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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027847 | Chr3 | 32757825 | 32761143 | - | Probable acetyltransferase NATA1-like |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027847.m1 | 114 | 199 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 54.9 | 1.00E-14 |
LITCHI027847.m1 | 123 | 199 | PF13508.10 | Acetyltransf_7 | Domain | 33.1 | 5.90E-08 |
LITCHI027847.m1 | 145 | 199 | PF13673.10 | Acetyltransf_10 | Domain | 32.4 | 8.00E-08 |
LITCHI027847.m1 | 146 | 203 | PF08445.13 | FR47 | Family | 22.6 | 8.60E-05 |
LITCHI027847.m2 | 114 | 199 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 55.6 | 6.30E-15 |
LITCHI027847.m2 | 123 | 199 | PF13508.10 | Acetyltransf_7 | Domain | 33.7 | 3.80E-08 |
LITCHI027847.m2 | 145 | 199 | PF13673.10 | Acetyltransf_10 | Domain | 33 | 5.20E-08 |
LITCHI027847.m2 | 146 | 203 | PF08445.13 | FR47 | Family | 23.1 | 5.90E-05 |
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>LITCHI027847.m1 ATGGCCGCCGCCGCACCACCGCCGGCACCGACCCCAGCACCTGAACCATCGATGAGCGTG GAAGAAGCGAGGCAGGCAATGTTCTCTCGGGTCCGGCTGGCGACCCCGGCCGATGTGCCC CACTTACACAAACTAATAGAGCAGATGGCAGTGTTCGAGAAACTGACCCACCTCTTCTCG GCTACGGAGTCCTCCCTCTCCTCCACCCTCTTCAACTCCCCTCCCTTTACTTCCTTCACC ATCTTCATACTCGAACTGTCCCCGAGGCCCTTCACCGCCGCCGCCGTCATGGACGGCGTC GTCGACCTCGACCTCCCCCTCGTTGACCCCGAAAGAGACACCTTCCTCTCCGACAAAGCC AACGACGTAACGGTTGCAGGGTTCGTGCTGTTCTTCCCCAACTACTCGACGTTCCTGGGG AAGCCGGGGTTCTACGTGGAGGATCTGTTCGTGAGGGAGTGTTACAGGCGCAAAGGCCTG GGGCGGATGCTGCTGTCCGCGGTGGCCAAACAGGCTGTGAAGATGGGGTACGGGAGAGTG GAGTGGTTGGTGCTTGACTGGAATGTCAATGCTATCAAGTTCTATCAGGAAATGGGTGCT GAGGTTCTCCAGGAATGGAGGATTTGTAGACTCACTGGTCAGACTCTTCAGGCTTACGGT GATGTACTGAATCAAGTTGACAGCTTCTCAATCTCAGCATCCAAACGAAGATCAGGCCTT CTACAAATTGAAATGCCCACAAACACAGATATGCACACAGATGACATATGCATACATACG TATAAACGGTTATTGTTAGTAATCTTCCGGACCATTAGATAG >LITCHI027847.m2 ATGGCCGCCGCCGCACCACCGCCGGCACCGACCCCAGCACCTGAACCATCGATGAGCGTG GAAGAAGCGAGGCAGGCAATGTTCTCTCGGGTCCGGCTGGCGACCCCGGCCGATGTGCCC CACTTACACAAACTAATAGAGCAGATGGCAGTGTTCGAGAAACTGACCCACCTCTTCTCG GCTACGGAGTCCTCCCTCTCCTCCACCCTCTTCAACTCCCCTCCCTTTACTTCCTTCACC ATCTTCATACTCGAACTGTCCCCGAGGCCCTTCACCGCCGCCGCCGTCATGGACGGCGTC GTCGACCTCGACCTCCCCCTCGTTGACCCCGAAAGAGACACCTTCCTCTCCGACAAAGCC AACGACGTAACGGTTGCAGGGTTCGTGCTGTTCTTCCCCAACTACTCGACGTTCCTGGGG AAGCCGGGGTTCTACGTGGAGGATCTGTTCGTGAGGGAGTGTTACAGGCGCAAAGGCCTG GGGCGGATGCTGCTGTCCGCGGTGGCCAAACAGGCTGTGAAGATGGGGTACGGGAGAGTG GAGTGGTTGGTGCTTGACTGGAATGTCAATGCTATCAAGTTCTATCAGGAAATGGGTGCT GAGGTTCTCCAGGAATGGAGGATTTGTAGACTCACTGGTCAGACTCTTCAGGCTTACGGT GATGTATGA
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>LITCHI027847.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTATAGAAAAGTATAGCGCTACATTACGATGCAGACAATTCCGCACGTAGTTGGTTAGTT GACAGTTAGCGCTACGAAGCGATGCAGTAAATTCCGCTCGTAGTCGTCTAGAGATTTAGC ACTACATTTGCGATGCAGAGAATTCCGCATTGTAGTTGTTCTGTGAATAGTTTAGCGCCC TACGTATAATGTAGTAAATTCCGTAACGTAGTGGTTGAGATGCATTAGTAAGCTTCACGT TGGCGTTAGTTAAAATCGTCCGTGATGGTTAGAATGAGTCAAGGGTATACAGGGAGAGTT TTAAAGAAAATTTTAAGACTTGTAAATTGTATGTTAGTATGTGTGATATGATATCCTATG ATGTTATCGCACTAACTTGTTGTTCATTTTGTAGCTTGTTTGTTTTCATTTCGTGCCACC GCCGGACGAGACCGACTTTTGCTTATATATATATCTATAGGTGGGCAATCACGCAAGACG CTGGGATATATTTTGTATATGTATTTAATCGTGTATATTGTGAATTTGAATGATGTAGGG ATTGTAAAAGTGATAAATATTCTTGCATTTATACATTTGGTGCACTTATGTATCTTATGA ATTGTTTATGCTTATGAAACTGTGATGAATGATGCATGATTGAGAATAAAGAAGTTGGGA GGTTTACAGAAATAGTTGAAGTGTTGTTTTCTTGACAGGTAAAATTTTGGTTTATCAAAA ACGCAGCCGTTATGCTGCCGAAATTTTTATAAAATGAAATTGAAATAGAATCAAACAAAA GGTTTATCTCTCCCAACCAGTAACAGATAAAATCAAATCACTAAGTTTTAACGAGTAAAC CGGATACAAAAAGATAGGGTTCGCTTCCCGGATGTCTTCGATCCAACGAGTTGGTTTCGA GGAATCCGTTGAAGTGCTCGACAGGATCCTCCAGACGAGAGCTTAGATAAGGTCTGGGAA GGGTCCTGTCAGTTCAAACCCAATAAAGTTTCACCTAGGTTTATCAATTCGAACGGTGAA CCCAAATAAGATTTGGATTTGAATTCTAAATTTCATTTGGGTTTGAGAAGAAGAATAAGA AGAAGAGAAGAAGAAGAGAGAGAGAGAGACAGAGGGAGAGATAGATAGACAATGGCTAGT GGGAAAAGAAGAAGAAAATGGTGACATAGACCTTTTTACCTGCCATTTCTAGGTTCAACC TCCTCAATGACGTTTATGCCCTTCAAATTGATGTATCCATTAGTTCATTGACAAAATTAT TATGTCATTTAACGATTTGCTCATTTTAGTTATTATTTTCAATATCAAGGGTGGTTTAAT ATTATTTCCAATGCCAAAGGTAAAATAATAATAACCCTATGAAAAAAAGGGAAAACAAAA ACATAATTAATGAATTATTATAATAAGAATTTGATTATTTTATTGATTATTGATTGGACA ATCTAAGTAAATCATTACAACTATTAAATTTGTTATAAAGTAGTTATTGAAGTCAATTCA ATTATTGTAATTGTTGGATAAGACTATCCAACCAGTACGATAGTTAAACCCTTATAATAA ATATAGACTTTCCAAATTTTTATAATTAATTATTACTATCAAAATAAAAAGAGTTTGATT CTTTTATTGGTTAGTTAAGATTACTGATTAATAATAATATTTGGATTGATTGTAAGATTG ATTATCGAAGAATATCCAATGATAAAAATATAAAAAGTAATATTAGGTTTTTTTAAATTT TTTATTTATATTTATATTTAAATAATATAATATATAAATTATTAATATCATAATAATGAT CGTATTAAATTATAATTTATAAGAAACTCGTGACTTTAATTATAGATACTATATGATATT AATTAATTAATTAATGATGAGTTACGTGTAACTGGTAACTCAGATGATAGGTGCACCACT CATAAGCACGGAGAGAGAGAGCAGTAGACACGCAACGACCTCAGTCAACAAAATCACTCA TTTTTCTAGTCGAAACCAAA >LITCHI027847.m2 - Up_Stream_Len 2000 TTATAGAAAAGTATAGCGCTACATTACGATGCAGACAATTCCGCACGTAGTTGGTTAGTT GACAGTTAGCGCTACGAAGCGATGCAGTAAATTCCGCTCGTAGTCGTCTAGAGATTTAGC ACTACATTTGCGATGCAGAGAATTCCGCATTGTAGTTGTTCTGTGAATAGTTTAGCGCCC TACGTATAATGTAGTAAATTCCGTAACGTAGTGGTTGAGATGCATTAGTAAGCTTCACGT TGGCGTTAGTTAAAATCGTCCGTGATGGTTAGAATGAGTCAAGGGTATACAGGGAGAGTT TTAAAGAAAATTTTAAGACTTGTAAATTGTATGTTAGTATGTGTGATATGATATCCTATG ATGTTATCGCACTAACTTGTTGTTCATTTTGTAGCTTGTTTGTTTTCATTTCGTGCCACC GCCGGACGAGACCGACTTTTGCTTATATATATATCTATAGGTGGGCAATCACGCAAGACG CTGGGATATATTTTGTATATGTATTTAATCGTGTATATTGTGAATTTGAATGATGTAGGG ATTGTAAAAGTGATAAATATTCTTGCATTTATACATTTGGTGCACTTATGTATCTTATGA ATTGTTTATGCTTATGAAACTGTGATGAATGATGCATGATTGAGAATAAAGAAGTTGGGA GGTTTACAGAAATAGTTGAAGTGTTGTTTTCTTGACAGGTAAAATTTTGGTTTATCAAAA ACGCAGCCGTTATGCTGCCGAAATTTTTATAAAATGAAATTGAAATAGAATCAAACAAAA GGTTTATCTCTCCCAACCAGTAACAGATAAAATCAAATCACTAAGTTTTAACGAGTAAAC CGGATACAAAAAGATAGGGTTCGCTTCCCGGATGTCTTCGATCCAACGAGTTGGTTTCGA GGAATCCGTTGAAGTGCTCGACAGGATCCTCCAGACGAGAGCTTAGATAAGGTCTGGGAA GGGTCCTGTCAGTTCAAACCCAATAAAGTTTCACCTAGGTTTATCAATTCGAACGGTGAA CCCAAATAAGATTTGGATTTGAATTCTAAATTTCATTTGGGTTTGAGAAGAAGAATAAGA AGAAGAGAAGAAGAAGAGAGAGAGAGAGACAGAGGGAGAGATAGATAGACAATGGCTAGT GGGAAAAGAAGAAGAAAATGGTGACATAGACCTTTTTACCTGCCATTTCTAGGTTCAACC TCCTCAATGACGTTTATGCCCTTCAAATTGATGTATCCATTAGTTCATTGACAAAATTAT TATGTCATTTAACGATTTGCTCATTTTAGTTATTATTTTCAATATCAAGGGTGGTTTAAT ATTATTTCCAATGCCAAAGGTAAAATAATAATAACCCTATGAAAAAAAGGGAAAACAAAA ACATAATTAATGAATTATTATAATAAGAATTTGATTATTTTATTGATTATTGATTGGACA ATCTAAGTAAATCATTACAACTATTAAATTTGTTATAAAGTAGTTATTGAAGTCAATTCA ATTATTGTAATTGTTGGATAAGACTATCCAACCAGTACGATAGTTAAACCCTTATAATAA ATATAGACTTTCCAAATTTTTATAATTAATTATTACTATCAAAATAAAAAGAGTTTGATT CTTTTATTGGTTAGTTAAGATTACTGATTAATAATAATATTTGGATTGATTGTAAGATTG ATTATCGAAGAATATCCAATGATAAAAATATAAAAAGTAATATTAGGTTTTTTTAAATTT TTTATTTATATTTATATTTAAATAATATAATATATAAATTATTAATATCATAATAATGAT CGTATTAAATTATAATTTATAAGAAACTCGTGACTTTAATTATAGATACTATATGATATT AATTAATTAATTAATGATGAGTTACGTGTAACTGGTAACTCAGATGATAGGTGCACCACT CATAAGCACGGAGAGAGAGAGCAGTAGACACGCAACGACCTCAGTCAACAAAATCACTCA TTTTTCTAGTCGAAACCAAA
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