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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI028022 | Chr9 | 1547135 | 1553291 | + | Regulatory protein NPR3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI028022.m1 | 54 | 170 | PF00651.34 | BTB | Domain | 46.8 | 3.10E-12 |
LITCHI028022.m1 | 216 | 264 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 42.1 | 7.50E-11 |
LITCHI028022.m1 | 264 | 346 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 28.1 | 2.40E-06 |
LITCHI028022.m1 | 363 | 563 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 316.3 | 8.30E-95 |
LITCHI028022.m2 | 54 | 170 | PF00651.34 | BTB | Domain | 46.9 | 2.90E-12 |
LITCHI028022.m2 | 216 | 264 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 42.3 | 6.70E-11 |
LITCHI028022.m2 | 264 | 346 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 28.3 | 2.20E-06 |
LITCHI028022.m2 | 363 | 491 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 187.6 | 2.00E-55 |
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>LITCHI028022.m1 ATGGCAATTTCGTCGGAACCATCATCATCTTTGAGCTTCACTTCGAATGGTTCGATCAGT CAGTGTTCGGCCTCAGAGGCGGGTCCTAATCTGGAGGTTATCAGCCTAAGCAAGCTGAGT TCTAGTTTGGAGCAACTCTTGGTTGTTGATTCAACATGTGATTATAGCGATGCGGAGGTG ATTGTTGAAGGTGTCTCAGTTGGGGTTCATCGATGTATTCTGGCGGCTAGAAGTACGTTT TTTCATGACTTGTTTAAGAAGCCATCGTCGTCGTCTTCGGAAGGGAAGCCGAAATATTGT ATGAGGGAGTTGTTGCCTTATGGGAACGTGGGATATGAAGCTTTTTCGATATTTTTGAGC TATTTGTACACTGGAAAGTTGAAGCCTTCTCCTGTGGAGGTCTCGACTTGTGTTGATAAT GTATGCGCCCATGATGCTTGTAGACCTGCTATTAATTTTGCAGTCGAGATGATGTATGCC TCCTCTATATTTCAAGTACCAGAGCTCGTTTCGCTTTACCAGCGACGTCTACTTAACTTT GTTGAAAAAGCTCTTGTGGAAGATGTTATTCCAATCCTTTTGGTTGCCTTCCATTGTAAA TCGAGTCAGCTTGTTGCTCAATGTGTTGACAGAGTAGTACGTTCTGATCTTGACGGTATC TGCATTGAGAAAGAGCTTCCCACTGAAGTTGCAGAGAATATTAGAAAGCTCCGGCTCAAG CCTCTTCCTGATGATGAAAACGATATGGTTGAAGGAGACCCTTTGCGTGAGAAGAGAATC AGGAGGATACATAGGGCATTAGATTCGGATGATGTTGAACTTGTTAAACTTCTCTTGTCT GAGTCAGATATAACCTTGGATGAAGCCAATGCTCTCCATTATGCTGCAGCCTACTGTGAT CCCAAGGTTCTGTCAGAGGTTCTCAGCCTTTGTTTGGCTGATGTCAACCTTAGAAATTCT CGGGGTTACACAGTTCTCCATATTGGAGCAATGCGCAAGGAGCCATCTGTGATCGTATCG CTTCTGACTAAAGGAGCTTGTGCATCCGATTTGACATTGGATGGGCGGAGCGCTGTTAGC ATCTGCCAGAGGTTGACTAGGCCTAAAGATTATCATGCCAAGACAGAGCAAGGACAAGAA ACGAATAAAGACCGCATTTGCATTGATGTTCTCGAGAGAGAAATGAGGAGGAATCCAATG GCTGGGGATGCATCCGTGACATCCCAAACCCTTGCTGATGATTTGCATATGAAACTGCTA TACTTAGAAAACAGAGTGGCATTTGCACGACTATTATTCCCTACTGAAGCGAAGCTAGCT ATGGACATAGCACATACTGAGACAACATCTGAGTTTGCTGGTCTTTCTGCTTCAAAAGGT TCGAGTGGAAACTTAAGAGAGGTTGACTTGAATGAAACGCCTGTCATGCAGAACAAAAGA CTTCGTTCGAGGATGGAAGCCCTTATGAAAACAGTGGAGATGGGTCGACGCTATTTCCCC CATTGTTCAGAAGTGTTGGATAAGTTCATGGATGATGACCTTCCTGATTTGTTTTACCTC GAGAAAGGCTCCATGGATGAGCAGAGAATCAAGCGGACACGCTTCATGGAACTTAAAGAG GATGTTCAGAAGGCATTTAATAAGGACAAAGCTGAGCGCTCCGGGTTGTCTTCCTCATCA TCTTCGACATCTATAAAAGATGGTATGAGAAACAAGCTCAGAAAGTTGTGA >LITCHI028022.m2 ATGGCAATTTCGTCGGAACCATCATCATCTTTGAGCTTCACTTCGAATGGTTCGATCAGT CAGTGTTCGGCCTCAGAGGCGGGTCCTAATCTGGAGGTTATCAGCCTAAGCAAGCTGAGT TCTAGTTTGGAGCAACTCTTGGTTGTTGATTCAACATGTGATTATAGCGATGCGGAGGTG ATTGTTGAAGGTGTCTCAGTTGGGGTTCATCGATGTATTCTGGCGGCTAGAAGTACGTTT TTTCATGACTTGTTTAAGAAGCCATCGTCGTCGTCTTCGGAAGGGAAGCCGAAATATTGT ATGAGGGAGTTGTTGCCTTATGGGAACGTGGGATATGAAGCTTTTTCGATATTTTTGAGC TATTTGTACACTGGAAAGTTGAAGCCTTCTCCTGTGGAGGTCTCGACTTGTGTTGATAAT GTATGCGCCCATGATGCTTGTAGACCTGCTATTAATTTTGCAGTCGAGATGATGTATGCC TCCTCTATATTTCAAGTACCAGAGCTCGTTTCGCTTTACCAGCGACGTCTACTTAACTTT GTTGAAAAAGCTCTTGTGGAAGATGTTATTCCAATCCTTTTGGTTGCCTTCCATTGTAAA TCGAGTCAGCTTGTTGCTCAATGTGTTGACAGAGTAGTACGTTCTGATCTTGACGGTATC TGCATTGAGAAAGAGCTTCCCACTGAAGTTGCAGAGAATATTAGAAAGCTCCGGCTCAAG CCTCTTCCTGATGATGAAAACGATATGGTTGAAGGAGACCCTTTGCGTGAGAAGAGAATC AGGAGGATACATAGGGCATTAGATTCGGATGATGTTGAACTTGTTAAACTTCTCTTGTCT GAGTCAGATATAACCTTGGATGAAGCCAATGCTCTCCATTATGCTGCAGCCTACTGTGAT CCCAAGGTTCTGTCAGAGGTTCTCAGCCTTTGTTTGGCTGATGTCAACCTTAGAAATTCT CGGGGTTACACAGTTCTCCATATTGGAGCAATGCGCAAGGAGCCATCTGTGATCGTATCG CTTCTGACTAAAGGAGCTTGTGCATCCGATTTGACATTGGATGGGCGGAGCGCTGTTAGC ATCTGCCAGAGGTTGACTAGGCCTAAAGATTATCATGCCAAGACAGAGCAAGGACAAGAA ACGAATAAAGACCGCATTTGCATTGATGTTCTCGAGAGAGAAATGAGGAGGAATCCAATG GCTGGGGATGCATCCGTGACATCCCAAACCCTTGCTGATGATTTGCATATGAAACTGCTA TACTTAGAAAACAGAGTGGCATTTGCACGACTATTATTCCCTACTGAAGCGAAGCTAGCT ATGGACATAGCACATACTGAGACAACATCTGAGTTTGCTGGTCTTTCTGCTTCAAAAGGT TCGAGTGGAAACTTAAGAGAGGTTGACTTGAATGAAACGCCTGTCATGCAGAACAAAAGA CTTCGTTCGAGGATGGAAGCCCTTATGAAAACAGGTAAATGCAAGCTGCAAATCTCTTCT ACATTCGGATGTTTTGTTTATGTCATAGTCTTGTTTTGTTTAATGGAATTTTTATTTTTC AATTCCGATCAAATGGATGCTTTGGTTTTCATATTTTCTTAA
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>LITCHI028022.m1 MAISSEPSSSLSFTSNGSISQCSASEAGPNLEVISLSKLSSSLEQLLVVDSTCDYSDAEV IVEGVSVGVHRCILAARSTFFHDLFKKPSSSSSEGKPKYCMRELLPYGNVGYEAFSIFLS YLYTGKLKPSPVEVSTCVDNVCAHDACRPAINFAVEMMYASSIFQVPELVSLYQRRLLNF VEKALVEDVIPILLVAFHCKSSQLVAQCVDRVVRSDLDGICIEKELPTEVAENIRKLRLK PLPDDENDMVEGDPLREKRIRRIHRALDSDDVELVKLLLSESDITLDEANALHYAAAYCD PKVLSEVLSLCLADVNLRNSRGYTVLHIGAMRKEPSVIVSLLTKGACASDLTLDGRSAVS ICQRLTRPKDYHAKTEQGQETNKDRICIDVLEREMRRNPMAGDASVTSQTLADDLHMKLL YLENRVAFARLLFPTEAKLAMDIAHTETTSEFAGLSASKGSSGNLREVDLNETPVMQNKR LRSRMEALMKTVEMGRRYFPHCSEVLDKFMDDDLPDLFYLEKGSMDEQRIKRTRFMELKE DVQKAFNKDKAERSGLSSSSSSTSIKDGMRNKLRKL. >LITCHI028022.m2 MAISSEPSSSLSFTSNGSISQCSASEAGPNLEVISLSKLSSSLEQLLVVDSTCDYSDAEV IVEGVSVGVHRCILAARSTFFHDLFKKPSSSSSEGKPKYCMRELLPYGNVGYEAFSIFLS YLYTGKLKPSPVEVSTCVDNVCAHDACRPAINFAVEMMYASSIFQVPELVSLYQRRLLNF VEKALVEDVIPILLVAFHCKSSQLVAQCVDRVVRSDLDGICIEKELPTEVAENIRKLRLK PLPDDENDMVEGDPLREKRIRRIHRALDSDDVELVKLLLSESDITLDEANALHYAAAYCD PKVLSEVLSLCLADVNLRNSRGYTVLHIGAMRKEPSVIVSLLTKGACASDLTLDGRSAVS ICQRLTRPKDYHAKTEQGQETNKDRICIDVLEREMRRNPMAGDASVTSQTLADDLHMKLL YLENRVAFARLLFPTEAKLAMDIAHTETTSEFAGLSASKGSSGNLREVDLNETPVMQNKR LRSRMEALMKTGKCKLQISSTFGCFVYVIVLFCLMEFLFFNSDQMDALVFIFS.
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>LITCHI028022.m2 AAAAGGTGAACCAAAGTAGACGCAAGGGATAATGATTCCCGACATAAGATAACATTTTTA TCTTTAACTTGTCATGGGAAAGAAAAGACTTACGGGGCTGTGAGGGCGTCGTGTTCGTGT ATGTCTGCGTGTGAATAAAACCTAAAATTAAAAATACTATTCTCTCAATGAAATGACGCC ATTGTTGACATCACAAGAAACCAGCTACTAGTGGTGACATCACCTAAATCGTCACCAAAA CGACTACATCTCTCCAACGACTCCCTGTTGCGGAAAGCGAAAAACGAAATTTCTTGTTAA CAGCACACGTTTTTTCCTCCTCCTTTTGGCACCCATCATCAGATCACAACAAATCTATCA GCTTCTTCTTCTACCCAGATGGGGATCTGATTGATCGCAAGCTGCGTTTTTAGTTGATAC CCAGATGGCAATTTCGTCGGAACCATCATCATCTTTGAGCTTCACTTCGAATGGTTCGAT CAGTCAGTGTTCGGCCTCAGAGGCGGGTCCTAATCTGGAGGTTATCAGCCTAAGCAAGCT GAGTTCTAGTTTGGAGCAACTCTTGGTTGTTGATTCAACATGTGATTATAGCGATGCGGA GGTGATTGTTGAAGGTGTCTCAGTTGGGGTTCATCGATGTATTCTGGCGGCTAGAAGTAC GTTTTTTCATGACTTGTTTAAGAAGCCATCGTCGTCGTCTTCGGAAGGGAAGCCGAAATA TTGTATGAGGGAGTTGTTGCCTTATGGGAACGTGGGATATGAAGCTTTTTCGATATTTTT GAGCTATTTGTACACTGGAAAGTTGAAGCCTTCTCCTGTGGAGGTCTCGACTTGTGTTGA TAATGTATGCGCCCATGATGCTTGTAGACCTGCTATTAATTTTGCAGTCGAGATGATGTA TGCCTCCTCTATATTTCAAGTACCAGAGCTCGTTTCGCTTTACCAGCGACGTCTACTTAA 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TTAATGCGACAATTGTTTGGAATTTGATCTTAGTAGTTAGTATTGTTTGAGGCTAACTCA CATTTTTTCATGTGGCAACCTCAAAGATATTGAATTTGAAGCAAGAATTTGTTCTGTCAA AATTGACATGAAATGAATTACAACCTGCAATCATCAGTAACTTTTTCAGTACAAAATTTC CATTTATGGTTTCCATAGTTGCTCTTATCTAAGCTATGGTTGTTGTGATGATAGTGGAGA TGGGTCGACGCTATTTCCCCCATTGTTCAGAAGTGTTGGATAAGTTCATGGATGATGACC TTCCTGATTTGTTTTACCTCGAGAAAGGCTCCATGGATGAGCAGAGAATCAAGCGGACAC GCTTCATGGAACTTAAAGAGGATGTTCAGAAGGCATTTAATAAGGACAAAGCTGAGCGCT CCGGGTTGTCTTCCTCATCATCTTCGACATCTATAAAAGATGGTATGAGAAACAAGCTCA GAAAGTTGTGATGGCCTGTAAAATAGGTTGTTCCATGATTACTTACTGAGTTGGATAGTT TTGGATGAAAATTTCTGGTGAGATCCTGTAATTTGTTTGGCTCACTTTCTGTACAATTTG AGCCAAGAGCAAACTTGCTGTTCTGTACACTACCTTTTGTGCAATTAAACCAGCAAAATC ATCACACTTTTGAGAGCTACTAGGTATATGTTCAGACTTCATATAGGAATACTGCAACTA TAATATATGTCCATTGCATTTTTGCTGACTTGGGCTCCGTGTAAAAATAGATCTGTGAAA TAATTATAGTACTACCAAGACAATTTCATAGCTGAAAAATTAACACCCTGTTGAAATGAA TCATATGTTTTTTTTCTGTGGAACGAGATTGATGTATCTTTCTCTCTGTTGTACACTGCA TTCAATTTCTTCAATGACTAGACCACAATAACATAGAAAAGCATTACTGGTTGGCAAGTA TTTCACAATTAACAAGTGTTTACCACGTTATTAATTTAATAAAATAATTTCATGTATTCT AAATTGAATTAAAAGGGATTAAAGTTATTAGAATAGAGAATTTAGGGAAG >LITCHI028022.m1 AAAAGGTGAACCAAAGTAGACGCAAGGGATAATGATTCCCGACATAAGATAACATTTTTA TCTTTAACTTGTCATGGGAAAGAAAAGACTTACGGGGCTGTGAGGGCGTCGTGTTCGTGT ATGTCTGCGTGTGAATAAAACCTAAAATTAAAAATACTATTCTCTCAATGAAATGACGCC ATTGTTGACATCACAAGAAACCAGCTACTAGTGGTGACATCACCTAAATCGTCACCAAAA CGACTACATCTCTCCAACGACTCCCTGTTGCGGAAAGCGAAAAACGAAATTTCTTGTTAA CAGCACACGTTTTTTCCTCCTCCTTTTGGCACCCATCATCAGATCACAACAAATCTATCA GCTTCTTCTTCTACCCAGATGGGGATCTGATTGATCGCAAGCTGCGTTTTTAGTTGATAC CCAGATGGCAATTTCGTCGGAACCATCATCATCTTTGAGCTTCACTTCGAATGGTTCGAT CAGTCAGTGTTCGGCCTCAGAGGCGGGTCCTAATCTGGAGGTTATCAGCCTAAGCAAGCT GAGTTCTAGTTTGGAGCAACTCTTGGTTGTTGATTCAACATGTGATTATAGCGATGCGGA GGTGATTGTTGAAGGTGTCTCAGTTGGGGTTCATCGATGTATTCTGGCGGCTAGAAGTAC GTTTTTTCATGACTTGTTTAAGAAGCCATCGTCGTCGTCTTCGGAAGGGAAGCCGAAATA TTGTATGAGGGAGTTGTTGCCTTATGGGAACGTGGGATATGAAGCTTTTTCGATATTTTT GAGCTATTTGTACACTGGAAAGTTGAAGCCTTCTCCTGTGGAGGTCTCGACTTGTGTTGA 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