACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTCGGCGTGAATAACCATAAC AAAACAACAGTTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCCACATATACATGG GTCCTCAAAACATTTCTGGAAGCAATGCAACATAAGCATCCTGTAGCTGTTGTGACGGAT GGCGATATTGCGATGCATAAAGCACTAAAGACAGTAATGCCTGGGGCAACTAGGCGATTA TGTGCATGGCATCTGGAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTTGCCTTCACTAGG GAGTTCACGACCTGCATGCTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAACAGTATTGGTCG ATGATGGTTGCAACGTATAAATTAGAGGATAACGCTTGGGTTAGAAAGTTGTTTGGCAGA CGAAAGCAATGGGCAGAAACGTTTTTGAGAACCACTTTCTTTGGGGGCATGCGAAGCACG CAACGTTCTGAGAGTATAAACCGTTTATTTAATAAATATTTGAACCGTCGTCTGAAGTTA TTCGAGTTCGTCAGCCAAACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGCCACAATGAGGCAAGA GACAACTTTGAGAACATTAATTCGCAGCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTGCAAATAGAG ACACATGCATCAGAAGTTTATACTCGCAACTTATTCTTAAAAGTAAGGGATGAAATCAAT TCAGAAGCAACGCTAAGCATCGTAAATTGTGCCACTGATATGACACAACAAATATTTACA TTTAAAAAGTTTGCGTGTGGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAACTGAAAAT AGCTTCCTATGCTCATGCAAATTGTTTCAGACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTC AGTGCAATGAAAGCTATGAACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATATTGCGTCGGTGG ACAAAGAATGCAAAGGCCGACGACGACGTTGATAAGGTGGTGCAAATGTTGTTCACATGG CACGGTAAACTTCATTTTCTGTTTCCTTTATATTATGTAAACATCTTTTTTATATTAATA TCATTCATGTATTGTATAGGAAGGCTACGCGGCCACGTTCTAG