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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027928 | Chr3 | 34937101 | 34942182 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 11 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027928.m1 | 217 | 296 | PF16543.8 | DFRP_C | Domain | 61.1 | 1.20E-16 |
LITCHI027928.m2 | 217 | 296 | PF16543.8 | DFRP_C | Domain | 61 | 1.30E-16 |
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>LITCHI027928.m1 ATGCCGCCGAAGCCGAAGCCATCGAAGGCCGATGTGGCGAAGAAGCAGAAAGTGGTGGAA GACAAAACCTTCGGCCTGAAGAACAAGAACAAGAGCAAAAATGTCCAGAAATACGTCCAA AGTCTTCAACAAGCCGTTCAGCCCAAACCTGACCAGTCCAAAGTCGCCGCCAAGAAAAAG AAAGAGGAAGAGAAAGCGAGAGAGAAGGAGCTGAACGAATTGTTCAAGGTTGCTGTGAGT CAGCCGAAGGTACCAGTCGGTGTGGATCCGAAATCCATAGTGTGCGAGTTTTTCAAGGTT GGACAGTGTCAAAAGGGTTTCAAATGCAAGTTCTCACATGACTTGAATGTTCAGAGGAAG GGTGAAAAGATTGATATTTATAGTGATAAGCGTGATGAAGAAACGATGGAGGATTGGGAT CAAGCAACACTGGAGAAGGTTGTTGAGTCGAAGAAGAACGAGTATAATCAGAATAAACCA ACTGAGATTGTTTGCAAATACTTTTTGGAAGCAGTGGAAAAGAAACAATATGGTTGGTTT TGGGTTTGTCCAAATGGTGGCAAAGATTGTCACTACAGACATGCTCTTCCTCCTGGATAT GTCTTAAAATCTCAAATGAAGGCACTTCTAGAGGAAGAGAGTGAGAAAATGCCTATTGAA GAAGAAATTGAAGATCAGCGTGCAAAATTAACGGCATCAACTCCAATGACTCCTGAGCTG TTTATGCAATGGAAGCAGAAAAAGACAGAAGAAAGAGAGGCAGGCTTAGCTGCACAACGA GCTGAGAGGGCTAAGAATGACCGTATGAGTGGTCGTGAGTTGTTTCTTTCGGATGCAAGC TTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCATATGAAAAATACCAGAGAGAAGAAGAACCTGAGAGC ACCAAACAAAGGGTTAAGGATGAATCGTCAGCAGCTGGAACAAGCTCTTCCACTAACACC GTGGCTAATTCTGAAGAAATCCTTCTTGATGATGATGATGATGACGATGACGAGCTGGAC ATGGACGAGCTAAATGAACTTGAAGCAAGTTTGTCAAGAACATCTATTCAGATTCGCGAA CCAGGTATTGAAGCTTCTTAA >LITCHI027928.m2 ATGCCGCCGAAGCCGAAGCCATCGAAGGCCGATGTGGCGAAGAAGCAGAAAGTGGTGGAA GACAAAACCTTCGGCCTGAAGAACAAGAACAAGAGCAAAAATGTCCAGAAATACGTCCAA AGTCTTCAACAAGCCGTTCAGCCCAAACCTGACCAGTCCAAAGTCGCCGCCAAGAAAAAG AAAGAGGAAGAGAAAGCGAGAGAGAAGGAGCTGAACGAATTGTTCAAGGTTGCTGTGAGT CAGCCGAAGGTACCAGTCGGTGTGGATCCGAAATCCATAGTGTGCGAGTTTTTCAAGGTT GGACAGTGTCAAAAGGGTTTCAAATGCAAGTTCTCACATGACTTGAATGTTCAGAGGAAG GGTGAAAAGATTGATATTTATAGTGATAAGCGTGATGAAGAAACGATGGAGGATTGGGAT CAAGCAACACTGGAGAAGGTTGTTGAGTCGAAGAAGAACGAGTATAATCAGAATAAACCA ACTGAGATTGTTTGCAAATACTTTTTGGAAGCAGTGGAAAAGAAACAATATGGTTGGTTT TGGGTTTGTCCAAATGGTGGCAAAGATTGTCACTACAGACATGCTCTTCCTCCTGGATAT GTCTTAAAATCTCAAATGAAGGCACTTCTAGAGGAAGAGAGTGAGAAAATGCCTATTGAA GAAGAAATTGAAGATCAGCGTGCAAAATTAACGGCATCAACTCCAATGACTCCTGAGCTG TTTATGCAATGGAAGCAGAAAAAGACAGAAGAAAGAGAGGCAGGCTTAGCTGCACAACGA GCTGAGAGGGCTAAGAATGACCGTATGAGTGGTCGTGAGTTGTTTCTTTCGGATGCAAGC TTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCATATGAAAAATACCAGAGAGAAGAAGAACCTGAGAGC ACCAAACAAAGGGTAGTCTTGTTTCGCATCTTGAATTTTTGGACAATTTTTTGGTTATTT GAATCTCTGTTTGGCATTAATAATTTTCCCACTAGTTAA
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>LITCHI027928.m2 TTCGAATGGAAATAGTGACGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGTCTTGTCCCAA TCAAAAGCAAACCAAGCAAGGACAAATTCGTAATATCAAATCTATAAAACAAACACAAGC CCAGCAACACCCCCACTGCCCCTTGTCCATCGGAAACCCTCACACCCGCACACACACGCA GTCACGTCACTCAGCTCAGCAAGCAAATCCACTGGAAACCCTAAATCAGCTTTTGATCGA TTTCATTCATTTAACCATCCAAATTCAAATTCAGTGAATTTATAAAACCAGATTGCTCGA ATTCAATTAAAAAAAAGGAACATGCCGCCGAAGCCGAAGCCATCGAAGGCCGATGTGGCG AAGAAGCAGAAAGTGGTGGAAGACAAAACCTTCGGCCTGAAGAACAAGAACAAGAGCAAA AATGTCCAGAAATACGTCCAAAGTCTTCAACAAGCCGTTCAGCCCAAACCTGACCAGTCC AAAGTCGCCGCCAAGAAAAAGAAAGAGGAAGAGAAAGCGAGAGAGAAGGAGCTGAACGAA TTGTTCAAGGTTGCTGTGAGTCAGCCGAAGGTACCAGTCGGTGTGGATCCGAAATCCATA GTGTGCGAGTTTTTCAAGGTTGGACAGTGTCAAAAGGGTTTCAAATGCAAGTTCTCACAT GACTTGAATGTTCAGAGGAAGGGTGAAAAGATTGATATTTATAGTGATAAGCGTGATGAA GAAACGATGGAGGATTGGGATCAAGCAACACTGGAGAAGGTTGTTGAGTCGAAGAAGAAC GAGTATAATCAGAATAAACCAACTGAGATTGTTTGCAAATACTTTTTGGAAGCAGTGGAA AAGAAACAATATGGTTGGTTTTGGGTTTGTCCAAATGGTGGCAAAGATTGTCACTACAGA CATGCTCTTCCTCCTGGATATGTCTTAAAATCTCAAATGAAGGCACTTCTAGAGGAAGAG AGTGAGAAAATGCCTATTGAAGAAGAAATTGAAGATCAGCGTGCAAAATTAACGGCATCA ACTCCAATGACTCCTGAGCTGTTTATGCAATGGAAGCAGAAAAAGACAGAAGAAAGAGAG GCAGGCTTAGCTGCACAACGAGCTGAGAGGGCTAAGAATGACCGTATGAGTGGTCGTGAG TTGTTTCTTTCGGATGCAAGCTTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCATATGAAAAATACCAG AGAGAAGAAGAACCTGAGAGCACCAAACAAAGGGTAGTCTTGTTTCGCATCTTGAATTTT TGGACAATTTTTTGGTTATTTGAATCTCTGTTTGGCATTAATAATTTTCCCACTAGTTAA AATGCTCTAGCATTTTCTTTTTGCCGCACAGGGCTTGTTTGTCATGTTACCTCTTGCAAC TCAACTTGTTATGAGGTGCTTGAAGGATAATGTACAACTACTCAACATTTATTGTGCAAT TGTAGGTTAAGGATGAATCGTCAGCAGCTGGAACAAGCTCTTCCACTAACACCGTGGCTA ATTCTGAAGAAATCCTTCTTGATGATGATGATGATGACGATGACGAGCTGGACATGGACG AGCTAAATGAACTTGAAGCAAGTTTGTCAAGAACATCTATTCAGATTCGCGAACCAGGTA TTGAAGCTTCTTAAAGGGAAAGAGGAGAGCAAGAGAAAAACCCTTTGCTCTCAAGGCATC ATAAATCTAATGGGGGATTAAAGAGATCAAGGGTTCGGCCATTGAATCGACCATCATCAC TAGTAATAATCCATGTTTTGGTCCAGACAAATGTTGTGTCATGTTCAACTTCTTGATCTT CAAATTGTAATTGGATTGACTTATGGCAGGGTTTACGTTTTGATTGGGGTTGCCCTGCCT GATATCATCAAGTGATTTTATCATAGACATTTCTGTGTACCTTTTTTATTTGCTTGTCTT CATCAGTCATTTATGCAGAGCTGGTTAATTTTGCTTTAATTAGTAATTGAGCAACAATAC CAATTTAATTTGAAAATTATGCTACAACTGGTTTTGCATGCTTGGTTTGTGAACTCTGTT GAAGCAAACCTACGGTTGGTGGTTTTCTAAGTTCATGTAAAGTGAAATAATAAATTTGTA GGTTAACGTTGTAATTGAAAGTCAAACACATTTTCACACAGAC >LITCHI027928.m1 TTCGAATGGAAATAGTGACGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGTCTTGTCCCAA TCAAAAGCAAACCAAGCAAGGACAAATTCGTAATATCAAATCTATAAAACAAACACAAGC CCAGCAACACCCCCACTGCCCCTTGTCCATCGGAAACCCTCACACCCGCACACACACGCA GTCACGTCACTCAGCTCAGCAAGCAAATCCACTGGAAACCCTAAATCAGCTTTTGATCGA TTTCATTCATTTAACCATCCAAATTCAAATTCAGTGAATTTATAAAACCAGATTGCTCGA ATTCAATTAAAAAAAAGGAACATGCCGCCGAAGCCGAAGCCATCGAAGGCCGATGTGGCG AAGAAGCAGAAAGTGGTGGAAGACAAAACCTTCGGCCTGAAGAACAAGAACAAGAGCAAA AATGTCCAGAAATACGTCCAAAGTCTTCAACAAGCCGTTCAGCCCAAACCTGACCAGTCC AAAGTCGCCGCCAAGAAAAAGAAAGAGGAAGAGAAAGCGAGAGAGAAGGAGCTGAACGAA TTGTTCAAGGTTGCTGTGAGTCAGCCGAAGGTACCAGTCGGTGTGGATCCGAAATCCATA GTGTGCGAGTTTTTCAAGGTTGGACAGTGTCAAAAGGGTTTCAAATGCAAGTTCTCACAT GACTTGAATGTTCAGAGGAAGGGTGAAAAGATTGATATTTATAGTGATAAGCGTGATGAA GAAACGATGGAGGATTGGGATCAAGCAACACTGGAGAAGGTTGTTGAGTCGAAGAAGAAC GAGTATAATCAGAATAAACCAACTGAGATTGTTTGCAAATACTTTTTGGAAGCAGTGGAA AAGAAACAATATGGTTGGTTTTGGGTTTGTCCAAATGGTGGCAAAGATTGTCACTACAGA CATGCTCTTCCTCCTGGATATGTCTTAAAATCTCAAATGAAGGCACTTCTAGAGGAAGAG AGTGAGAAAATGCCTATTGAAGAAGAAATTGAAGATCAGCGTGCAAAATTAACGGCATCA ACTCCAATGACTCCTGAGCTGTTTATGCAATGGAAGCAGAAAAAGACAGAAGAAAGAGAG GCAGGCTTAGCTGCACAACGAGCTGAGAGGGCTAAGAATGACCGTATGAGTGGTCGTGAG TTGTTTCTTTCGGATGCAAGCTTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCATATGAAAAATACCAG AGAGAAGAAGAACCTGAGAGCACCAAACAAAGGGTTAAGGATGAATCGTCAGCAGCTGGA ACAAGCTCTTCCACTAACACCGTGGCTAATTCTGAAGAAATCCTTCTTGATGATGATGAT GATGACGATGACGAGCTGGACATGGACGAGCTAAATGAACTTGAAGCAAGTTTGTCAAGA ACATCTATTCAGATTCGCGAACCAGGTATTGAAGCTTCTTAAAGGGAAAGAGGAGAGCAA GAGAAAAACCCTTTGCTCTCAAGGCATCATAAATCTAATGGGGGATTAAAGAGATCAAGG GTTCGGCCATTGAATCGACCATCATCACTAGTAATAATCCATGTTTTGGTCCAGACAAAT GTTGTGTCATGTTCAACTTCTTGATCTTCAAATTGTAATTGGATTGACTTATGGCAGGGT TTACGTTTTGATTGGGGTTGCCCTGCCTGATATCATCAAGTGATTTTATCATAGACATTT CTGTGTACCTTTTTTATTTGCTTGTCTTCATCAGTCATTTATGCAGAGCTGGTTAATTTT GCTTTAATTAGTAATTGAGCAACAATACCAATTTAATTTGAAAATTATGCTACAACTGGT TTTGCATGCTTGGTTTGTGAACTCTGTTGAAGCAAACCTACGGTTGGTGGTTTTCTAAGT TCATGTAAAGTGAAATAATAAATTTGTAGGTTAACGTTGTAATTGAAAGTCAAACACATT TTCACACAGAC
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>LITCHI027928.m2 - Up_Stream_Len 2000 CTGAACACAATAGCTTGACAATCACAGCTTAAATAAAATTAAATAGAGGAATTCACATGA CTGAAAATAAAAACAAAGAGAAACAAAACAGAAGATCTTGACCTAAGCAAGTTTGAATGG CCTTTCGAAGATCAAGATACTTTTGCCAGAACACTCTTTGAGCATCGACTCGAACGCTCG ATTCATGAATCCACTAACCACCATTTCTTCTCTTCGATTATACAATACAATCCTCTCACC TAGAAAAACAAATTTGAAATGAATAAATAAACGACAATGTCGAGATCGCCTGAGATCTAT GTAGAGGGATGAAGAATTTTGACTTTACCTTGTTTATGTTGATGTCGGATAAAAGAAATG CGAGAGTGATTGTTTGGGAGAGAGGGAGATTGGAAAGGAGAGTAGAGTAGATCTGTTTTT TTTTTCGTTTTGTGCATGTGCTACTATGTGATATGGATGGATCCCAGACTGTGCCCAGAC TTCATTGCAACGATGATGGGTGTAGGTGCGACGATGAGGTACGACAGTTAGGACTTTGGA CGGTGGGTTGGGATTCCTAGAGTGAGAATGAGAGAAAAAAGTTAGGAATAGAGAGAGTGA CAAGTTTTGTCGAGAGAGAATGACCGTCACACAACTATAAAAGGGTGGGTCAGTTGTGAT TTGGTTGAGTAATCAAGGATATTCTTGTAAAAATAAAAAAAAAAAAAAACCGTGCAGTGA TTTAAAAAAAAAAAGTCATTTCTCAAATGAGTCATCACAAAAAGGTCAGATTTCAACAAA ACCCGAAGAGATAACACCCGAACCGTGTTGTTGACACCTTATAATAACCCTATAACAACA CTTTTCGAATTTGTAATCAACCTAATCAACCTAACACAAAGATAGATAAATCTTAATCAA GTTTATGTTTTTCCTCCTAAAAAATAGATTTACATAAACACTCAACTTAAAAAATTAAGA AAAAAAAAAAAACCGAAATTACTGCATGAAACTTAAATTCTTTCAACAAAAAGAGAGAGT TCACCATTTTTTGTTTTTGTTTCCAACGATTAGCAGTGACTTCTCCTTTCCCCAGCACCT CTAATGTTAGATAACACCAAAACGACAAGTCACAATAAATATGGCTCACATGCAACGATT GAATGAGCGCTCTGTCTCATAATTTGCATAATTTGGTTAGAGTAATATTAAATTTCTTAA ATATTTTGTTCAAATTTTGAATTGTCAAAATTTTATTAATTAACATAACATCATATGATT TATAAGATTTTGACAACTCAATATAATATTATTTGAACAAAATATTTGAGAAATCTAGTA TTACTCATTTTGTTATCATAATTATTCACTTTGAACTTTAGAAACATGAAATTTTTGGTA TATATATATATATATGTGTGTGTATATGTATATATATATATATGTAAGAGAATAATTATT TGAATTTATTAGGGACAAACTTTTATTGAATGAATATAAATTATTGTGATGTTTGGTTCA ATTTTAATGAAACAAATATTATTTTAATTAGTAAAGTGTAACTTAATAATTTTGTTTATA TGACTAAAAAAGTATCAATATTTCTTTTAAAAAGTAATTCAATATAATTGGGCATTTATG AATTAATAAGATTTATAAATTTCCAGCTAATTTAACATAAACTCGTGCCAGAATCCATTT TCGAATGGAAATAGTGACGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGTCTTGTCCCAAT CAAAAGCAAACCAAGCAAGGACAAATTCGTAATATCAAATCTATAAAACAAACACAAGCC CAGCAACACCCCCACTGCCCCTTGTCCATCGGAAACCCTCACACCCGCACACACACGCAG TCACGTCACTCAGCTCAGCAAGCAAATCCACTGGAAACCCTAAATCAGCTTTTGATCGAT TTCATTCATTTAACCATCCAAATTCAAATTCAGTGAATTTATAAAACCAGATTGCTCGAA TTCAATTAAAAAAAAGGAAC >LITCHI027928.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTGAACACAATAGCTTGACAATCACAGCTTAAATAAAATTAAATAGAGGAATTCACATGA CTGAAAATAAAAACAAAGAGAAACAAAACAGAAGATCTTGACCTAAGCAAGTTTGAATGG CCTTTCGAAGATCAAGATACTTTTGCCAGAACACTCTTTGAGCATCGACTCGAACGCTCG ATTCATGAATCCACTAACCACCATTTCTTCTCTTCGATTATACAATACAATCCTCTCACC TAGAAAAACAAATTTGAAATGAATAAATAAACGACAATGTCGAGATCGCCTGAGATCTAT GTAGAGGGATGAAGAATTTTGACTTTACCTTGTTTATGTTGATGTCGGATAAAAGAAATG CGAGAGTGATTGTTTGGGAGAGAGGGAGATTGGAAAGGAGAGTAGAGTAGATCTGTTTTT TTTTTCGTTTTGTGCATGTGCTACTATGTGATATGGATGGATCCCAGACTGTGCCCAGAC TTCATTGCAACGATGATGGGTGTAGGTGCGACGATGAGGTACGACAGTTAGGACTTTGGA CGGTGGGTTGGGATTCCTAGAGTGAGAATGAGAGAAAAAAGTTAGGAATAGAGAGAGTGA CAAGTTTTGTCGAGAGAGAATGACCGTCACACAACTATAAAAGGGTGGGTCAGTTGTGAT TTGGTTGAGTAATCAAGGATATTCTTGTAAAAATAAAAAAAAAAAAAAACCGTGCAGTGA TTTAAAAAAAAAAAGTCATTTCTCAAATGAGTCATCACAAAAAGGTCAGATTTCAACAAA ACCCGAAGAGATAACACCCGAACCGTGTTGTTGACACCTTATAATAACCCTATAACAACA CTTTTCGAATTTGTAATCAACCTAATCAACCTAACACAAAGATAGATAAATCTTAATCAA GTTTATGTTTTTCCTCCTAAAAAATAGATTTACATAAACACTCAACTTAAAAAATTAAGA AAAAAAAAAAAACCGAAATTACTGCATGAAACTTAAATTCTTTCAACAAAAAGAGAGAGT TCACCATTTTTTGTTTTTGTTTCCAACGATTAGCAGTGACTTCTCCTTTCCCCAGCACCT CTAATGTTAGATAACACCAAAACGACAAGTCACAATAAATATGGCTCACATGCAACGATT GAATGAGCGCTCTGTCTCATAATTTGCATAATTTGGTTAGAGTAATATTAAATTTCTTAA ATATTTTGTTCAAATTTTGAATTGTCAAAATTTTATTAATTAACATAACATCATATGATT TATAAGATTTTGACAACTCAATATAATATTATTTGAACAAAATATTTGAGAAATCTAGTA TTACTCATTTTGTTATCATAATTATTCACTTTGAACTTTAGAAACATGAAATTTTTGGTA TATATATATATATATGTGTGTGTATATGTATATATATATATATGTAAGAGAATAATTATT TGAATTTATTAGGGACAAACTTTTATTGAATGAATATAAATTATTGTGATGTTTGGTTCA ATTTTAATGAAACAAATATTATTTTAATTAGTAAAGTGTAACTTAATAATTTTGTTTATA TGACTAAAAAAGTATCAATATTTCTTTTAAAAAGTAATTCAATATAATTGGGCATTTATG AATTAATAAGATTTATAAATTTCCAGCTAATTTAACATAAACTCGTGCCAGAATCCATTT TCGAATGGAAATAGTGACGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGTCTTGTCCCAAT CAAAAGCAAACCAAGCAAGGACAAATTCGTAATATCAAATCTATAAAACAAACACAAGCC CAGCAACACCCCCACTGCCCCTTGTCCATCGGAAACCCTCACACCCGCACACACACGCAG TCACGTCACTCAGCTCAGCAAGCAAATCCACTGGAAACCCTAAATCAGCTTTTGATCGAT TTCATTCATTTAACCATCCAAATTCAAATTCAGTGAATTTATAAAACCAGATTGCTCGAA TTCAATTAAAAAAAAGGAAC
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>LITCHI027928.m2 GenomeSequence - TTCGAATGGAAATAGTGACGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGTCTTGTCCCAA TCAAAAGCAAACCAAGCAAGGACAAATTCGTAATATCAAATCTATAAAACAAACACAAGC CCAGCAACACCCCCACTGCCCCTTGTCCATCGGAAACCCTCACACCCGCACACACACGCA GTCACGTCACTCAGCTCAGCAAGCAAATCCACTGGAAACCCTAAATCAGCTTTTGATCGA TTTCATTCATTTAACCATCCAAATTCAAATTCAGTGAATTTATAAAACCAGATTGCTCGA ATTCAATTAAAAAAAAGGAACATGCCGCCGAAGCCGAAGCCATCGAAGGCCGATGTGGCG AAGAAGCAGAAAGTGGTGGAAGACAAAACCTTCGGCCTGAAGAACAAGAACAAGAGCAAA AATGTCCAGAAATACGTCCAAAGTCTTCAACAAGCCGTTCAGCCCAAACCTGACCAGTCC AAAGTCGCCGCCAAGGTCCCCTCTTTCGCTTTCACTTCTTATTTTCTCTTTTTAAATTTA TTGTTAGCTTTATAAGGTTTTTTTTTTTTTTTAATCTATATACATATATATTTATCTTTA ATTTATATCTTTAAATTAAGGTGGTTTTAGGTTTAGTTTTGATATTGTGGTGTAAAGTGA GTGCATTGTACTTGCAAGTGTATGATTTTTTATGCGAATTAGATTTTCGATAGATTTTGA GAGAATGACATTAGAAACTGATGAATTCTGCTAAAAGTTTTGGAAAATGAAAGAGTTATT TACATTTTCCCTCTTCACGATTAGCGAATCATCATTTTCCCCCCTTAAGAAGGGGTAAAA AAATGTTTCCCGAATCAATAGGGAGAAACTAATGATTCGTCAATCATTAGGGGAAAAATG 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